演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

VIPR1VPAC1

vasoactive intestinal peptide receptor 1

VIPR1 編碼 vasoactive intestinal peptide receptor 1,屬於 G protein-coupled receptor,能受 VIP 與 PACAP 神經胜肽活化,並啟動 cAMP 依賴性訊息傳遞。

Homo sapiens3p22.1UniProt P32241
OFFICIAL SYMBOL
VIPR1
CHROMOSOME
3
UNIPROT
P32241
PDB / ALPHAFOLD
8E3Y
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

vasoactive intestinal peptide receptor 1 是由 VIPR1 編碼的蛋白質,屬於 G protein-coupled receptor 2 family。其蛋白質全長 457 個胺基酸,具有七段跨膜螺旋,是多次穿膜的細胞膜受體;胞外區域與胞質區域交錯分布於跨膜區段之間。這種拓樸結構使受體能接收細胞外神經胜肽訊號,並將訊號傳向細胞內。

Official symbol
VIPR1
Gene name
vasoactive intestinal peptide receptor 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12694
UniProt
P32241
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
VPAC1RDC1HVR1VPAC1R

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p22.1
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegVIPR1pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr3:42,489,299–42,537,696
Gene span
48,398 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000325123 ★42,502,643–42,537,56813
ENST0000043364742,489,299–42,537,68814
ENST0000045027442,501,912–42,527,4965
ENST0000088301642,502,577–42,537,68813
ENST0000088301742,502,577–42,537,68813
ENST0000088301842,502,577–42,537,58113
ENST0000088301942,502,577–42,537,68812
ENST0000088302042,502,577–42,537,68813
ENST0000088302142,502,577–42,537,68813
ENST0000088302242,502,577–42,537,58113
ENST0000088302342,502,577–42,537,68812
ENST0000088302442,502,577–42,537,68813

顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

vasoactive intestinal peptide receptor 1 是由神經胜肽 vasoactive intestinal peptide(VIP)與 pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide(PACAP)活化的 G protein-coupled receptor。它可結合 VIP,以及 PACAP 的兩種生物活性形式 PACAP27 和 PACAP38;來源所述的配體親和力順序為 VIP 與 PACAP27 相同,且高於 PACAP38。

配體結合會使受體構形改變,進而觸發經由 guanine nucleotide-binding proteins(G proteins)的訊號傳遞,並調節下游效應因子的活性。受體活化後也會啟動 cAMP 依賴性路徑,將細胞外配體訊號轉化為細胞內反應。來源指出這項訊號作用,但未進一步界定特定下游效應因子或其生物學結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 42502643 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>VIPR1 ENST00000325123 GRCh38 chr3:42501643-42502743 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCGGTGTCACCCAGCGGCCGAGCAGCCGCCCCTTGGAAGCTCAGCACCAAAGGCAGGCGGCCAGGGTCCT
GGCCCCTCTCTGGACCCCAGTATCCCCAGCTGTAAAATAGGGAATGCAGGAGGAGGACGACGTCTGTGGA
TCGTTTTAGGTCAGCTGCGGAGTCGGCCTGCGGGCTGGGAGCAGACCTCGCTCCCCACGCGAGGGCGCTG
GCACTTCAGCCCAGCCTCCCTGGGGAGGTGCCCTGGACGAGACCCGCGAGGGTGCGGACACCTCATCCTC
CCTGGAGCAGGTCTCCCGAGGCTTGAAGGGCCAGGGCACCCAACAGGTGCTGAGCGCGCCCCACCAGGTC
ACCCGGGAGCAGGGAACACCAAGGAACCCAGAGTCGGGCCTCTTTCGAGCCCTCGCTTCCTCTCGCCTGG
CTTCTTCGGCGCGAAGGATGAATTGGGGTTGTTGAAAATTGATCAAACAACCCGATCTCTGTCAGCGCCT
GGACACTTGCTGGGCCCCAGCTCGCAGCCTGGGAAGATAAGTGGCACTTCCTGTCTCGTAATCGGATTTG
CGCGCACGAACCCTCGGAGACGCACAGGTGGGAAATGGGGAGGCTGGCGGGGAGGCCTCCTGGAGGAGGT
GGCTCCGAGGGTAGACATGAGGAGCGCCCTGGGATGGGGCTGAGGGTGGATACAGAGGTGGGAGCTTGCG
AAGGTCGTGAGCTAAGCATGGAAGGATGGAATGTGTTCGGGTCTCGAGATTCCCGGGTGATGAGCCCGGA
GGGGCGAAGGCCTATAAATGTCTCACGACGGAAGACCAAGGTGTGGGATTGGCAAAGAGAGAGCAGAGCT
TCCTCACTGGCAGGGGCTCCCCAGCCCCGCCCCATACCTGCGCGGCGGCCCCGCCTCCACCCATCCATTG
GCTAGATCCGCCGCCCGTCAGACGAGCCCCCGGGGCCCGCCCCCAGCCCTGAGCTGCGCCTCTTAGCTCT
GGGGCCACAGCGCCAGCGCCACTCTGCCAGGCTCCCGGCCATCGCCCGCCTGGTGCGCCGCCCGCCAGCT
CTTTGCCCGCGCGGGGCCGCCCGCCGCGGGCTCAGGGCAGACCATGCGCCC
VIPR1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
VIPR1_1 ↗3:42,502,643正股42,502,594–42,502,653

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_5CZWMH · CTCF_binding_site · 42501555–42501576 · regulatory

ENSR3_5CZWMW · CTCF_binding_site · 42501643–42501664 · regulatory

ENSR3_5CZWNR · CTCF_binding_site · 42501833–42501854 · regulatory

ENSR3_BBFQ3 · promoter · 42502122–42502653 · regulatory

ENSR3_BBFQ6 · enhancer · 42502654–42503587 · regulatory

ENSR3_BBFQR · enhancer · 42507220–42507773 · regulatory

· motif · 42501557–42501573 · motif

· motif · 42501645–42501661 · motif

· motif · 42501835–42501851 · motif

· motif · 42501867–42501880 · motif

· motif · 42501867–42501880 · motif

· motif · 42502455–42502465 · motif

· motif · 42502506–42502516 · motif

· motif · 42502530–42502540 · motif

· motif · 42502586–42502596 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:457 aa

1 aa457 aa訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 P32241 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

vasoactive intestinal peptide receptor 1 長 457 個胺基酸,具有七段螺旋形跨膜區域,構成多次穿膜的受體結構。其 N 端含有訊號區段;胞外與胞質拓樸區域分布於各跨膜螺旋之間,C 端區域位於胞質側。該蛋白質屬於 G protein-coupled receptor 2 family。

訊號胜肽1–30 aa
拓樸區域Extracellular31–141 aa
跨膜區Helical; Name=1142–166 aa
拓樸區域Cytoplasmic167–174 aa
跨膜區Helical; Name=2175–196 aa
拓樸區域Extracellular197–216 aa
跨膜區Helical; Name=3217–241 aa
拓樸區域Cytoplasmic242–254 aa
跨膜區Helical; Name=4255–276 aa
拓樸區域Extracellular277–291 aa
跨膜區Helical; Name=5292–316 aa
拓樸區域Cytoplasmic317–338 aa
跨膜區Helical; Name=6339–359 aa
拓樸區域Extracellular360–367 aa
跨膜區Helical; Name=7368–391 aa
拓樸區域Cytoplasmic392–457 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8E3Y…

PDB · 8E3Y

EM · 2.30 A · R=28-457

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

vasoactive intestinal peptide receptor 1 位於細胞膜,屬於多次穿膜蛋白質。 來源未提供此受體在不同條件下的定位變化或異構型定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
VPAC1VIPR1PRDM5VIP
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

vasoactive intestinal peptide receptor 1 與 ADCYAP1/PACAP 及 VIP 有互作關係;PACAP27、PACAP38 可活化受體,而 VIP 與受體的互作會使 VIPR1 活化。來源描述的是配體與受體間的互作及其活化結果,未指出更大型複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能vasoactive intestinal peptide receptor 1 是可由 VIP 與 ADCYAP1/PACAP 神經胜肽活化的 G protein-coupled receptor。它能結合 VIP、PACAP27 與 PACAP38,配體親和力為 VIP 與 PACAP27 相同,且高於 PACAP38。配體結合引發受體構形改變,促使訊號經 G proteins 傳遞並調節下游效應因子,也會活化 cAMP 依賴性路徑。含實驗來源
證據與來源

G protein-coupled receptor activated by the neuropeptides vasoactive intestinal peptide (VIP) and pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide (ADCYAP1/PACAP). Binds VIP and both PACAP27 and PACAP38 bioactive peptides with the following order of ligand affinity VIP = PACAP27 > PACAP38. Ligand binding causes a conformation change that triggers signaling via guanine nucleotide-binding proteins (G proteins) and modulates the activity of downstream effectors. Activates cAMP-dependent pathway

PMID 35477937 ↗ · PMID 36385145 ↗ · PMID 8179610 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用vasoactive intestinal peptide receptor 1 與 ADCYAP1/PACAP 互作,並可由 PACAP27 和 PACAP38 神經胜肽活化;它也與 VIP 互作,而 VIP 與受體的互作會導致 VIPR1 活化。含實驗來源
證據與來源

Interacts with ADCYAP1/PACAP; activated by both PACAP27 and PACAP38 neuropeptides. Interacts with VIP; the interaction results in VIPR1 activation

PMID 36385145 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位vasoactive intestinal peptide receptor 1 是位於細胞膜的多次穿膜蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 8179610 ↗ · PMID 36385145 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000325123 · 2,754 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ACTCTGCCAGGCTCCCGGCCATCGCCCGCCTGGTGCGCCG40
41CCCGCCAGCTCTTTGCCCGCGCGGGGCCGCCCGCCGCGGG80
81CTCAGGGCAGACCATGCGCCCGCCAAGTCCGCTGCCCGCC120
121CGCTGGCTATGCGTGCTGGCAGGCGCCCTCGCCTGGGCCC160
161TTGGGCCGGCGGGCGGCCAGGCGGCCAGGCTGCAGGAGGA200
201GTGTGACTATGTGCAGATGATCGAGGTGCAGCACAAGCAG240
241TGCCTGGAGGAGGCCCAGCTGGAGAATGAGACAATAGGCT280
281GCAGCAAGATGTGGGACAACCTCACCTGCTGGCCAGCCAC320
321CCCTCGGGGCCAGGTAGTTGTCTTGGCCTGTCCCCTCATC360
361TTCAAGCTCTTCTCCTCCATTCAAGGCCGCAATGTAAGCC400
401GCAGCTGCACCGACGAAGGCTGGACGCACCTGGAGCCTGG440
441CCCGTACCCCATTGCCTGTGGTTTGGATGACAAGGCAGCG480
481AGTTTGGATGAGCAGCAGACCATGTTCTACGGTTCTGTGA520
521AGACCGGCTACACCATTGGCTACGGCCTGTCCCTCGCCAC560
561CCTTCTGGTCGCCACAGCTATCCTGAGCCTGTTCAGGAAG600
601CTCCACTGCACGCGGAACTACATCCACATGCACCTCTTCA640
641TATCCTTCATCCTGAGGGCTGCCGCTGTCTTCATCAAAGA680
681CTTGGCCCTCTTCGACAGCGGGGAGTCGGACCAGTGCTCC720
721GAGGGCTCGGTGGGCTGTAAGGCAGCCATGGTCTTTTTCC760
761AATATTGTGTCATGGCTAACTTCTTCTGGCTGCTGGTGGA800
801GGGCCTCTACCTGTACACCCTGCTTGCCGTCTCCTTCTTC840
841TCTGAGCGGAAGTACTTCTGGGGGTACATACTCATCGGCT880
881GGGGGGTACCCAGCACATTCACCATGGTGTGGACCATCGC920
921CAGGATCCATTTTGAGGATTATGGGTGCTGGGACACCATC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。