基因總覽
vasoactive intestinal peptide receptor 1 是由 VIPR1 編碼的蛋白質,屬於 G protein-coupled receptor 2 family。其蛋白質全長 457 個胺基酸,具有七段跨膜螺旋,是多次穿膜的細胞膜受體;胞外區域與胞質區域交錯分布於跨膜區段之間。這種拓樸結構使受體能接收細胞外神經胜肽訊號,並將訊號傳向細胞內。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000325123 ★ | 42,502,643–42,537,568 | 13 |
| ENST00000433647 | 42,489,299–42,537,688 | 14 |
| ENST00000450274 | 42,501,912–42,527,496 | 5 |
| ENST00000883016 | 42,502,577–42,537,688 | 13 |
| ENST00000883017 | 42,502,577–42,537,688 | 13 |
| ENST00000883018 | 42,502,577–42,537,581 | 13 |
| ENST00000883019 | 42,502,577–42,537,688 | 12 |
| ENST00000883020 | 42,502,577–42,537,688 | 13 |
| ENST00000883021 | 42,502,577–42,537,688 | 13 |
| ENST00000883022 | 42,502,577–42,537,581 | 13 |
| ENST00000883023 | 42,502,577–42,537,688 | 12 |
| ENST00000883024 | 42,502,577–42,537,688 | 13 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
vasoactive intestinal peptide receptor 1 是由神經胜肽 vasoactive intestinal peptide(VIP)與 pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide(PACAP)活化的 G protein-coupled receptor。它可結合 VIP,以及 PACAP 的兩種生物活性形式 PACAP27 和 PACAP38;來源所述的配體親和力順序為 VIP 與 PACAP27 相同,且高於 PACAP38。
配體結合會使受體構形改變,進而觸發經由 guanine nucleotide-binding proteins(G proteins)的訊號傳遞,並調節下游效應因子的活性。受體活化後也會啟動 cAMP 依賴性路徑,將細胞外配體訊號轉化為細胞內反應。來源指出這項訊號作用,但未進一步界定特定下游效應因子或其生物學結果。
Promoter 與基因調控
>VIPR1 ENST00000325123 GRCh38 chr3:42501643-42502743 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCGGTGTCACCCAGCGGCCGAGCAGCCGCCCCTTGGAAGCTCAGCACCAAAGGCAGGCGGCCAGGGTCCT GGCCCCTCTCTGGACCCCAGTATCCCCAGCTGTAAAATAGGGAATGCAGGAGGAGGACGACGTCTGTGGA TCGTTTTAGGTCAGCTGCGGAGTCGGCCTGCGGGCTGGGAGCAGACCTCGCTCCCCACGCGAGGGCGCTG GCACTTCAGCCCAGCCTCCCTGGGGAGGTGCCCTGGACGAGACCCGCGAGGGTGCGGACACCTCATCCTC CCTGGAGCAGGTCTCCCGAGGCTTGAAGGGCCAGGGCACCCAACAGGTGCTGAGCGCGCCCCACCAGGTC ACCCGGGAGCAGGGAACACCAAGGAACCCAGAGTCGGGCCTCTTTCGAGCCCTCGCTTCCTCTCGCCTGG CTTCTTCGGCGCGAAGGATGAATTGGGGTTGTTGAAAATTGATCAAACAACCCGATCTCTGTCAGCGCCT GGACACTTGCTGGGCCCCAGCTCGCAGCCTGGGAAGATAAGTGGCACTTCCTGTCTCGTAATCGGATTTG CGCGCACGAACCCTCGGAGACGCACAGGTGGGAAATGGGGAGGCTGGCGGGGAGGCCTCCTGGAGGAGGT GGCTCCGAGGGTAGACATGAGGAGCGCCCTGGGATGGGGCTGAGGGTGGATACAGAGGTGGGAGCTTGCG AAGGTCGTGAGCTAAGCATGGAAGGATGGAATGTGTTCGGGTCTCGAGATTCCCGGGTGATGAGCCCGGA GGGGCGAAGGCCTATAAATGTCTCACGACGGAAGACCAAGGTGTGGGATTGGCAAAGAGAGAGCAGAGCT TCCTCACTGGCAGGGGCTCCCCAGCCCCGCCCCATACCTGCGCGGCGGCCCCGCCTCCACCCATCCATTG GCTAGATCCGCCGCCCGTCAGACGAGCCCCCGGGGCCCGCCCCCAGCCCTGAGCTGCGCCTCTTAGCTCT GGGGCCACAGCGCCAGCGCCACTCTGCCAGGCTCCCGGCCATCGCCCGCCTGGTGCGCCGCCCGCCAGCT CTTTGCCCGCGCGGGGCCGCCCGCCGCGGGCTCAGGGCAGACCATGCGCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| VIPR1_1 ↗ | 3:42,502,643 | 正股 | 42,502,594–42,502,653 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_5CZWMH · CTCF_binding_site · 42501555–42501576 · regulatory
ENSR3_5CZWMW · CTCF_binding_site · 42501643–42501664 · regulatory
ENSR3_5CZWNR · CTCF_binding_site · 42501833–42501854 · regulatory
ENSR3_BBFQ3 · promoter · 42502122–42502653 · regulatory
ENSR3_BBFQ6 · enhancer · 42502654–42503587 · regulatory
ENSR3_BBFQR · enhancer · 42507220–42507773 · regulatory
· motif · 42501557–42501573 · motif
· motif · 42501645–42501661 · motif
· motif · 42501835–42501851 · motif
· motif · 42501867–42501880 · motif
· motif · 42501867–42501880 · motif
· motif · 42502455–42502465 · motif
· motif · 42502506–42502516 · motif
· motif · 42502530–42502540 · motif
· motif · 42502586–42502596 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:457 aa
vasoactive intestinal peptide receptor 1 長 457 個胺基酸,具有七段螺旋形跨膜區域,構成多次穿膜的受體結構。其 N 端含有訊號區段;胞外與胞質拓樸區域分布於各跨膜螺旋之間,C 端區域位於胞質側。該蛋白質屬於 G protein-coupled receptor 2 family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
vasoactive intestinal peptide receptor 1 位於細胞膜,屬於多次穿膜蛋白質。 來源未提供此受體在不同條件下的定位變化或異構型定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- PRDM5Q9NQX1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VIPP01282 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
vasoactive intestinal peptide receptor 1 與 ADCYAP1/PACAP 及 VIP 有互作關係;PACAP27、PACAP38 可活化受體,而 VIP 與受體的互作會使 VIPR1 活化。來源描述的是配體與受體間的互作及其活化結果,未指出更大型複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | vasoactive intestinal peptide receptor 1 是可由 VIP 與 ADCYAP1/PACAP 神經胜肽活化的 G protein-coupled receptor。它能結合 VIP、PACAP27 與 PACAP38,配體親和力為 VIP 與 PACAP27 相同,且高於 PACAP38。配體結合引發受體構形改變,促使訊號經 G proteins 傳遞並調節下游效應因子,也會活化 cAMP 依賴性路徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源G protein-coupled receptor activated by the neuropeptides vasoactive intestinal peptide (VIP) and pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide (ADCYAP1/PACAP). Binds VIP and both PACAP27 and PACAP38 bioactive peptides with the following order of ligand affinity VIP = PACAP27 > PACAP38. Ligand binding causes a conformation change that triggers signaling via guanine nucleotide-binding proteins (G proteins) and modulates the activity of downstream effectors. Activates cAMP-dependent pathway PMID 35477937 ↗ · PMID 36385145 ↗ · PMID 8179610 ↗ |
| 交互作用 | vasoactive intestinal peptide receptor 1 與 ADCYAP1/PACAP 互作,並可由 PACAP27 和 PACAP38 神經胜肽活化;它也與 VIP 互作,而 VIP 與受體的互作會導致 VIPR1 活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with ADCYAP1/PACAP; activated by both PACAP27 and PACAP38 neuropeptides. Interacts with VIP; the interaction results in VIPR1 activation PMID 36385145 ↗ |
| 細胞定位 | vasoactive intestinal peptide receptor 1 是位於細胞膜的多次穿膜蛋白質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTCTGCCAGGCTCCCGGCCATCGCCCGCCTGGTGCGCCG40CCCGCCAGCTCTTTGCCCGCGCGGGGCCGCCCGCCGCGGG80CTCAGGGCAGACCATGCGCCCGCCAAGTCCGCTGCCCGCC120CGCTGGCTATGCGTGCTGGCAGGCGCCCTCGCCTGGGCCC160TTGGGCCGGCGGGCGGCCAGGCGGCCAGGCTGCAGGAGGA200GTGTGACTATGTGCAGATGATCGAGGTGCAGCACAAGCAG240TGCCTGGAGGAGGCCCAGCTGGAGAATGAGACAATAGGCT280GCAGCAAGATGTGGGACAACCTCACCTGCTGGCCAGCCAC320CCCTCGGGGCCAGGTAGTTGTCTTGGCCTGTCCCCTCATC360TTCAAGCTCTTCTCCTCCATTCAAGGCCGCAATGTAAGCC400GCAGCTGCACCGACGAAGGCTGGACGCACCTGGAGCCTGG440CCCGTACCCCATTGCCTGTGGTTTGGATGACAAGGCAGCG480AGTTTGGATGAGCAGCAGACCATGTTCTACGGTTCTGTGA520AGACCGGCTACACCATTGGCTACGGCCTGTCCCTCGCCAC560CCTTCTGGTCGCCACAGCTATCCTGAGCCTGTTCAGGAAG600CTCCACTGCACGCGGAACTACATCCACATGCACCTCTTCA640TATCCTTCATCCTGAGGGCTGCCGCTGTCTTCATCAAAGA680CTTGGCCCTCTTCGACAGCGGGGAGTCGGACCAGTGCTCC720GAGGGCTCGGTGGGCTGTAAGGCAGCCATGGTCTTTTTCC760AATATTGTGTCATGGCTAACTTCTTCTGGCTGCTGGTGGA800GGGCCTCTACCTGTACACCCTGCTTGCCGTCTCCTTCTTC840TCTGAGCGGAAGTACTTCTGGGGGTACATACTCATCGGCT880GGGGGGTACCCAGCACATTCACCATGGTGTGGACCATCGC920CAGGATCCATTTTGAGGATTATGGGTGCTGGGACACCATC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。