基因總覽
vasoactive intestinal peptide(VIP)是由蛋白質編碼基因產生的神經胜肽,屬於 glucagon family。來源資料指出,VIP 可形成具有生物活性的形式,並能作用於 PACAP subfamily 的 class B1 G protein-coupled receptors;其蛋白質序列長 170 個胺基酸,N 端具有訊號序列。VIP 在中樞與周邊神經系統廣泛表現,並參與多種生理過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000367244 ★ | 152,750,797–152,759,760 | 7 |
| ENST00000367243 | 152,746,498–152,760,674 | 7 |
| ENST00000897583 | 152,746,498–152,760,674 | 7 |
| ENST00000897584 | 152,746,498–152,760,674 | 7 |
| ENST00000897585 | 152,746,498–152,759,633 | 6 |
| ENST00000897586 | 152,746,498–152,760,674 | 7 |
| ENST00001141112 | 152,746,498–152,760,674 | 7 |
| ENST00000897587 | 152,750,791–152,760,674 | 6 |
| ENST00000431366 | 152,754,211–152,759,765 | 5 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
VIP 透過活化 PACAP subfamily 的 class B1 G protein-coupled receptors 發揮多種生理作用,相關受體包括 VIP receptor 1(VPR1)與 VIP receptor 2(VPR2)。在中樞神經系統與周邊神經系統中,VIP 主要具有神經保護與免疫調節作用。
VIP 的作用也涉及心血管與平滑肌生理:它可促進血管舒張並降低動脈血壓,也能刺激心肌收縮。此外,VIP 會增加糖原分解,並使氣管、胃及膽囊的平滑肌放鬆。這些作用涵蓋神經、免疫、循環及消化相關生理過程。
資料亦指出,VIP 的生物活性形式可造成血管舒張。另有一種名為 PHM-27 的生物活性形式,可作為 calcitonin receptor(CALCR)的強效致效劑,其效能與 calcitonin 相近;此項受體作用是針對 PHM-27 所述,不能據此概括為所有 VIP 活性形式均具有相同作用。
Promoter 與基因調控
>VIP ENST00000367244 GRCh38 chr6:152749797-152750897 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGTGGCTGCATTTTTACCTTAAACTCTGATTGAATGTGTGCTAGACTACCTTTAGTTACAAATCCACAAA TAGAAGTGAAGTATTTATCAAAGTACTATATAAATGCTTTTCAACTATTTGAAGCCACCTGTCAAGTGAT TGAATCAGAAATGTTCAAAACTGGTTTGAGTATGTGTGTGTGTTGGGGATGAGGGTAGAAAACTAATTCT ACATTATGCAAAGACTTATAAAAGTGATGAGGAAAATCTTTAAAAAGAAAAGACAATTAAATTCCTTGAG GTATATAGCCTGACAACAATTTATTTTTTGGATCATTTGACACAGTGTATGTAAAAGTGCATTGGGAATT GTGCCATTTTATACAAATATGAAATAGCACTACTTGTACTGCTTTGTACAACAGCGTGCATATCTTACTA TCTTAGAGACTTTCTGAAACACTTATCTTGGAATTAGTTTCAACAAAGACGAAATGTAATAATAGGAAGG TGAAAATTATCTCTAGAGCTTTTAAAGTTAGGATAGATTTCAAGAAAGATTAAATCTGGAACTATATGAA TAGCATAAAAATTAAAAATATTAAGAGAATTGATACTTTGTAATAAAGTATAATTATACTTTTATAAGCG TAATGAACATAAGTGTTTGTTGCTTTATGCATTTGTTTCTACACATGAAGTCTTTATTTTCTGAAGGAAT CCCAATGGCCCTGGCTATAACACTACAATCATTTTCTTATTTTACAATTAATTAAAGGTTAAAACATTTC ACATTGAGCTTGCTACTTTGTTTGTTTAAAGAAAAGTAAATTTCCTCTTATCTTACATTTTGAAGTTGCT CACTATAAACTTATATAAATTAGGCATAATGACAATTAAGTAAGAACTTCAAGCCCTATTCATCCCATGG CCGTCATACTGTGACGTCTTTCAGAGCACTTTGTGATTGCTCAGTCCTAAGTATAAGCCCTATAAAATGA TGGGCTTTGAAATGCTGGTCAGGGTAGAGTGAGAAGCACCAGCAGGCAGTAACAGCCAACCCTTAGCCAT TGCTAAGGGCAGAGAACTGGTGGAGCCTTTCTCTTACTCCCAGGACTTCAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| VIP_2 ↗ | 6:152,746,544 | 正股 | 152,746,495–152,746,554 |
| VIP_1 ↗ | 6:152,750,797 | 正股 | 152,750,748–152,750,807 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_948LXF · enhancer · 152746166–152746563 · regulatory
ENSR6_86H8XF · enhancer · 152748946–152749118 · regulatory
ENSR6_53BX3JF · CTCF_binding_site · 152749020–152749041 · regulatory
ENSR6_7BZHXT · promoter · 152750707–152750808 · regulatory
ENSR6_86H8ZH · enhancer · 152750809–152751006 · regulatory
· motif · 152749022–152749038 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:170 aa
VIP 蛋白質長 170 個胺基酸,屬於 glucagon family。序列註解標示第 1 至 20 個胺基酸為訊號序列;來源未提供其他結構域或功能區域的註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
VIP 的定位註記為分泌。 來源未提供其他定位條件、異構型差異或細胞內轉位的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- DPP4P27487 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FAPQ12884 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTNNA3Q9UI47-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MGST1P10620 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VIPR1P32241 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | VIP 是神經胜肽,透過活化 PACAP subfamily 的 class B1 G protein-coupled receptors,包括 VPR1 與 VPR2,參與多種生理過程。它在中樞與周邊神經系統廣泛表現,主要具有神經保護及免疫調節作用;另可促進血管舒張、降低動脈血壓、刺激心肌收縮、增加糖原分解,並放鬆氣管、胃與膽囊的平滑肌。 | 含實驗來源 | 證據與來源VIP is a neuropeptide involved in a diverse array of physiological processes through activating the PACAP subfamily of class B1 G protein-coupled receptors: VIP receptor 1 (VPR1) and VIP receptor 2 (VPR2). Abundantly expressed throughout the CNS and peripheral nervous systems where they primarily exert neuroprotective and immune modulatory roles. Also causes vasodilation, lowers arterial blood pressure, stimulates myocardial contractility, increases glycogenolysis and relaxes the smooth muscle of trachea, stomach and gall bladder PMID 1318039 ↗ · PMID 15013843 ↗ · PMID 3456568 ↗ · PMID 36385145 ↗ · PMID 8933357 ↗ |
| 功能 | VIP 的生物活性形式可造成血管舒張。PHM-27 是 CALCR 的強效致效劑,其效能與 calcitonin 相近;此受體作用特指 PHM-27。 | 含實驗來源 | 證據與來源Bioactive forms that cause vasodilation. PHM-27 is a potent agonist of the calcitonin receptor CALCR, with similar efficacy as calcitonin PMID 15013843 ↗ · PMID 3654650 ↗ |
| 功能 | VIP 的生物活性形式可造成血管舒張;此作用見於相關生物活性形式,來源未進一步提供作用機制或條件。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGGGTAGAGTGAGAAGCACCAGCAGGCAGTAACAGCCAAC40CCTTAGCCATTGCTAAGGGCAGAGAACTGGTGGAGCCTTT80CTCTTACTCCCAGGACTTCAGCACCTAAGACAGCTCCAAA120ACAAACCAGAACAGTCAGCTCCGGGGGAGCACGACTGGGC160GAGAGGCACAGAAATGGACACCAGAAATAAGGCCCAGCTC200CTTGTGCTCCTGACTCTTCTCAGTGTGCTCTTCTCACAGA240CTTCGGCATGGCCTCTTTACAGGGCACCTTCTGCTCTCAG280GTTGGGTGACAGAATACCCTTTGAGGGAGCAAATGAACCT320GATCAAGTTTCATTAAAAGAAGACATTGACATGTTGCAAA360ATGCATTAGCTGAAAATGACACACCCTATTATGATGTATC400CAGAAATGCCAGGCATGCTGATGGAGTTTTCACCAGTGAC440TTCAGTAAACTCTTGGGTCAACTTTCTGCCAAAAAGTACC480TTGAGTCTCTTATGGGAAAACGTGTTAGCAGTAACATCTC520AGAAGACCCTGTACCAGTCAAACGTCACTCAGATGCAGTC560TTCACTGACAACTATACCCGCCTTAGAAAACAAATGGCTG600TAAAGAAATATTTGAACTCAATTCTGAATGGAAAGAGGAG640CAGTGAGGGAGAATCTCCCGACTTTCCAGAAGAGTTAGAA680AAATGATGAAAAAGACCTTTGGAGCAAAGCTGATGACAAC720TTCCCAGTGAATTCTTGAAGGAAAATGATACGCAACATAA760TTAAATTTTGAGTTCTACATAAGTAATTCAAGAAAACAAC800TTCAATATCCAAACCAAATAAAAATATTGTGTTGTGAATG840TTGTGATGTATTCTAGCTAATGTAATAACTGTGAAGTTTA880CATTGTAAATAGTATTTGAGAGTTCTAAATTTTGTCTTTA920ACTCATAAAAAGCCTGCAATTTCATATGCTGTATATCCTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。