基因總覽
VGF nerve growth factor inducible 是蛋白質編碼基因，其產物 Neurosecretory protein VGF 為可分泌的多功能前驅蛋白。它可經細胞類型特異性的加工產生不同胜肽；來源指出，前驅物會由 PCSK1 和 PCSK2 蛋白水解處理。VGF 及其加工產物與神經生成、神經可塑性和多項生理調節相關。不過，多數所述作用標註為相似性推定，解讀時應保留此證據限制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000249330 ★ | 101,162,509–101,165,569 | 2 |
| ENST00000445482 | 101,162,509–101,165,114 | 2 |
| ENST00000970416 | 101,162,509–101,167,245 | 2 |
| ENST00001141734 | 101,162,509–101,165,577 | 2 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
VGF 及其加工產生的胜肽被認為參與神經生成與神經可塑性，並與學習、記憶、憂鬱及慢性疼痛相關。這些作用多以相似性推定描述；來源未將它們限定為單一作用途徑，而是指出 VGF 可透過不同細胞受體影響多種生理功能，包括能量消耗、疼痛、壓力反應、胃部調節、葡萄糖恆定與脂解。
在體液恆定方面，VGF 透過調節加壓素釋放發揮作用。它可活化 GABAergic interneurons，進而抑制與加壓素神經元相連的突觸前 glutamatergic neurons。下視丘中的食慾調節也與 VGF 有關：來源描述其以 orexin 依賴方式刺激進食，並正向調節 orexin 神經元活化；後者與胃酸分泌增加及胃排空相關。這些敘述同樣屬相似性推定。
VGF 對代謝與免疫相關反應的影響涉及不同受體及細胞情境。它可透過結合時折疊的方式活化 G 蛋白偶聯受體 C3AR1，並促進脂肪細胞脂解。另在 macrophages 與 microglia 中，VGF 與 C1QBP 受體互作，伴隨細胞內鈣濃度上升及敏感性增加；來源未將此描述為已確立的普遍效應。
在記憶形成與憂鬱相關行為方面，VGF 可能藉由影響突觸可塑性及神經生成參與調節。來源也指出它可短暫誘發 NTRK2/TRKB 受體活化，接續促使 CREB 磷酸化。胰島瘤細胞中，VGF 會增加細胞內鈣動員並誘發胰島素分泌。另有一項來源記載其對 M.luteus 具殺菌活性、對 P. Pastoris 具抗真菌活性；此結果不應延伸解讀為其他微生物或情境中的作用。
Promoter 與基因調控
>VGF ENST00000249330 GRCh38 chr7:101165469-101166569 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCAAACCTTCCCTTTAAGCGGTGGAGAGAGCTGGAGTTGAGTCACCCCCCCCCCACCTGCGCAACCCCCT CCCCACCTGCTCTGGTCTCGCCCTCCAAACGTCCTTGGGGGAGGGGAGCGGCAGGAGGGAAAGCGACTGG GGGAGTGTGGGAAGAGATGGGCCGAAGGGGGCACAGCGGGGGGCCTTGACACAAGCGGCAGTCAGGGGAC AGAAGGACAGACACACCTTTTTCTCCAGACACAGCACGGATCGTGAAACAGACACGACCCAGAGGCACAC ACATCCTCATTCTTTCCCTTTTCTCTTCCGACTCGGACCCTTCCCGATGGGATTACCAAAACCGCAAGAT CCACCCATCTGCCCCTGTCAGGGGGCTGCCACCCGCACTGCCGATTCGCGGACAGCGCCCGCAGGCGTGC AGATCTGTCCCTCTGCACTCAGGTTCACGCCGTCCTTGGGCGCGTGGTCTCGGGGTGGGGAACCCGGCCC CCTGGTCGGCTCTTGAATCTTTATCCTTCCCCTCCCCAGTATTGAGCTCCCACTGGTGCCCAGTCAGACG CTGGGACTACCCTTTTTCTATTCCACTCAGCAACGCGGGCTCCATCCAGCAGCTCCAAGTTGCTCTGCAA CCCACCCTCCCGCCTTCCAGCGCCTCTGCATCCACCCTTCCATTCATTCTCCCATTCATTCATTCATCCT TTTCTCCTCGTCCCTCCTTCATTCATTCATAGCCCCCCGCCCTGCCCGCTTCAGCATTTCATTCATTCAT TCATTCATTCATTTCCCGGAGCTCCGCTAGCGCACACCCCTTCAGCCGAAGGCCCCAGCGCGCAGGCGCA GGCCGGGAGAGGCAGGCACCCTCCAATCGTCGGGCGTCCTTCCTCCTCCGGGCGGCCGCCCGCTTCCCCA TGAATGAACATTGACGTCAATGGGGCGGGGCGCGCCCACGTGACCCCGCGCGCTCCCCTTTATAAGGCGG TGGAGGCGCGGGCGCTGTCCAGCGTGCTGAAGCCGGAGCGAGCTAGCCGCCCGGAGCCGCGCCGACCCAG CTGAGCCCAGCCCACGGGACGCCAGACCTCGACCGTCGCTCCTACCCCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| VGF_1 ↗ | 7:101,165,569 | 負股 | 101,165,559–101,165,618 |
| VGF_3 ↗ | 7:101,167,228 | 負股 | 101,167,218–101,167,277 |
| VGF_4 ↗ | 7:101,167,444 | 負股 | 101,167,434–101,167,493 |
| VGF_2 ↗ | 7:101,169,952 | 負股 | 101,169,942–101,170,001 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_93H656 · enhancer · 101161048–101161347 · regulatory
ENSR7_BQ448 · promoter · 101165104–101166059 · regulatory
ENSR7_5TRGL8 · CTCF_binding_site · 101165369–101165390 · regulatory
ENSR7_5TRGP8 · CTCF_binding_site · 101166017–101166038 · regulatory
ENSR7_BQ44H · enhancer · 101167060–101167960 · regulatory
ENSR7_CD33C · enhancer · 101168154–101169941 · regulatory
ENSR7_5TRH7L · CTCF_binding_site · 101168904–101168925 · regulatory
ENSR7_BQ44W · promoter · 101169942–101170884 · regulatory
ENSR7_5TRHDG · CTCF_binding_site · 101169951–101169972 · regulatory
· motif · 101162685–101162696 · motif
· motif · 101162878–101162891 · motif
· motif · 101162958–101162971 · motif
· motif · 101162968–101162981 · motif
· motif · 101163012–101163021 · motif
· motif · 101163012–101163021 · motif
· motif · 101163012–101163021 · motif
· motif · 101163012–101163021 · motif
· motif · 101163066–101163079 · motif
· motif · 101163072–101163085 · motif
· motif · 101163190–101163199 · motif
· motif · 101163294–101163307 · motif
· motif · 101163300–101163313 · motif
· motif · 101163333–101163346 · motif
· motif · 101163339–101163352 · motif
· motif · 101163345–101163358 · motif
· motif · 101163358–101163371 · motif
· motif · 101163393–101163404 · motif
· motif · 101163399–101163410 · motif
· motif · 101163618–101163631 · motif
· motif · 101163687–101163700 · motif
· motif · 101163741–101163754 · motif
· motif · 101163900–101163916 · motif
· motif · 101163900–101163916 · motif
· motif · 101165371–101165387 · motif
· motif · 101165616–101165625 · motif
· motif · 101165616–101165625 · motif
· motif · 101165628–101165644 · motif
· motif · 101165730–101165741 · motif
· motif · 101165730–101165741 · motif
· motif · 101166019–101166035 · motif
· motif · 101167142–101167151 · motif
· motif · 101167142–101167151 · motif
· motif · 101168906–101168922 · motif
· motif · 101169883–101169896 · motif
· motif · 101169953–101169966 · motif
· motif · 101169953–101169969 · motif
· motif · 101170008–101170021 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：615 aa
Neurosecretory protein VGF 長 615 個胺基酸，具有位於第 1–22 位的訊號序列。序列註解指出三段無序區域：第 22–201 位、第 218–257 位，以及第 342–600 位。此蛋白質可由 PCSK1、PCSK2 加工，但來源未在此特徵資料中提供各加工產物的序列範圍。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Neurosecretory protein VGF 儲存於分泌囊泡，之後可被分泌。 下視丘儲存顆粒中的 NERP peptides 與加壓素共定位；此描述指向特定胜肽及儲存位置，不應直接視為所有 VGF 相關產物均具有相同定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
VGF 與細胞膜上的 HSPA8 有互作記錄；另有相似性推定指出它與 C3AR1 及 C1QBP 互作。來源未說明這些互作構成同一複合體，因此不宜合併為單一蛋白質複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 8 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | VGF 是可分泌的多聚蛋白前驅物，會依細胞類型由 prohormone convertases PCSK1 和 PCSK2 包裝並進行蛋白水解加工；此加工描述屬相似性推定。VGF 及其加工胜肽被認為參與神經生成與神經可塑性，並與學習、記憶、憂鬱及慢性疼痛相關。 | 推論支持 | 證據與來源Secreted polyprotein that is packaged and proteolytically processed by prohormone convertases PCSK1 and PCSK2 in a cell-type-specific manner (By similarity). VGF and peptides derived from its processing play many roles in neurogenesis and neuroplasticity associated with learning, memory, depression and chronic pain (By similarity) |
| 功能 | VGF 透過調節加壓素釋放，參與體液恆定的控制；它也會抑制與加壓素神經元相連的突觸前 glutamatergic neurons。 | 推論支持 | 證據與來源Plays a role in the control of body fluid homeostasis by regulating vasopressin release. Suppresses presynaptic glutamatergic neurons connected to vasopressin neurons |
| 功能 | VGF 透過調節加壓素釋放參與體液恆定；相似性推定指出，它活化抑制性神經元 GABAergic interneurons，從而抑制突觸前 glutamatergic neurons。它也以 orexin 依賴方式刺激下視丘的進食行為，並正向調節 orexin 神經元活化，與胃酸分泌增加及胃排空相關。 | 推論支持 | 證據與來源Plays a role in the control of body fluid homeostasis by regulating vasopressin release. Activates GABAergic interneurons which are inhibitory neurons of the nervous system and thereby suppresses presynaptic glutamatergic neurons (By similarity). Also stimulates feeding behavior in an orexin-dependent manner in the hypothalamus (By similarity). Functions as a positive regulator for the activation of orexin neurons resulting in elevated gastric acid secretion and gastric emptying (By similarity) |
| 功能 | VGF 是可分泌的多功能神經胜肽，可結合不同細胞受體，與能量消耗、疼痛、壓力反應、胃部調節、葡萄糖恆定及脂解相關。相似性推定指出，VGF 以結合時折疊的方式活化 G 蛋白偶聯受體 C3AR1，促進脂肪細胞脂解；在 macrophages 與 microglia 中與 C1QBP 受體互作，則伴隨細胞內鈣升高及敏感性增加。 | 推論支持 | 證據與來源Secreted multifunctional neuropeptide that binds to different cell receptors and thereby plays multiple physiological roles including modulation of energy expenditure, pain, response to stress, gastric regulation, glucose homeostasis as well as lipolysis (By similarity). Activates the G-protein-coupled receptor C3AR1 via a folding-upon-binding mechanism leading to enhanced lipolysis in adipocytes (By similarity). Interacts with C1QBP receptor in macrophages and microglia causing increased levels of intracellular calcium and hypersensitivity (By similarity) |
| 功能 | VGF 可能藉由影響突觸可塑性與神經生成，參與記憶形成及憂鬱相關行為的調節。相似性推定指出，它會短暫誘發 NTRK2/TRKB 受體活化，接續促使 CREB 磷酸化；在胰島瘤細胞中，VGF 也會透過增加細胞內鈣動員誘發胰島素分泌。 | 推論支持 | 證據與來源Plays a role in the regulation of memory formation and depression-related behaviors potentially by influencing synaptic plasticity and neurogenesis. Induces acute and transient activation of the NTRK2/TRKB receptor and subsequent CREB phosphorylation (By similarity). Also induces insulin secretion in insulinoma cells by increasing intracellular calcium mobilization (By similarity) |
| 功能 | 來源記載 VGF 對 M.luteus 具有殺菌活性，並對 P. Pastoris 具有抗真菌活性；此描述僅限於列出的微生物。 | 含實驗來源 | 證據與來源Has bactericidal activity against M.luteus, and antifungal activity against P. Pastoris PMID 23250050 ↗ |
| 交互作用 | VGF 與細胞膜上的 HSPA8 有互作記錄；與 C3AR1 及 C1QBP 的互作則標示為相似性推定。來源未說明這些互作形成複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with HSPA8 on cell membrane. Interacts with C3AR1 (By similarity). Interacts with C1QBP (By similarity) PMID 28934328 ↗ |
| 細胞定位 | Neurosecretory protein VGF 儲存於分泌囊泡，之後被分泌。下視丘儲存顆粒中的 NERP peptides 與加壓素共定位；此共定位描述限於所述胜肽與儲存顆粒情境。 | 含實驗來源 | 證據與來源Neurosecretory protein VGF; Secreted; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle; Stored in secretory vesicles and then secreted, NERP peptides colocalize with vasopressin in the storage granules of hypothalamus PMID 19194657 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGCGTGCTGAAGCCGGAGCGAGCTAGCCGCCCGGAGCCGC40GCCGACCCAGCTGAGCCCAGCCCACGGGACGCCAGACCTC80GACCGTCGCTCCTACCCCGGCCACCGCTCGGAGCCGAGGC120GGACGCGTCCCGATCTTCCCCTGTCCCCACCCTGCCCCGA160CCCTCCTCTCCACCTCTCGCGTCGTGACACCAGCTGTCTC200CGGCAGCCTCTTGGTCATGAAAGCCCTCAGATTGTCGGCT240TCCGCCCTCTTCTGCCTTCTGCTGATCAACGGGTTAGGGG280CAGCACCCCCTGGTCGCCCTGAGGCGCAGCCTCCTCCTCT320CAGCTCTGAGCATAAAGAGCCGGTAGCCGGGGACGCAGTG360CCCGGGCCAAAGGATGGCAGCGCCCCAGAGGTCCGAGGCG400CTCGGAATTCCGAGCCGCAGGACGAGGGAGAGCTTTTCCA440GGGCGTGGATCCCCGGGCGCTGGCCGCGGTGCTGCTGCAG480GCACTCGACCGTCCCGCCTCACCCCCGGCACCAAGCGGCT520CCCAGCAGGGGCCGGAGGAAGAAGCAGCTGAAGCTCTGCT560GACCGAGACCGTGCGCAGCCAGACCCACAGCCTCCCGGCG600CCGGAGAGCCCGGAGCCCGCGGCTCCGCCTCGCCCTCAGA640CTCCGGAGAATGGGCCCGAGGCGAGCGATCCCTCCGAGGA680GCTCGAGGCGCTAGCGTCCCTGCTCCAGGAACTGCGAGAT720TTCAGTCCAAGTAGCGCCAAGCGCCAGCAGGAGACGGCGG760CAGCAGAGACGGAAACCCGCACGCACACGCTGACCCGAGT800GAATCTGGAGAGCCCGGGGCCAGAGCGCGTATGGCGCGCT840TCCTGGGGAGAGTTCCAGGCGCGTGTCCCGGAGCGCGCGC880CCCTGCCGCCCCCGGCCCCCTCTCAATTCCAGGCGCGTAT920GCCCGACAGCGGGCCCCTTCCCGAAACCCACAAGTTCGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。