基因總覽
VENTXP7 的正式名稱為 VENT homeobox pseudogene 7，分類為假基因，並屬於 Vent homeobox 基因家族。來源將其歸入此家族，但沒有提供 VENTXP7 產生 RNA 或蛋白質的資料，也未描述其序列或結構特徵。因此，這些資料可確認其家族歸屬與假基因分類，不能據此判定它具有功能性蛋白質產物。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000475503 ★ | 21,405,737–21,406,508 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
Homeobox 基因編碼可與 DNA 結合的蛋白質；這類基因中的許多成員被認為可能參與胚胎早期發育。這是對 Homeobox 基因家族的概括性描述，並非對 VENTXP7 本身的功能證明。
Homeobox 蛋白質所含的 DNA 結合區域稱為 homeodomain，長度為 60 至 63 個胺基酸。VENTXP7 被列為 Vent homeobox 基因家族的假基因，但現有資料未說明它是否產生蛋白質，也未提供其直接參與胚胎發育或其他生物過程的證據。
Promoter 與基因調控
>VENTXP7 ENST00000475503 GRCh38 chr3:21404737-21405837 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTACAAAGGCACCAAGAACATACACTGGAGAAAGGACGACCTCTTCAAAAAATAGTGCTGGGAAAATTGG ATGTCCGTATTCAGAAAAATGAAACTGGACTTCTTTCTCTCCTCATCTATAAAAATCAACTCAAGATGGA TTAAACACTTAAATGTAAGACCTAAACTTATAAAACTACTAGAAGAAAACACAGAGAAAACAATTCAGAA TATTAGTCTAGGCCAAGATTTTGTGGCTAAGACCTCAAAAGCACAAACAACTAAAACAAAAATAGGCTAA CCAGACTATATTAAACTAAAAACCTTCTGCACAGTAAAAGAAACAGAGTGAAGAGACAACCAGTTGACAG TTGAATGGGAGAAAATGTTTGCAAATCATTCATCTGAAAAGGAATTAATCAGAATATACAAAGAACTCAA ACAACTAAACAATTAAAAAAAAGAAAAATTCCATTAAACAGTGAGCAGAATGGGGCCAGGCAAGGTGGCT CACATTTTTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGAATCACTTGAGGTCAGCAGTTCAAGACCA GCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATAAGCCTGGCTTGGTGGCACACAC CTGTAATCCCAGTTACGTGGGAGACTGAGGCACGAAAATCACTTGAATCAGGGATTCAGAGGTTGTAATG AGCCGAGATCCTGCTACTGCACTCCAGCCTGTGTGACAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA AGTGGGAAAGAACATGAAAAGACAGTTCTCAAAAGAATACATACAAATGGCCAACAAGTATACGAAAAAA TTATCAGCATCATTATTTATCAGGAAAATGCAAATCAAAACTAAAGATTACATATCATCTTATCCTAGTT AAAATGGCTATTATTAAAAAGACAAAAAGCAAGCTGGATCCTGCGCCTGGCCAGCCCCGCCCGACCTTCC CTCCGGCCCACCTGACCGCCATGTGTCTCTCCTCCTCCCCACCTCGTGGCTGGCAGCAGCCCTCCAGCTT TGGCTCCGTGGACTGGCTCTGCCTGAGCAGCTGCTCAGGGTCGACCCACAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
基因座與轉錄註解
VENTXP7 依 HGNC／Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000475503 ★ | processed_pseudogene | 772 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Homeobox 基因編碼可與 DNA 結合的蛋白質，其中許多被認為可能參與胚胎早期發育。這類蛋白質含有稱為 homeodomain 的 DNA 結合區域，長度為 60 至 63 個胺基酸。VENTXP7 是 Vent homeobox 基因家族的假基因；此描述未證明該假基因具有蛋白質產物或直接參與上述過程。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Homeobox genes encode DNA-binding proteins, many of which are thought to be involved in early embryonic development. Homeobox genes encode a DNA-binding domain of 60 to 63 amino acids referred to as the homeodomain. This pseudogene is a member of the Vent homeobox gene family. |
DNA 與 RNA 序列
ATGTGTCTCTCCTCCTCCCCACCTCGTGGCTGGCAGCAGC40CCTCCAGCTTTGGCTCCGTGGACTGGCTCTGCCTGAGCAG80CTGCTCAGGGTCGACCCACACCCCCAGGCCTGCCGACGTC120TCCCCCGGGAGCCTCCCTGGCCCGGGCCAGACGTTCGGCA160CCCGGGAGCCCCCTCAGGCTGTCAGTACCAAGGAGGCTAG200CTCGTCAAATCTGCATGCGCCGGAGAGGACTGTGGCTGGG240TTGAGTAAGGAGCCAAACCCCTAGCTGGCTCCCGGTGTCC280GCACAGCCTTCACCACGGAGCAGGTCCGTGCCTTGGAGGG320CGTCTTCCGGCACCACCAGTACCTGGGCCCTCTGGAGCGG360AATTGGCTGGCCAGGGAGATGCAGCTCTCAGAGGTCCAGA400TAAAAACCTGGTTTCAAAATCGCCGGATGAAACACAAACG440GCAAATGCAGGACTCCCAGCTAAACGGCCCCTTATCGGGG480TCTCTCCACGGGCCCCCTGCTTTCCACTCACCATCTTCTG520GCCTTGCCAATGGCCTGCAGCTGCTGTGCCCTTGGGCACC560CCTGCCTGGGTCCCCTGGCTGCCCCTTGGCTCCTTCTGGG600GTCTCCGACAAATGGATCAAGAGGCCCTGGCCTCTTCGTG640GGCTTCCTGCTGCGGGCAGCCTCTGGCATACCACCCCCCA680CGCCCAGGAAGTGGTGCGCATAAGCTGGGACCAGCCCTGT720CCACGGGGCCCCGGGGCCTGTGTGCTCTGCCAGAGACAGG760GGATGCATTTGA772cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。