基因總覽
VEGFB 是蛋白質編碼基因，其產物 vascular endothelial growth factor B 屬於 PDGF/VEGF 生長因子家族。來源將其描述為內皮細胞的生長因子，並指出 VEGF-B167 與 VEGF-B186 在分子結合特性上有所不同。蛋白質長度為 207 個胺基酸，序列註解包含位於第 1 至 21 位的訊號區，以及第 122 至 207 位的無序區；這些特徵提供其基本的蛋白質與序列概況。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000309422 ★ | 64,234,584–64,239,264 | 7 |
| ENST00000426086 | 64,234,521–64,239,264 | 7 |
| ENST00000868565 | 64,234,521–64,238,791 | 6 |
| ENST00000970131 | 64,234,521–64,238,793 | 7 |
| ENST00000970132 | 64,234,521–64,238,787 | 7 |
| ENST00000970133 | 64,234,521–64,238,785 | 8 |
| ENST00001042197 | 64,234,521–64,238,787 | 7 |
| ENST00001042200 | 64,234,521–64,238,786 | 7 |
| ENST00001042201 | 64,234,521–64,238,793 | 6 |
| ENST00001042202 | 64,234,521–64,238,789 | 7 |
| ENST00001071019 | 64,234,521–64,238,791 | 7 |
| ENST00001127272 | 64,234,521–64,238,786 | 6 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
VEGF-B 是作用於內皮細胞的生長因子。來源指出，其異構型 VEGF-B167 能結合 heparin 與 neuropilin-1，顯示不同分子形式具有特定的結合特性。
另一異構型 VEGF-B186 與 neuropilin-1 的結合受蛋白水解調控。這表示該結合關係會隨蛋白水解作用而受到調節；來源未進一步說明調節的方向或其對內皮細胞生長的具體影響。
Promoter 與基因調控
>VEGFB ENST00000309422 GRCh38 chr11:64233584-64234684 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACTGCTAGCAGCCTGCCTAGTTCAGTGATGGAGTTAGACGCATACCCTTTCTAGTCTTCTGGGAGGAGCA CCCCCATGTCCACAGCTGCTGTCACACCTCAAAGTGACCAGGGACTTCGGATGCCATTGGACCCTAGACA AGCCAGGGCCACTCTGAGCCCTCCCTATCTATCACAGGAAGGGTTAGACTGAGGTTCCTAACCCTGTGTA AGGGTAAAAAGCTGTGAGGCCCCTAGAGTGGGGTGGAAGGGGGCAGGACTTCAGGGACAGCAGGAATTGG ATTCCCAGGGTTAATTGTGACCCATTGCAGGAAGGTGAAGCAGATGCACCTTAACTTCATGGATGAAAAG GATCGGATCATCACAGCCTTCTACAACGAAGCCCGGGCACGGGCCAGGTCTGTCCCTGCTCTATTCTGCT CCCTGCTCCCTGTCCAGGAACCACACTTCGGGATCCCTATCCCAACCACCCAGGTGCCCTCTCCTCCAGG GCCAACAGAGGCATCCTTCAGCAGGAGCGACAACGGCTAGGGCAGCGGCAGCCGCCACCATCCGAGCCAA CCCAAGGCCCCGAGATCGTGCCCCGGGGCGCCGGCCCCTGAGGGGCTCACCTGGATGGGGCCTGCAGTGC GTTCCCGCTTTGCTTCCTTCCCTGGACGGCCCGCTCCCCGAAACGCGCGCAATAAAGTGATTCGCAGAGC TCGTGTCCGGCTCCCTCCTTAAGGCCCGACGCCCCCGGCCCCGGCCTCGCCAAGGGGCAGCGCCCCGCCC TCCGGGTAGTGGCGGCGGCGACTGGGGAGCCCAGCCTCCTGGGCGGTGCGTCCCCTTTCCCCTGCCGCGG CGGGAGGCGGGAGGGGGTGTGTGGAGGAGGCGGGCCCCGCCGACGGCCTCGCCCCCCCACCCCGCCGCCC CGCCCCCGCCCCACGGGCCGGTGGGGAGCGCGTGTCTGGGTCACATGAGCCGCCTGCCCGCCAGCCCGGG CCCAGCCCCCCGCCGCCCCCGCCGTCCCCGCCGCCGCTGCCCGCCGCCACCGGCCGCCCGCCCGCCCGGC TCCTCCGGCCGCCTCCGCTGCGCTGCGCTGCGCTGCCTGCACCCAGGGCTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| VEGFB_1 ↗ | 11:64,234,584 | 正股 | 64,234,535–64,234,594 |
| VEGFB_2 ↗ | 11:64,234,828 | 正股 | 64,234,779–64,234,838 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_BGQ6K · promoter · 64229788–64230768 · regulatory
ENSR11_83TZQP · promoter · 64234366–64234594 · regulatory
ENSR11_5K4X7K · CTCF_binding_site · 64234845–64234866 · regulatory
ENSR11_5K4XNX · CTCF_binding_site · 64237728–64237749 · regulatory
ENSR11_9XHFP · enhancer · 64238876–64239384 · regulatory
· motif · 64230281–64230296 · motif
· motif · 64230315–64230324 · motif
· motif · 64230391–64230401 · motif
· motif · 64230469–64230479 · motif
· motif · 64230495–64230505 · motif
· motif · 64230526–64230536 · motif
· motif · 64230705–64230715 · motif
· motif · 64230755–64230765 · motif
· motif · 64231000–64231017 · motif
· motif · 64231009–64231017 · motif
· motif · 64233671–64233683 · motif
· motif · 64233673–64233695 · motif
· motif · 64233673–64233695 · motif
· motif · 64234311–64234324 · motif
· motif · 64234431–64234444 · motif
· motif · 64234471–64234484 · motif
· motif · 64234492–64234505 · motif
· motif · 64234575–64234588 · motif
· motif · 64234590–64234603 · motif
· motif · 64234641–64234654 · motif
· motif · 64234718–64234731 · motif
· motif · 64234847–64234863 · motif
· motif · 64234946–64234957 · motif
· motif · 64234946–64234957 · motif
· motif · 64234948–64234957 · motif
· motif · 64235038–64235051 · motif
· motif · 64235038–64235051 · motif
· motif · 64235108–64235121 · motif
· motif · 64235385–64235398 · motif
· motif · 64237730–64237746 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：207 aa
vascular endothelial growth factor B 長 207 個胺基酸，屬於 PDGF/VEGF 生長因子家族。序列註解標示第 1 至 21 位為訊號區，第 122 至 207 位為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
VEGF-B 會分泌至細胞外，但在未經 heparin 釋放前，仍可與細胞或細胞外基質保持關聯。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- KLHL12Q53G59 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
VEGF-B 可形成由雙硫鍵連結的同源二聚體，也可與 VEGF 形成異源二聚體。來源指出的是二聚體形成及其連結方式，未提供其他互作細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | VEGF-B 是作用於內皮細胞的生長因子。異構型 VEGF-B167 可結合 heparin 與 neuropilin-1；VEGF-B186 與 neuropilin-1 的結合則受蛋白水解調控。來源未說明這項調控的方向或具體後果。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Growth factor for endothelial cells. VEGF-B167 binds heparin and neuropilin-1 whereas the binding to neuropilin-1 of VEGF-B186 is regulated by proteolysis |
| 交互作用 | VEGF-B 可形成同源二聚體，兩個單體之間以雙硫鍵連結；此外，也能與 VEGF 形成異源二聚體。來源未提供異源二聚體的連結方式或其功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | VEGF-B 會分泌至細胞外，但分泌後仍可與細胞或細胞外基質保持關聯；heparin 可使其脫離這些關聯。來源未指出釋放發生的細胞類型或條件。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Secreted; Secreted but remains associated to cells or to the extracellular matrix unless released by heparin |
核酸與蛋白質序列
GCCGTCCCCGCCGCCGCTGCCCGCCGCCACCGGCCGCCCG40CCCGCCCGGCTCCTCCGGCCGCCTCCGCTGCGCTGCGCTG80CGCTGCCTGCACCCAGGGCTCGGGAGGGGGCCGCGGAGGA120GTCGCCCCCCGCGCCCGGCCCCCGCCCGCCGCGCCCGGGC160CCGCGCCATGGGGCTCTGGCTGTCGCCGCCCCCCGCGCCG200CCGGGCTAGGGCGATGCGGGCGCCCCCGGCGGGCGGCCCC240GGCGGGCACCATGAGCCCTCTGCTCCGCCGCCTGCTGCTC280GCCGCACTCCTGCAGCTGGCCCCCGCCCAGGCCCCTGTCT320CCCAGCCTGATGCCCCTGGCCACCAGAGGAAAGTGGTGTC360ATGGATAGATGTGTATACTCGCGCTACCTGCCAGCCCCGG400GAGGTGGTGGTGCCCTTGACTGTGGAGCTCATGGGCACCG440TGGCCAAACAGCTGGTGCCCAGCTGCGTGACTGTGCAGCG480CTGTGGTGGCTGCTGCCCTGACGATGGCCTGGAGTGTGTG520CCCACTGGGCAGCACCAAGTCCGGATGCAGATCCTCATGA560TCCGGTACCCGAGCAGTCAGCTGGGGGAGATGTCCCTGGA600AGAACACAGCCAGTGTGAATGCAGACCTAAAAAAAAGGAC640AGTGCTGTGAAGCCAGACAGGGCTGCCACTCCCCACCACC680GTCCCCAGCCCCGTTCTGTTCCGGGCTGGGACTCTGCCCC720CGGAGCACCCTCCCCAGCTGACATCACCCATCCCACTCCA760GCCCCAGGCCCCTCTGCCCACGCTGCACCCAGCACCACCA800GCGCCCTGACCCCCGGACCTGCCGCTGCCGCTGCCGACGC840CGCAGCTTCCTCCGTTGCCAAGGGCGGGGCTTAGAGCTCA880ACCCAGACACCTGCAGGTGCCGGAAGCTGCGAAGGTGACA920CATGGCTTTTCAGACTCAGCAGGGTGACTTGCCTCAGAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。