基因總覽
VCY(variable charge Y-linked)是位於 Y 染色體的蛋白質編碼基因,屬於 VCX/VCY family。現有資料指出,其蛋白質產物可能與精子發生或性別比例偏移相關,但尚未確定具體作用。蛋白質序列長 125 個胺基酸;所提供的序列註解將全長區域標示為無序區。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000250825 ★ | 13,985,772–13,986,473 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料對 VCY 的生物學功能提出兩種可能性:其產物可能介導精子發生中的某個過程,也可能在性別比例偏移中發揮作用。這些描述均屬可能性,資料未指出其介導的具體過程、作用方式或性別比例偏移的方向,也未說明兩者是否相關。因此,目前不能據此確定 VCY 在上述生物學現象中的確切角色。
Promoter 與基因調控
>VCY ENST00000250825 GRCh38 chrY:13986373-13987473 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCCAAACCATAGCGTGCCTTTTCATTGTGTTGATTGTTGGCTGTGCAGAAACTTTTAGTTTCCAGGATGC TCACTTGCCCTATACATTTCAGCTGCCTAGACCCCCACATTGTGTGAATGTGTGAGCCAATTGTTTAGAA TAAACTGTATCTCATATATAATATTATTCATAAATAAATACTACATGGTAGTAAATACATATTTATGATA TATAATATTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGTATCCTGTTTG GTTTAGTTTCTCCTTCTCTGAGGAACCCAGCCCGATACAGATACCCAGCTGAGCTAGTGTGTTTGCTAAT CTTGACCTCTGGAAGCCAGTGCTTTAAACCATGAGAATGAAAAATTGTGAGGCACTATGTGGATGCTGGG AGAAGCATGTGAGATGGAAAAGTTGTTCCATGGCAGCCAAGAAGTGAATGATCCTCAAGGTGTAGCAGAG GAATTTGTAGGAGAGAGGGATGACTGACGTCTTCGTACAGCCCTCCATCCATCCCAGTTAGCATGGAGGG ATTTTAGGTAGGACATACAGAAACTGGGTAATGATGGTAGTTGTGGAGGAACAGAATGTACCACTGAATG GGGGTTCCGGGGGAAACATGTGGGGGAAATATCCTCCCTTGCCACATGATCTGCCAAAACTGAACATGGG GAGTTTAGGAGGGGCGACATGTCAGTTTGGGAACTATCTTTAGGGGTGCTAACCCAAATCTCCCTTTCTC CAACTAGAGCACCCTGCCTTCCTCATTAGATGTCACCGCCCCCCCCCCCCGCCCCCGACTTCATCCGCCA TGTCCTGATGGTGCTTTATGACGTATAAGGCCTTCCTTCCCACCCAGGGCTACCATTGGCTGGGTAGTGG AGTGTTGACCAATCACAGCTCAGGGGCGTGATCGTCTCGTCCTGGGATCGCGAGAGGGGTATACACAGGG AGGCCAGGCAGCCTGGAGTTAGTCGACCGTTGCGAGACGTTGAGCTGCGGCAGATGAGTCCAAAGCCGAG AGCCTCGGGACCTCCGGCCAAGGCCAAGGAGACAGGAAAGAGGAAGTCCTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:125 aa
VCY 蛋白長 125 個胺基酸,屬於 VCX/VCY family。序列註解將第 1 至第 125 位標示為無序區,涵蓋全長蛋白。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SH3GL3Q8IVP1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | VCY 可能介導精子發生中的某個過程,也可能在性別比例偏移中發揮作用;資料未進一步指出具體過程或作用方式,兩種可能性的確切關係亦未說明。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGTCGACCGTTGCGAGACGTTGAGCTGCGGCAGATGAGTC40CAAAGCCGAGAGCCTCGGGACCTCCGGCCAAGGCCAAGGA80GACAGGAAAGAGGAAGTCCTCCTCTCAGCCGAGCCCCAGT120GGCCCGAAGAAGAAGACTACCAAGGTGGCCGAGAAGGGAG160AAGCAGTTCGTGGAGGGAGACGCGGGAAGAAAGGGGCTGC200GACAAAGATGGCGGCCGTGACGGCACCTGAGGCGGAGAGC240GGGCCAGCGGCACCCGGCCCCAGCGACCAGCCCAGCCAGG280AGCTCCCTCAGCACGAGCTGCCGCCGGAGGAGCCAGTGAG320CGAGGGGACCCAGCACGACCCCCTGAGTCAGGAGAGCGAG360CTGGAGGAACCACTGAGTAAGGGGCGCCCATCTACTCCCC400TATCTCCCTGAGCAGCAACTAAGTTTAGGCCCAGCTGCCA440GACCTCAGAGATCTCACCAGCAGGGTGCTTCCCATGTTGA480TGACAATAAAATGAATGTGTTGCAAACCGA510cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。