基因總覽
VBP1 的正式名稱為 VHL binding protein 1，屬於蛋白質編碼基因，其產物屬於 prefoldin subunit alpha 家族。它的基本角色與蛋白質折疊相關，也能與 VHL 結合。現有資料未提供其胺基酸長度、結構域或其他序列特徵，因此不據此補述更細部的分子結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000286428 ★ | 155,216,460–155,239,841 | 6 |
| ENST00000535916 | 155,197,007–155,239,044 | 7 |
| ENST00000625964 | 155,208,904–155,239,810 | 6 |
| ENST00000926244 | 155,216,440–155,239,839 | 6 |
| ENST00000971683 | 155,216,445–155,239,814 | 6 |
| ENST00000910826 | 155,216,448–155,239,814 | 3 |
| ENST00001101066 | 155,216,455–155,239,829 | 6 |
| ENST00001101067 | 155,216,455–155,239,817 | 6 |
| ENST00000926245 | 155,216,464–155,239,817 | 6 |
| ENST00000926246 | 155,216,474–155,238,913 | 7 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
VBP1 參與新生多胜肽鏈的折疊。它能結合尚未完成合成的新生多胜肽鏈，並促進其折疊；這項作用發生於非天然構形蛋白質面臨多種競爭性處理途徑的環境中。來源描述的是促進折疊，並未指出 VBP1 對所有目標蛋白質的作用結果，也未提供其折疊效率或特定底物範圍。
VBP1 也會特異性結合細胞質伴護蛋白複合體 c-CPN，並將目標蛋白質轉交給該複合體。這表示 VBP1 不僅與新生鏈結合，也可將目標蛋白質導向另一折疊相關因子；來源未進一步說明轉交的分子步驟，或這兩項作用是否適用於同一批蛋白質。
在非天然構形蛋白質有多種競爭性去向的情境下，VBP1 對新生鏈的結合與促進折疊，以及對 c-CPN 的特異性結合和蛋白質轉交，構成來源所述的主要功能。資料未提供這些活動對特定細胞過程或生理結果的影響，因此其功能意義可限於蛋白質折疊及目標蛋白質轉交，不延伸推論其他機制。
Promoter 與基因調控
>VBP1 ENST00000286428 GRCh38 chrX:155215460-155216560 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGAGCTGTACAGGTTCACTGAGCTTTAGTTTCCTCATTCACAATATGACGATACCAATTTCTTCCTCAT ATTATATCTAAAGACATATCTATGTCTATATGCTTGATCGTACATTATGTGCGGAGATAAACCGGTAACA GTGATTGCCTCTGAGAAGAGAGACTTACTTTCCATTGCGTAATTCTTAGGCTCATGGTAGAATTTGTGCA AGTGGATGAAGCACTGCCTCACTGGGAAACACTCCAGTGAAATAAAGCACAGAAAAGAGCCCGAAGAATA ATTACTTGGTTCTGTATGACACATGTGCTTTTAAAGGGTTGTAGTGTAGGATGACATTGGGTAAGTCCAT GGGCCTAGAAGCCTAGGTGGAGTTCTTAGGATTTTGTATGTAGACTATGAAGTTTTGGAAACGTTTGAGC TGGAGAGAAGACATTCTGATCAAAGGTGGCTTTCAGGAAAGGCTGGTGCGACAGGCAGGGTATTTATTAG AATGAGGCCAGTGACCACTCTGAAACAGACACAAAGTAAGTTCCCTTCAAGGGGCAGGAAGCTCCCTGGG ATGGTGAGACCAGAAAGGCACAGAGGCTGAACCCTCGTGATGGCGCTAGGTCCCAGGTTCGCTAGCATCC GAGAGAGGGGATTGGGTCGCTCCAGAGGCCATTGCGAAGGCTGCTGCCAGTTCTAGGGTCGGGGTGGGGT CAGGCTAGGTCCCTATTCCTAGGGCTTTAGCACCGCTCACTCACAAGACCCCTTTTCCCAGGAGGACGTA TGGGTTTTTCCTGTCGCTCCAGCTTCTCTTTCGCGGCCCTTCCACGCTTGTCACTTACCTGAGCGCAGCC AATCAGCACCTAGAGGTTGGGCTACTTTCGGCCAAAGGAGAACGGGGACTTGTGGGGGACGCTCCCTGCG CACCAATGAATGTGCATGGAGATGGAGAGGCGGGCCTGCAAGTGCGAACAAGCCAATCACGGAATCCCGG CGGCCGGCGGCCCGGGAGGCAGTCGCGCGCTCGCATCCCCAAGATGGCGGCCGTTAAGGACAGTTGTGGC AAAGGAGAAATGGCCACAGGGAATGGGCGGCGGCTCCACCTGGGGATTCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| VBP1_1 ↗ | X:155,216,460 | 正股 | 155,216,411–155,216,470 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_949LF4 · promoter · 155215970–155216470 · regulatory
ENSRX_53CHPMR · CTCF_binding_site · 155216680–155216701 · regulatory
· motif · 155213079–155213092 · motif
· motif · 155213079–155213092 · motif
· motif · 155213152–155213165 · motif
· motif · 155213152–155213165 · motif
· motif · 155215633–155215642 · motif
· motif · 155215633–155215642 · motif
· motif · 155216213–155216226 · motif
· motif · 155216213–155216226 · motif
· motif · 155216481–155216491 · motif
· motif · 155216562–155216579 · motif
· motif · 155216682–155216698 · motif
· motif · 155219318–155219324 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：197 aa
VBP1 屬於 prefoldin subunit alpha 家族。現有蛋白質註解未提供其結構域、功能區域或序列特徵，因此無法據此描述更具體的蛋白質構造。
蛋白質三維結構
細胞內定位
與 VHL 形成複合體時，VBP1 可轉移至細胞核；此定位變化與 VHL 複合體狀態相關。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 36 個夥伴
- AIRIMQ9NX04 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BECN1Q14457 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFHC1Q5JVL4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ENKD1Q9H0I2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FGF1P05230 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABPB1Q06547-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GLIS2Q9BZE0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPANK1O95872 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IKZF3Q9UKT9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- L3MBTL3Q96JM7-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO1P25800 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO2P25791-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO3Q8TAP4-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MISPQ8IVT2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYOZ1Q9NP98 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PFDN2Q9UHV9 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- PFDN4Q9NQP4 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- PFDN5Q99471 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- PNMA1Q8ND90 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKAB2O43741 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SULT1B1O43704 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SUOXP51687 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCEANCQ8N8B7-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
VBP1 可與兩個 PFD-alpha 類及四個 PFD-beta 類次單元組成異源六聚體，並結合 VHL 的 C 端區域。資料支持其複合體組成與對 VHL 的結合，但未說明這些互作之間的功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | VBP1 特異性結合細胞質伴護蛋白複合體 c-CPN，並將目標蛋白質轉交給它；此外，VBP1 會結合新生多胜肽鏈並促進其折疊，尤其是在非天然構形蛋白質面臨多種競爭性途徑的環境中。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds specifically to cytosolic chaperonin (c-CPN) and transfers target proteins to it. Binds to nascent polypeptide chain and promotes folding in an environment in which there are many competing pathways for nonnative proteins PMID 9630229 ↗ |
| 交互作用 | VBP1 可與兩個 PFD-alpha 類及四個 PFD-beta 類次單元組成異源六聚體，並結合 VHL 的 C 端區域。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Heterohexamer of two PFD-alpha type and four PFD-beta type subunits. Binds to the C-terminal part of VHL |
| 細胞定位 | VBP1 位於細胞質與細胞核；與 VHL 形成複合體時，VBP1 可轉移至細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGTCGCGCGCTCGCATCCCCAAGATGGCGGCCGTTAAGGA40CAGTTGTGGCAAAGGAGAAATGGCCACAGGGAATGGGCGG80CGGCTCCACCTGGGGATTCCTGAGGCCGTGTTTGTGGAAG120ATGTAGATTCCTTCATGAAACAGCCTGGGAATGAGACTGC160AGATACAGTATTAAAGAAGCTGGATGAACAGTACCAGAAG200TATAAGTTTATGGAACTCAACCTTGCTCAAAAGAAAAGAA240GGCTAAAAGGTCAGATTCCTGAAATTAAACAGACTTTGGA280AATTCTAAAATACATGCAGAAGAAAAAAGAGTCCACCAAC320TCAATGGAGACCAGATTCTTGCTGGCAGATAACCTGTATT360GCAAAGCTTCAGTTCCTCCTACCGATAAAGTGTGTCTGTG400GTTGGGGGCTAATGTAATGCTTGAATATGATATTGATGAA440GCTCAGGCATTGTTGGAAAAGAATTTATCGACTGCCACAA480AGAATCTTGATTCCCTGGAGGAAGACCTTGACTTTCTTCG520AGATCAATTTACTACCACAGAAGTCAATATGGCCAGGGTT560TATAATTGGGATGTAAAAAGAAGAAACAAGGATGACTCTA600CCAAGAACAAAGCATAATGCTGGCAATTAAAAATGTGGTT640TAGTTTTCCAAACATGTTATCTTAAATACCCCTTTATCCT680TACAGGTTGACATAACTTTGAATGTTTTAACAGCAAGAAT720TTTAAGAAAAGATAAACACCATTTTATTTATTTATAAAAA760CAAAATTAGTTTCAAATATTTTTGACATTGTGATTTTTTT800TTCCACATTTCTCAGCAAAGCTAATGGTATTTTAATCATT840ATTTTTGCCTGTCATAAGAAAACTCTTAGCTGAAATGGCC880GAAAACTGTGAGACATGCTATGGAAGCTGAATGCCGGACG920CTAGCACAGTTTACTTTTTCCCTTTCTAATTGGCTGATGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。