基因總覽
VAV3（vav guanine nucleotide exchange factor 3）是蛋白質編碼基因，產物屬於鳥嘌呤核苷酸交換因子。這類蛋白質可與 GTP 結合蛋白互動；VAV3 的來源註解列出 RhoA、RhoG，以及作用程度較低的 Rac1。其功能涉及血管新生、整合素介導的訊號，以及傷口癒合相關細胞活動。VAV3 蛋白具有多個功能區域，包括 CH、DH、PH、SH3 與 SH2 結構域，並含有鋅指區域；這些結構特色構成蛋白質辨識與互動的基礎。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370056 ★ | 107,571,161–107,965,180 | 27 |
| ENST00000527011 | 107,571,161–107,965,275 | 28 |
| ENST00000415432 | 107,571,161–107,688,504 | 10 |
| ENST00000923907 | 107,571,161–107,965,275 | 28 |
| ENST00001141905 | 107,571,161–107,965,275 | 27 |
| ENST00000529809 | 107,617,584–107,749,508 | 6 |
| ENST00000490388 | 107,668,963–107,964,853 | 20 |
| ENST00001110455 | 107,681,673–107,965,275 | 19 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
VAV3 是 Rho 家族 GTP 結合蛋白的交換因子，可與不帶核苷酸的 RhoA、RhoG 結合，也能以較弱程度作用於 Rac1。來源指出，VAV3 參與血管新生；依序列相似性推定，磷酸化的 EPHA2 招募 VAV3，對 EFNA1 誘導的 RAC1 GTPase 活化，以及血管內皮細胞遷移與組裝至關重要。這項關聯的證據標註為 By similarity，應保留其推論性質。
VAV3 也可能在部分細胞類型中參與整合素介導的訊號。在破骨細胞中，VAV3 與 SYK tyrosine kinase 一同為 integrin alpha-v/beta-1（ITGAV-ITGB1）訊號所需；此訊號事件對破骨細胞細胞骨架的適當組織與功能具有重要性。該路徑涉及 RAC1 活化，但不涉及 RHO 活化。
在傷口癒合過程中，VAV3 是正常癒合所需的因子之一。它參與巨噬細胞吞噬凋亡嗜中性球之前的吞噬杯形成。依序列相似性推定，VAV3 也負責 integrin beta-2（ITGB2）介導的巨噬細胞黏附，並在較小程度上促進 beta-3（ITGB3）介導的黏附；來源則指出，VAV3 不影響 integrin beta-1（ITGB1）介導的黏附。這些結果反映其作用會因整合素亞型與細胞情境而異。
Promoter 與基因調控
>VAV3 ENST00000370056 GRCh38 chr1:107965080-107966180 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CGAAGGACCACATTCCTATCGAACAGCAATAATTCACTGTGGCAATATCTTGCCACAAATAATTTAAACA TTAATTGTGGTTTTGAGGGGCAGTGTGCAGTGGGAGTAAAAGGGGTAGGGTTTAGAGTCTCCAAAAGATT TACTTAAGAAACACGAATGCACTGCTTGTGCACTGCGCAAAAGTTCTGGGGTCAAGTTCCAACTTTCACT AAGGATCCCAGAACAGCCCGGCAGGAGCTGCCCAGGGCTAACGCGCTTTGCTCTCAAACCCGGCCGCCAG TCGCCGACGCATGCGCAGTCTAGCACCGTGGCACAGGCCTTTCTCAAGCAGGTTTTTGTGGGGTCAGCAA AAGGGCCAGAACAGCAACGGCAAACAGTTCCGAGCCTGACAGTGCAGGGGCAAACCAGCTCCAAGTGAAA ATCACCTCGCGAGGAAATAGGCTCAGGGATCGGGGCGGTTTCCGCAGGCGTCTCCACACACGCACTCTCA CTCACTTTGAGGGTGCCAAAACACCACTAGGGGCAACTAGGAGGAATAGGCTGAGGAATCAGCTATAGAG AATGGAGGGGATAGAGCTGCAAGGGGCGAGGGGGCGACGATCTCTAAAACTTTCAGCGCCGTGCTCTACT GATGCTCTAGGCACTTTTTTCATTGCTCTGGGGAGTCTGGGTGCCCCAATTAATCCGTCGCTCCTTTGAG CATTTGTTGTTTAGGGGGTCCTGGGGGACCCCATCGTATTACAGTATTCAGCCACACTCCCCGCAAAGCC GGGAAGCCGCCCCGAGAGAAGACCCCAGGACGCCGGGGGCTGCGTGAGCCCCGCAAGGCTGCAGGCGGGG GCGCGGGATCCCCTTTCTGGCCGCCGCCCCCCTCCGCCGGCCCCTCCCCCGCGCCCCGCCCTCGGCCACA GACCCCAGCCCCGGCCGCCGGCGCGCTCCCACCCGCGCGTCTGGGGACTTGCGGACCGCAGCGAGACCGG CCGGCGTGCTGGGCATGCTCAGTGGCGGGCCGGGCGCTGGAGTCGGAAGCCTGTGCGCGGCAGCCGCCGC CGAGCCGGCCGGGGCGCACGGAGAGCGCGCGGGACTCGCTGCAGCGGCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| VAV3_1 ↗ | 1:107,688,499 | 負股 | 107,688,489–107,688,548 |
| VAV3_2 ↗ | 1:107,965,180 | 負股 | 107,965,170–107,965,229 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_93KT2L · promoter · 107963877–107964377 · regulatory
ENSR1_BRFHZ · promoter · 107964999–107965670 · regulatory
ENSR1_5XDMM2 · CTCF_binding_site · 107965651–107965672 · regulatory
ENSR1_856P5G · enhancer · 107967842–107968035 · regulatory
· motif · 107964224–107964237 · motif
· motif · 107965653–107965669 · motif
· motif · 107965827–107965838 · motif
· motif · 107965884–107965895 · motif
· motif · 107965884–107965895 · motif
VAV3 的表現受 EGF 與 TGF-beta 下調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：847 aa
VAV3 蛋白長 847 個胺基酸，包含 CH、DH、PH、SH3 1、SH2 與 SH3 2 結構域，另有 Phorbol-ester/DAG-type 鋅指區域。來源亦標示胺基酸 560–847 的區段足以與 ROS1 互動。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- CBLBQ13191 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GAB1Q13480 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- METP08581 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PIK3R1P27986 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RINT1Q6NUQ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZRANB1Q9UGI0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
VAV3 與 SH2B2 的 PH domain 互動；也透過自身 SH2 domains 與磷酸化形式的 EPHA2 互動。VAV3 與 ROS1 有持續性互動，且此互動可介導 VAV3 磷酸化。來源描述的是分子互動關係，未指出這些蛋白形成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | VAV3 是 RhoA、RhoG 的核苷酸交換因子，對 Rac1 的作用程度較低，並可實體結合這些 GTPase 的無核苷酸狀態。它參與血管新生；依相似性推定，磷酸化 EPHA2 招募 VAV3 對 EFNA1 誘導的 RAC1 活化及血管內皮細胞遷移、組裝至關重要。VAV3 可能參與部分細胞的整合素訊號；在破骨細胞中與 SYK 一同支援 ITGAV-ITGB1 訊號及細胞骨架組織，涉及 RAC1 而非 RHO 活化。VAV3 亦為傷口癒合所需，參與巨噬細胞吞噬凋亡嗜中性球前的吞噬杯形成，並促進 ITGB2 及較弱程度的 ITGB3 介導黏附；不影響 ITGB1 介導黏附。 | 推論支持 | 證據與來源Exchange factor for GTP-binding proteins RhoA, RhoG and, to a lesser extent, Rac1. Binds physically to the nucleotide-free states of those GTPases. Plays an important role in angiogenesis. Its recruitment by phosphorylated EPHA2 is critical for EFNA1-induced RAC1 GTPase activation and vascular endothelial cell migration and assembly (By similarity). May be important for integrin-mediated signaling, at least in some cell types. In osteoclasts, along with SYK tyrosine kinase, required for signaling through integrin alpha-v/beta-1 (ITAGV-ITGB1), a crucial event for osteoclast proper cytoskeleton organization and function. This signaling pathway involves RAC1, but not RHO, activation. Necessary for proper wound healing. In the course of wound healing, required for the phagocytotic cup formation preceding macrophage phagocytosis of apoptotic neutrophils. Responsible for integrin beta-2 (ITGB2)-mediated macrophage adhesion and, to a lesser extent, contributes to beta-3 (ITGB3)-mediated adhesion. Does not affect integrin beta-1 (ITGB1)-mediated adhesion (By similarity) |
| 交互作用 | VAV3 與 SH2B2 的 PH domain 互動，也透過自身 SH2 domains 與磷酸化形式的 EPHA2 互動。VAV3 另與 ROS1 持續互動，而此互動可介導 VAV3 磷酸化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with the PH domain of SH2B2. Interacts (via SH2 domains) with the phosphorylated form of EPHA2. Interacts with ROS1; constitutive interaction that mediates VAV3 phosphorylation PMID 11094073 ↗ · PMID 12400014 ↗ · PMID 16782872 ↗ |
| 調控 | EGF 與 TGF-beta 會下調 VAV3。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTGGCGGGCCGGGCGCTGGAGTCGGAAGCCTGTGCGCGG40CAGCCGCCGCCGAGCCGGCCGGGGCGCACGGAGAGCGCGC80GGGACTCGCTGCAGCGGCGGCCGGGTCGCGGCGCACCCGG120GCCGGGACCGGAGCCGAGCCTAGCGCGGCGCCCGCGACCC160GTCAGCCGCGGCTCCTGCTCCCTCGATCCCGCGCGGGGAA200AGGGCCGGCGGCTGTTGGCGTCGGCGGGGCGCGGAGGAAC240CGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGCATCCTTGCCGCCCGCC280CCGGCCCAGCCGCGTCCCGGAGCCGTCGGGCATGGAGCCG320TGGAAGCAGTGCGCGCAGTGGCTCATCCATTGCAAGGTGC360TGCCCACCAACCACCGGGTGACCTGGGACTCGGCTCAGGT400GTTCGACCTTGCGCAGACCCTCCGCGATGGAGTCCTGCTC440TGCCAGCTGCTTAACAACCTCCGGGCGCACTCCATCAACC480TGAAGGAGATCAACCTGAGGCCGCAGATGTCCCAGTTTCT520CTGTTTGAAGAACATAAGGACATTTCTCACGGCCTGTTGT560GAGACGTTTGGAATGAGGAAAAGTGAACTTTTCGAGGCAT600TTGACTTGTTTGATGTTCGTGACTTTGGAAAGGTTATAGA640AACATTATCACGACTTTCTCGAACACCTATAGCATTGGCC680ACAGGAATCAGGCCCTTCCCAACAGAAGAAAGCATTAATG720ATGAAGACATCTACAAAGGCCTTCCTGATTTAATAGATGA760AACCCTTGTGGAAGATGAAGAAGATCTCTATGACTGTGTT800TATGGGGAAGATGAAGGTGGAGAAGTCTATGAGGACTTAA840TGAAGGCAGAGGAAGCACATCAGCCCAAATGTCCAGAAAA880TGATATACGAAGTTGTTGTCTAGCAGAAATTAAGCAGACA920GAAGAAAAATATACAGAAACTTTGGAGTCAATAGAAAAGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。