演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

VASP

vasodilator stimulated phosphoprotein

VASP 是 Ena/VASP 家族的肌動蛋白相關蛋白,參與細胞骨架重塑相關活動,並促進肌動蛋白絲延長。

Homo sapiens19q13.32UniProt P50552
OFFICIAL SYMBOL
VASP
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P50552
PDB / ALPHAFOLD
1EGX
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

vasodilator stimulated phosphoprotein(VASP)是由蛋白質編碼基因 VASP 產生的蛋白質,屬於 Ena/VASP 家族,並與肌動蛋白相關。其蛋白質全長 380 個胺基酸,具有 WH1 結構域與 EVH2 區域;序列中另包含被註記為無序的區段,以及兩個串聯重複序列。這些結構特徵構成 VASP 的基本分子架構。VASP 的主要角色與肌動蛋白細胞骨架相關,涉及細胞骨架重塑及細胞極性所依賴的多種過程;其具體分子作用與生物學情境詳述於功能段落。

Official symbol
VASP
Gene name
vasodilator stimulated phosphoprotein
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12652
UniProt
P50552
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.32
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25VASPpq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:45,506,579–45,527,839
Gene span
21,261 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000245932 ★45,507,479–45,526,98313
ENST0000058962745,506,579–45,517,8343
ENST0000086292545,506,613–45,527,83913
ENST0000086292645,506,613–45,527,83913
ENST0000086292745,506,613–45,527,83910
ENST0000086292845,506,613–45,527,83913
ENST0000086292945,506,613–45,527,83910
ENST0000091655745,506,613–45,527,83913
ENST0000091655845,506,613–45,527,83913
ENST0000091655945,506,613–45,527,83913
ENST0000091656045,506,613–45,527,83913
ENST0000091656145,506,613–45,527,83913

顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

VASP 是肌動蛋白相關蛋白,參與依賴細胞骨架重塑與細胞極性的多種過程,包括軸突導引、片狀偽足與絲狀偽足的動態、血小板活化及細胞遷移。這些作用與細胞形態及移動相關的肌動蛋白骨架調節相連。

在肌動蛋白絲生長時,VASP 促進絲的延長。它可保護生長中肌動蛋白絲的尖端端(barbed end),避免該端受到封端作用;在有封端蛋白存在時,VASP 也能提高肌動蛋白聚合速率。其促進延長的方式之一,是幫助與 profilin 結合的肌動蛋白單體轉移至生長中肌動蛋白絲的尖端端,支持肌動蛋白單體持續加入。

VASP 也參與宿主細胞中 Listeria monocytogenes 依賴肌動蛋白的移動。在血小板中,它調節肌動蛋白動態,並在血小板聚集的調節上扮演重要角色。這些作用將肌動蛋白絲的生長與細胞移動、血小板活化及聚集等過程連結;來源並未進一步界定各過程之間的因果關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 45507479 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>VASP ENST00000245932 GRCh38 chr19:45506479-45507579 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCGTGTGTAAATGTGGAACTAACTGATTTCCCAGGGCTCGGGCGCCTCACCCGGGCCAGGTGGCGCTCTA
CCCAAGGGGCGCGACCAAATCAGTGACGTCACTCGGGGCGGGGCCGGCAAGACACGCTGCGGAAGCCTCA
GAGGGTGTCTGGGCTCAGCCCGGAGCCGGCGTGTGGGGGCGGGGGCTCCCGGGAGGGTCTCCTCACCTCC
GGGCCCTCCTGAGGGCTGGGATGATCCTGCTGTCCTCCGCAGGCGAAACTGAGTCAGAGCGGGGCGTGCG
TGGGCCGGAGGCTTTACACACCAAAGAAGCCGGCGCCTCCTGCCCACCCCGGGCGAATGCCGGGCCCCCC
ACTCCCGCACTCCTCGCCAGTCCCCACCTCCACCCCACCCCACCCCCGACCCTGCGGCTGTGAGTCAGCG
ACCGACCGCGCCCCCTTGGCCCACTTCCTCCTCACCTTCCCGGGGCGGGCGGGGTGGGGTGAGAGGGGTT
GGGCCCTACTCCCCCGACTTCCACTCCCGTGCGGGTGGGGGTCTCGCCCCCTTAGTAACCTCTCCGAAAT
TGACAGAAGAGAAACGCTGGGGAGGGGCGGTGTTCCGAAGATGGGATTTCAGGGAGAAAATCTGAGACCA
CTTGCTTAACTTGAGGGTCCTCCTCGACCCCCAAAATTGAGCGGAGTACGAGATGGAGAAGTCGATGGGG
AAAGAAATCGCGCCCCTTCCGAGACCCTCCTCAGAATTCCCACAGTGGGAGCGAACTAGGAAGCAAGGGA
GGTCCCCTTCCCCTTCACCAACTTGCCCCTCAGGTGGGGGTGATTCCCAGGGTGCACCCCTGGGCTACAA
CATTGGGGAGAGGAGCGAGATCGCGGAAGCCGAGGGTGCAGAGTTGCCCTTTTAAGCGCCCTCCACCCCC
TCGCCTGGAGGCGCACGCGGCCCCTTTAAGGCGCGGGGCATTGTGGGTGCGGGGAGTGGAATTTTGGAAC
GAAATGTAACGAAGAGAAGTACAGTAGTAAGAGTAACACTGTAGCCGCCACCGGCAAGGGGTGCGCGCTG
GGGAGCGGACGCTGCATCCCCTTTCTGCTGCAGGAACCTCTCATCAGACCG
VASP 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
VASP_1 ↗19:45,507,487正股45,507,438–45,507,497

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_83C5C5 · enhancer · 45505291–45505418 · regulatory

ENSR19_BC2SN · enhancer · 45506031–45506853 · regulatory

ENSR19_BC2SR · promoter · 45506854–45507489 · regulatory

· motif · 45504092–45504101 · motif

· motif · 45506486–45506499 · motif

· motif · 45506569–45506582 · motif

· motif · 45506569–45506582 · motif

· motif · 45506582–45506592 · motif

· motif · 45506648–45506661 · motif

· motif · 45506653–45506663 · motif

· motif · 45506753–45506766 · motif

· motif · 45506888–45506896 · motif

· motif · 45506920–45506931 · motif

· motif · 45506920–45506931 · motif

· motif · 45507338–45507349 · motif

· motif · 45507380–45507393 · motif

· motif · 45507602–45507612 · motif

· motif · 45507789–45507802 · motif

· motif · 45508522–45508531 · motif

· motif · 45508661–45508671 · motif

· motif · 45508751–45508764 · motif

· motif · 45508751–45508764 · motif

· motif · 45508954–45508967 · motif

· motif · 45508954–45508967 · motif

· motif · 45509045–45509058 · motif

· motif · 45509045–45509058 · motif

· motif · 45509079–45509096 · motif

· motif · 45509100–45509115 · motif

· motif · 45509109–45509122 · motif

· motif · 45509304–45509311 · motif

· motif · 45509402–45509411 · motif

· motif · 45509658–45509669 · motif

· motif · 45509702–45509711 · motif

· motif · 45511962–45511977 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:380 aa

1 aa380 aa結構域功能區域基序重複區
依 P50552 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

VASP 長 380 個胺基酸,屬於 Ena/VASP 家族。其 WH1 結構域位於第 2–113 個胺基酸;EVH2 區域位於第 225–377 個胺基酸,並標註有 A、B、C 三個區塊。第 111–343 位胺基酸區段被註記為無序區,另於第 344–373 位胺基酸含兩個串聯重複序列。

結構域WH12–113 aa
重複區1344–358 aa
重複區2359–373 aa
功能區域Disordered111–343 aa
功能區域EVH2225–377 aa
功能區域EVH2 block A225–245 aa
功能區域EVH2 block B259–278 aa
功能區域EVH2 block C343–377 aa
功能區域2 X 15 AA tandem repeats of L-[EQ]-[KR]-[MV]-K-[EQ]-E-[IL]-[IL]-E-[AEV]-[FV]-[KRV]-[KQ]-E344–373 aa
基序KLKR234–237 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1EGX…

PDB · 1EGX

NMR · - · A=1-115

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Cytoplasm, cytoskeleton;Cell junction, focal adhesion;Cell junction, tight junction;Cell projection, lamellipodium membrane;Cell projection, filopodium membrane

VASP 位於細胞質及細胞骨架,也可見於黏著斑、緊密連接,以及片狀偽足與絲狀偽足的膜。 基礎狀態下,它沿周邊細胞質中的肌動蛋白絲側面分布;在突出中的片狀偽足及絲狀偽足尖端,則定位於質膜。 凝血酶或 PMA 刺激也會使 VASP 轉位至黏著斑。 來源另指出,細胞進入凋亡前期時,VASP 與 MEFV 共定位於大型焦點。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell junction, focal adhesion;Cell junction, tight junction;Cell projection, lamellipodium membrane;Cell projection, filopodium membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 18 個夥伴 · 最多顯示 50 個
VASPVASPABI1ABI2ABI3BAIAP2CEP43FAF2HSPA8NR4A1NSMAFPFN1PSORS1C2RPS6KA1SCGB2A2TRIM9XIRP1ZYXVCLypkA
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

VASP 形成同源四聚體,並與 PFN1、PFN2、LPP、ACTN1、ACTG1 及 APBB1IP 互作;與 MEFV 的互作較弱。VASP 的 EVH1 結構域可結合 ZYX 的富含脯胺酸區域,此互作與 VASP 靶向黏著斑及細胞頂端肌動蛋白豐富結構的形成有關。EVH1 結構域也與 Listeria monocytogenes ActA 的富含脯胺酸區域互作。此外,VASP 的富含脯胺酸區域與 DNMBP 的 C 端 SH3 結構域互作,此項關係標註為相似性推定。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Ena/VASP 家族蛋白與肌動蛋白相關,參與依賴細胞骨架重塑及細胞極性的過程,包括軸突導引、片狀偽足與絲狀偽足動態、血小板活化及細胞遷移。VASP 促進肌動蛋白絲延長,保護生長中絲的尖端端免受封端,並在封端蛋白存在時提高聚合速率;它也促使 profilin 結合的肌動蛋白單體轉移至尖端端。VASP 另參與宿主細胞內 Listeria monocytogenes 的肌動蛋白依賴性移動,並調節血小板肌動蛋白動態及血小板聚集。含實驗來源
證據與來源

Ena/VASP proteins are actin-associated proteins involved in a range of processes dependent on cytoskeleton remodeling and cell polarity such as axon guidance, lamellipodial and filopodial dynamics, platelet activation and cell migration. VASP promotes actin filament elongation. It protects the barbed end of growing actin filaments against capping and increases the rate of actin polymerization in the presence of capping protein. VASP stimulates actin filament elongation by promoting the transfer of profilin-bound actin monomers onto the barbed end of growing actin filaments. Plays a role in actin-based mobility of Listeria monocytogenes in host cells. Regulates actin dynamics in platelets and plays an important role in regulating platelet aggregation

PMID 10087267 ↗ · PMID 10438535 ↗ · PMID 15939738 ↗ · PMID 17082196 ↗ · PMID 18559661 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用VASP 形成同源四聚體,並與 PFN1、PFN2、LPP、ACTN1、ACTG1、APBB1IP 及 MEFV 互作,其中與 MEFV 的互作較弱。VASP 的 EVH1 結構域結合 ZYX 的富含脯胺酸區域,該互作與黏著斑定位及細胞頂端肌動蛋白豐富結構形成有關;EVH1 也與 Listeria monocytogenes ActA 的富含脯胺酸區域互作。VASP 的富含脯胺酸區域與 DNMBP 的 C 端 SH3 結構域互作,此項關係為相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Homotetramer. Interacts with PFN1, PFN2, LPP, ACTN1 and ACTG1. Interacts, via the EVH1 domain, with the Pro-rich regions of ZYX. This interaction is important for targeting to focal adhesions and the formation of actin-rich structures at the apical surface of cells. Interacts, via the EVH1 domain, with the Pro-rich domain of Listeria monocytogenes actA. Interacts with APBB1IP. Interacts, via the Pro-rich domain, with the C-terminal SH3 domain of DNMBP (By similarity). Interacts weakly with MEFV

PMID 10087267 ↗ · PMID 10637295 ↗ · PMID 10801818 ↗ · PMID 15469845 ↗ · PMID 16631741 ↗ · PMID 17914456 ↗ · PMID 18689676 ↗ · PMID 19109554 ↗ · PMID 7737110 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位VASP 可定位於細胞質、細胞骨架、黏著斑、緊密連接,以及片狀偽足與絲狀偽足膜。基礎狀態下,它沿周邊細胞質的肌動蛋白絲側面分布;在突出中的片狀偽足及絲狀偽足尖端則位於質膜。凝血酶或 PMA 刺激會使 VASP 轉位至黏著斑;細胞進入凋亡前期時,VASP 與 MEFV 共定位於大型焦點。推論支持
證據與來源

Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton; Cell junction, focal adhesion; Cell junction, tight junction; Cell projection, lamellipodium membrane; Cell projection, filopodium membrane; Targeted to stress fibers and focal adhesions through interaction with a number of proteins including MRL family members. Localizes to the plasma membrane in protruding lamellipodia and filopodial tips. Stimulation by thrombin or PMA, also translocates VASP to focal adhesions. Localized along the sides of actin filaments throughout the peripheral cytoplasm under basal conditions. In pre-apoptotic cells, colocalizes with MEFV in large specks (pyroptosomes)

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000245932 · 2,242 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACAGTAGTAAGAGTAACACTGTAGCCGCCACCGGCAAGGG40
41GTGCGCGCTGGGGAGCGGACGCTGCATCCCCTTTCTGCTG80
81CAGGAACCTCTCATCAGACCGCCTGAGGGAAGCGGCGCCC120
121GGAGACCCGCCCCGGCCCGGTCCACATTCTCCCCAGGAAG160
161CCGGACTCTATGGGGCGGGACCCTGGGGGAGCCTGAGCCG200
201AGCCCGGAGCCAGCCCCGAACCCCTGAACCTCCAGCCAGG240
241GGCGCCCCGGGAGCAGCCAGCCCGTGGGCGAGCCGCCCGC280
281CCGCCGAGCAGCCATGAGCGAGACGGTCATCTGTTCCAGC320
321CGGGCCACTGTGATGCTTTATGATGATGGCAACAAGCGAT360
361GGCTCCCTGCTGGCACGGGTCCCCAGGCCTTCAGCCGCGT400
401CCAGATCTACCACAACCCCACGGCCAATTCCTTTCGCGTC440
441GTGGGCCGGAAGATGCAGCCCGACCAGCAGGTGGTCATCA480
481ACTGTGCCATCGTCCGGGGTGTCAAGTATAACCAGGCCAC520
521CCCCAACTTCCATCAGTGGCGCGACGCTCGCCAGGTCTGG560
561GGCCTCAACTTCGGCAGCAAGGAGGATGCGGCCCAGTTTG600
601CCGCCGGCATGGCCAGTGCCCTAGAGGCGTTGGAAGGAGG640
641TGGGCCCCCTCCACCCCCAGCACTTCCCACCTGGTCGGTC680
681CCGAACGGCCCCTCCCCGGAGGAGGTGGAGCAGCAGAAAA720
721GGCAGCAGCCCGGCCCGTCGGAGCACATAGAGCGCCGGGT760
761CTCCAATGCAGGAGGCCCACCTGCTCCCCCCGCTGGGGGT800
801CCACCCCCACCACCAGGACCTCCCCCTCCTCCAGGTCCCC840
841CCCCACCCCCAGGTTTGCCCCCTTCGGGGGTCCCAGCTGC880
881AGCGCACGGAGCAGGGGGAGGACCACCCCCTGCACCCCCT920
921CTCCCGGCAGCACAGGGCCCTGGTGGTGGGGGAGCTGGGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。