基因總覽
vasodilator stimulated phosphoprotein(VASP)是由蛋白質編碼基因 VASP 產生的蛋白質,屬於 Ena/VASP 家族,並與肌動蛋白相關。其蛋白質全長 380 個胺基酸,具有 WH1 結構域與 EVH2 區域;序列中另包含被註記為無序的區段,以及兩個串聯重複序列。這些結構特徵構成 VASP 的基本分子架構。VASP 的主要角色與肌動蛋白細胞骨架相關,涉及細胞骨架重塑及細胞極性所依賴的多種過程;其具體分子作用與生物學情境詳述於功能段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000245932 ★ | 45,507,479–45,526,983 | 13 |
| ENST00000589627 | 45,506,579–45,517,834 | 3 |
| ENST00000862925 | 45,506,613–45,527,839 | 13 |
| ENST00000862926 | 45,506,613–45,527,839 | 13 |
| ENST00000862927 | 45,506,613–45,527,839 | 10 |
| ENST00000862928 | 45,506,613–45,527,839 | 13 |
| ENST00000862929 | 45,506,613–45,527,839 | 10 |
| ENST00000916557 | 45,506,613–45,527,839 | 13 |
| ENST00000916558 | 45,506,613–45,527,839 | 13 |
| ENST00000916559 | 45,506,613–45,527,839 | 13 |
| ENST00000916560 | 45,506,613–45,527,839 | 13 |
| ENST00000916561 | 45,506,613–45,527,839 | 13 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
VASP 是肌動蛋白相關蛋白,參與依賴細胞骨架重塑與細胞極性的多種過程,包括軸突導引、片狀偽足與絲狀偽足的動態、血小板活化及細胞遷移。這些作用與細胞形態及移動相關的肌動蛋白骨架調節相連。
在肌動蛋白絲生長時,VASP 促進絲的延長。它可保護生長中肌動蛋白絲的尖端端(barbed end),避免該端受到封端作用;在有封端蛋白存在時,VASP 也能提高肌動蛋白聚合速率。其促進延長的方式之一,是幫助與 profilin 結合的肌動蛋白單體轉移至生長中肌動蛋白絲的尖端端,支持肌動蛋白單體持續加入。
VASP 也參與宿主細胞中 Listeria monocytogenes 依賴肌動蛋白的移動。在血小板中,它調節肌動蛋白動態,並在血小板聚集的調節上扮演重要角色。這些作用將肌動蛋白絲的生長與細胞移動、血小板活化及聚集等過程連結;來源並未進一步界定各過程之間的因果關係。
Promoter 與基因調控
>VASP ENST00000245932 GRCh38 chr19:45506479-45507579 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCGTGTGTAAATGTGGAACTAACTGATTTCCCAGGGCTCGGGCGCCTCACCCGGGCCAGGTGGCGCTCTA CCCAAGGGGCGCGACCAAATCAGTGACGTCACTCGGGGCGGGGCCGGCAAGACACGCTGCGGAAGCCTCA GAGGGTGTCTGGGCTCAGCCCGGAGCCGGCGTGTGGGGGCGGGGGCTCCCGGGAGGGTCTCCTCACCTCC GGGCCCTCCTGAGGGCTGGGATGATCCTGCTGTCCTCCGCAGGCGAAACTGAGTCAGAGCGGGGCGTGCG TGGGCCGGAGGCTTTACACACCAAAGAAGCCGGCGCCTCCTGCCCACCCCGGGCGAATGCCGGGCCCCCC ACTCCCGCACTCCTCGCCAGTCCCCACCTCCACCCCACCCCACCCCCGACCCTGCGGCTGTGAGTCAGCG ACCGACCGCGCCCCCTTGGCCCACTTCCTCCTCACCTTCCCGGGGCGGGCGGGGTGGGGTGAGAGGGGTT GGGCCCTACTCCCCCGACTTCCACTCCCGTGCGGGTGGGGGTCTCGCCCCCTTAGTAACCTCTCCGAAAT TGACAGAAGAGAAACGCTGGGGAGGGGCGGTGTTCCGAAGATGGGATTTCAGGGAGAAAATCTGAGACCA CTTGCTTAACTTGAGGGTCCTCCTCGACCCCCAAAATTGAGCGGAGTACGAGATGGAGAAGTCGATGGGG AAAGAAATCGCGCCCCTTCCGAGACCCTCCTCAGAATTCCCACAGTGGGAGCGAACTAGGAAGCAAGGGA GGTCCCCTTCCCCTTCACCAACTTGCCCCTCAGGTGGGGGTGATTCCCAGGGTGCACCCCTGGGCTACAA CATTGGGGAGAGGAGCGAGATCGCGGAAGCCGAGGGTGCAGAGTTGCCCTTTTAAGCGCCCTCCACCCCC TCGCCTGGAGGCGCACGCGGCCCCTTTAAGGCGCGGGGCATTGTGGGTGCGGGGAGTGGAATTTTGGAAC GAAATGTAACGAAGAGAAGTACAGTAGTAAGAGTAACACTGTAGCCGCCACCGGCAAGGGGTGCGCGCTG GGGAGCGGACGCTGCATCCCCTTTCTGCTGCAGGAACCTCTCATCAGACCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| VASP_1 ↗ | 19:45,507,487 | 正股 | 45,507,438–45,507,497 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_83C5C5 · enhancer · 45505291–45505418 · regulatory
ENSR19_BC2SN · enhancer · 45506031–45506853 · regulatory
ENSR19_BC2SR · promoter · 45506854–45507489 · regulatory
· motif · 45504092–45504101 · motif
· motif · 45506486–45506499 · motif
· motif · 45506569–45506582 · motif
· motif · 45506569–45506582 · motif
· motif · 45506582–45506592 · motif
· motif · 45506648–45506661 · motif
· motif · 45506653–45506663 · motif
· motif · 45506753–45506766 · motif
· motif · 45506888–45506896 · motif
· motif · 45506920–45506931 · motif
· motif · 45506920–45506931 · motif
· motif · 45507338–45507349 · motif
· motif · 45507380–45507393 · motif
· motif · 45507602–45507612 · motif
· motif · 45507789–45507802 · motif
· motif · 45508522–45508531 · motif
· motif · 45508661–45508671 · motif
· motif · 45508751–45508764 · motif
· motif · 45508751–45508764 · motif
· motif · 45508954–45508967 · motif
· motif · 45508954–45508967 · motif
· motif · 45509045–45509058 · motif
· motif · 45509045–45509058 · motif
· motif · 45509079–45509096 · motif
· motif · 45509100–45509115 · motif
· motif · 45509109–45509122 · motif
· motif · 45509304–45509311 · motif
· motif · 45509402–45509411 · motif
· motif · 45509658–45509669 · motif
· motif · 45509702–45509711 · motif
· motif · 45511962–45511977 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:380 aa
VASP 長 380 個胺基酸,屬於 Ena/VASP 家族。其 WH1 結構域位於第 2–113 個胺基酸;EVH2 區域位於第 225–377 個胺基酸,並標註有 A、B、C 三個區塊。第 111–343 位胺基酸區段被註記為無序區,另於第 344–373 位胺基酸含兩個串聯重複序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
VASP 位於細胞質及細胞骨架,也可見於黏著斑、緊密連接,以及片狀偽足與絲狀偽足的膜。 基礎狀態下,它沿周邊細胞質中的肌動蛋白絲側面分布;在突出中的片狀偽足及絲狀偽足尖端,則定位於質膜。 凝血酶或 PMA 刺激也會使 VASP 轉位至黏著斑。 來源另指出,細胞進入凋亡前期時,VASP 與 MEFV 共定位於大型焦點。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Cell junction, focal adhesion;Cell junction, tight junction;Cell projection, lamellipodium membrane;Cell projection, filopodium membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
- ABI1Q8IZP0-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ABI2Q9NYB9 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ABI3Q9P2A4 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- BAIAP2Q9UQB8-4 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CEP43O95684 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- FAF2Q96CS3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HSPA8P11142 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NR4A1P22736 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NSMAFQ92636 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PFN1P07737 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PSORS1C2Q9UIG4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RPS6KA1Q15418 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- SCGB2A2Q13296 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM9Q9C026 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- XIRP1Q702N8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ZYXQ15942 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- VCLP12003 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ypkAQ9RI12 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
VASP 形成同源四聚體,並與 PFN1、PFN2、LPP、ACTN1、ACTG1 及 APBB1IP 互作;與 MEFV 的互作較弱。VASP 的 EVH1 結構域可結合 ZYX 的富含脯胺酸區域,此互作與 VASP 靶向黏著斑及細胞頂端肌動蛋白豐富結構的形成有關。EVH1 結構域也與 Listeria monocytogenes ActA 的富含脯胺酸區域互作。此外,VASP 的富含脯胺酸區域與 DNMBP 的 C 端 SH3 結構域互作,此項關係標註為相似性推定。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Ena/VASP 家族蛋白與肌動蛋白相關,參與依賴細胞骨架重塑及細胞極性的過程,包括軸突導引、片狀偽足與絲狀偽足動態、血小板活化及細胞遷移。VASP 促進肌動蛋白絲延長,保護生長中絲的尖端端免受封端,並在封端蛋白存在時提高聚合速率;它也促使 profilin 結合的肌動蛋白單體轉移至尖端端。VASP 另參與宿主細胞內 Listeria monocytogenes 的肌動蛋白依賴性移動,並調節血小板肌動蛋白動態及血小板聚集。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ena/VASP proteins are actin-associated proteins involved in a range of processes dependent on cytoskeleton remodeling and cell polarity such as axon guidance, lamellipodial and filopodial dynamics, platelet activation and cell migration. VASP promotes actin filament elongation. It protects the barbed end of growing actin filaments against capping and increases the rate of actin polymerization in the presence of capping protein. VASP stimulates actin filament elongation by promoting the transfer of profilin-bound actin monomers onto the barbed end of growing actin filaments. Plays a role in actin-based mobility of Listeria monocytogenes in host cells. Regulates actin dynamics in platelets and plays an important role in regulating platelet aggregation PMID 10087267 ↗ · PMID 10438535 ↗ · PMID 15939738 ↗ · PMID 17082196 ↗ · PMID 18559661 ↗ |
| 交互作用 | VASP 形成同源四聚體,並與 PFN1、PFN2、LPP、ACTN1、ACTG1、APBB1IP 及 MEFV 互作,其中與 MEFV 的互作較弱。VASP 的 EVH1 結構域結合 ZYX 的富含脯胺酸區域,該互作與黏著斑定位及細胞頂端肌動蛋白豐富結構形成有關;EVH1 也與 Listeria monocytogenes ActA 的富含脯胺酸區域互作。VASP 的富含脯胺酸區域與 DNMBP 的 C 端 SH3 結構域互作,此項關係為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotetramer. Interacts with PFN1, PFN2, LPP, ACTN1 and ACTG1. Interacts, via the EVH1 domain, with the Pro-rich regions of ZYX. This interaction is important for targeting to focal adhesions and the formation of actin-rich structures at the apical surface of cells. Interacts, via the EVH1 domain, with the Pro-rich domain of Listeria monocytogenes actA. Interacts with APBB1IP. Interacts, via the Pro-rich domain, with the C-terminal SH3 domain of DNMBP (By similarity). Interacts weakly with MEFV PMID 10087267 ↗ · PMID 10637295 ↗ · PMID 10801818 ↗ · PMID 15469845 ↗ · PMID 16631741 ↗ · PMID 17914456 ↗ · PMID 18689676 ↗ · PMID 19109554 ↗ · PMID 7737110 ↗ |
| 細胞定位 | VASP 可定位於細胞質、細胞骨架、黏著斑、緊密連接,以及片狀偽足與絲狀偽足膜。基礎狀態下,它沿周邊細胞質的肌動蛋白絲側面分布;在突出中的片狀偽足及絲狀偽足尖端則位於質膜。凝血酶或 PMA 刺激會使 VASP 轉位至黏著斑;細胞進入凋亡前期時,VASP 與 MEFV 共定位於大型焦點。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton; Cell junction, focal adhesion; Cell junction, tight junction; Cell projection, lamellipodium membrane; Cell projection, filopodium membrane; Targeted to stress fibers and focal adhesions through interaction with a number of proteins including MRL family members. Localizes to the plasma membrane in protruding lamellipodia and filopodial tips. Stimulation by thrombin or PMA, also translocates VASP to focal adhesions. Localized along the sides of actin filaments throughout the peripheral cytoplasm under basal conditions. In pre-apoptotic cells, colocalizes with MEFV in large specks (pyroptosomes) |
核酸與蛋白質序列
ACAGTAGTAAGAGTAACACTGTAGCCGCCACCGGCAAGGG40GTGCGCGCTGGGGAGCGGACGCTGCATCCCCTTTCTGCTG80CAGGAACCTCTCATCAGACCGCCTGAGGGAAGCGGCGCCC120GGAGACCCGCCCCGGCCCGGTCCACATTCTCCCCAGGAAG160CCGGACTCTATGGGGCGGGACCCTGGGGGAGCCTGAGCCG200AGCCCGGAGCCAGCCCCGAACCCCTGAACCTCCAGCCAGG240GGCGCCCCGGGAGCAGCCAGCCCGTGGGCGAGCCGCCCGC280CCGCCGAGCAGCCATGAGCGAGACGGTCATCTGTTCCAGC320CGGGCCACTGTGATGCTTTATGATGATGGCAACAAGCGAT360GGCTCCCTGCTGGCACGGGTCCCCAGGCCTTCAGCCGCGT400CCAGATCTACCACAACCCCACGGCCAATTCCTTTCGCGTC440GTGGGCCGGAAGATGCAGCCCGACCAGCAGGTGGTCATCA480ACTGTGCCATCGTCCGGGGTGTCAAGTATAACCAGGCCAC520CCCCAACTTCCATCAGTGGCGCGACGCTCGCCAGGTCTGG560GGCCTCAACTTCGGCAGCAAGGAGGATGCGGCCCAGTTTG600CCGCCGGCATGGCCAGTGCCCTAGAGGCGTTGGAAGGAGG640TGGGCCCCCTCCACCCCCAGCACTTCCCACCTGGTCGGTC680CCGAACGGCCCCTCCCCGGAGGAGGTGGAGCAGCAGAAAA720GGCAGCAGCCCGGCCCGTCGGAGCACATAGAGCGCCGGGT760CTCCAATGCAGGAGGCCCACCTGCTCCCCCCGCTGGGGGT800CCACCCCCACCACCAGGACCTCCCCCTCCTCCAGGTCCCC840CCCCACCCCCAGGTTTGCCCCCTTCGGGGGTCCCAGCTGC880AGCGCACGGAGCAGGGGGAGGACCACCCCCTGCACCCCCT920CTCCCGGCAGCACAGGGCCCTGGTGGTGGGGGAGCTGGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。