演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UXTART-27

ubiquitously expressed prefoldin like chaperone

UXT 是屬於 UXT family 的蛋白質,參與轉錄調控,並與多種蛋白質複合體及細胞訊號相關。

Homo sapiensXp11.23UniProt Q9UBK9
OFFICIAL SYMBOL
UXT
CHROMOSOME
X
UNIPROT
Q9UBK9
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UXT(ubiquitously expressed prefoldin like chaperone)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 UXT family。現有資料描述它參與基因轉錄調控,也出現在多種蛋白質複合體及分子互作中;這些資訊呈現其作為不同細胞活動參與者的基本性質。來源未提供其胺基酸長度或更詳細的蛋白質結構描述,因此不進一步推定其結構特徵。

Official symbol
UXT
Gene name
ubiquitously expressed prefoldin like chaperone
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12641
UniProt
Q9UBK9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ART-27STAP1SKP2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXp11.23
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegUXTpq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:47,651,792–47,659,301
Gene span
7,510 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000333119 ★47,651,796–47,659,1807
ENST0000033589047,651,792–47,659,1836
ENST0000093647847,651,792–47,659,1876
ENST0000093647947,651,792–47,659,1877
ENST0000093648047,651,792–47,659,1835
ENST0000093648147,651,792–47,659,1876
ENST0000097403147,651,792–47,659,1878
ENST0000107605047,651,792–47,659,1875
ENST0000109928347,651,792–47,659,1834
ENST0000109928547,651,792–47,659,1875
ENST0000109928647,651,792–47,659,1875
ENST0000113238047,651,792–47,659,1877

顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UXT 參與基因轉錄調控,其作用依不同轉錄因子與調控情境而異。它與共抑制因子 URI1 協同調節 Androgen receptor AR 媒介的轉錄;UXT 與 URI1 也會共同關聯至 NKX3-1 啟動子區域的染色質。對 estrogen receptor ESR1,UXT 則藉由促使其由細胞核移至細胞質,負向調節 ESR1 的轉錄活性。

在 NF-kappa-B 調控中,UXT 可能作為核內伴護蛋白,協助形成 NF-kappa-B enhanceosome,並因此正向調節 NF-kappa-B 的轉錄活性。相關互作資料指出,UXT 可在細胞核與 RELA 特異性互作,並形成動態複合體;受到刺激時,它會被招募至 NF-kappa-B enhanceosome。這些結果描述的是特定轉錄調控情境,並不表示 UXT 對所有轉錄活動具有相同方向的影響。

UXT 也參與 TNF 誘導的細胞凋亡調控。它在由 TRADD、TRAF2 與 RIPK1/RIP 組成的 apoptotic complex I 中,透過阻止 FADD 與 caspase 8 被招募,協助保護細胞免於 TNF 誘導的凋亡。

此外,UXT 是粒線體相關 LRPPRC 複合體的可能成分;該多結構域組織者被認為可能連結粒線體、微管細胞骨架與染色體重塑。來源指出,UXT 濃度增加與粒線體逐步聚集及細胞死亡有關,且可能透過 UXT 與 LRPPRC 的關聯發生。UXT 亦可抑制細胞轉化,可能藉由互作並抑制 MECOM 等促進細胞增殖與存活因子的生物活性;此處來源以可能性描述其作用方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 47659180 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UXT ENST00000333119 GRCh38 chrX:47659080-47660180 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAG
GAAGGGCTTAACTTGCTTGGGTTTTGAGCATTTGAAAAAAAAAACTTGCTTTTACATATGAAACACAAAT
TATCTGGGAAGACTTCCTTGGTAGGGGTGGGTGCTCTAGGCTCTACAGATGGAAATAGCATTTGGGGATT
CATCCCATGGTCTGGATTCTTCTCCAGGCAAAGGCCCATTCTTGCTGGGTTATAAGTTCTTGTTTGAAAA
TCTAACCTGAAAAATAAATTCACTCAGTCACTCTAGTGCATAAGAATAAATTCACAAAAACCTTACCATT
TAAATAAAAACATGGGAACTATGCCTAACTACAAGATGGCCAATCTTCGGCAGAGGACTTCAGCCACCCT
CTCCATTTGACTATCAAACGAGGTGATTAGACAGAGAGTGTTGTCAATTTCCACTTGAGCCTCACTTATG
GGTTGCGAGTGCAGAGCTGGAGTTATCAAAGATGAATTTTAGAAAACCTGTCTCTGTTTAAAACCTTTTA
AATGCTTATACTCAGTCCCATTGCCAGGAGTGAAATCCAAACCTCCCGTGTGAAAAATCAATATCCAGGC
CGACAGATCACACGGGATCTTCCTTATAGACCAGAACCATAGTCAATTTTTAGGTCCTTTTAAATATTAA
ACTCTTCACTTCCTCTACCTCCACCTGTGCGTCGCGCCTACCTTAGAACCCGCCAAATCCCATTAAATCC
CACCCCCACCAGCCACACACGGTCTCCATAGGCTCCAGGCGCCGCTTTTGCAGTCCCCCATTGGCCGGTT
TATTGCCAGACGGCCCCTGCTCGCACGCCCTAGTCTTCTTTGATCTCCTCGGATTCCGTGAAGCCCTGCC
CTTCTCTTCTCCCCTTTGGCCCGTCTTCTTCCACTCAGGCCCGCCCCTCCCCAACTGGCTATTTGGTTGG
CCAGCGCGCTTGCCACTTACGTCATTCACCCGCGCCACCCGGAAGCCGCGGTTCCTACCAACCGTTCTTA
TTGCTGGCGGCCTGAGGTAAAGGCCGCGCTTGGGTGTCCCTGGGTGGTCGG
UXT 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UXT_1 ↗X:47,659,137負股47,659,127–47,659,186

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_9NWQ6 · promoter · 47658601–47659101 · regulatory

ENSRX_74RN25 · promoter · 47659170–47659245 · regulatory

ENSRX_9NWQC · enhancer · 47659246–47659688 · regulatory

ENSRX_BCGDL · enhancer · 47662121–47662732 · regulatory

· motif · 47658327–47658338 · motif

· motif · 47658491–47658506 · motif

· motif · 47658498–47658511 · motif

· motif · 47658624–47658635 · motif

· motif · 47658624–47658635 · motif

· motif · 47658679–47658688 · motif

· motif · 47658719–47658734 · motif

· motif · 47658719–47658734 · motif

· motif · 47658736–47658747 · motif

· motif · 47658783–47658792 · motif

· motif · 47658783–47658792 · motif

· motif · 47658804–47658814 · motif

· motif · 47658826–47658834 · motif

· motif · 47658826–47658843 · motif

· motif · 47658914–47658924 · motif

· motif · 47658919–47658929 · motif

· motif · 47658938–47658948 · motif

· motif · 47659111–47659126 · motif

· motif · 47659154–47659163 · motif

· motif · 47659154–47659165 · motif

· motif · 47659174–47659187 · motif

· motif · 47659174–47659187 · motif

· motif · 47659218–47659228 · motif

· motif · 47659223–47659233 · motif

· motif · 47659348–47659358 · motif

· motif · 47659402–47659412 · motif

· motif · 47659404–47659414 · motif

· motif · 47659577–47659597 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:157 aa

UXT 的蛋白質家族歸屬為 UXT family。來源未提供可進一步描述的結構域、功能區域或序列註解,因此無法據此補充其蛋白質結構細節。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UBK9…

AlphaFold · Q9UBK9

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus;Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome;Cytoplasm, cytoskeleton, spindle pole

UXT 的定位與異構型相關:Isoform 1 記錄於細胞質,Isoform 2 記錄於細胞核。 另有資料指出 UXT 主要位於細胞核,並在有絲分裂期間定位至紡錘極;其定位亦記錄於細胞質及微管組織中心等區域。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 21 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ART-27UXTDYNLT1ESR1KRT31KRT40KRTAP1-3KRTAP10-7KRTAP10-8KRTAP12-3KRTAP5-7KRTAP5-9MECOMMPP1NOTCH2NLANOTCH2NLCPAK5PFDN2RELARPAP3SARM1SIAH1YBX3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UXT 可形成同源六聚體,並是參與多種蛋白質複合體生合成的 PAQosome 成分;PAQosome 包含 R2TP 與 URI complex 成員及其他蛋白質。另有實體互作對象包括 LRPPRC、Androgen receptor AR、estrogen receptor ESR1、RELA、MECOM 與 URI1。TNF 刺激形成的 complex I 中,UXT 經 TPQE motif 與 TRAF2 互作;這項互作可阻止 FADD 與 CASP8 被招募至該複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UXT 參與基因轉錄調控,並與 URI1 協同調節 Androgen receptor AR 媒介的轉錄,兩者也共同關聯至 NKX3-1 啟動子染色質。UXT 促使 ESR1 移至細胞質而負向調節其轉錄活性;它可能協助形成 NF-kappa-B enhanceosome 並正向調節其轉錄。UXT 可能是粒線體相關 LRPPRC 的成分;其濃度增加與粒線體聚集及細胞死亡相關,但此作用可能透過 LRPPRC 發生。UXT 也抑制細胞轉化,可能藉由抑制 MECOM 等促進增殖與存活的因子。含實驗來源
證據與來源

Involved in gene transcription regulation. Acts in concert with the corepressor URI1 to regulate androgen receptor AR-mediated transcription. Together with URI1, associates with chromatin to the NKX3-1 promoter region. Negatively regulates the transcriptional activity of the estrogen receptor ESR1 by inducing its translocation into the cytoplasm. May act as nuclear chaperone that facilitates the formation of the NF-kappa-B enhanceosome and thus positively regulates NF-kappa-B transcription activity. Potential component of mitochondrial-associated LRPPRC, a multidomain organizer that potentially integrates mitochondria and the microtubular cytoskeleton with chromosome remodeling. Increasing concentrations of UXT contributes to progressive aggregation of mitochondria and cell death potentially through its association with LRPPRC. Suppresses cell transformation and it might mediate this function by interaction and inhibition of the biological activity of cell proliferation and survival stimulatory factors like MECOM

PMID 11827465 ↗ · PMID 11854421 ↗ · PMID 16221885 ↗ · PMID 17554592 ↗ · PMID 17620405 ↗ · PMID 17635584 ↗ · PMID 21307340 ↗ · PMID 21730289 ↗ · PMID 28106301 ↗

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功能UXT 有助於保護細胞免於 TNF 誘導的凋亡。其作用是在由 TRADD、TRAF2 與 RIPK1/RIP 組成的 apoptotic complex I 中,阻止 FADD 與 caspase 8 被招募至該複合體;來源未提供其他實驗條件或量化結果。含實驗來源
證據與來源

Plays a role in protecting cells against TNF-induced apoptosis by preventing the recruitment of FADD and caspase 8 to the apoptotic complex I, composed of TRADD, TRAF2 and RIPK1/RIP

PMID 21307340 ↗

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交互作用UXT 可形成同源六聚體,並屬於參與多種蛋白質複合體生合成的 PAQosome;該複合體含 R2TP complex 與 URI complex 成員及其他蛋白質。UXT 也與 LRPPRC、Androgen receptor AR、ESR1、RELA、MECOM 及 URI1 互作;在細胞核中,它與 RELA 特異性互作,並可於刺激後被招募至 NF-kappa-B enhanceosome。含實驗來源
證據與來源

Homohexamer. Component of the PAQosome complex which is responsible for the biogenesis of several protein complexes and which consists of R2TP complex members RUVBL1, RUVBL2, RPAP3 and PIH1D1, URI complex members PFDN2, PFDN6, PDRG1, UXT and URI1 as well as ASDURF, POLR2E and DNAAF10/WDR92. Interacts with LRPPRC. Interacts with androgen receptor AR (via N-terminus). Interacts with estrogen receptor ESR1; the interaction relocalizes ESR1 from the nucleus to the cytoplasm. In the nucleus, interacts specifically with RELA (via RHD domain) and forms a dynamic complex with NF-kappa-B and is recruited to the NF-kappa-B enhanceosome upon stimulation. Interacts with MECOM. Interacts with URI1

PMID 11827465 ↗ · PMID 11854421 ↗ · PMID 16221885 ↗ · PMID 17554592 ↗ · PMID 17620405 ↗ · PMID 17635584 ↗ · PMID 21730289 ↗ · PMID 28106301 ↗ · PMID 31738558 ↗

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交互作用TNF 刺激會形成由 TNF receptor TNFRSF1A、TRADD、TRAF2 與 RIPK1 組成的 complex I。UXT 透過 TPQE motif 在此複合體中與 TRAF2 互作;該互作會阻止 FADD 與 CASP8/caspase 8 被招募至 complex I。含實驗來源
證據與來源

Part of complex I composed of TNF receptor TNFRSF1A, TRADD, TRAF2 and RIPK1 formed in response to TNF stimulation. Within the complex, interacts (via TPQE motif) with TRAF2; the interaction prevents the recruitment of FADD and CASP8/caspase 8 to complex I

PMID 21307340 ↗

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細胞定位UXT 的 Isoform 1 記錄定位於細胞質;此筆資料未提供其他定位條件或動態資訊。含實驗來源
證據與來源

Isoform 1; Cytoplasm

PMID 21307340 ↗

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細胞定位UXT 的 Isoform 2 記錄定位於細胞核;此筆資料未提供其他定位條件或動態資訊。含實驗來源
證據與來源

Isoform 2; Nucleus

PMID 33010352 ↗

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細胞定位UXT 記錄於細胞質、細胞核、微管組織中心及紡錘極等位置,並主要位於細胞核。另有資料指出,UXT 在有絲分裂期間會定位至紡錘極;這筆資料未描述造成定位變化的其他條件。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle pole; Predominantly localizes to the nucleus. Localizes to spindle pole during mitosis

PMID 21307340 ↗ · PMID 28106301 ↗ · PMID 11854421 ↗ · PMID 17620405 ↗ · PMID 16221885 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000333119 · 595 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTCATTCACCCGCGCCACCCGGAAGCCGCGGTTCCTACCA40
41ACCGTTCTTATTGCTGGCGGCCTGAGGAGCCCATCATGGC80
81GACGCCCCCTAAGCGGCGGGCGGTGGAGGCCACGGGGGAG120
121AAAGTGCTGCGCTACGAGACCTTCATCAGTGACGTGCTGC160
161AGCGGGACTTGCGAAAGGTGCTGGACCATCGAGACAAGGT200
201ATATGAGCAGCTGGCCAAATACCTTCAACTGAGAAATGTC240
241ATTGAGCGACTCCAGGAAGCTAAGCACTCGGAGTTATATA280
281TGCAGGTGGATTTGGGCTGTAACTTCTTCGTTGACACAGT320
321GGTCCCAGATACTTCACGCATCTATGTGGCCCTGGGATAT360
361GGTTTTTTCCTGGAGTTGACACTGGCAGAAGCTCTCAAGT400
401TCATTGATCGTAAGAGCTCTCTCCTCACAGAGCTCAGCAA440
441CAGCCTCACCAAGGACTCCATGAATATCAAAGCCCATATC480
481CACATGTTGCTAGAGGGGCTTAGAGAACTACAAGGCCTGC520
521AGAATTTCCCAGAGAAGCCTCACCATTGACTTCTTCCCCC560
561CATCCTCAGACATTAAAGAGCCTGAATGCCTTTGA595

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。