基因總覽
UXT(ubiquitously expressed prefoldin like chaperone)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 UXT family。現有資料描述它參與基因轉錄調控,也出現在多種蛋白質複合體及分子互作中;這些資訊呈現其作為不同細胞活動參與者的基本性質。來源未提供其胺基酸長度或更詳細的蛋白質結構描述,因此不進一步推定其結構特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000333119 ★ | 47,651,796–47,659,180 | 7 |
| ENST00000335890 | 47,651,792–47,659,183 | 6 |
| ENST00000936478 | 47,651,792–47,659,187 | 6 |
| ENST00000936479 | 47,651,792–47,659,187 | 7 |
| ENST00000936480 | 47,651,792–47,659,183 | 5 |
| ENST00000936481 | 47,651,792–47,659,187 | 6 |
| ENST00000974031 | 47,651,792–47,659,187 | 8 |
| ENST00001076050 | 47,651,792–47,659,187 | 5 |
| ENST00001099283 | 47,651,792–47,659,183 | 4 |
| ENST00001099285 | 47,651,792–47,659,187 | 5 |
| ENST00001099286 | 47,651,792–47,659,187 | 5 |
| ENST00001132380 | 47,651,792–47,659,187 | 7 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UXT 參與基因轉錄調控,其作用依不同轉錄因子與調控情境而異。它與共抑制因子 URI1 協同調節 Androgen receptor AR 媒介的轉錄;UXT 與 URI1 也會共同關聯至 NKX3-1 啟動子區域的染色質。對 estrogen receptor ESR1,UXT 則藉由促使其由細胞核移至細胞質,負向調節 ESR1 的轉錄活性。
在 NF-kappa-B 調控中,UXT 可能作為核內伴護蛋白,協助形成 NF-kappa-B enhanceosome,並因此正向調節 NF-kappa-B 的轉錄活性。相關互作資料指出,UXT 可在細胞核與 RELA 特異性互作,並形成動態複合體;受到刺激時,它會被招募至 NF-kappa-B enhanceosome。這些結果描述的是特定轉錄調控情境,並不表示 UXT 對所有轉錄活動具有相同方向的影響。
UXT 也參與 TNF 誘導的細胞凋亡調控。它在由 TRADD、TRAF2 與 RIPK1/RIP 組成的 apoptotic complex I 中,透過阻止 FADD 與 caspase 8 被招募,協助保護細胞免於 TNF 誘導的凋亡。
此外,UXT 是粒線體相關 LRPPRC 複合體的可能成分;該多結構域組織者被認為可能連結粒線體、微管細胞骨架與染色體重塑。來源指出,UXT 濃度增加與粒線體逐步聚集及細胞死亡有關,且可能透過 UXT 與 LRPPRC 的關聯發生。UXT 亦可抑制細胞轉化,可能藉由互作並抑制 MECOM 等促進細胞增殖與存活因子的生物活性;此處來源以可能性描述其作用方式。
Promoter 與基因調控
>UXT ENST00000333119 GRCh38 chrX:47659080-47660180 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAAAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAG GAAGGGCTTAACTTGCTTGGGTTTTGAGCATTTGAAAAAAAAAACTTGCTTTTACATATGAAACACAAAT TATCTGGGAAGACTTCCTTGGTAGGGGTGGGTGCTCTAGGCTCTACAGATGGAAATAGCATTTGGGGATT CATCCCATGGTCTGGATTCTTCTCCAGGCAAAGGCCCATTCTTGCTGGGTTATAAGTTCTTGTTTGAAAA TCTAACCTGAAAAATAAATTCACTCAGTCACTCTAGTGCATAAGAATAAATTCACAAAAACCTTACCATT TAAATAAAAACATGGGAACTATGCCTAACTACAAGATGGCCAATCTTCGGCAGAGGACTTCAGCCACCCT CTCCATTTGACTATCAAACGAGGTGATTAGACAGAGAGTGTTGTCAATTTCCACTTGAGCCTCACTTATG GGTTGCGAGTGCAGAGCTGGAGTTATCAAAGATGAATTTTAGAAAACCTGTCTCTGTTTAAAACCTTTTA AATGCTTATACTCAGTCCCATTGCCAGGAGTGAAATCCAAACCTCCCGTGTGAAAAATCAATATCCAGGC CGACAGATCACACGGGATCTTCCTTATAGACCAGAACCATAGTCAATTTTTAGGTCCTTTTAAATATTAA ACTCTTCACTTCCTCTACCTCCACCTGTGCGTCGCGCCTACCTTAGAACCCGCCAAATCCCATTAAATCC CACCCCCACCAGCCACACACGGTCTCCATAGGCTCCAGGCGCCGCTTTTGCAGTCCCCCATTGGCCGGTT TATTGCCAGACGGCCCCTGCTCGCACGCCCTAGTCTTCTTTGATCTCCTCGGATTCCGTGAAGCCCTGCC CTTCTCTTCTCCCCTTTGGCCCGTCTTCTTCCACTCAGGCCCGCCCCTCCCCAACTGGCTATTTGGTTGG CCAGCGCGCTTGCCACTTACGTCATTCACCCGCGCCACCCGGAAGCCGCGGTTCCTACCAACCGTTCTTA TTGCTGGCGGCCTGAGGTAAAGGCCGCGCTTGGGTGTCCCTGGGTGGTCGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UXT_1 ↗ | X:47,659,137 | 負股 | 47,659,127–47,659,186 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_9NWQ6 · promoter · 47658601–47659101 · regulatory
ENSRX_74RN25 · promoter · 47659170–47659245 · regulatory
ENSRX_9NWQC · enhancer · 47659246–47659688 · regulatory
ENSRX_BCGDL · enhancer · 47662121–47662732 · regulatory
· motif · 47658327–47658338 · motif
· motif · 47658491–47658506 · motif
· motif · 47658498–47658511 · motif
· motif · 47658624–47658635 · motif
· motif · 47658624–47658635 · motif
· motif · 47658679–47658688 · motif
· motif · 47658719–47658734 · motif
· motif · 47658719–47658734 · motif
· motif · 47658736–47658747 · motif
· motif · 47658783–47658792 · motif
· motif · 47658783–47658792 · motif
· motif · 47658804–47658814 · motif
· motif · 47658826–47658834 · motif
· motif · 47658826–47658843 · motif
· motif · 47658914–47658924 · motif
· motif · 47658919–47658929 · motif
· motif · 47658938–47658948 · motif
· motif · 47659111–47659126 · motif
· motif · 47659154–47659163 · motif
· motif · 47659154–47659165 · motif
· motif · 47659174–47659187 · motif
· motif · 47659174–47659187 · motif
· motif · 47659218–47659228 · motif
· motif · 47659223–47659233 · motif
· motif · 47659348–47659358 · motif
· motif · 47659402–47659412 · motif
· motif · 47659404–47659414 · motif
· motif · 47659577–47659597 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:157 aa
UXT 的蛋白質家族歸屬為 UXT family。來源未提供可進一步描述的結構域、功能區域或序列註解,因此無法據此補充其蛋白質結構細節。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UXT 的定位與異構型相關:Isoform 1 記錄於細胞質,Isoform 2 記錄於細胞核。 另有資料指出 UXT 主要位於細胞核,並在有絲分裂期間定位至紡錘極;其定位亦記錄於細胞質及微管組織中心等區域。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
- DYNLT1P63172 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ESR1P03372 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-3Q8IUG1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KRTAP12-3P60328 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KRTAP5-7Q6L8G8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP5-9P26371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MECOMQ03112 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MPP1Q00013 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOTCH2NLAQ7Z3S9 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- NOTCH2NLCP0DPK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PAK5Q9P286 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PFDN2Q9UHV9 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- RELAQ04206 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- RPAP3Q9H6T3 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- SARM1Q0D2N8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SIAH1Q8IUQ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YBX3P16989 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
UXT 可形成同源六聚體,並是參與多種蛋白質複合體生合成的 PAQosome 成分;PAQosome 包含 R2TP 與 URI complex 成員及其他蛋白質。另有實體互作對象包括 LRPPRC、Androgen receptor AR、estrogen receptor ESR1、RELA、MECOM 與 URI1。TNF 刺激形成的 complex I 中,UXT 經 TPQE motif 與 TRAF2 互作;這項互作可阻止 FADD 與 CASP8 被招募至該複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UXT 參與基因轉錄調控,並與 URI1 協同調節 Androgen receptor AR 媒介的轉錄,兩者也共同關聯至 NKX3-1 啟動子染色質。UXT 促使 ESR1 移至細胞質而負向調節其轉錄活性;它可能協助形成 NF-kappa-B enhanceosome 並正向調節其轉錄。UXT 可能是粒線體相關 LRPPRC 的成分;其濃度增加與粒線體聚集及細胞死亡相關,但此作用可能透過 LRPPRC 發生。UXT 也抑制細胞轉化,可能藉由抑制 MECOM 等促進增殖與存活的因子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in gene transcription regulation. Acts in concert with the corepressor URI1 to regulate androgen receptor AR-mediated transcription. Together with URI1, associates with chromatin to the NKX3-1 promoter region. Negatively regulates the transcriptional activity of the estrogen receptor ESR1 by inducing its translocation into the cytoplasm. May act as nuclear chaperone that facilitates the formation of the NF-kappa-B enhanceosome and thus positively regulates NF-kappa-B transcription activity. Potential component of mitochondrial-associated LRPPRC, a multidomain organizer that potentially integrates mitochondria and the microtubular cytoskeleton with chromosome remodeling. Increasing concentrations of UXT contributes to progressive aggregation of mitochondria and cell death potentially through its association with LRPPRC. Suppresses cell transformation and it might mediate this function by interaction and inhibition of the biological activity of cell proliferation and survival stimulatory factors like MECOM PMID 11827465 ↗ · PMID 11854421 ↗ · PMID 16221885 ↗ · PMID 17554592 ↗ · PMID 17620405 ↗ · PMID 17635584 ↗ · PMID 21307340 ↗ · PMID 21730289 ↗ · PMID 28106301 ↗ |
| 功能 | UXT 有助於保護細胞免於 TNF 誘導的凋亡。其作用是在由 TRADD、TRAF2 與 RIPK1/RIP 組成的 apoptotic complex I 中,阻止 FADD 與 caspase 8 被招募至該複合體;來源未提供其他實驗條件或量化結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays a role in protecting cells against TNF-induced apoptosis by preventing the recruitment of FADD and caspase 8 to the apoptotic complex I, composed of TRADD, TRAF2 and RIPK1/RIP PMID 21307340 ↗ |
| 交互作用 | UXT 可形成同源六聚體,並屬於參與多種蛋白質複合體生合成的 PAQosome;該複合體含 R2TP complex 與 URI complex 成員及其他蛋白質。UXT 也與 LRPPRC、Androgen receptor AR、ESR1、RELA、MECOM 及 URI1 互作;在細胞核中,它與 RELA 特異性互作,並可於刺激後被招募至 NF-kappa-B enhanceosome。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homohexamer. Component of the PAQosome complex which is responsible for the biogenesis of several protein complexes and which consists of R2TP complex members RUVBL1, RUVBL2, RPAP3 and PIH1D1, URI complex members PFDN2, PFDN6, PDRG1, UXT and URI1 as well as ASDURF, POLR2E and DNAAF10/WDR92. Interacts with LRPPRC. Interacts with androgen receptor AR (via N-terminus). Interacts with estrogen receptor ESR1; the interaction relocalizes ESR1 from the nucleus to the cytoplasm. In the nucleus, interacts specifically with RELA (via RHD domain) and forms a dynamic complex with NF-kappa-B and is recruited to the NF-kappa-B enhanceosome upon stimulation. Interacts with MECOM. Interacts with URI1 PMID 11827465 ↗ · PMID 11854421 ↗ · PMID 16221885 ↗ · PMID 17554592 ↗ · PMID 17620405 ↗ · PMID 17635584 ↗ · PMID 21730289 ↗ · PMID 28106301 ↗ · PMID 31738558 ↗ |
| 交互作用 | TNF 刺激會形成由 TNF receptor TNFRSF1A、TRADD、TRAF2 與 RIPK1 組成的 complex I。UXT 透過 TPQE motif 在此複合體中與 TRAF2 互作;該互作會阻止 FADD 與 CASP8/caspase 8 被招募至 complex I。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of complex I composed of TNF receptor TNFRSF1A, TRADD, TRAF2 and RIPK1 formed in response to TNF stimulation. Within the complex, interacts (via TPQE motif) with TRAF2; the interaction prevents the recruitment of FADD and CASP8/caspase 8 to complex I PMID 21307340 ↗ |
| 細胞定位 | UXT 的 Isoform 1 記錄定位於細胞質;此筆資料未提供其他定位條件或動態資訊。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | UXT 的 Isoform 2 記錄定位於細胞核;此筆資料未提供其他定位條件或動態資訊。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | UXT 記錄於細胞質、細胞核、微管組織中心及紡錘極等位置,並主要位於細胞核。另有資料指出,UXT 在有絲分裂期間會定位至紡錘極;這筆資料未描述造成定位變化的其他條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle pole; Predominantly localizes to the nucleus. Localizes to spindle pole during mitosis PMID 21307340 ↗ · PMID 28106301 ↗ · PMID 11854421 ↗ · PMID 17620405 ↗ · PMID 16221885 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTCATTCACCCGCGCCACCCGGAAGCCGCGGTTCCTACCA40ACCGTTCTTATTGCTGGCGGCCTGAGGAGCCCATCATGGC80GACGCCCCCTAAGCGGCGGGCGGTGGAGGCCACGGGGGAG120AAAGTGCTGCGCTACGAGACCTTCATCAGTGACGTGCTGC160AGCGGGACTTGCGAAAGGTGCTGGACCATCGAGACAAGGT200ATATGAGCAGCTGGCCAAATACCTTCAACTGAGAAATGTC240ATTGAGCGACTCCAGGAAGCTAAGCACTCGGAGTTATATA280TGCAGGTGGATTTGGGCTGTAACTTCTTCGTTGACACAGT320GGTCCCAGATACTTCACGCATCTATGTGGCCCTGGGATAT360GGTTTTTTCCTGGAGTTGACACTGGCAGAAGCTCTCAAGT400TCATTGATCGTAAGAGCTCTCTCCTCACAGAGCTCAGCAA440CAGCCTCACCAAGGACTCCATGAATATCAAAGCCCATATC480CACATGTTGCTAGAGGGGCTTAGAGAACTACAAGGCCTGC520AGAATTTCCCAGAGAAGCCTCACCATTGACTTCTTCCCCC560CATCCTCAGACATTAAAGAGCCTGAATGCCTTTGA595cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。