演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UTYKDM6AL

ubiquitously transcribed tetratricopeptide repeat containing, Y-linked

UTY 是位於 Y 染色體的蛋白質編碼基因,其產物可催化組蛋白 H3K27me3 去甲基化,但賴胺酸去甲基酶活性相對較低。

Homo sapiensYq11.221UniProt O14607
OFFICIAL SYMBOL
UTY
CHROMOSOME
Y
UNIPROT
O14607
PDB / ALPHAFOLD
3ZLI
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UTY(ubiquitously transcribed tetratricopeptide repeat containing, Y-linked)是位於 Y 染色體的蛋白質編碼基因,產物屬於 UTX family。其蛋白質長 1,347 個胺基酸,含有多個 TPR 重複序列與 JmjC 結構域,並具有數段註解為無序的區域。這些特徵構成 UTY 的基本分子架構;其組蛋白去甲基化作用及活性特性另見功能說明。

Official symbol
UTY
Gene name
ubiquitously transcribed tetratricopeptide repeat containing, Y-linked
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12638
UniProt
O14607
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KDM6ALKDM6C

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome YYq11.221
chrY · 57,227,415 bp · GRCh38chrYp11.32 · 1–300000 · gnegchrYp11.31 · 300001–600000 · gpos50chrYp11.2 · 600001–10300000 · gnegchrYp11.1 · 10300001–10400000 · acenchrYq11.1 · 10400001–10600000 · acenchrYq11.21 · 10600001–12400000 · gnegchrYq11.221 · 12400001–17100000 · gpos50chrYq11.222 · 17100001–19600000 · gnegchrYq11.223 · 19600001–23800000 · gpos50chrYq11.23 · 23800001–26600000 · gnegchrYq12 · 26600001–57227415 · gvarUTYpq1 bp57,227,415 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrY:13,234,577–13,480,673
Gene span
246,097 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000545955 ★13,248,385–13,480,03330
ENST0000033139713,248,379–13,480,67328
ENST0000038289613,248,381–13,480,67330
ENST0000101148913,248,381–13,480,67328
ENST0000094364413,248,385–13,480,67330
ENST0000094364313,248,389–13,480,67329
ENST0000092013213,248,434–13,480,67330
ENST0000092013413,248,434–13,480,67326
ENST0000092013313,248,468–13,480,67329
ENST0000068291313,249,856–13,479,66529
ENST0000053758013,249,856–13,479,66528
ENST0000053887813,249,856–13,479,66529

顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UTY 是男性特異性的組蛋白去甲基酶,可作用於組蛋白 H3 第 27 位賴胺酸上的三甲基化標記 H3K27me3,催化其去甲基化。來源指出,UTY 的賴胺酸去甲基酶活性相對較低,因此描述其功能時,需保留這項活性限制,不能將其概括為高活性的去甲基酶。

此反應使 H3K27me3 轉為相同位置的單甲基化賴胺酸。反應式中,三甲基化底物與 2-氧戊二酸及氧氣反應,生成單甲基化產物,並伴隨甲醛、琥珀酸與二氧化碳生成。這些產物與反應物說明了所列反應的化學計量;來源並未提供其他細胞情境或調控過程的細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 13480033 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UTY ENST00000545955 GRCh38 chrY:13479933-13481033 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAAACGTACAAAAGCAAGCTGTGCCCTGACCACCTTGGGCAAATGTATCATGGGTAAGTCTTGCAAAATA
AACTTTTTAAATTGACTAAGACCTCTCTCAGATATTTGGGGTTCAGAAATAAATTCTTTTACCTATTATT
TATAATTTTGGTTACAATTGAGAAAGTAAGAAAAAAGTGGTGTTTTTTTCTTTTCTAAGGGTTACTGCAT
CTTGAAAGTGTGATGAAGGTCTTAATTATTGTTCTTATAATTCCTGTCCACAGAAGCTCCTACTCTTACT
GAGACCTCACGGAATTATCATTATCACAATAGAAATAAACATTTTGGGTTTGTGGAGTAACTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTGCTCATCGTTTGTTGTTTAGATAATATCATGAACTGATAAATGCAGTTGCCACGTTG
ATTCCCTAGGGCCTGGCTTACCGACTGAGGTCATAAGATATTATGCCTTCTCTTTAGACTTGGTCAGTGG
AGAGGAAATGGGCAAAGAACCAGCCTATGGAGGTGACAAGGCCTTAGGGCCAAAAGTCTTGAGGGTGAAG
GTTTAGGGCCTGCGCAGCTTCCCTGCCATGCCCCGCAAGGTCTCGCATTCGCAAGGCTTGTGACAGTGGG
AGCCTCATTACGGACTCTCCTAAAGTCCATGGTGTCCTCTTTTCGCATTTGCGCCCCGTGGGTGATGCCC
GATGCCGCCCTTCCCATCGCTCTCTTCCCCTTCAAGCGTATCGCAACTGCAAAAACACCCAGCACAGACA
CTCCATTTTCTATCTTAATGCATTTAACTAGCACAACCTACAGGTTGTTCCATCCCAGAGACTACCCTTT
TCTCCATAGACGTGACCATCAACCAACCAGCGGTCAGAATCAGTCAGCCTCTGTCATGTTCCTAGGTCCT
TGGCGAACTGGCTGGGCGGGGTCCCAGCAGCCTAGGAGTACAGTGGAGCAATGCCTGACGTAAGTCAACA
AAGATCACGTGAGACGAATCAGTCGCCTAGATTGGCTACAACTAAGTGGTTGGGAGCGGGGAGGTCGCGG
CGGCTGCGTGGGGTTCGCCCGTGACACAATTACAACTTTGTGCTGGTGCTG
UTY 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRY_B4N82 · enhancer · 13478246–13478855 · regulatory

ENSRY_556L94 · CTCF_binding_site · 13479276–13479297 · regulatory

ENSRY_B4N88 · promoter · 13479655–13480523 · regulatory

· motif · 13478314–13478323 · motif

· motif · 13478314–13478323 · motif

· motif · 13478558–13478568 · motif

· motif · 13479278–13479294 · motif

· motif · 13479594–13479604 · motif

· motif · 13479657–13479672 · motif

· motif · 13479657–13479672 · motif

· motif · 13480041–13480050 · motif

· motif · 13480041–13480050 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1347 aa

1 aa1347 aa結構域功能區域重複區
依 O14607 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UTY 蛋白質長 1,347 個胺基酸,屬於 UTX family。序列中註解有 8 個 TPR 重複序列,分布於胺基酸位置 90–382;JmjC 結構域位於 1042–1205。另有四段區域被註解為無序,分別位於 571–621、633–689、757–819 與 990–1026。

重複區TPR 190–123 aa
重複區TPR 2127–160 aa
重複區TPR 3167–196 aa
重複區TPR 4202–235 aa
重複區TPR 5247–280 aa
重複區TPR 6281–314 aa
重複區TPR 7315–348 aa
重複區TPR 8349–382 aa
結構域JmjC1042–1205 aa
功能區域Disordered571–621 aa
功能區域Disordered633–689 aa
功能區域Disordered757–819 aa
功能區域Disordered990–1026 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3ZLI…

PDB · 3ZLI

X-ray · 1.80 A · A/B=878-1347

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

UTY 的細胞內定位記錄為細胞核;來源未提供定位改變的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KDM6ALUTY
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UTY 與 TLE1 及 TLE2 有交互作用。來源未進一步說明這些關係是否涉及特定複合體,亦未提供其結合方式或功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UTY 是男性特異性的組蛋白去甲基酶,可催化組蛋白 H3 第 27 位賴胺酸三甲基化標記 H3K27me3 去甲基化;其賴胺酸去甲基酶活性相對較低。含實驗來源
證據與來源

Male-specific histone demethylase that catalyzes trimethylated 'Lys-27' (H3K27me3) demethylation in histone H3. Has relatively low lysine demethylase activity

PMID 24798337 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysyl(27)-[histone H3] + 2 2-oxoglutarate + 2 O2 = N(6)-methyl-L-lysyl(27)-[histone H3] + 2 formaldehyde + 2 succinate + 2 CO2含實驗來源
證據與來源

N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysyl(27)-[histone H3] + 2 2-oxoglutarate + 2 O2 = N(6)-methyl-L-lysyl(27)-[histone H3] + 2 formaldehyde + 2 succinate + 2 CO2

PMID 24798337 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用UTY 與 TLE1 及 TLE2 有交互作用;來源未說明此交互作用的結合方式、所在複合體或功能後果。推論支持
證據與來源

Interacts with TLE1 and TLE2

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位UTY 的細胞內定位記錄為細胞核;此註記未提供定位變動條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000545955 · 6,174 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGTCGCCTAGATTGGCTACAACTAAGTGGTTGGGAGCGGG40
41GAGGTCGCGGCGGCTGCGTGGGGTTCGCCCGTGACACAAT80
81TACAACTTTGTGCTGGTGCTGGCAAAGTTTGTGATTTTAA120
121GAAATTCTGCTGTGCTCTCCAGCACTGCGAGCTTCTGCCT160
161TCCCTGTAGTTTCCCAGATGTGATCCAGGTAGCCGAGTTC200
201CGCTGCCCGTGCTTCGGTAGCTTAAGTCTTTGCCTCAGCT240
241TTTTTCCTTGCAGCCGCTGAGGAGGCGATAAAATTGGCGT280
281CACAGTCTCAAGCAGCGATTGAAGGCGTCTTTTCAACTAC320
321TCGATTAAGGTTGGGTATCGTCGTGGGACTTGGAAATTTG360
361TTGTTTCCATGAAATCCTGCGCAGTGTCGCTCACTACCGC400
401CGCTGTTGCCTTCGGTGATGAGGCAAAGAAAATGGCGGAA440
441GGAAAAGCGAGCCGCGAGAGTGAAGAGGAGTCTGTTAGCC480
481TGACAGTCGAGGAAAGGGAGGCGCTTGGTGGCATGGACAG520
521CCGTCTCTTCGGGTTCGTGAGGCTTCATGAAGATGGCGCC560
561AGAACGAAGACCCTACTAGGCAAGGCTGTTCGCTGCTACG600
601AATCTTTAATCTTAAAAGCTGAAGGAAAAGTGGAGTCTGA640
641CTTCTTTTGCCAATTAGGTCACTTCAACCTCTTGTTGGAA680
681GATTATTCAAAAGCATTATCTGCATATCAGAGATATTACA720
721GTTTACAGGCTGACTACTGGAAGAATGCTGCGTTTTTATA760
761TGGCCTTGGTTTGGTCTACTTCTACTACAATGCATTTCAT800
801TGGGCAATTAAAGCATTTCAAGATGTCCTTTATGTTGACC840
841CCAGCTTTTGTCGAGCCAAGGAAATTCATTTACGACTTGG880
881GCTCATGTTCAAAGTGAACACAGACTACAAGTCTAGTTTA920
921AAGCATTTTCAGTTAGCCTTGATTGACTGTAATCCATGTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。