基因總覽
urotensin 2 是由蛋白質編碼基因 UTS2 產生的蛋白質,屬於 urotensin-2 family。來源資料將其主要角色描述為強效血管收縮因子;目前提供的資訊未進一步說明其成熟形式或作用機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361696 ★ | 7,847,612–7,853,065 | 4 |
| ENST00000377516 | 7,843,008–7,853,512 | 7 |
| ENST00001145311 | 7,847,612–7,853,072 | 4 |
| ENST00000054668 | 7,847,766–7,853,431 | 5 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
urotensin 2 的來源註解指出,它具有強效血管收縮作用。現有資料未提供此作用所涉及的分子機制、作用條件或其他生物學過程,因此無法據此進一步描述。
Promoter 與基因調控
>UTS2 ENST00000361696 GRCh38 chr1:7852965-7854065 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCGAGACAGTGTTTCTCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAAATCCTAAACTCAAGTGATCCTCCTGCCTC GGCCTCTCAAAGTGCTGAAATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTATCTTTGTAACTTTTGTGTTT AGGTCCACAGAAAGTTTTGAGCAAAGAACTACCATGATCTGACTTATGCAGATGCTTCTGGCATCACTCT GCTGTGCTGAGCCTGTGGCAGGCCCGAAGGCAGACTTCAGGACGCCTGTCGGGGACCTTTCCACCCATCC GGGCTTGGACCAGCTTGGGCAGAGTACAGTTGGGAGTAGAGGCCACATTCTGGAAATGTTTATCAGCGAG TTTTCTGGTGTTAAGTCCTTCCTCCCTCCTTGCTGAATAATAATCAACTTTATGAAGTTATTTCCTTTCT CTGAAGATTGAAGTGCTTGCGGCTTCACATGAGGCCACGTGTATGTACAGAATTGTCTTGAGCCTGGAGC AATGTTTGCTATGTATTTTAACTTTTCACTGTTTTAAAGGAAATAGCTGGTTTTACGTTTTAATCCACAG ATTGTCATTCTTCAGGGATGGCAGCCCTAAACACAGCATGGCAACTCATCTACTCACTCATGAAAGATTA AAAAATGGAAACCAACGTATTTCATCTTATGCTCTGCGTCACTTCTGCTCGGACTCATAAATCCACGTCT CTTTGCTTTGGCCACTTCAACTCATATCCAAGCCTTCCTTTAATTCATGATTTATTGCTGTAAGTTGCCT CTTTTGCCAGATTTATAAACTCACTGTTCTTTATATAATACCTACTTTGTACACTAGGCAACAAGACAGT TAATTTATTGTCTATGACTTGTTACCTTGAAAAATTACATCAATGCAAAGTGATTGCCTTTTAGCCTCCA TAGCCAATAAATTCATTTTTTTTTTTTTTTTGGAGAGGATGATGTCAGGTCATAGGATGATATATATAAT CAGTGAGCAGGCAGAATGAGGAGACAGTTGAAAGTTCTCTACAACAGAAGCCAAGAAGGAAGCCGTCTAT CTTGTGGCGATCATGTATAAGCTGGCCTCCTGCTGTTTGCTTTTCATAGGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UTS2_2 ↗ | 1:7,853,065 | 負股 | 7,853,055–7,853,114 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_888DL · enhancer · 7856450–7856675 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:124 aa
urotensin 2 前體長 124 個胺基酸,屬於 urotensin-2 family。序列註解指出,其第 1 至第 20 位胺基酸為訊號胜肽區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源資料將 urotensin 2 註記為分泌型蛋白質;未提供分泌條件或不同形式的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GAGACAGTTGAAAGTTCTCTACAACAGAAGCCAAGAAGGA40AGCCGTCTATCTTGTGGCGATCATGTATAAGCTGGCCTCC80TGCTGTTTGCTTTTCATAGGATTCTTAAATCCTCTCTTAT120CTCTTCCTCTCCTTGACTCCAGGGAAATATCCTTTCAACT160CTCAGCACCTCATGAAGACGCGCGCTTAACTCCGGAGGAG200CTAGAAAGAGCTTCCCTTCTACAGATACTGCCAGAGATGC240TGGGTGCAGAAAGAGGGGATATTCTCAGGAAAGCAGACTC280AAGTACCAACATTTTTAACCCAAGAGGAAATTTGAGAAAG320TTTCAGGATTTCTCTGGACAAGATCCTAACATTTTACTGA360GTCATCTTTTGGCCAGAATCTGGAAACCATACAAGAAACG400TGAGACTCCTGATTGCTTCTGGAAATACTGTGTCTGAAGT440GAAATAAGCATCTGTTAGTCAGCTCAGAAACACCCATCTT480AGAATATGAAAAATAACACAATGCTTGATTTGAAAACAGT520GTGGAGAAAAACTAGGCAAACTACACCCTGTTCATTGTTA560CCTGGAAAATAAATCCTCTATGTTTTGCACA591cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。