演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UTRNDRP

utrophin

UTRN 編碼 utrophin,這種蛋白質可能參與將細胞骨架錨定於質膜。

Homo sapiens6q24.2UniProt P46939
OFFICIAL SYMBOL
UTRN
CHROMOSOME
6
UNIPROT
P46939
PDB / ALPHAFOLD
6M5G
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UTRN 是蛋白質編碼基因,其產物為 utrophin,亦稱 Dystrophin-related protein 1。utrophin 長 3,433 個胺基酸,具有多個 spectrin 重複區,並含有 Calponin-homology(CH)、WW 與退化型 ZZ zinc finger 結構域。來源將其主要角色概述為可能參與細胞骨架與質膜之間的錨定;此描述仍屬可能性,而非確定結論。

Official symbol
UTRN
Gene name
utrophin
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12635
UniProt
P46939
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DRPDRP1DMDL

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66q24.2
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegUTRNpq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr6:144,284,852–144,853,034
Gene span
568,183 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000367545 ★144,285,335–144,853,03475
ENST00001096443144,284,936–144,308,3563
ENST00001105757144,284,936–144,493,85733
ENST00001105758144,284,936–144,294,1082
ENST00001139250144,284,936–144,853,03475
ENST00001130592144,285,303–144,292,1872
ENST00000628146144,330,820–144,426,3586
ENST00000421035144,344,101–144,426,3286
ENST00000367524144,583,171–144,853,03424
ENST00000367526144,583,210–144,853,03425
ENST00000367525144,659,844–144,678,5522
ENST00000432686144,797,745–144,828,8556

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

utrophin 可能參與將細胞骨架錨定於質膜。現有資料僅以「可能」描述此角色,未進一步說明其作用機制、發生條件或對細胞活動的具體影響,因此不能據此將此功能視為已確立,也無法推論其參與其他特定生物學過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 144285335 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UTRN ENST00000367545 GRCh38 chr6:144284335-144285435 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACAGGAACACACGAGCAATGAAATGTGTAAATAAGAAAAATGCACACACATCACGAGCTCATTTCTTCC
CAGATATTTTTTGGTCAACCTCTCAAGCTTGGAACAGGCTCTATAACAGATGTGCGTTTGTGTGTGCATA
TTGGAAAACAGAAAAATAAGGTCAGCGCAAACACTACTTGTAATACAAACTAATGTAAGAGAAAACTTCT
TTTTCAATATTAACAACGACACTAGAGAAATAATGTAAAATAAATATACGGTTGGAACTAGGGGTAAAAA
AAAAATCAGCAACGTCAGCAAACTGAGATGGGGTGAGTTGGAAGGCAGATTGGAATTTATCTCTTAAAAA
AATATCACCCTAACTAGAGACCTGTTTTGCCTAAGGGGACGTGACTCACATTTTCGGATAATCTGAATAA
GGGGAATTGTGTCTGCTCGAGGCATCCATTCTGGTTCGGTCTCCGGACTCCCGGCTCCCGGCACGCACGG
TTCACTCTGGAGCGCGCGCCCCAGGCCAGCCAAGCGCCGAGCCGGGCTGCTGCGGGCTGGGAGGGCGCGC
AGGGCCGGCGCTGATTGACGGGGCGCGCAGTCAGGTGACTTGGGGCGCCAAGTTCCCGACGCGGTGGCCG
CGGTGACCGCCGAGGCCCGGCAGACGCTGACCCGGGAACGTAGTGGGGCTGATCTTCCGGAACAAAGTTG
CTGGGCCGGCGGCGGCGGGGCGAGAGCGCCGAGGGGGAGCCGGAGCGCTGCAGAGGCGCGGGCCGGAGGG
CTGGCGCTGATCTGCACCCTTCTCATCTGGAGAGCGGACCCCTGGCTGCCCGGAGGCGAGCCCCTTCCCG
GGGGGTGGGGGCGGCAACGCGCGACCCAGCGGTCCTGCGCCCCACCCTCCCTCCTCCGCCTCCAGCGCTC
GGCTCCAACAAAGGGGCAGGCCCGCAGCGGGGAGGAGGAGGAGGAGCCGCCGAAGGAGCGAGCCTCTCTC
GCGCACAAAGTTGTGGAGTCGTTTTTCCTCGGAGCAGGGAAGCGGGCAGCAGCAGCCGGCCGCGGGCTTT
CTCCCGCCGAGGGGCGAGGAGGAGCCTCTGGCTCCAGAAGCCGATTGGGGA
UTRN 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_B33M5G · enhancer · 144283882–144284821 · regulatory

ENSR6_B33M5K · promoter · 144284822–144285345 · regulatory

ENSR6_D969N · enhancer · 144285346–144287541 · regulatory

· motif · 144284628–144284639 · motif

· motif · 144284953–144284970 · motif

· motif · 144284959–144284976 · motif

· motif · 144286377–144286389 · motif

· motif · 144286380–144286387 · motif

· motif · 144286955–144286972 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:3433 aa

1 aa3433 aa結構域功能區域重複區鋅指
依 P46939 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

utrophin 長 3,433 個胺基酸。其 N 端含有 actin-binding 區域及兩個 Calponin-homology(CH)結構域;蛋白質中段排列有多個 spectrin 重複區,另含 WW 結構域與退化型 ZZ-type zinc finger。資料亦標示數段與 SYNM 互作的區域,以及兩段預測為無序的區域。

結構域Calponin-homology (CH) 131–135 aa
結構域Calponin-homology (CH) 2150–255 aa
重複區Spectrin 1312–416 aa
重複區Spectrin 2421–525 aa
重複區Spectrin 3532–636 aa
重複區Spectrin 4690–795 aa
重複區Spectrin 5801–901 aa
重複區Spectrin 6910–1012 aa
重複區Spectrin 71019–1121 aa
重複區Spectrin 81128–1229 aa
重複區Spectrin 91236–1333 aa
重複區Spectrin 101335–1436 aa
重複區Spectrin 111438–1540 aa
重複區Spectrin 121547–1648 aa
重複區Spectrin 131653–1747 aa
重複區Spectrin 141748–1848 aa
重複區Spectrin 151849–1968 aa
重複區Spectrin 161979–2080 aa
重複區Spectrin 172087–2186 aa
重複區Spectrin 182229–2332 aa
重複區Spectrin 192349–2439 aa
重複區Spectrin 202446–2555 aa
重複區Spectrin 212562–2687 aa
重複區Spectrin 222694–2796 aa
結構域WW2812–2845 aa
鋅指ZZ-type; degenerate3065–3121 aa
功能區域Actin-binding1–246 aa
功能區域Interaction with SYNM268–905 aa
功能區域Disordered284–303 aa
功能區域Interaction with SYNM1336–1768 aa
功能區域Interaction with SYNM2798–3165 aa
功能區域Disordered3357–3390 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6M5G…

PDB · 6M5G

EM · 3.60 A · F/G/H=1-261

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Postsynaptic cell membrane;Cytoplasm, cytoskeleton

utrophin 被標示位於突觸後細胞膜的周邊膜位置、細胞質側,也見於細胞質中的細胞骨架及神經肌肉接合處。 資料未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DRPUTRNDAG1DTNAPPP3CASNTB1SNTB2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

utrophin 可形成同源二聚體,並與 syntrophins SNTA1、SNTB1、SNTB2 及 SYNM 互作。它透過 WW 與 ZZ 結構域和 DAG1 互作;DAG1 一側涉及 betaDAG1 的 PPXY 基序,而該基序的酪胺酸磷酸化會抑制此互作。與 DTNB 及 PGM5 的互作屬 By similarity 證據。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能utrophin 可能參與將細胞骨架錨定於質膜。此敘述指出一項可能的連結作用,但未提供作用機制、實驗條件或其他功能細節,因此保留其推測性質。推論支持
證據與來源

May play a role in anchoring the cytoskeleton to the plasma membrane

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用utrophin 可形成同源二聚體,並與 SNTA1、SNTB1、SNTB2、SYNM 及 DAG1 互作;DAG1 的 PPXY 基序酪胺酸磷酸化會抑制其與 utrophin 的互作。utrophin 與 DTNB、PGM5 的互作則標示為 By similarity。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Interacts with the syntrophins SNTA1; SNTB1 and SNTB2. Interacts with SYNM. Interacts (via its WWW and ZZ domains) with DAG1 (via the PPXY motif of betaDAG1); the interaction is inhibited by the tyrosine phosphorylation of the PPXY motif of DAG1. Interacts with DTNB (By similarity). Interacts with PGM5 (By similarity)

PMID 10647184 ↗ · PMID 10767429 ↗ · PMID 10769203 ↗ · PMID 16777071 ↗ · PMID 7844150 ↗ · PMID 8576247 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位utrophin 被標示於突觸後細胞膜的周邊膜位置及細胞質側,也位於細胞質中的細胞骨架與神經肌肉接合處;這筆資料未說明定位變化條件或異構型差異。資料庫紀錄
證據與來源

Postsynaptic cell membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Cytoplasm, cytoskeleton; Neuromuscular junction

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000367545 · 12,918 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTTTTTCCTCGGAGCAGGGAAGCGGGCAGCAGCAGCCGGC40
41CGCGGGCTTTCTCCCGCCGAGGGGCGAGGAGGAGCCTCTG80
81GCTCCAGAAGCCGATTGGGGAATCACGGGGAGCGGCGCCC120
121CCCTTCTTTTGGGTCATTTCTGCAAACGGAAAACTCTGTA160
161GCGTTTGGCAAAGTTGGTGCCTGCGCGCCCCTTCCAGGTT200
201TGCGCTTTGACTGTTTTGTTTTTGGCGGAACTACCAGGCA240
241GGAAGATTGCACAAGTAAGGGGCGTTTTCAGTCGGGTGTC280
281AATTTCTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTAAAATTTCGGTTC320
321GTGTCTGCTTCTCCAAGCTTTATTTTTTTTTTTAAATACA360
361TCGCACCACCAAACTAACACTCGCACACACCCCCGCGGTT400
401ACTCCGTGTCAAACTCCTAGAGGAGCCCTTGGCCAGCTCG440
441GGGTGCGGCGGTGGCGACCGGCAGGCGAGGAGGCCCGCGG480
481GCAGCAGGTATTGATGTCAAGCTGAACCATCGTAGGAAGT520
521TGAAAGCCTTAGAAAGAGGACTTGGTAAAGTTTTTGGATT560
561ATCTTGAAACTCTGGCAAGATGGCCAAGTATGGAGAACAT600
601GAAGCCAGTCCTGACAATGGGCAGAACGAATTCAGTGATA640
641TCATTAAGTCCAGATCTGATGAACACAATGACGTACAGAA680
681GAAAACCTTTACCAAATGGATAAATGCTCGATTTTCAAAG720
721AGTGGGAAACCACCCATCAATGATATGTTCACAGACCTCA760
761AAGATGGAAGGAAGCTATTGGATCTTCTAGAAGGCCTCAC800
801AGGAACATCACTGCCAAAGGAACGTGGTTCCACAAGGGTA840
841CATGCCTTAAATAACGTCAACAGAGTGCTGCAGGTTTTAC880
881ATCAGAACAATGTGGAATTAGTGAATATAGGGGGAACTGA920
921CATTGTGGATGGAAATCACAAACTGACTTTGGGGTTACTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。