演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UTF1

undifferentiated embryonic cell transcription factor 1

UTF1(undifferentiated embryonic cell transcription factor 1)是蛋白質編碼基因,其產物可作為 ATF2 的轉錄共活化因子。

Homo sapiens10q26.3UniProt Q5T230
OFFICIAL SYMBOL
UTF1
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q5T230
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UTF1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 undifferentiated embryonic cell transcription factor 1。其蛋白質產物長 341 個胺基酸,序列中包含數段特徵不同的區域:N 端與中段有預測為無序的區域,靠近 C 端則有 leucine-zipper 區域。已知的功能描述指出,UTF1 可協助 ATF2 的轉錄活性;與 ATF2 的結合及和 TFIID 複合體的關聯,提供了認識其分子角色的線索。

Official symbol
UTF1
Gene name
undifferentiated embryonic cell transcription factor 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12634
UniProt
Q5T230
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q26.3
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegUTF1pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr10:133,229,352–133,231,558
Gene span
2,207 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000304477 ★133,230,217–133,231,5582
ENST00001135696133,229,352–133,231,5582

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UTF1 的已知功能之一,是作為 ATF2 的轉錄共活化因子。這表示 UTF1 與 ATF2 的關係涉及轉錄調控中的協同作用,UTF1 扮演協助 ATF2 的角色;現有資料未進一步說明其作用於哪些特定基因、如何改變轉錄量,或此作用發生的細胞條件,因此不宜延伸推定其調控範圍或結果。

UTF1 會結合 ATF2 的 N 端區域,這項結合關係與其作為 ATF2 共活化因子的功能相呼應。不過,資料僅指出結合區域與功能角色,並未提供更詳細的分子機制,也未說明結合是否需要特定刺激或其他分子參與。

UTF1 也透過與 TBP 的交互作用,與 TFIID 複合體建立關聯。這項資訊顯示 UTF1 除了與 ATF2 互動,也能與轉錄相關複合體建立聯繫;但現有描述未明確交代此關聯如何影響 ATF2 的共活化作用,亦未指出 UTF1 是否直接成為 TFIID 複合體的組成部分。就目前資料而言,可確認的是其共活化角色、對 ATF2 N 端的結合,以及透過 TBP 與 TFIID 的關聯,尚不足以推論更廣泛的生物學作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 133230217 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UTF1 ENST00000304477 GRCh38 chr10:133229217-133230317 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGAAGAATCCCAGAAAATACAGACACCCCTCCAGGAGGTGGGGCCTAATTACTCTCCCCATGAGTTGGG
GATGGGCTGAGGGGCCGGATTCCAGTGACCAGAGCAGGGATGGAAAGGCGATACCTGAAGACTGCAAGAG
TGGCAGACAGTCCGCACCCCAGCACGGAGCAGACCTCACCGGTGCTGAGCCACAAGACAGGAGGGGCGAG
ACTCCACCCCTGCGCCTTCCTTCCTAAAACCCACCACCCTAGTCGGATCACAGGAAGACACCAGGCAAAC
CCAAGTCGAGGAACATTCAACAAAACACCTGGCCCGTCCTCAACCGTGTCGAGGACGCGAGAAGCTGCCA
CGGCCCAGAGGAGACCCAGGAGACAGAAGGACTCGGCGCCGTGCGGCAAGGAGGAAGAGCATTTAATAGG
AAGAGAATTTCCTCCTCCCAGGGATGCTGGCTGCAGACGCGCTGCAGATGGAAGAAGTTCAGATTTTAAA
AGCTACTTCTGCGAGCGCGTGAATTCCGACACCCATTCCCGCGGCTGGCGTGGCTTCTCCTCGGACCCAT
CCCCTGGCCTGGCGACTCCCCCTGGGACCCGGGTCGGTCCTCCGGACCCCTCGCGTGCAGGTGCTGAGCC
CGGGCGGGGGCGGCGGGGGCGGGGGCAGCACTGGGGGCCGGACAAGGGGGCGCCAGCGCCTTCCGGAGCG
GGAGGGGCTCCGCACACACCTCGACGGGGGCGGGGGTAGGCTCGGCACAGGCTAAAAACGAGCGGAGCCG
CCGGGGCTTAGGCATCGCGGCACCTCCGTTGAACGGGTCTAAGAACAGAACTCCTGAGGACCCTCCGTTT
CCAACCGAAGCCAGTCTTTGCTCTGCGTCTTCCCGGCCGCAGCGCCAGGACCGACCCCTTAGGACCCGGC
GGGCGGGGCGGGGCGCGCGGGGCGGGGCGGGGATGGTGGGAGGGTCGCGTAGACCCGGCTGGGACGGAGG
GACGGCGGCGCGGGATGCTCAGAACGCGTGTGGGCGGCCCGGGCGGCGTCTGGCCCTCTCCCCATCCTCG
CGCGCCGCGCCCCAGCCCCGGGATGCTGCTCCGGCCCCGCAGGCCGCCCCC
UTF1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UTF1_1 ↗10:133,230,217正股133,230,168–133,230,227

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_536C435 · CTCF_binding_site · 133226443–133226464 · regulatory

ENSR10_93XTQC · enhancer · 133226487–133226753 · regulatory

ENSR10_536C43P · CTCF_binding_site · 133226570–133226591 · regulatory

ENSR10_93XTR8 · enhancer · 133229369–133229799 · regulatory

ENSR10_93XTRC · promoter · 133229903–133230227 · regulatory

· motif · 133225211–133225217 · motif

· motif · 133226445–133226461 · motif

· motif · 133226572–133226588 · motif

· motif · 133230577–133230593 · motif

· motif · 133230577–133230593 · motif

· motif · 133231330–133231339 · motif

· motif · 133231330–133231339 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:341 aa

1 aa341 aa功能區域
依 Q5T230 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UTF1 蛋白質長 341 個胺基酸。第 1–62 位及第 146–273 位各有一段註記為無序的區域;第 279–310 位則是 leucine-zipper 區域。這些序列特徵描述其蛋白質區段,資料未提供更進一步的結構或功能細節。

功能區域Disordered1–62 aa
功能區域Disordered146–273 aa
功能區域Leucine-zipper279–310 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q5T230…

AlphaFold · Q5T230

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

UTF1 的定位註記為細胞核。 來源未提供定位變化的條件、不同異構型之間的差異,或定位動態的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UTF1UTF1TRIP10
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UTF1 會結合 ATF2 的 N 端區域;此外,它透過與 TBP 交互作用而與 TFIID 複合體相關聯。資料指出的是前者的區域性結合,以及後者經由 TBP 建立的複合體關聯,未說明 UTF1 是否為 TFIID 的直接組成亞基。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UTF1 可作為 ATF2 的轉錄共活化因子,協助其參與轉錄調控。此描述支持 UTF1 與 ATF2 之間具有共活化功能關係,但未提供作用條件、特定靶基因或轉錄結果的細節。含實驗來源
證據與來源

Acts as a transcriptional coactivator of ATF2

PMID 9748258 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用UTF1 會結合 ATF2 的 N 端區域,並透過與 TBP 交互作用而與 TFIID 複合體相關聯。這筆資料分別指出 UTF1 與 ATF2 的結合位置,以及經 TBP 建立的複合體關聯,未說明 UTF1 是否為 TFIID 的直接組成部分。含實驗來源
證據與來源

Binds to the N-terminal region of ATF2. Associates with the TFIID complex through interaction with TBP

PMID 9748258 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位UTF1 的細胞內定位註記為細胞核;此資料未提供定位變化條件或其他定位細節。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000304477 · 1,214 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGAACGCGTGTGGGCGGCCCGGGCGGCGTCTGGCCCTCTC40
41CCCATCCTCGCGCGCCGCGCCCCAGCCCCGGGATGCTGCT80
81CCGGCCCCGCAGGCCGCCCCCGCTCGCGCCCCCCGCGCCG120
121CCCTCGCCCGCCAGCCCCGACCCCGAGCCGCGGACACCCG160
161GAGACGCCCCGGGGACCCCGCCCCGGAGGCCCGCCTCGCC200
201CAGCGCGCTGGGGGAACTCGGGTTGCCGGTGTCCCCGGGC240
241TCGGCGCAGCGCACGCCCTGGAGCGCCCGGGAGACGGAGC280
281TGCTGCTGGGGACGCTGCTGCAACCGGCCGTGTGGCGCGC320
321GCTGCTCCTGGACCGCCGCCAGGCCCTGCCCACCTACCGC360
361CGCGTGTCGGCCGCGCTGGCCCAGCAGCAGGTGCGCCGCA400
401CCCCCGCGCAGTGCCGCCGCCGCTACAAGTTCCTTAAAGA440
441CAAGTTTCGCGAGGCGCACGGCCAGCCGCCCGGGCCCTTC480
481GACGAGCAGATCCGGAAGCTCATGGGGCTGCTGGGCGACA520
521ACGGGCGCAAACGGCCTCGCCGCCGCTCCCCGGGGTCCGG560
561GCGCCCCCAGCGCGCCCGCCGCCCGGTCCCCAACGCGCAC600
601GCGCCGGCTCCCAGCGAACCAGACGCCACCCCGCTGCCCA640
641CCGCCCGCGACCGCGACGCGGACCCCACCTGGACGCTCCG680
681CTTCAGCCCGTCCCCACCGAAGTCTGCGGACGCCTCCCCC720
721GCCCCCGGCTCCCCGCCAGCTCCCGCCCCGACCGCCCTCG760
761CCACCTGCATCCCCGAGGACCGCGCGCCCGTCCGCGGCCC800
801CGGGTCCCCGCCGCCACCCCCGGCCCGCGAAGACCCCGAC840
841TCGCCGCCCGGCCGCCCCGAGGACTGCGCGCCCCCTCCGG880
881CCGCGCCCCCGTCGCTGAACACCGCCCTGCTGCAGACCCT920
921GGGGCACCTGGGCGACATCGCGAACATCCTGGGCCCGCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。