演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

USP7HAUSP

ubiquitin specific peptidase 7

USP7 是一種去泛素化酵素,可移除目標蛋白上的泛素,並參與蛋白質穩定性、DNA 修復與轉錄調節等多種細胞過程。

Homo sapiens16p13.2UniProt Q93009
OFFICIAL SYMBOL
USP7
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q93009
PDB / ALPHAFOLD
9K2W
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ubiquitin specific peptidase 7(USP7)是由 USP7 基因編碼的蛋白質,屬於 peptidase C19 家族。其主要分子性質是能辨識並水解蛋白質與泛素之間的鍵結,因此可調整多種細胞蛋白質所帶有的泛素標記。USP7 具有 MATH 與 USP 結構域;前者涉及與多種蛋白質的互作,後者構成其催化區域。它的作用對象涵蓋轉錄調節、DNA 修復、染色質調控及訊號相關蛋白,顯示其功能並非侷限於單一細胞途徑。

Official symbol
USP7
Gene name
ubiquitin specific peptidase 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12630
UniProt
Q93009
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HAUSP

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.2
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegUSP7pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:8,892,094–8,975,328
Gene span
83,235 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000344836 ★8,892,097–8,963,90631
ENST000006737048,892,097–8,975,32831
ENST000003818868,892,097–8,936,72931
ENST000009230788,892,097–8,963,97231
ENST000009230798,892,097–8,963,96731
ENST000009230808,892,097–8,963,94030
ENST000009230818,892,097–8,963,92431
ENST000009230828,892,097–8,963,60331
ENST000009695238,892,097–8,963,92930
ENST000005630858,895,045–8,956,38029
ENST000005660048,920,405–8,956,3805
ENST000005692308,920,443–8,964,5145

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

USP7 是硫醇依賴型水解酵素,可切斷泛素 C 端甘胺酸參與形成的酯、硫酯、醯胺、胜肽及異胜肽鍵。藉由移除目標蛋白上的泛素,USP7 能改變其穩定性;它對 Lys-48 連結的泛素鏈具有偏好。多種目標包括 p53/TP53、MDM2、FOXO4、PTEN、DNMT1、UHRF1、ERCC6、KMT2E/MLL5、FOXP3、REST、CRY1、CRY2、SIRT7 與 DEPTOR,但不同目標所產生的生物學結果並不相同。

在 p53/TP53 調控中,USP7 可去泛素化 p53/TP53,減少其降解,並促進 p53/TP53 依賴的轉錄調節、細胞生長抑制與細胞凋亡;但與 DAXX 協同時,USP7 也能抑制 MDM2 的自我泛素化並增強其對 p53/TP53 的 E3 連接酶活性,促使 p53/TP53 泛素化及蛋白酶體降解。因此,USP7 對這組蛋白的作用方向會依作用對象與相關複合體而異。過氧化氫存在時,USP7 去泛素化 FOXO4 的作用不依賴 p53/TP53,並抑制 FOXO4 誘導的轉錄活性。

USP7 也參與基因組維護。紫外線損傷後,它受 KIAA1530/UVSSA 招募至 DNA 損傷處,去泛素化 ERCC6,避免 ERCC6 因紫外線而降解,參與轉錄偶聯核苷酸切除修復。與 UHRF1 及 DNMT1 的作用則可避免這些蛋白降解,並支持 DNMT1 進行 DNA 甲基化維持。對烷基化 DNA 損傷的修復,USP7 可去泛素化 ALKBH3;OTUD4 招募 USP7 與 USP9X 以穩定 ALKBH3,進而促進相關修復。

在其他細胞功能中,USP7 去泛素化並穩定 FOXP3,有助於調節性 T 細胞的抑制能力;穩定 CRY1 與 CRY2,參與維持晝夜節律週期;穩定 REST,支持神經前驅細胞維持。它也透過去泛素化 TRIM27 與 WASHC1,調節 WASH 複合體活性、肌動蛋白聚合及胞內體蛋白回收。對磷酸化 DEPTOR 的去泛素化會促進其穩定,並降低 mTORC1 訊號。USP7 與 PRC1-like 複合體相關,可能藉由去泛素化其組成成分參與染色質調控;雖可去泛素化組蛋白 H2B,但此作用是否在體內發生尚不確定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 8963906 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>USP7 ENST00000344836 GRCh38 chr16:8963806-8964906 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCCCCGGGTGAATGATCCCAGACTGGGTTGATAGGAAGGAAGTAAATTAATACCAAATGTGAAGGGTAG
TGGGCTTGTTTTATTTTTATATTATTATTTTATTATCACTATTAGTTGAGACAGGGTCTCATTCTGTTGC
CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTTTGATCACTGCAGCCTCAGTCAACCTCCCAAGCGAACCTCCAG
CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGTCACTACAGGCAGGAGGCACAACACCCGGCTAATTAAAAATACATTTCA
AAAATATAAAAACAAAACCCAAAACCTTTGTAGAGAGGGTGGTCTCTTACTCTTGGCCTCAAGTGATTCT
CCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATCACAGGTGTGAGCAGCTGCGCCCCGCCTGGGGTTGCTCTTG
AGGAGCCAAACTTTGCCAGATTAGGCTGACAGTGAGAAAATAAATTCTTCCACGGTAGATACTGGGTGAA
AAAGTGCACGTCAGCGGGCAAGGGTAAGTAACGACAATAACAGGAACTTCTAGGCGCTGACCCCAAGCTC
CCTTCCGGGCCCTATCCCGAGCAGTCCCCGGGCAACCTCCAGCGCTCGCCCCGGCGCGCTAGGCTGGGAC
CTGAACCCCGGCTGCCGGGTGGCTTCTGGGCCCCTCCTCATTGCCGCTCCTGGGTCTTTCGGGGTGTCCG
GCTCCCCAGGATGGGAAGGATTCCGGTTCACCTCCGCAGGGCTAAGTCACCGGGCGGCCCGCCTCGGCCC
CCAGGGCCCGGGGGCAGGGAGCGCCGAGGGTCCGCCGCGGGGCTGCGGCGCAGGCGGTGCCGGGGCGCGG
CGCTGCGGGGCAGGCGGGCCTCGGCGGCGGCGGCAGGCGGGTCGCTCCCTGCTCCGCCTCCCGTGCTCCG
CCCTGCGCTCCCGCTCCGCCCTCCGGCTCGGCGCCCGCCCGCTTGCTCTCCTCGCTCGCTCGCTCGCTCC
GCGGCCCCCCATGCGGATGTGACATTTCACGCCGCCGCCATTTTGAGAGCGAGCCGAGCCGAGCTGCCGG
GCGCCGCGTCCGCTGCCGGAGCCCCGACGACGACGCCGAGGAGGCGGAGGC
USP7 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
USP7_2 ↗16:8,936,639負股8,936,629–8,936,688
USP7_1 ↗16:8,963,456負股8,963,446–8,963,505

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_B3R24 · enhancer · 8958117–8959109 · regulatory

ENSR16_CW26 · enhancer · 8959705–8960962 · regulatory

ENSR16_95K39 · promoter · 8962117–8962617 · regulatory

ENSR16_CW2D · enhancer · 8962618–8963895 · regulatory

ENSR16_95K3R · promoter · 8963896–8964396 · regulatory

ENSR16_544X63 · CTCF_binding_site · 8964653–8964674 · regulatory

ENSR16_95K4D · enhancer · 8966002–8966458 · regulatory

ENSR16_B3R3C · enhancer · 8966856–8967618 · regulatory

· motif · 8959936–8959950 · motif

· motif · 8959942–8959956 · motif

· motif · 8960405–8960420 · motif

· motif · 8961613–8961628 · motif

· motif · 8962417–8962432 · motif

· motif · 8962544–8962553 · motif

· motif · 8962600–8962609 · motif

· motif · 8962782–8962791 · motif

· motif · 8962811–8962818 · motif

· motif · 8962902–8962911 · motif

· motif · 8963115–8963125 · motif

· motif · 8963884–8963894 · motif

· motif · 8963906–8963917 · motif

· motif · 8964338–8964347 · motif

· motif · 8964353–8964360 · motif

· motif · 8964655–8964671 · motif

· motif · 8966182–8966195 · motif

· motif · 8966182–8966195 · motif

· motif · 8967801–8967807 · motif

USP7 在調節性 T 細胞(Treg)中表現上調;在神經前驅細胞分化期間則表現下調。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1102 aa

1 aa1102 aa結構域功能區域
依 Q93009 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

USP7 蛋白長 1102 個胺基酸,屬於 peptidase C19 家族。其 MATH 結構域位於胺基酸 68–195,USP 結構域位於 214–521;胺基酸 1–38 為無序區。胺基酸 70–205 區域與核定位所需區段相關;胺基酸 1–208 區域涉及與 TSPYL5 的互作,而 53–208 區域涉及與 p53/TP53、MDM2 及 EBNA1 的互作。與 ICP0/VMW110 的互作區域位於胺基酸 622–801。

結構域MATH68–195 aa
結構域USP214–521 aa
功能區域Interaction with TSPYL51–208 aa
功能區域Disordered1–38 aa
功能區域Interaction with p53/TP53, MDM2 and EBNA153–208 aa
功能區域Necessary for nuclear localization70–205 aa
功能區域Interaction with ICP0/VMW110622–801 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9K2W…

PDB · 9K2W

EM · 3.54 A · A=1-1102

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm;Nucleus, PML body;Chromosome

USP7 可見於細胞核、細胞質、染色體及 PML 核小體,且只存在於一部分 ND10 核小體。 感染早期與 ICP0/VMW110 結合時,含 USP7 的 ND10 比例增加;FAM170A 互作則被報告可促進 USP7 移入細胞核。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 31 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HAUSPUSP7ANKS1ABCORBMI1CBX8CHEK2DAXXMAGEE1MAGEL2MALMDM2MDM4MEX3CMYD88NPM1PCGF2PEG3PTENRB1RING1RNF2SMAD3SOX2TBCBTP53TRIM27TSPYL5ZNF76EBNA1KIE-2Mdm4vIRF-4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 31 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

USP7 可形成同源二聚體,也可與 DAXX、MDM2 等共同出現在複合體中;它與 DAXX 的直接互作不依賴 MDM2 或 p53/TP53。USP7 還與 KMT2E/MLL5 isoform 3 及 OGT isoform 1 組成複合體,該複合體可穩定 KMT2E/MLL5。其他直接互作包括 PTEN、ABRAXAS2、OTUD4、MAGEL2 與 TRIM27。與 FOXO4 的互作在過氧化氫存在時增強;與 p53/TP53 的互作則在 DNA 損傷反應中增強。感染相關互作包括 USP7 與 herpesvirus 1 ICP0/VMW110,以及 Epstein-Barr virus EBNA1;後者與 USP7、CSNK2B 形成三元複合體,且 EBNA1 對 USP7 的親和力為 p53/TP53 的 10 倍,能與其競爭結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

USP7 基因變異與 Hao-Fountain syndrome(HAFOUS)相關,該症候群為體染色體顯性神經發育疾病。患者可有全面性發展遲緩、程度不一的智能障礙、自閉症類群障礙、言語能力不佳或缺乏,以及輕微顏面特徵;多數患者會發生癲癇。其他可能表現包括肌張力低下、男性性腺功能低下及眼部異常。來源指出此疾病由影響 USP7 基因的變異造成。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

13 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 13 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能USP7 是水解酵素,可去除多種目標蛋白上的泛素,作用對象包括 p53/TP53、MDM2、FOXO4、PTEN、ERCC6、DNMT1、UHRF1、KMT2E/MLL5、DAXX、FOXP3、REST、CRY1/2、SIRT7、DEPTOR 及其他蛋白。其影響依底物而異:可能改變蛋白穩定性、轉錄或細胞訊號;部分機制涉及 DNA 修復、DNA 甲基化、細胞生長、調節性 T 細胞功能及胞內體蛋白回收。USP7 偏好 Lys-48 連結泛素鏈;其對組蛋白 H2B 的去泛素化是否在體內發生仍不確定。含實驗來源
證據與來源

Hydrolase that deubiquitinates target proteins such as ARMC5, FOXO4, DEPTOR, KAT5, p53/TP53, MDM2, ERCC6, DNMT1, UHRF1, PTEN, KMT2E/MLL5 and DAXX. Together with DAXX, prevents MDM2 self-ubiquitination and enhances the E3 ligase activity of MDM2 towards p53/TP53, thereby promoting p53/TP53 ubiquitination and proteasomal degradation. Deubiquitinates p53/TP53, preventing degradation of p53/TP53, and enhances p53/TP53-dependent transcription regulation, cell growth repression and apoptosis. Deubiquitinates p53/TP53 and MDM2 and strongly stabilizes p53/TP53 even in the presence of excess MDM2, and also induces p53/TP53-dependent cell growth repression and apoptosis. Deubiquitination of FOXO4 in presence of hydrogen peroxide is not dependent on p53/TP53 and inhibits FOXO4-induced transcriptional activity. In association with DAXX, is involved in the deubiquitination and translocation of PTEN from the nucleus to the cytoplasm, both processes that are counteracted by PML. Deubiquitinates KMT2E/MLL5 preventing KMT2E/MLL5 proteasomal-mediated degradation. Involved in cell proliferation during early embryonic development. Involved in transcription-coupled nucleotide excision repair (TC-NER) in response to UV damage: recruited to DNA damage sites following interaction with KIAA1530/UVSSA and promotes deubiquitination of ERCC6, preventing UV-induced degradation of ERCC6. Involved in maintenance of DNA methylation via its interaction with UHRF1 and DNMT1: acts by mediating deubiquitination of UHRF1 and DNMT1, preventing their degradation and promoting DNA methylation by DNMT1. Deubiquitinates alkylation repair enzyme ALKBH3. OTUD4 recruits USP7 and USP9X to stabilize ALKBH3, thereby promoting the repair of alkylated DNA lesions. Acts as a chromatin regulator via its association with the Polycomb group (PcG) multiprotein PRC1-like complex; may act by deubiquitinating components of the PRC1-like complex. Able to mediate deubiquitination of histone H2B; it is however unsure whether this activity takes place in vivo. Exhibits a preference towards 'Lys-48'-linked ubiquitin chains. Increases regulatory T-cells (Treg) suppressive capacity by deubiquitinating and stabilizing the transcription factor FOXP3 which is crucial for Treg cell function. Plays a role in the maintenance of the circadian clock periodicity via deubiquitination and stabilization of the CRY1 and CRY2 proteins. Deubiquitinates REST, thereby stabilizing REST and promoting the maintenance of neural progenitor cells. Deubiquitinates SIRT7, inhibiting SIRT7 histone deacetylase activity and regulating gluconeogenesis. Involved in the regulation of WASH-dependent actin polymerization at the surface of endosomes and the regulation of endosomal protein recycling. It maintains optimal WASH complex activity and precise F-actin levels via deubiquitination of TRIM27 and WASHC1. Mediates the deubiquitination of phosphorylated DEPTOR, promoting its stability and leading to decreased mTORC1 signaling. Deubiquitinates H2AB1, H2BC4 and H2BC22 (By similarity)

PMID 11923872 ↗ · PMID 15053880 ↗ · PMID 16845383 ↗ · PMID 16964248 ↗ · PMID 18566590 ↗ · PMID 18716620 ↗ · PMID 20153724 ↗ · PMID 20601937 ↗ · PMID 21258371 ↗ · PMID 21745816 ↗ · PMID 22411829 ↗ · PMID 22466611 ↗ · PMID 22466612 ↗ · PMID 22689415 ↗ · PMID 23973222 ↗ · PMID 25283148 ↗ · PMID 25865756 ↗ · PMID 25944111 ↗ · PMID 26365382 ↗ · PMID 26678539 ↗ · PMID 26786098 ↗ · PMID 27123980 ↗ · PMID 28655758 ↗ · PMID 33544460 ↗ · PMID 35216969 ↗

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功能在 HSV-1 感染期間,USP7 有助於 herpesvirus 1 轉錄活化蛋白 ICP0/VMW110 的整體穩定性及反式活化能力。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Contributes to the overall stabilization and trans-activation capability of the herpesvirus 1 trans-acting transcriptional protein ICP0/VMW110 during HSV-1 infection

PMID 14506283 ↗ · PMID 16160161 ↗ · PMID 18590780 ↗

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功能Epstein-Barr virus 感染時,病毒蛋白 EBNA1 與 USP7 的互作會增加 USP7 與 PML 蛋白的結合;這種 USP7 與 PML 的關聯是 PML 發生多聚泛素化及降解所必需的。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Upon infection with Epstein-Barr virus, the interaction with viral EBNA1 increases the association of USP7 with PML proteins, which is required for the polyubiquitylation and degradation of PML

PMID 20719947 ↗ · PMID 24216761 ↗

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分子活性USP7 的催化活性依賴硫醇,可水解由泛素 C 端 Gly 參與形成的酯鍵、硫酯鍵、醯胺鍵、胜肽鍵及異胜肽鍵。泛素是一種由 76 個胺基酸組成的蛋白質,連接至其他蛋白質時可作為細胞內標記。含實驗來源
證據與來源

Thiol-dependent hydrolysis of ester, thioester, amide, peptide and isopeptide bonds formed by the C-terminal Gly of ubiquitin (a 76-residue protein attached to proteins as an intracellular targeting signal).

PMID 11923872 ↗ · PMID 12507430 ↗ · PMID 14506283 ↗ · PMID 15053880 ↗ · PMID 16964248 ↗ · PMID 18716620 ↗ · PMID 21745816 ↗ · PMID 25865756 ↗ · PMID 26678539 ↗ · PMID 28655758 ↗ · PMID 33544460 ↗ · PMID 35216969 ↗

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交互作用USP7 可為單體或同源二聚體,也參與多種蛋白複合體。其與 DAXX 直接互作,且不依賴 MDM2 或 p53/TP53;亦與 MDM2、KMT2E/MLL5 isoform 3、OGT isoform 1、FOXO4、p53/TP53、PTEN、DNMT1、UHRF1、FOXP3、REST、ERCC6 等互作。FOXO4 互作在過氧化氫存在時增強,p53/TP53 互作在 DNA 損傷時增強;ATXN1 的 poly-Gln 區域較長時,互作較弱。USP7 也參與 PRC1-like 複合體,並與 OTUD4、USP9X、MAGEL2、TRIM27 等有直接互作;與 FAM170A 的互作可促進其核轉位及去泛素化活性。含實驗來源
證據與來源

Monomer. Homodimer. Part of a complex with DAXX, MDM2, RASSF1 and USP7. Part of a complex with DAXX, MDM2 and USP7. Interacts with MDM2; the interaction is independent of p53/TP53. Interacts with DAXX; the interaction is direct and independent of MDM2 and p53/TP53. Component of a complex composed of KMT2E/MLL5 (isoform 3), OGT (isoform 1) and USP7; the complex stabilizes KMT2E/MLL5, preventing KMT2E/MLL5 ubiquitination and proteasomal-mediated degradation. Interacts (via MATH domain) with KMT2E/MLL5 isoform 3. Interacts with OGT isoform 1. Interacts with FOXO4; the interaction is enhanced in presence of hydrogen peroxide and occurs independently of p53/TP53. Interacts with p53/TP53; the interaction is enhanced in response to DNA damage. Interacts with TSPYL5; this impairs interaction with p53/TP53. Interacts with PTEN; the interaction is direct. Interacts with ATXN1 and the strength of interaction is influenced by the length of the poly-Gln region in ATXN1. A weaker interaction seen with mutants having longer poly-Gln regions. Interacts with KIAA1530/UVSSA. Interacts with ABRAXAS2; the interaction is direct. Identified in a complex with TP53/p53 and ABRAXAS2. Interacts with MEX3C and antagonizes its ability to degrade mRNA. Interacts with DNMT1 and UHRF1. Interacts with FOXP3. Interacts (via MATH domain) with RNF220. Associated component of the Polycomb group (PcG) multiprotein PRC1-like complex. Interacts with EPOP (By similarity). Interacts with OTUD4 and USP9X; the interaction is direct. Interacts with CRY2. Interacts with REST. Interacts with ERCC6. Part of a complex consisting of USP7, MAGEL2 and TRIM27; directly interacts with MAGEL2; directly interacts with TRIM27. Interacts with FAM170A; this interaction promotes USP7 nuclear translocation and deubiquitinating activity (By similarity)

PMID 12093161 ↗ · PMID 16845383 ↗ · PMID 16964248 ↗ · PMID 18566590 ↗ · PMID 18716620 ↗ · PMID 20601937 ↗ · PMID 21170034 ↗ · PMID 21258371 ↗ · PMID 21745816 ↗ · PMID 22411829 ↗ · PMID 22466611 ↗ · PMID 22466612 ↗ · PMID 22863774 ↗ · PMID 25266658 ↗ · PMID 25283148 ↗ · PMID 25944111 ↗ · PMID 26030138 ↗ · PMID 26365382 ↗ · PMID 26678539 ↗ · PMID 27123980 ↗

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交互作用感染相關情境中,USP7 的 isoform 1 與 isoform 2 可和 herpesvirus 1 轉錄活化蛋白 ICP0/VMW110 互作。這種結合可能調節 USP7 的底物專一性或活性,並有助於穩定病毒蛋白;來源以可能性描述其作用。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Isoform 1 and isoform 2 interact with herpesvirus 1 trans-acting transcriptional protein ICP0/VMW110. Binding to ICP0/VMW110 may modulate the substrate specificity or activity of USP7 to stabilize viral proteins

PMID 14506283 ↗ · PMID 16160161 ↗ · PMID 18590780 ↗ · PMID 9034339 ↗

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交互作用感染 Epstein-Barr virus 時,EBNA1 可在與 USP7 互作的同時,另與相關因子互作;此作用對 EBNA1 破壞 PML 核小體是必要的。EBNA1、USP7 與 CSNK2B 形成三元複合體。EBNA1 對 USP7 的親和力比 p53/TP53 高 10 倍,並可競爭 USP7 結合。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with Epstein-Barr virus EBNA1; the interaction is independent and simultaneous to EBNA1 interaction with USP7 as well as necessary for PML nuclear bodies disruption by EBNA1. EBNA1, USP7 and CSNK2B form a ternary complex. EBNA1 shows a 10-fold higher affinity than p53/TP53 and can compete with it for USP7 binding

PMID 14506283 ↗ · PMID 24216761 ↗

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交互作用在感染相關情境中,USP7 與人類巨細胞病毒蛋白 UL35 及 UL35A 互作;這些互作會抑制 USP7 形成核小體的能力。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with human cytomegalovirus proteins UL35 and UL35A; these interactions inhibit the ability of USP7 to form nuclear bodies

PMID 22072767 ↗

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交互作用感染 herpes virus 8(HHV-8)時,USP7 與病毒蛋白 vIRF-1、vIRF-3 互作。這些互作可能降低可供 USP7 去泛素化並穩定 TP53 的量,進而干擾感染期間的 TP53 訊號路徑;其影響以可能性表述。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with herpes virus 8/HHV-8 proteins vIRF-1 and vIRF-3; these interactions may disrupt TP53 signaling pathway during viral infection by decreasing the availability of USP7 for deubiquitinating and stabilizing TP53

PMID 29343584 ↗ · PMID 31666375 ↗

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交互作用感染 herpes virus 8(HHV-8)時,USP7 與病毒蛋白 vIRF-2 互作。此互作可透過破壞 USP7 與先天免疫訊號蛋白 TRAF3、TRAF6 的互作來調節抗病毒訊號,並因此影響 TRAF3 與 TRAF6 的泛素化。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with herpes virus 8/HHV-8 protein vIRF-2; this interaction modulates antiviral signaling via disruption of USP7 interactions with innate immune signaling proteins TRAF3 and TRAF6 thus affecting their ubiquitination

PMID 31666375 ↗

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細胞定位USP7 位於細胞核、細胞質、染色體及 PML 核小體,僅見於一部分 ND10 核小體。感染早期與 ICP0/VMW110 結合會提高含 USP7 的 ND10 比例。USP7 在細胞核與 ATXN1 共定位,並與 DAXX 在斑點狀結構共定位;也與 PML、PTEN 共定位於 PML 核小體。與 FAM170A 互作則被報告可促進 USP7 核轉位。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm; Nucleus, PML body; Chromosome; Present in a minority of ND10 nuclear bodies. Association with ICP0/VMW110 at early times of infection leads to an increased proportion of USP7-containing ND10. Colocalizes with ATXN1 in the nucleus. Colocalized with DAXX in speckled structures. Colocalized with PML and PTEN in promyelocytic leukemia protein (PML) nuclear bodies. Interaction with FAM170A promotes its nuclear translocation (By similarity)

PMID 21258371 ↗ · PMID 23973222 ↗ · PMID 25283148 ↗ · PMID 26678539 ↗ · PMID 9034339 ↗ · PMID 20601937 ↗

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調控USP7 在調節性 T 細胞(Treg)中表現上調;在神經前驅細胞分化期間,USP7 表現則下調。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated in regulatory T-cells (Treg). Down-regulated during neural progenitor cell differentiation

PMID 21258371 ↗ · PMID 23973222 ↗

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疾病關聯影響 USP7 基因的變異會造成 Hao-Fountain syndrome(HAFOUS),這是一種體染色體顯性神經發育疾病。其特徵包括全面性發展遲緩、程度不一的智能障礙、自閉症類群障礙、言語能力不佳或缺乏及輕微顏面特徵;多數患者有癲癇。可變表現還包括肌張力低下、男性性腺功能低下及眼部異常。含實驗來源
證據與來源

Hao-Fountain syndrome HAFOUS An autosomal dominant neurodevelopmental disorder characterized by global developmental delay, varying degrees of intellectual disability, autism spectrum disorder, poor or absent speech, and mild facial dysmorphism. Most patients develop seizures. Additional variable features include hypotonia, hypogonadism in males, and ocular anomalies. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616863

PMID 26365382 ↗ · PMID 30679821 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 13 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000344836 · 5,831 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GACATTTCACGCCGCCGCCATTTTGAGAGCGAGCCGAGCC40
41GAGCTGCCGGGCGCCGCGTCCGCTGCCGGAGCCCCGACGA80
81CGACGCCGAGGAGGCGGAGGCCGCGGCTCTCGGAACGCGG120
121CCGGCCCGTCGCCCGCCCGCTCCGCCGCTCCCGCCGGCCC160
161CAGGGCCCGCAGGCCCGCCGCGGCCGGCCAGGCCTCCCGT200
201CCGCCGCGCCCGGCCCGAGGCGGGGCTGACTCCGCGGCCC240
241CCGACCGGCCGCCCTCCGCCCCCGGCCGGCCCGCGGCCCC280
281GCAGCCCCGGCCCCGGCCCCGGCGGCGGGAGGCGGGCCCC320
321GCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGCAGCGAGCGACGAGGCCG360
361CCCGGCCCGGCCCGCCGGCCGCCCGCCCGCCTCGGCGCCG400
401AGATTGGGCGAATCGCGAGCAAGTACGTGCGCGTCTCCCT440
441GCCGCCGCCGCCGCCCGCCGCGGGCCGCCCCGGGGCCGCC480
481GTCGCCGACGACGCGCGGGAGGAGGAGGAGGAGGCCGCCC520
521CGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCCGGCTCGCCGCCGC560
561CCGCCCGCCGGGCTCGCAGCCCCGGCCCCCGGCCGCAGGC600
601GAGGCCCAGGCCGCGGCCGACATGAACCACCAGCAGCAGC640
641AGCAGCAGCAGAAAGCGGGCGAGCAGCAGTTGAGCGAGCC680
681CGAGGACATGGAGATGGAAGCGGGAGATACAGATGACCCA720
721CCAAGAATTACTCAGAACCCTGTGATCAATGGGAATGTGG760
761CCCTGAGTGATGGACACAACACCGCGGAGGAGGACATGGA800
801GGATGACACCAGTTGGCGCTCCGAGGCAACCTTTCAGTTC840
841ACTGTGGAGCGCTTCAGCAGACTGAGTGAGTCGGTCCTTA880
881GCCCTCCGTGTTTTGTGCGAAATCTGCCATGGAAGATTAT920
921GGTGATGCCACGCTTTTATCCAGACAGACCACACCAAAAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。