演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

USP26

ubiquitin specific peptidase 26

USP26 是一種去泛素化酶,透過移除泛素調節多種生物學過程,並與細胞重編程、雄性激素受體訊號及精子生成相關。

Homo sapiensXq26.2UniProt Q9BXU7
OFFICIAL SYMBOL
USP26
CHROMOSOME
X
UNIPROT
Q9BXU7
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

USP26(ubiquitin specific peptidase 26)是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因,其產物屬於 peptidase C19 家族。蛋白質長 913 個胺基酸,含有 USP 結構域,並在部分區段具有無序特徵。其主要角色是去泛素化,可藉由移除蛋白質上的泛素,參與調節不同生物學過程。來源也指出 USP26 與細胞重編程、雄性激素受體訊號及精子生成有關;具體作用方式與已知底物詳見功能說明。

Official symbol
USP26
Gene name
ubiquitin specific peptidase 26
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13485
UniProt
Q9BXU7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq26.2
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegUSP26pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:133,023,168–133,097,109
Gene span
73,942 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000511190 ★133,023,168–133,097,1096
ENST00000370832133,024,631–133,028,2721

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

USP26 是一種去泛素化酶,能移除參與不同生物學過程之蛋白質上的泛素,因此可調節這些過程。其酵素活性依賴硫醇,作用方式是水解泛素 C 端 Gly 所形成的酯鍵、硫酯鍵、醯胺鍵、胜肽鍵及異胜肽鍵;泛素是一種 76 個胺基酸的蛋白質,附加於蛋白質上作為細胞內的標的訊號。

在體細胞重編程中,USP26 可移除 CBX4 與 CBX6 上的 Lys-48 連結泛素,並使這兩種蛋白質穩定。CBX4 和 CBX6 是 polycomb-repressive complex 1(PRC1)的組成成分;來源將 USP26 的這項作用與體細胞重編程相連結。

USP26 也會去泛素化 androgen receptor(AR),並可能使其穩定,進而調節 androgen receptor signaling pathway。穩定 AR 的作用帶有「可能」的不確定性,來源未進一步說明此途徑中其他步驟或具體生理結果。

此外,USP26 可能參與精子生成。這項功能的描述同樣保留可能性;來源未提供其在精子生成過程中的具體分子作用方式。整體而言,現有資料將 USP26 的功能連結到特定蛋白質的去泛素化及其穩定性調節,但不同功能所涉及的生物學情境並不相同。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 133097109 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>USP26 ENST00000511190 GRCh38 chrX:133097009-133098109 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAAACATCCCAGTACAAATCTGGGTCCTTCTCGCCACATCCAGCCCGGTGCTAACTGATGCCAGTGCTGA
CAGCACTCCCTTGCACCCCAATTCTAATGTTTTCCCATATTCCCCACCTGATAGCAGCAAGAGAGGGCCT
GGTAAGAGAGGGAAAGGATCAGTGAATGCATCATGGAGGCGGCTGTGTTTGAGCTGGGACCTAATTGGTG
GACAGAGATGGGGGGAAAGGAAATTCTAGTAGGAGGCTGATTACTCTTAAATAGTGGTCTACGACACAGA
CATTGGTGCTAGAGGGTCATGGATTCAAACGCTAGTATGGCCATTTCCTAGTTCTACTCGTGATCCCCTT
CCTCAGTCCTCTTATCACCCCACATCCATTCTCCCAGTCGTATAAACTCTCTCCTAACTGCTTATGCTCA
CTTAGTTTAATGCCCATTCTGTTTAACTCACCTGCAATGGCGGCACCATCCCCAATTTAATGCCCTTACT
TCCTATGCACAATTGTTAGGTGTACAGCTATTTAGGCTCATTTTTCACTGTAGATCCCCGTCCTGGCATC
ACGCCCGTTCCTTTTTCCCAAACGTAAATGCTGAGGGGTGGGTTTCAATTCCCTGCTACGAATTGAGTCT
CATCCCAATGGTAGAAATGGCTGGGAAGATCTTTCCCGTACAAGGCAATAATATGCAAAAAATGTAAAAG
CGGTTGGCGCGTTATTTGAATTCATTGCGGGAACCACGCAGAAAGTCTCGTGGGAGTTACTTTGTGATAG
TTTTTTCCTTCCATTCCCCACAGTTCCTGCCACTGCACGCGCAACACCTCCAAGCAATAATCCTTCCCAC
CAATAAGGAGCAAAGGCCCGGGGTGTGGACGGACTTTCCTGTTATAGAGAAGGTGGGAGTAGACAGTATC
CTGGTCAATTGTTTCAGTCACAACCAATCAGGATCTTTGAGGGTGGAGCCATACACTGGCAATAAAAGAA
GCCTGCCCCTGTGGCGGGGCCCATTTTGTTTTCGATCGTTAAGTGGGCACGTGGTGGAGCGTTGGTGTGT
CAGGGGTGTCGACTTCTTCCACAAACTATTGTAAGATCAATTTGCTTTTCA
USP26 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_536B8NM · CTCF_binding_site · 133096088–133096109 · regulatory

· motif · 133096090–133096106 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:913 aa

1 aa913 aa結構域功能區域
依 Q9BXU7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

USP26 蛋白質長 913 個胺基酸,屬於 peptidase C19 家族。其 USP 結構域位於第 295 至 886 個胺基酸;另在第 601–636 與第 753–772 個胺基酸區段標註為無序區。

結構域USP295–886 aa
功能區域Disordered601–636 aa
功能區域Disordered753–772 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9BXU7…

AlphaFold · Q9BXU7

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme

USP26 被標註位於細胞核,以及細胞質中的細胞骨架與鞭毛軸絲。 來源未提供不同細胞狀態或異構型之間定位差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
USP26USP26CFTR
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

USP26 與 RING1 有交互作用。來源僅指出兩者互作,未說明這是否構成特定複合體,也未提供其互作對 USP26 功能的影響。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

USP26 的變異可能造成 X 連鎖精子生成失敗症 6(SPGFX6),但此處描述為可能的病因關聯。該男性不孕疾病與弱畸形精子症有關,特徵包括精子前進運動力降低,以及精子形態異常,例如頭部較薄、鞭毛較短或彎曲。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能USP26 是去泛素化酶,透過去除相關過程中組成成分的泛素來調節多種生物學過程。在體細胞重編程中,它會去除 PRC1 成分 CBX4 與 CBX6 上的 Lys-48 連結泛素並使其穩定;它也會去泛素化且可能穩定 AR,調節 androgen receptor signaling pathway。此外,USP26 可能參與精子生成。含實驗來源
證據與來源

Deubiquitinase regulating several biological processes through the deubiquitination of components of these processes. Involved in somatic cell reprogramming through the 'Lys-48'-linked deubiquitination and stabilization of CBX4 and CBX6, two components of the polycomb-repressive complex 1 (PRC1). Also deubiquitinates and probably stabilizes the androgen receptor (AR), regulating the androgen receptor signaling pathway. May play a role in spermatogenesis

PMID 20501646 ↗ · PMID 28839133 ↗ · PMID 34202084 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性USP26 具有依賴硫醇的水解活性,可水解由泛素 C 端 Gly 形成的酯鍵、硫酯鍵、醯胺鍵、胜肽鍵及異胜肽鍵。泛素是長 76 個胺基酸、附加於蛋白質上作為細胞內標的訊號的蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Thiol-dependent hydrolysis of ester, thioester, amide, peptide and isopeptide bonds formed by the C-terminal Gly of ubiquitin (a 76-residue protein attached to proteins as an intracellular targeting signal).

PMID 28839133 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用USP26 與 RING1 有交互作用;此項資料未進一步描述互作的功能或是否涉及特定複合體。含實驗來源
證據與來源

Interacts with RING1

PMID 28839133 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位USP26 的定位包括細胞核,以及細胞質中的細胞骨架與鞭毛軸絲。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme

PMID 20501646 ↗ · PMID 34202084 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯X 連鎖精子生成失敗症 6(SPGFX6)是男性不孕疾病,與弱畸形精子症相關,表現為精子前進運動力降低及形態異常,例如頭部較薄、鞭毛較短或彎曲。影響 USP26 的變異可能造成此病,但資料表述為可能的病因關聯。含實驗來源
證據與來源

Spermatogenic failure, X-linked, 6 SPGFX6 A male infertility disorder due to asthenoteratozoospermia and characterized by reduced progressive sperm motility and morphologic sperm abnormalities, such as thin heads and short or coiled flagella. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 301101

PMID 34202084 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000511190 · 5,525 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCATTTTGTTTTCGATCGTTAAGTGGGCACGTGGTGGAGC40
41GTTGGTGTGTCAGGGGTGTCGACTTCTTCCACAAACTATT80
81TAAGAGACAGCAGCAGGAGGGACTGGACTGGATTGTAGAA120
121AACTTCAAGAGTTAAGGAGTGCGGAGTGCTGCTCAGGTGC160
161CTTTGTTTCAGGTCATAGTCTCTGTTCTATATAGCAGCCA200
201ACCACAAGGGTTGATTGAGTCTCACTCTGTTACCCAAGCT240
241GGAGTGTAGTGATGCAATCACAGCTCACTGCAGCCTTGAC280
281CTCCTGAACTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTCCTAAC320
321TGGGGCTACAGATTCCCTGTTTCTGCTTTAACCTGGGCTG360
361CTTGCTAAGTGCTTGCCTCTCAGGATCCTTGTGGAGCTGA400
401ACTTGCAAAACAGATTGGAACTTCAAGATTATCAATAATC440
441GGAGATACGTATATTTTATTTGTAAAGAAAACATGGCTGC480
481CCTATTCCTACGTGGTTTTGTCCAAATAGGGAACTGCAAG520
521ACTGGGATATCTAAGTCAAAAGAAGCATTCATTGAAGCAG560
561TGGAAAGAAAGAAGAAAGATAGACTGGTGCTGTATTTCAA600
601AAGTGGAAAATATAGCACTTTTCGGCTAAGTGATAATATT640
641CAAAATGTAGTCCTTAAATCCTATAGAGGAAACCAAAATC680
681ACCTGCATTTAACTTTACAAAATAATAATGGCTTGTTTAT720
721TGAAGGATTATCCTCCACAGATGCTGAACAATTGAAGATA760
761TTCTTGGACAGAGTTCATCAAAACGAGGTTCAGCCACCTG800
801TGAGACCTGGTAAGGGTGGGAGTGTCTTTTCTAGCACAAC840
841ACAGAAGGAAATCAACAAAACTTCATTCCACAAAGTTGAT880
881GAGAAATCAAGTAGCAAATCTTTTGAGATAGCAAAAGGAA920
921GTGGGACAGGTGTCCTTCAGAGGATGCCTTTGCTTACATC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。