基因總覽
USP24（ubiquitin specific peptidase 24）是蛋白質編碼基因，產物為 ubiquitin-specific protease，屬於 peptidase C19 家族。此蛋白質長 2620 個胺基酸，具有 N 端 UBA domain 與位於蛋白質中後段的 USP domain；序列中另有數段被註記為無序區域。這些家族與結構特徵，構成認識 USP24 蛋白質的基本背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000294383 ★ | 55,066,359–55,215,364 | 68 |
| ENST00000927917 | 55,066,222–55,215,753 | 68 |
| ENST00000927918 | 55,066,222–55,215,753 | 67 |
| ENST00001145774 | 55,066,222–55,215,753 | 68 |
| ENST00001068567 | 55,066,361–55,215,753 | 68 |
| ENST00000484447 | 55,071,268–55,215,753 | 68 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
USP24 是一種 ubiquitin-specific protease，參與調節不同情境下的細胞存活。來源指出，它可透過調節部分受質的蛋白質穩定性發揮作用，列出的受質包括 DDB2、MCL1 與 TP53；但未進一步說明各受質的穩定性變化方向或其對細胞存活的具體影響，因此不宜將此關係延伸為特定的分子路徑或因果機制。
在酵素作用方面，USP24 進行依賴硫醇的水解反應，可切割由 ubiquitin C 端 Gly 所形成的酯鍵、硫酯鍵、醯胺鍵、胜肽鍵及異胜肽鍵。ubiquitin 是一種由 76 個胺基酸組成的蛋白質，可附接於蛋白質並作為細胞內標的訊號。這項酵素活性描述了 USP24 能處理的鍵結類型；來源未提供各類鍵結在細胞中對應的特定底物或反應條件。
USP24 也被指出對 ferritinophagy 具有正向作用。此過程中，ferritin 在 lysosome 內降解並釋出游離鐵；來源支持 USP24 促進這項過程，但未交代其作用方式，也未說明此功能與前述細胞存活調節之間的關係。
Promoter 與基因調控
>USP24 ENST00000294383 GRCh38 chr1:55215264-55216364 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTAGAGGAATCCTCAAAGGTGGAAAGAAACAGGGATAGGATGCTGCCCAAGAGGCAGGGACAAAGAATCG GAGCCAAAGACTGCGGTAAAAATGTGGGAAGGTGATGTCCACGATGTTCGAACGAGTCCGTGGCCGAAGG AAGTAAGAGTCTGGGTTTCTGGAGGTTTTCATACAGAGAACTGGGATTTAGATTTCGGGCTGGAAAAATA TATTTTGGACTCTCAGGGGCTTTCAGGGTAAGAGTTCGGTAGAGTTCAGTCAGCTTGGCGGAGACAGGTA GTCAGTTAATGTTGGAAGGAAAATTCGGACAGCTGGGAATTAATTTCAACGGGTTTAGGGTGATTTCGGC AAGGGCTGGCGGGGCTAGGGTCGAGTGTGAATTTCGTCTTGGGTGGTCCACGCGTCTGGTTTGGGCAGGA ATTTCTGTGGGCAGCGAGGCGTATTCAGGCAGCGTTGCGGGTGAATCTGCGTGGGATGAGGGTGGATTTC CTTCAGGACTGCGGTGCATTTCAGGCCGGGGTGGAGGTGCCTCACAGCCGCGGCGCAGGGAATTCCCTCT AGGATGGGGGAGCGGGTCGGGCGGCGCCGGCCAGGGAGGGGAAGTCCAACGGGGGTTCGGAGAGGCTCGG GGGACTCGGACGGAGAGAAGCCGGGTCGCGGCTGCGGAGGCTCGGCCGGCCAAGGGATTTCCGCGACGTT CAGCGCTGCGAGCTGCGCGGCGCTGCGGCCCCTCCCGTCCCGGGGGAACCTGTTGCCGGCGAAACAGGCG GGCGGTGGCGACGATGGAGAAGCCTTCCTCGCCTCTGCCTGGCTGCACGGCAGCCCTTTCACCTTAGGCA CGCTCCGCGGCGCGGCCCCTCCCTCCGCTCCTTCGTTTAAAACAAACAGAATACGCCGCCGCCAACCCTA GCCTGCCAACGGCGAGCACGGTCGCCTCCCGTGCCGCTTCCGGGAGCCGAGGCGCGGCCCCGCCGCCCGG GGAGGAGGAGGCGGAGGGGGAGGAGGCCAACATGGCGGCGCGCAGGGCTGGGCCGGGCCGCAGCCGCGCC TGAGCGCCTCACCGCACTAGCTCGGCTCGCAGGACCCAAGCCCGCACCCAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_BDXSQ · enhancer · 55211099–55211773 · regulatory
ENSR1_9RWNQ · enhancer · 55212001–55212352 · regulatory
ENSR1_5GZMK4 · CTCF_binding_site · 55214795–55214816 · regulatory
ENSR1_758MWN · promoter · 55215354–55215417 · regulatory
ENSR1_C7GX7 · enhancer · 55215418–55216506 · regulatory
ENSR1_5GZMNX · CTCF_binding_site · 55215623–55215644 · regulatory
ENSR1_9RWQC · promoter · 55217525–55217871 · regulatory
ENSR1_758N2M · enhancer · 55217872–55217991 · regulatory
· motif · 55211239–55211254 · motif
· motif · 55211527–55211538 · motif
· motif · 55211527–55211538 · motif
· motif · 55211529–55211538 · motif
· motif · 55212114–55212127 · motif
· motif · 55212464–55212475 · motif
· motif · 55212642–55212650 · motif
· motif · 55212883–55212891 · motif
· motif · 55212883–55212898 · motif
· motif · 55214501–55214512 · motif
· motif · 55214501–55214512 · motif
· motif · 55214503–55214512 · motif
· motif · 55214527–55214542 · motif
· motif · 55214665–55214678 · motif
· motif · 55214797–55214813 · motif
· motif · 55214832–55214845 · motif
· motif · 55214871–55214884 · motif
· motif · 55215198–55215211 · motif
· motif · 55215345–55215355 · motif
· motif · 55215370–55215383 · motif
· motif · 55215409–55215420 · motif
· motif · 55215411–55215420 · motif
· motif · 55215460–55215473 · motif
· motif · 55215530–55215543 · motif
· motif · 55215616–55215629 · motif
· motif · 55215616–55215629 · motif
· motif · 55215625–55215641 · motif
· motif · 55215668–55215679 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：2620 aa
USP24 蛋白質長 2620 個胺基酸，屬於 peptidase C19 家族。其序列註解包含位於第 3–44 個胺基酸的 UBA domain，以及第 1689–2042 個胺基酸的 USP domain。另有多段區域被註記為無序區域，分別位於第 45–102、1034–1054、1129–1151、1921–1945、2063–2090 與 2575–2620 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 21 experiments
在微生物感染情境下，USP24 與 human cytomegalovirus 蛋白質 UL38 有交互作用。來源將此描述為互作，但未指出兩者是否構成複合體，或此互作對任一方功能的影響。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | USP24 是 ubiquitin-specific protease，可在不同情境下藉由調節部分受質的蛋白質穩定性，參與細胞存活的調控；列出的受質包括 DDB2、MCL1 與 TP53。此外，USP24 對 ferritinophagy 具有正向作用；該過程涉及 ferritin 在 lysosome 中降解並釋出游離鐵。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ubiquitin-specific protease that regulates cell survival in various contexts through modulating the protein stability of some of its substrates including DDB2, MCL1 or TP53. Plays a positive role on ferritinophagy where ferritin is degraded in lysosomes and releases free iron PMID 23159851 ↗ · PMID 29695420 ↗ |
| 分子活性 | USP24 具有依賴硫醇的水解活性，可水解由 ubiquitin C 端 Gly 所形成的酯鍵、硫酯鍵、醯胺鍵、胜肽鍵及異胜肽鍵。ubiquitin 是由 76 個胺基酸組成的蛋白質，可附接於蛋白質，作為細胞內標的訊號。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Thiol-dependent hydrolysis of ester, thioester, amide, peptide and isopeptide bonds formed by the C-terminal Gly of ubiquitin (a 76-residue protein attached to proteins as an intracellular targeting signal). |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，USP24 與 human cytomegalovirus 蛋白質 UL38 互作；來源未進一步說明這項互作是否形成複合體，或其對蛋白質功能造成何種影響。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGGAGGCCAACATGGCGGCGCGCAGGGCTGGGCCGGGCCG40CAGCCGCGCCTGAGCGCCTCACCGCACTAGCTCGGCTCGC80AGGACCCAAGCCCGCACCCAGCCTGGCCCGGCTGCTGCGG120AGCACCCGGGGCAGGAACGCAGGGGCCAACCTGGGCGCGG160AGGCGGCGCGGAGGGTGCGCCGCGCGGCCCGCCAGGCCCG200GGACCCGTAGCTTCGCCGTGCGCTGGCCGGGGCGGCCAGG240AGGCCCAAGCCATGGAATCGGAGGAGGAGCAGCACATGAC280CACGCTGCTGTGCATGGGCTTCTCAGACCCCGCCACCATC320CGCAAGGCCCTGCGCCTGGCCAAGAACGACATTAACGAGG360CCGTGGCACTGCTCACCAACGAGCGGCCGGGCCTCGACTA400CGGCGGCTACGAGCCCATGGACAGCGGCGGTGGCCCCAGC440CCCGGGCCCGGCGGGGGCCCGCGGGGCGACGGCGGAGGTG480ACGGCGGCGGCGGCGGCCCCTCCCGCGGCGGGAGCACCGG520AGGCGGGGGCGGCTTCGACCCCCCGCCCGCCTACCACGAG560GTGGTGGACGCGGAGAAGAATGATGAGAATGGAAACTGCT600CAGGGGAAGGAATTGAATTCCCTACAACAAATTTATATGA640ACTGGAAAGCCGTGTTTTGACTGATCATTGGTCCATCCCT680TACAAGCGAGAAGAATCACTAGGCAAATGCCTGTTGGCAT720CTACCTACCTAGCAAGACTTGGTCTTTCCGAGTCTGATGA760GAATTGTAGAAGGTTTATGGACAGGTGTATGCCTGAAGCA800TTTAAAAAGCTCCTGACATCAAGTGCTGTTCACAAGTGGG840GTACTGAAATTCATGAAGGAATTTACAACATGTTGATGCT880ATTAATAGAACTGGTCGCAGAGAGAATAAAACAAGATCCA920ATTCCCACTGGTCTCCTGGGTGTGCTTACAATGGCTTTCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。