基因總覽
USP22（ubiquitin specific peptidase 22）是蛋白質編碼基因，產物屬於 peptidase C19 家族的 UBP8 subfamily。其蛋白質具有去泛素化酶活性，可移除蛋白質上的泛素，並參與多種細胞過程。USP22 也屬於 SAGA 轉錄共活化組蛋白乙醯轉移酶複合體的一員，因而與轉錄調控相關。蛋白質全長 525 個胺基酸，包含 UBP-type zinc finger 與 USP domain；這些結構特徵與其家族分類及酵素功能相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000261497 ★ | 20,999,596–21,043,011 | 13 |
| ENST00001136623 | 20,999,596–21,043,070 | 13 |
| ENST00000537526 | 20,999,597–21,043,760 | 13 |
| ENST00000952978 | 20,999,598–21,043,070 | 14 |
| ENST00000929029 | 20,999,599–21,043,070 | 11 |
| ENST00000929028 | 20,999,599–21,043,070 | 12 |
| ENST00000884362 | 20,999,739–21,043,070 | 13 |
| ENST00000929030 | 20,999,739–21,043,070 | 13 |
| ENST00001000665 | 20,999,757–21,043,070 | 4 |
| ENST00000929031 | 20,999,767–21,043,070 | 14 |
| ENST00000582335 | 21,011,230–21,019,139 | 3 |
| ENST00000476111 | 21,017,942–21,042,273 | 5 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
USP22 的主要作用之一是調節蛋白質的泛素化狀態。其硫醇依賴性水解作用可切斷由泛素 C 端 Gly 形成的酯鍵、硫酯鍵、醯胺鍵、胜肽鍵及異胜肽鍵。在 SAGA 複合體中，USP22 催化組蛋白 H2A 與 H2B 去泛素化，並作為轉錄共活化因子；它也可由 MYC 等活化因子帶至特定基因啟動子，且在這些位置為轉錄所需。
USP22 亦參與細胞週期調節。它能在特定細胞週期階段穩定 CCNB1，並抵消蛋白酶體介導的 CCNB1 降解，促進細胞週期進程。此外，USP22 透過穩定去乙醯化酶 SIRT1，拮抗 TP53 的轉錄活化，因而調節細胞週期進程與細胞凋亡。
在免疫與發炎過程中，USP22 的作用依靶分子和情境而異。抗病毒反應中，它使 importin KPNA2 去泛素化，促使 IRF3 移入細胞核，進而產生第一型干擾素；另一方面，它會負向調節 STING1 的活化與泛素化，參與第三型干擾素訊號調控。USP22 也可促進 ATG5 依賴的自噬，使 NLRP3 降解並抑制 NLRP3 發炎小體活化；此項作用為相似性推定。
其他免疫相關作用包括使 CD274 去泛素化並提高其穩定性，參與維持對自身的免疫耐受；以及藉由調節 RIPK3 的磷酸化與泛素化，控制程序性壞死。在細菌感染期間，USP22 可移除 TRAF6 上的 Lys-48 連結多聚泛素鏈，促進促發炎反應；此作用亦為相似性推定。這些不同方向的調節顯示，USP22 透過改變多種蛋白質的泛素化或穩定性，參與轉錄、細胞命運與免疫反應。
Promoter 與基因調控
>USP22 ENST00000261497 GRCh38 chr17:21042911-21044011 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGCCGCCCACTGCGGTAGCAGCTAGTAGGAATTGGATGTGCTTTAAGTGTAAATACCAGATTTCCAAGAC TTGCTGCAAAAACTGTAAAACATTCCACTAACGATTTTGCAATACTGCCTACATGCTGAAATAATTTGAC TTTATTGGGTTGAGATATATTACTGTAACTTTCTTTTTTCATTAGAAAAATGTAGCCACTAGCAAATGTG AAGTGTCAGGCGTGTGGCGCGCAGATGCCTCTTTAAACTGGATGGCGCCGGGTTGGCCCTCACTATCAGC GGGCTCCCGACAGGAGGCGCCCCAGCTTGCGGCCGGGGGCAGCGCCTACCAGGCAGTTGGCAGGCAGTTC CAGCCCCGGGCCACGGCACTGCAGGGCCCGAGCCAGGTTACGGCAACCGGGGGCCCTGCAAACAGCTCCC GATTAGGGGGTGCTTTTGGGTGGGAAAGCGCAGGCCCTGGATGGAGGCCCGACCTGCGGCGCTCCAGCTC ATCGCCCCGCCTCTTTGCGGCAGAGCTCAGGCCGGCGCAAACCGGTTCAGTGCTAGGACTGACGTCTCGC GCCGCCCAACCGCAGCACGCCCCCGCCTCCCCAGTCCTCTGGAAGAGACAGGGAACGTCTAGCCGCCAGG GTCCCGGGAGGCGGCTCTGTACCAGACGGACTATACTGAGAGCCTATGACAATAGCCGAAGGTGCCGGGG GGGGGGGGGGGGTGGCCTACTACCAATAAAGGAAGGGGAGGGGCGGGCCCTCGTTAGCTTCCCCCCCCTA CCACGCTTCCTCGGGCGCGGGTCTACCCAGAGCCTAACGGGCGCGCGAGTGTGGGGGAAGGGCCTGGCGC GGGCTGGAGACTGCGCAGTGCGGTGCCGGCCGGGAGGGGGGGGGGGGGTGACGTAATCTCCGTCCGCGGC CGCGGCGCCCCGCCCCGCGACACCCTCCGCGAACCGCGAGAGCGCAGCGCAGGCGGTCCGCAGCAGCCGC AGCTCGGGGGCGGTGCCTGCCTTGCAGCCTCCCCTCGGCGATCGCGCAGCCCCATCTTTGTCCGGCCTCC GCGCTTTGTTCTCGGCGCCCGGGCCTTGGCCAGCCTGGCCAGCCGCCGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| USP22_2 ↗ | 17:21,043,008 | 負股 | 21,042,998–21,043,057 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_9BCHW · promoter · 21043001–21043501 · regulatory
ENSR17_56XM7F · CTCF_binding_site · 21043016–21043037 · regulatory
ENSR17_56XMBL · CTCF_binding_site · 21043709–21043730 · regulatory
ENSR17_9BCJ5 · promoter · 21043750–21044250 · regulatory
ENSR17_56XMBS · CTCF_binding_site · 21043751–21043772 · regulatory
· motif · 21042296–21042307 · motif
· motif · 21042298–21042307 · motif
· motif · 21042362–21042372 · motif
· motif · 21042382–21042392 · motif
· motif · 21042756–21042765 · motif
· motif · 21043018–21043031 · motif
· motif · 21043018–21043034 · motif
· motif · 21043030–21043047 · motif
· motif · 21043063–21043078 · motif
· motif · 21043113–21043126 · motif
· motif · 21043113–21043126 · motif
· motif · 21043263–21043273 · motif
· motif · 21043268–21043278 · motif
· motif · 21043296–21043306 · motif
· motif · 21043298–21043308 · motif
· motif · 21043299–21043309 · motif
· motif · 21043300–21043310 · motif
· motif · 21043301–21043311 · motif
· motif · 21043302–21043312 · motif
· motif · 21043303–21043313 · motif
· motif · 21043304–21043314 · motif
· motif · 21043305–21043315 · motif
· motif · 21043422–21043432 · motif
· motif · 21043423–21043436 · motif
· motif · 21043428–21043438 · motif
· motif · 21043437–21043445 · motif
· motif · 21043508–21043518 · motif
· motif · 21043565–21043576 · motif
· motif · 21043711–21043727 · motif
· motif · 21043753–21043769 · motif
· motif · 21043792–21043814 · motif
· motif · 21043792–21043814 · motif
· motif · 21044085–21044096 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：525 aa
USP22 蛋白質長 525 個胺基酸，屬於 peptidase C19 家族的 UBP8 subfamily。其序列含有位於第 21–138 個胺基酸的 UBP-type zinc finger，以及第 176–520 個胺基酸的 USP domain。
蛋白質三維結構
細胞內定位
現有資料未指出兩處定位的調控條件或不同異構型間的差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- AASDHPPTQ9NRN7 · UniProt INTERACTION · 7 experiments · 2 筆來源紀錄
- ATXN7L1Q9ULK2 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- FUBP1Q96AE4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFATC2Q13469 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ATXN7L3Q14CW9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAG4O95429 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
USP22 是部分 SAGA 轉錄共活化組蛋白乙醯轉移酶複合體的組成成員；已列出的成員包括 ATXN7、ATXN7L3、ENY2、GCN5L2、SUPT3H、TAF10 與 TRRAP。在 SAGA 中，USP22、ATXN7L3 與 ENY2 形成執行組蛋白去泛素化所需的次複合體。USP22 直接與 ATXN7L3 互作，並由此被招募至 SAGA；也有資料記載其與 ATXN7L3B 弱互作。與 MED1 的互作則為相似性推定。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | USP22 是去泛素化酶，參與轉錄調控、細胞週期、免疫與發炎。在 SAGA 複合體中，它使 H2A、H2B 去泛素化並協助轉錄，也可由 MYC 等活化因子帶至特定啟動子。它能穩定 CCNB1，或透過穩定 SIRT1 拮抗 TP53 轉錄活化；在免疫方面則調節干擾素訊號、NLRP3、CD274、RIPK3 與 TRAF6。NLRP3 與 TRAF6 相關作用為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Deubiquitinase that plays a role in several cellular processes including transcriptional regulation, cell cycle progression or innate immunity. As part of the transcription regulatory histone acetylation (HAT) complex SAGA, catalyzes the deubiquitination of both histones H2A and H2B, thereby acting as a transcriptional coactivator. Recruited to specific gene promoters by activators such as MYC, where it is required for transcription. Facilitates cell-cycle progression by stabilizing CCNB1 and antagonizing its proteasome-mediated degradation in a cell cycle-specific manner. Modulates cell cycle progression and apoptosis also by antagonizing TP53 transcriptional activation through deacetylase SIRT1 stabilization. Plays multiple roles in immunity and inflammation. Participates in antiviral response by deubiquitinating the importin KPNA2, leading to IRF3 nuclear translocation and subsequent type I interferon production. Acts as a central regulator of type III IFN signaling by negatively regulating STING1 activation and ubiquitination. Inhibits NLRP3 inflammasome activation by promoting NLRP3 degradation through ATG5-dependent autophagy (By similarity). Deubiquitinates CD274 to induce its stabilization and thereby participates in maintenance of immune tolerance to self. Controls necroptotic cell death by regulating RIPK3 phosphorylation and ubiquitination. During bacterial infection, promotes pro-inflammatory response by targeting TRAF6 and removing its 'Lys-48'-linked polyubiquitination (By similarity) PMID 18206972 ↗ · PMID 18206973 ↗ · PMID 18469533 ↗ · PMID 22542455 ↗ · PMID 27030811 ↗ · PMID 31399419 ↗ · PMID 32130408 ↗ · PMID 33369872 ↗ · PMID 35933402 ↗ |
| 分子活性 | USP22 的酵素活性依賴硫醇，可水解由泛素 C 端 Gly 形成的酯鍵、硫酯鍵、醯胺鍵、胜肽鍵及異胜肽鍵。泛素是由 76 個胺基酸構成、可附著於蛋白質並作為細胞內標記訊號的蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Thiol-dependent hydrolysis of ester, thioester, amide, peptide and isopeptide bonds formed by the C-terminal Gly of ubiquitin (a 76-residue protein attached to proteins as an intracellular targeting signal). PMID 18206973 ↗ · PMID 22542455 ↗ · PMID 31399419 ↗ · PMID 32130408 ↗ · PMID 33369872 ↗ |
| 交互作用 | USP22 是部分 SAGA 轉錄共活化組蛋白乙醯轉移酶複合體的成員；其列出的組成包括 ATXN7、ATXN7L3、ENY2、GCN5L2、SUPT3H、TAF10、TRRAP 與 USP22。在複合體內，USP22、ATXN7L3、ENY2 形成執行組蛋白去泛素化所需的次複合體。USP22 直接與 ATXN7L3 互作並因此被招募至 SAGA，也與 ATXN7L3B 弱互作；與 MED1 的互作為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of some SAGA transcription coactivator-HAT complexes, at least composed of ATXN7, ATXN7L3, ENY2, GCN5L2, SUPT3H, TAF10, TRRAP and USP22. Within the SAGA complex, ATXN7L3, ENY2 and USP22 form a subcomplex required for histone deubiquitination. Interacts directly with ATXN7L3; leading to its recruitment to the SAGA complex. Interacts with ATXN7L3 and weakly with ATXN7L3B. Interacts with MED1 (By similarity) PMID 18206972 ↗ · PMID 27601583 ↗ |
| 細胞定位 | USP22 的細胞內定位包括細胞核與細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTGCAGCCTCCCCTCGGCGATCGCGCAGCCCCATCTTTG40TCCGGCCTCCGCGCTTTGTTCTCGGCGCCCGGGCCTTGGC80CAGCCTGGCCAGCCGCCGAGCAGCCCCCACGCCGCGCTGG120CGTCGTCCTCGCCTCCCTCGCCGCCGCCCCCCGCGCGCGG160CCGGGCCTTGCCCCCCATGGTGTCCCGGCCAGAGCCCGAG200GGCGAGGCCATGGACGCCGAGCTGGCGGTAGCGCCGCCGG240GCTGCTCGCACCTGGGCAGCTTCAAGGTGGACAACTGGAA280GCAGAACCTGCGGGCCATCTACCAGTGCTTCGTGTGGAGC320GGCACGGCTGAGGCCCGCAAGCGCAAGGCCAAGTCCTGTA360TCTGCCATGTCTGTGGCGTCCACCTCAACAGGCTGCATTC400CTGCCTCTACTGTGTCTTCTTCGGCTGTTTCACAAAGAAG440CATATTCACGAGCATGCGAAGGCGAAGCGGCACAACCTGG480CCATTGATCTGATGTACGGAGGCATCTACTGTTTTCTGTG520CCAGGACTACATCTATGACAAAGACATGGAAATAATCGCC560AAGGAGGAGCAGCGAAAAGCTTGGAAAATGCAAGGCGTTG600GAGAGAAGTTTTCAACTTGGGAACCAACCAAACGGGAGCT640TGAACTGCTGAAGCACAACCCGAAAAGGAGAAAGATCACC680TCGAACTGCACCATAGGTCTGCGTGGGCTGATCAACCTTG720GGAACACATGCTTCATGAACTGCATCGTGCAGGCCCTGAC760CCACACGCCACTTCTGCGGGACTTCTTCCTGTCTGACAGG800CACCGCTGTGAGATGCAGAGCCCCAGCTCCTGTCTGGTCT840GTGAGATGTCCTCACTGTTTCAGGAGTTTTACTCTGGACA880CCGGTCCCCTCACATCCCGTATAAGTTGCTGCACCTGGTG920TGGACCCACGCGAGGCACCTAGCAGGCTACGAGCAGCAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。