演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

USP14TGT

ubiquitin specific peptidase 14

USP14 是一種與蛋白酶體相關的去泛素化酶,可從被標記的蛋白質移除泛素,並參與多種蛋白質降解調控。

Homo sapiens18p11.32UniProt P54578
OFFICIAL SYMBOL
USP14
CHROMOSOME
18
UNIPROT
P54578
PDB / ALPHAFOLD
5GJQ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

USP14(ubiquitin specific peptidase 14)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 peptidase C19 family 的 USP14/UBP6 subfamily。蛋白質長 494 個胺基酸,具有 N 端 Ubiquitin-like 結構域及涵蓋主要部分序列的 USP 結構域。USP14 是去泛素化酶,與蛋白酶體可逆結合;細胞內也有相當一部分 USP14 不與蛋白酶體結合。其基本角色是處理蛋白質上的泛素標記,並參與蛋白質降解的調控。

Official symbol
USP14
Gene name
ubiquitin specific peptidase 14
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12612
UniProt
P54578
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TGTUbp6

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1818p11.32
chr18 · 80,373,285 bp · GRCh38chr18p11.32 · 1–2900000 · gnegchr18p11.31 · 2900001–7200000 · gpos50chr18p11.23 · 7200001–8500000 · gnegchr18p11.22 · 8500001–10900000 · gpos25chr18p11.21 · 10900001–15400000 · gnegchr18p11.1 · 15400001–18500000 · acenchr18q11.1 · 18500001–21500000 · acenchr18q11.2 · 21500001–27500000 · gnegchr18q12.1 · 27500001–35100000 · gpos100chr18q12.2 · 35100001–39500000 · gnegchr18q12.3 · 39500001–45900000 · gpos75chr18q21.1 · 45900001–50700000 · gnegchr18q21.2 · 50700001–56200000 · gpos75chr18q21.31 · 56200001–58600000 · gnegchr18q21.32 · 58600001–61300000 · gpos50chr18q21.33 · 61300001–63900000 · gnegchr18q22.1 · 63900001–69100000 · gpos100chr18q22.2 · 69100001–71000000 · gnegchr18q22.3 · 71000001–75400000 · gpos25chr18q23 · 75400001–80373285 · gnegUSP14pq1 bp80,373,285 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr18:158,328–214,629
Gene span
56,302 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000261601 ★158,557–214,62916
ENST00000582707158,328–214,62915
ENST00000400266158,328–214,62915
ENST00000383589158,328–214,62914
ENST00000873770158,328–214,62916
ENST00000873771158,328–214,62915
ENST00000873772158,328–214,62915
ENST00000936898158,328–214,62914
ENST00000947712158,328–214,62916
ENST00001131546158,328–214,62916
ENST00000580410158,557–163,4313
ENST00000581983158,858–163,4543

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

USP14 是蛋白酶體相關的去泛素化酶,可從送往蛋白酶體的泛素化蛋白質上移除泛素,促進蛋白酶體處泛素的再生。它與蛋白酶體呈可逆結合,但細胞內也有相當一部分 USP14 游離於蛋白酶體之外。其酵素活性依賴硫醇,可水解由泛素 C 端 Gly 形成的酯鍵、硫酯鍵、醯胺鍵、胜肽鍵及異胜肽鍵。

USP14 也參與特定蛋白質的降解調控。CXCR4 的降解需要 USP14,而 CXCR4 對 CXCL12 誘導的細胞趨化至關重要。此外,在未受壓力的條件下,USP14 會透過與 ERN1 作用,抑制未摺疊內質網蛋白質的降解,因此作為內質網相關降解(ERAD)的生理性抑制因子。

在先天免疫方面,USP14 可穩定病毒 DNA 感測器 CGAS,抑制其自噬性降解,因而參與抗病毒防禦。TRIM14 與 USP14 的互作可招募 USP14,使其切割 CGAS 的泛素鏈。USP14 也抑制 OPTN 介導的 KDM4D 選擇性自噬性降解;來源指出,此作用會負向調節 H3K9me2 與 H3K9me3。

此外,USP14 對神經肌肉接合處的突觸發育與功能不可或缺;此項功能的證據標示為相似性推論。上述作用顯示 USP14 除了參與蛋白酶體處理泛素標記,也會影響特定蛋白質的穩定性與降解途徑。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 158557 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>USP14 ENST00000261601 GRCh38 chr18:157557-158657 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTCAGTCACATCTGTGGGCTCCACTTCTAATTCTAGTTCTCTTGCTATTGCCACCACACCTGCAGTTGTG
TCCTGAACTCAAGCCTTGAACCCTTGTGGGAAAAGACTTGTTGCCAGAGCAGTCAGAATACACAAAACAT
TGGAGTTAGCTGTTTTACACGGGGGTGGTTAGTGGCACCCCAAAACAACTAAAATAGTAATCATAGATCA
CTGGAACAGATATAATAGTATTTAAAAAGTTCAAAATATTGTGAGAATTACCAAAATGTGACACAGAGAC
ACGAAGTGAGCACATGCTGTTAGAAAAACAGAACTGATGGACTTACTAACCCAGGGTTGCCACAAACCTT
CAATTTATATATATATATATATAAATATATATAAATATATAAATATATATAAATATATAAAAATATATAA
ATATATAAAAATATATAAATATATATATATAGAACGCAATAAAATGAGGTGTGGGTGAAAAGAAAACTGA
GGTTTGCAGACATCATACAGCTAGCTAGTAACAGCTGGGTTTCAAAACACCTCTGACTTTACAACCACTA
ATTTTATTTATTTTATTTTGAGGCAGGGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGGCACGATCAC
AGCTCACTGCAGCCTCGACCTCCTGGGCTCAAGCGATTCTCCCGCCTCAGCCTCAGACAGCAGGTGGGAT
ACCAAGTTCCCACTTCATCTGCCGCAGGGCTGGGCCGCGCCAGGACCACGTGGCCAGTGCGCGCAGGGCG
ATGGGCGGCAGTGCGCAGGCGCGCACCTGCTGCGGTGGATGGGGCCCCGCGCCCGTCCCTCACTTGCTCC
CTCCTTCCTTCCCGCCACCCCTCCACCGCCTTCCCCCTCCTCCCTCCTCTCGCCACCTCTAGGCCCCGCC
CCGGTCCTGCCGCCCAGTCTCCTCGCTGCAGTCGCTCCGGAGCTGCACGGGTGTTTTGCGTGTTGCTGCG
TCATCGCCAGTGGCCGGTTTGAATGAGACTCGTCGCACCGAAGCCGCCGCCACCACCGCGCCTCCGCCTC
GGCCGCCGCCGCAGCTGCTCCTGGTCCCCGTCCCTTTGCCGCCCTCGTCAG
USP14 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
USP14_1 ↗18:158,589正股158,540–158,599

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR18_BSW · promoter · 158005–158601 · regulatory

ENSR18_5326K · CTCF_binding_site · 158443–158464 · regulatory

ENSR18_BT2 · enhancer · 158602–159594 · regulatory

· motif · 156695–156706 · motif

· motif · 158234–158249 · motif

· motif · 158245–158254 · motif

· motif · 158292–158308 · motif

· motif · 158292–158308 · motif

· motif · 158301–158310 · motif

· motif · 158301–158310 · motif

· motif · 158303–158319 · motif

· motif · 158303–158319 · motif

· motif · 158338–158349 · motif

· motif · 158338–158349 · motif

· motif · 158348–158357 · motif

· motif · 158370–158380 · motif

· motif · 158410–158420 · motif

· motif · 158429–158439 · motif

· motif · 158445–158461 · motif

· motif · 158459–158469 · motif

· motif · 158529–158543 · motif

· motif · 158529–158543 · motif

· motif · 158577–158594 · motif

· motif · 158988–159010 · motif

· motif · 158988–159010 · motif

· motif · 158998–159013 · motif

· motif · 159568–159582 · motif

· motif · 159568–159582 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:494 aa

1 aa494 aa結構域
依 P54578 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

USP14 蛋白質長 494 個胺基酸,屬於 peptidase C19 family 的 USP14/UBP6 subfamily。其 N 端第 4–80 位胺基酸構成 Ubiquitin-like 結構域;第 105–483 位胺基酸為 USP 結構域。

結構域Ubiquitin-like4–80 aa
結構域USP105–483 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5GJQ…

PDB · 5GJQ

EM · 4.50 A · x=1-494

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Cell membrane

USP14 位於細胞質,也可作為周邊膜蛋白定位於細胞膜。 來源未提供定位改變的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TGTUSP14PPP3CA
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

USP14 與 26S proteasome 結合,並與 FANCC、CXCR4 及 ERN1 互作。它也與 TRIM14 互作;此互作會招募 USP14,使其切割 CGAS 與 KDM4D 的泛素鏈。USP14 形成同源二聚體的說法仍屬潛在可能。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能USP14 是蛋白酶體相關去泛素化酶,可移除送往蛋白酶體之泛素化蛋白上的泛素並促進泛素再生;亦參與 CXCR4 降解、未受壓力時抑制 ERAD、神經肌肉接合處突觸功能,以及 CGAS 和 KDM4D 的穩定性調控。含實驗來源
證據與來源

Proteasome-associated deubiquitinase which releases ubiquitin from the proteasome targeted ubiquitinated proteins. Ensures the regeneration of ubiquitin at the proteasome. Is a reversibly associated subunit of the proteasome and a large fraction of proteasome-free protein exists within the cell. Required for the degradation of the chemokine receptor CXCR4 which is critical for CXCL12-induced cell chemotaxis. Also serves as a physiological inhibitor of endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) under the non-stressed condition by inhibiting the degradation of unfolded endoplasmic reticulum proteins via interaction with ERN1. Indispensable for synaptic development and function at neuromuscular junctions (NMJs) (By similarity). Plays a role in the innate immune defense against viruses by stabilizing the viral DNA sensor CGAS and thus inhibiting its autophagic degradation. Inhibits OPTN-mediated selective autophagic degradation of KDM4D and thereby negatively regulates H3K9me2 and H3K9me3

PMID 18162577 ↗ · PMID 19106094 ↗ · PMID 19135427 ↗ · PMID 27666593 ↗ · PMID 28396413 ↗ · PMID 35145029 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性USP14 具有依賴硫醇的水解活性,可水解由泛素 C 端 Gly 形成的酯鍵、硫酯鍵、醯胺鍵、胜肽鍵及異胜肽鍵;泛素是由 76 個胺基酸構成、附著於蛋白質上的細胞內標的訊號。含實驗來源
證據與來源

Thiol-dependent hydrolysis of ester, thioester, amide, peptide and isopeptide bonds formed by the C-terminal Gly of ubiquitin (a 76-residue protein attached to proteins as an intracellular targeting signal).

PMID 16211010 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用USP14 與 26S proteasome 結合,並與 FANCC、CXCR4、ERN1 及 TRIM14 互作;TRIM14 會招募 USP14,使其切割 CGAS 與 KDM4D 的泛素鏈。同源二聚體僅標示為可能形成。含實驗來源
證據與來源

Homodimer (Potential). Associates with the 26S proteasome. Interacts with FANCC, CXCR4 and ERN1. Interacts with TRIM14; this interaction recruits USP14 to cleave ubiquitin chains of CGAS and KDM4D

PMID 14499622 ↗ · PMID 19106094 ↗ · PMID 19135427 ↗ · PMID 27666593 ↗ · PMID 35145029 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位USP14 定位於細胞質,亦可見於細胞膜,並以周邊膜蛋白的形式定位。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Cell membrane / Peripheral membrane protein

PMID 19106094 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000261601 · 4,972 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAATGAGACTCGTCGCACCGAAGCCGCCGCCACCACCGCG40
41CCTCCGCCTCGGCCGCCGCCGCAGCTGCTCCTGGTCCCCG80
81TCCCTTTGCCGCCCTCGTCAGGCCCAGCTCTCCTGCGCCG120
121CCGCCTCCCGCCGCGCCCCGCCATGCCGCTCTACTCCGTT160
161ACTGTAAAATGGGGAAAGGAGAAATTTGAAGGTGTAGAAT200
201TGAATACAGATGAACCTCCAATGGTATTCAAGGCTCAGCT240
241GTTTGCGTTGACTGGAGTCCAGCCTGCCAGACAGAAAGTT280
281ATGGTGAAAGGAGGAACGCTAAAGGATGATGATTGGGGAA320
321ACATCAAAATAAAAAATGGAATGACTCTACTAATGATGGG360
361GTCAGCAGATGCTCTTCCAGAAGAACCCTCAGCCAAAACT400
401GTCTTCGTAGAAGACATGACAGAAGAACAGTTAGCATCTG440
441CTATGGAGTTACCATGTGGATTGACAAACCTTGGTAACAC480
481TTGTTACATGAATGCCACAGTTCAGTGTATTCGTTCTGTG520
521CCTGAACTCAAAGATGCCCTTAAAAGGTATGCAGGTGCCT560
561TGAGAGCTTCAGGGGAAATGGCTTCAGCGCAGTATATTAC600
601TGCAGCCCTTAGAGATTTGTTTGATTCCATGGATAAAACT640
641TCTTCCAGTATTCCACCTATTATTCTACTGCAGTTTTTGC680
681ACATGGCTTTCCCACAGTTTGCCGAGAAAGGTGAACAAGG720
721ACAGTATCTTCAACAGGATGCTAATGAATGTTGGATACAA760
761ATGATGCGAGTATTGCAACAGAAATTGGAAGCAATAGAGG800
801ATGATTCTGTTAAAGAGACAGACTCCTCATCTGCATCGGC840
841AGCGACACCTTCTAAAAAGAAAAGTTTAATCGATCAGTTC880
881TTCGGTGTTGAGTTTGAAACTACCATGAAATGTACAGAAT920
921CTGAAGAAGAAGAAGTCACCAAAGGAAAGGAAAATCAACT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。