基因總覽
USF2（upstream transcription factor 2, c-fos interacting）是蛋白質編碼基因，產物屬於轉錄因子。其蛋白質含有 bHLH 結構域，並具有亮氨酸拉鍊區域；這些是其序列註解中的結構特色。來源描述 USF2 可辨識特定 DNA 序列，並指出其 DNA 結合形式包括同源與異源二聚體。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000222305 ★ | 35,268,962–35,279,821 | 10 |
| ENST00000343550 | 35,268,485–35,279,821 | 9 |
| ENST00000595068 | 35,268,485–35,279,821 | 10 |
| ENST00000886191 | 35,268,485–35,279,821 | 9 |
| ENST00001143437 | 35,268,485–35,279,821 | 10 |
| ENST00000379134 | 35,269,102–35,279,256 | 8 |
| ENST00000594064 | 35,269,108–35,279,308 | 9 |
| ENST00000598058 | 35,269,115–35,270,097 | 4 |
| ENST00000596380 | 35,270,263–35,278,765 | 4 |
| ENST00000599471 | 35,270,450–35,279,667 | 5 |
| ENST00000599625 | 35,271,001–35,279,247 | 4 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
USF2 是轉錄因子，可辨識 DNA 上具對稱性的 E-box 序列，序列為 5'-CACGTG-3'。這類序列存在於多種病毒與細胞啟動子中，提供 USF2 與啟動子 DNA 結合的特定位置資訊。來源支持其 DNA 辨識特性，但未進一步說明結合後對特定基因轉錄的調控方向或效果。
Promoter 與基因調控
>USF2 ENST00000222305 GRCh38 chr19:35267962-35269062 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAAGCTCTGGAGAGAACCATTTGTTCGGCCGCGCGGGGCGGGGGACCGGGGCTGCTCCCGTATGCGTCTG TAAAGCGCCGCGTCCCGGGGGCACCGGAGTCCGGGGCCGGGAGGAAGAGACCCAGCCTGGCCCGGCCCGC GCCCGCGCCGCCGGCCGGAGAACGTGCCCCGCGCAGCCGCCGCCCGCCTGCGTGCGCGCCCCGGCCCCGC CCAGGCGTGCGCATGCGCCCCGGCCCTCCGCCTTCGCGCACCGCAGGCTGGCCGTCCGGGACGCGCGCGC GCTCCTCTCCCCTTCCAGCCCATCCCCCCCAGCCCCCCACCGACCTACTTTACTGTCTCCAAACTCGGGC AGCCCACCTGGCCCCCGACGACCCCAGCCCCTGCACCGGGTACCCCGACGTTCCATCCAGACCCGCGTTT CACCAGGGCGGCGCGCGGCGACCTCGCGCCCCGCGGAGCCCCGGGCTCGCGCGCGCCCGCCCGCCCCCGG AGACAGACCAGCGCGCGCGCCCCGGGCCGCCTCCCCCCAGCGCGCGTCCGCCCCGGGGCTCGCGCCGCCG CCGCCGCCGCCGCCGCGCGCGCGCAGCTCAAGTAAAGGAGGAAAAAAAAAAGGGGGAAAAATAGAAAGCG GCGGCGGCTGCAGCAGCGATCCGCCGCCGGACTGGGCCAAGCCGGGCGGCGGCCGCGCGAGCCGGCGATC CAGGGCACTGGCGGCGGCCAGCCAGGGCGGGCCGTGTTCAAAAAAAAAAGTCGCGGCGGCGGCGGCTGCT CAGGGAAGGAGGCCTGAGGGCCGCGTGCAGCGGGCGGGCAGCTGGGTGGGCTGGGGGCGGCCGCGCGGCG TCCCGGAGCCTCGGGCCGCCCGGAGCCGGCGGGCGGGCGGAGGCGGAGGCGGCGGCGGCTGCAGCGGCTG CAGGAGCGGCGGCGGCTGCGGCGGCGGCGGCGGCATCTCCTCCTCACATGACCCCACTGTTTGTCCCCGT GATCAGCGCGAGCGGCTCCCGTATCTCCTCCGTCCCCTCCTGCCGCGCGGCGTGAGCGCCGGGCTCGGGG CCCCCCCGGCCGCCCGCCCCCTCCCCTCCCTCCCTCCCCTCCCCTCCCCTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| USF2_2 ↗ | 19:35,268,530 | 正股 | 35,268,481–35,268,540 |
| USF2_1 ↗ | 19:35,268,962 | 正股 | 35,268,913–35,268,972 |
| USF2_3 ↗ | 19:35,269,102 | 正股 | 35,269,053–35,269,112 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_B8ZZJ · promoter · 35268121–35269118 · regulatory
ENSR19_5B9ZLC · CTCF_binding_site · 35269629–35269650 · regulatory
ENSR19_5B9ZM4 · CTCF_binding_site · 35269787–35269808 · regulatory
ENSR19_83322C · enhancer · 35272432–35272619 · regulatory
· motif · 35264024–35264039 · motif
· motif · 35264029–35264041 · motif
· motif · 35264032–35264039 · motif
· motif · 35266430–35266441 · motif
· motif · 35266917–35266930 · motif
· motif · 35267219–35267232 · motif
· motif · 35267219–35267232 · motif
· motif · 35267677–35267690 · motif
· motif · 35268099–35268110 · motif
· motif · 35268173–35268184 · motif
· motif · 35268173–35268184 · motif
· motif · 35268179–35268190 · motif
· motif · 35268179–35268190 · motif
· motif · 35268231–35268242 · motif
· motif · 35268233–35268244 · motif
· motif · 35268399–35268414 · motif
· motif · 35268441–35268454 · motif
· motif · 35268586–35268599 · motif
· motif · 35268835–35268848 · motif
· motif · 35268841–35268854 · motif
· motif · 35268886–35268899 · motif
· motif · 35269233–35269243 · motif
· motif · 35269382–35269395 · motif
· motif · 35269388–35269401 · motif
· motif · 35269631–35269647 · motif
· motif · 35269687–35269697 · motif
· motif · 35269789–35269805 · motif
· motif · 35270192–35270203 · motif
· motif · 35272525–35272538 · motif
· motif · 35272615–35272623 · motif
· motif · 35272745–35272756 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：346 aa
USF2 蛋白質長 346 個胺基酸。其 bHLH 結構域位於第 235–290 個胺基酸；另有兩段註記為無序區，分別位於第 1–44 與第 215–244 個胺基酸。亮氨酸拉鍊區域位於第 307–328 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供其定位變化條件或不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- FOSQ6FG41 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LZTS2Q9BRK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEAD2Q15562 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
USF2 可與 MAF 互作，此項資訊標註為相似性推定。有效的 DNA 結合需要與另一個 bHLH 蛋白形成二聚體；USF2 可形成同源二聚體，也可與 USF1 形成異源二聚體。在體內，USF1/USF2A 異源二聚體占 USF 結合活性的 66% 以上，而 USF1 與 USF2A 的同源二聚體各自合計不到 10%。在某些細胞中，USF1/USF2B 異源二聚體約占 15%。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | USF2 是轉錄因子，能辨識具對稱性的 E-box DNA 序列 5'-CACGTG-3'。這類序列存在於多種病毒與細胞啟動子中；該描述指出其結合序列與所在位置類型，但未說明結合後的轉錄調控方向或效果。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Transcription factor that binds to a symmetrical DNA sequence (E-boxes) (5'-CACGTG-3') that is found in a variety of viral and cellular promoters |
| 交互作用 | USF2 與 MAF 的互作標註為相似性推定。有效 DNA 結合需要與另一個 bHLH 蛋白二聚；USF2 可形成同源二聚體或與 USF1 形成異源二聚體。在體內，USF1/USF2A 異源二聚體占 USF 結合活性的 66% 以上，USF1 與 USF2A 同源二聚體合計不到 10%；USF1/USF2B 異源二聚體在某些細胞中約占 15%。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts with MAF (By similarity). Efficient DNA binding requires dimerization with another bHLH protein. Binds DNA as a homodimer or a heterodimer (USF1/USF2). In vivo, the USF1/USF2A heterodimer represents over 66% of the usf binding activity whereas the USF1 and USF2A homodimers represent less than 10%. The USF1/USF2B heterodimer accounted for almost 15% in some cell |
| 細胞定位 | USF2 的細胞內定位為細胞核。此筆資料未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTATCTCCTCCGTCCCCTCCTGCCGCGCGGCGTGAGCGCC40GGGCTCGGGGCCCCCCCGGCCGCCCGCCCCCTCCCCTCCC80TCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCCCCGGGCCCCGCGCCC120CCCCCGCCCCCGCCCCCCCCATGGACATGCTGGACCCGGG160TCTGGATCCCGCTGCCTCGGCCACCGCTGCTGCCGCCGCC200AGCCACGACAAGGGACCCGAGGCGGAGGAGGGCGTCGAGC240TGCAGGAAGGCGGGGACGGCCCAGGAGCGGAGGAGCAGAC280AGCGGTGGCCATCACCAGCGTCCAGCAGGCGGCGTTCGGC320GACCACAACATCCAGTACCAGTTCCGCACAGAGACAAATG360GAGGACAGGTGACATACCGCGTAGTCCAGGTGACTGATGG400TCAGCTGGACGGCCAGGGCGACACAGCTGGCGCCGTCAGC440GTCGTGTCCACCGCTGCCTTCGCGGGGGGGCAGCAGGCTG480TGACCCAGGTGGGTGTGGACGGGGCAGCCCAGCGCCCGGG520CCCCGCCGCTGCCTCTGTGCCCCCAGGTCCTGCAGCGCCC560TTCCCGCTGGCTGTGATCCAAAATCCCTTCAGCAATGGTG600GCAGTCCGGCGGCCGAGGCTGTCAGCGGGGAGGCACGATT640TGCCTATTTCCCAGCGTCCAGTGTGGGAGATACTACGGCT680GTGTCCGTACAGACCACAGACCAGAGCTTGCAGGCTGGAG720GCCAGTTCTACGTCATGATGACGCCCCAGGATGTGCTTCA760GACAGGAACACAGAGGACGATCGCCCCCCGGACACACCCT800TACTCTCCAAAAATTGATGGAACCAGAACACCCCGAGATG840AGAGGAGAAGAGCCCAGCACAACGAAGTGGAGCGGAGGCG880GAGGGACAAGATCAACAACTGGATCGTCCAGCTTTCGAAA920ATCATTCCAGACTGTAACGCAGACAACAGCAAGACGGGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。