演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UROS

uroporphyrinogen III synthase

UROS 編碼 uroporphyrinogen III synthase,催化血基質生合成相關路徑中的環化反應,形成卟啉代謝分支所需的 uroporphyrinogen III。

Homo sapiens10q26.2UniProt P10746
OFFICIAL SYMBOL
UROS
CHROMOSOME
10
UNIPROT
P10746
PDB / ALPHAFOLD
1JR2
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UROS 是蛋白質編碼基因,其產物為 uroporphyrinogen III synthase,屬於 uroporphyrinogen-III synthase 家族。此酵素參與卟啉代謝,產生的 uroporphyrinogen III 位於多種卟啉合成支路的分岔點;卟啉則可作為多種酵素的輔因子。

Official symbol
UROS
Gene name
uroporphyrinogen III synthase
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12592
UniProt
P10746
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q26.2
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegUROSpq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr10:125,784,980–125,823,288
Gene span
38,309 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000368797 ★125,788,586–125,823,25810
ENST00000616800125,784,980–125,796,1633
ENST00000622016125,785,517–125,798,1194
ENST00001036329125,785,523–125,823,2889
ENST00000879942125,788,574–125,823,2889
ENST00000879951125,788,577–125,823,23910
ENST00000879943125,788,579–125,823,28810
ENST00000879945125,788,580–125,823,28811
ENST00000879952125,788,580–125,823,28810
ENST00000879954125,788,580–125,823,2889
ENST00000879944125,788,581–125,823,28811
ENST00000961001125,788,582–125,823,25210

顯示 12/46 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

uroporphyrinogen III synthase 催化線性四吡咯 hydroxymethylbilane 環化,生成大環狀的 uroporphyrinogen III。此反應亦可表述為 hydroxymethylbilane 轉化為 uroporphyrinogen III 並生成水。

生成的 uroporphyrinogen III 是多條卟啉合成支路的分岔點,使其成為卟啉多樣性形成過程中的重要中間產物。相關代謝註解涵蓋含卟啉化合物代謝、protoporphyrin-IX 生合成,以及由 5-aminolevulinate 生成 coproporphyrinogen-III 的路徑步驟。

卟啉可作為多種酵素的輔因子,支持不同細胞過程;來源列舉的例子包括與 vitamin B12 相關的 methionine 合成,以及由 heme 參與的氧運輸。因此,UROS 所催化的反應連結了上游線性中間物與後續卟啉代謝支路。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 125823258 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UROS ENST00000368797 GRCh38 chr10:125823158-125824258 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCACGACTTGGTCAGCTGCCCCAGGAGCCAGAAAATACAGCCTAGCTGAGATCTGAAGAAGGAAGGGAA
AACTGCAGGATAAAGAAGAGCATTTGAAAAGGCTTCTACGGTAGAACGCGGCAAGAGCCTTCAAGAAACT
GAGGGCCCAAGTGAGTGCCGCCCGCAGAGTGAAGAGGAGGACAGCTGCTGCCCCGAGGGGAGAGGGCCCC
CTCTGCGAGCCCGGGGTGGCCGATTCAGGATCTGAGGCTTCAGCCTGAGAACTAAAGAGGACGAGAAGAA
CACACCTGTTGTGGCGGGCTTTTTCGGGGAGGACGCGGGTTGGGAGATTAACTGGACCGGACTAGACCTT
TAAAAAATAACTACTATGGCTGCAGTGTGTTAAAGACCGAGGAGAAACCTGAGAAAGAACTTATCTCCAG
TTTCTCCTCACAGACCCTCAGGGTCAGGGAAGACCCTACACTATTTTTACACAGCCTGGGCTTGCCAAAA
AGTTTTTCTCAGGTATAAACCAACTAGGGGAGCGTGTCCTTCTCACCTCGTCAATGACCTCGTCCTCTTC
ATCCTTTTCCTTGTCACTGTCATCATCGTCTTCATCCTCATTTTCGACTTCTTTTTCCTCTTCCTCGTCG
CGCTGGACTGGGGGATCCGGCGGCTGCGGAACCCCACTTTCCACGGCACGCCGCTTAGACCTGGACGCCA
TGTTGCCGCTCACACTGCGCCTGCGCAGCTTCCCCTTGCCTGACCTTCCGGACCAGCCCATAGTAGCCAA
GGGGGTGAGGAACTACGAAGAAGCTCGGCGCTGAGTGCACGTCAACCCCAATGCCCCTGCTGGATTCCGC
AGCCATGACCCCTTACAGTCACGTCCAGCTTGCGGTCCCATCTTGCTTTTTTCTTCCGCTTTCCACCCTC
CATCACTCCTCCCAAAGCTTCCCCTCCCCTTCCCGTAGTGGTTCAACCCATCTAACCTCTGGCCTCATTC
CGTGGCCTGGATGGCGGTGCGCATGCGCGAGCGCCTAGCTGCGCGCAGCCACCCACGCGACCCCAGTCTG
AGGTGCGGGGTCCTGGGGCCCGGCGCGGGTGGCCGCCGCGGCCCCTCGGGC
UROS 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UROS_2 ↗10:125,816,614負股125,816,604–125,816,663
UROS_1 ↗10:125,823,256負股125,823,246–125,823,305

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_93SXDH · enhancer · 125820644–125820971 · regulatory

ENSR10_BWZ7J · enhancer · 125822548–125823078 · regulatory

ENSR10_534L3JG · CTCF_binding_site · 125822681–125822702 · regulatory

ENSR10_93SXF7 · promoter · 125823079–125823556 · regulatory

ENSR10_93SXFN · enhancer · 125824759–125825090 · regulatory

· motif · 125820904–125820917 · motif

· motif · 125820904–125820917 · motif

· motif · 125820948–125820960 · motif

· motif · 125821550–125821559 · motif

· motif · 125821550–125821559 · motif

· motif · 125822541–125822556 · motif

· motif · 125822546–125822558 · motif

· motif · 125822549–125822556 · motif

· motif · 125822676–125822691 · motif

· motif · 125822681–125822693 · motif

· motif · 125822683–125822699 · motif

· motif · 125822684–125822691 · motif

· motif · 125822708–125822715 · motif

· motif · 125823218–125823231 · motif

· motif · 125823244–125823255 · motif

· motif · 125823250–125823261 · motif

· motif · 125823250–125823261 · motif

· motif · 125823283–125823296 · motif

· motif · 125823348–125823368 · motif

· motif · 125823357–125823368 · motif

· motif · 125823357–125823368 · motif

· motif · 125823381–125823396 · motif

· motif · 125823405–125823417 · motif

· motif · 125823407–125823414 · motif

· motif · 125823532–125823543 · motif

· motif · 125823532–125823543 · motif

· motif · 125823708–125823715 · motif

· motif · 125823720–125823735 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:265 aa

uroporphyrinogen III synthase 屬於 uroporphyrinogen-III synthase 家族。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1JR2…

PDB · 1JR2

X-ray · 1.84 A · A/B=1-265

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytosol

此蛋白質定位於細胞質,並註記位於 cytosol。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UROSUROS
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源將此蛋白質記載為單體;未提供其與其他蛋白質結合或形成複合體的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

UROS 活性缺乏與先天性紅血球生成性卟啉症(CEP)相關。來源指出,該病由影響此基因的變異造成;疾病表現程度不一,可從胎兒期嚴重溶血性貧血相關的非免疫性胎兒水腫,到成年後才出現皮膚病灶與光敏感。活性不足時,hydroxymethylbilane 可非酵素性轉化為 uroporphyrinogen-I 異構物。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能uroporphyrinogen III synthase 催化線性四吡咯 hydroxymethylbilane 環化,生成大環狀 uroporphyrinogen III;此產物是多條卟啉合成支路的分岔點。卟啉可作為多種酵素的輔因子,參與細胞內不同過程,例如 vitamin B12 相關的 methionine 合成或 heme 相關的氧運輸。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes cyclization of the linear tetrapyrrole, hydroxymethylbilane, to the macrocyclic uroporphyrinogen III, the branch point for the various sub-pathways leading to the wide diversity of porphyrins. Porphyrins act as cofactors for a multitude of enzymes that perform a variety of processes within the cell such as methionine synthesis (vitamin B12) or oxygen transport (heme)

PMID 11689424 ↗ · PMID 18004775 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hydroxymethylbilane = uroporphyrinogen III + H2O含實驗來源
證據與來源

hydroxymethylbilane = uroporphyrinogen III + H2O

PMID 11689424 ↗ · PMID 18004775 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性此註解將相關功能列為含卟啉化合物代謝與 protoporphyrin-IX 生合成,並標示由 5-aminolevulinate 生成 coproporphyrinogen-III 的路徑步驟為第 3/4 步;來源未提供此步驟的進一步反應描述。資料庫紀錄
證據與來源

Porphyrin-containing compound metabolism; protoporphyrin-IX biosynthesis; coproporphyrinogen-III from 5-aminolevulinate: step 3/4

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Monomer含實驗來源
證據與來源

Monomer

PMID 11689424 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位定位註解指出此蛋白質位於細胞質,並列出 cytosol;來源未說明定位改變的條件、異構型差異或細胞內動態。推論支持
證據與來源

Cytoplasm, cytosol

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯先天性紅血球生成性卟啉症(CEP)與影響 UROS 基因的變異及 UROS 活性缺乏相關。表現可由胎兒期嚴重溶血性貧血相關的非免疫性胎兒水腫,至較晚發病、成年時僅有皮膚病灶與光敏感;活性不足也會使 hydroxymethylbilane 非酵素性轉化為 uroporphyrinogen-I 異構物。含實驗來源
證據與來源

Congenital erythropoietic porphyria CEP Porphyrias are inherited defects in the biosynthesis of heme, resulting in the accumulation and increased excretion of porphyrins or porphyrin precursors. They are classified as erythropoietic or hepatic, depending on whether the enzyme deficiency occurs in red blood cells or in the liver. The manifestations of CEP are heterogeneous, ranging from nonimmune hydrops fetalis due to severe hemolytic anemia in utero to milder, later onset forms, which have only skin lesions due to cutaneous photosensitivity in adult life. The deficiency in UROS activity results in the non-enzymatic conversion of hydroxymethylbilane (HMB) into the uroporphyrinogen-I isomer. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 263700

PMID 11121156 ↗ · PMID 11689424 ↗ · PMID 12060141 ↗ · PMID 15304101 ↗ · PMID 1733834 ↗ · PMID 1737856 ↗ · PMID 21653323 ↗ · PMID 22350154 ↗ · PMID 2331520 ↗ · PMID 7860775 ↗ · PMID 8655129 ↗ · PMID 9188670 ↗ · PMID 9803266 ↗ · PMID 9834209 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000368797 · 1,336 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCATGCGCGAGCGCCTAGCTGCGCGCAGCCACCCACGCGA40
41CCCCAGTCTGAGGTGCGGGGTCCTGGGGCCCGGCGCGGGT80
81GGCCGCCGCGGCCCCTCGGGCTGCGTGGGGAGGGGGCTTC120
121CGCCCCTGTTGTCATTGCTCCTGCAGCCTTTTCGCTGGGA160
161CTGCGCGACACCGCCCCCCGACCGGGTGCCCGCTGTGTGC200
201CAGGCCGGGTGCTGGGCACGGTCCCGCGAGTGCCCTATAA240
241GGACTGCCAGGCAATAATGAAGGTTCTTTTACTGAAGGAT280
281GCGAAGGAAGATGACTGTGGCCAGGATCCGTATATCAGGG320
321AATTAGGATTATATGGACTTGAAGCCACTTTGATCCCTGT360
361TTTATCGTTTGAGTTTTTGTCTCTTCCCAGTTTCTCTGAG400
401AAGCTTTCTCATCCTGAAGATTACGGGGGACTCATTTTTA440
441CCAGCCCCAGAGCAGTGGAAGCAGCAGAGTTATGTTTGGA480
481GCAAAACAATAAAACTGAAGTCTGGGAAAGGTCTCTGAAA520
521GAAAAATGGAATGCCAAGTCAGTGTATGTGGTTGGAAATG560
561CTACTGCTTCTCTAGTGAGTAAAATTGGCCTGGATACAGA600
601AGGAGAAACCTGTGGAAATGCAGAAAAGCTTGCAGAATAT640
641ATTTGTTCCAGGGAGTCCTCAGCACTGCCTCTTCTATTTC680
681CCTGTGGAAACCTCAAAAGAGAAATCCTGCCAAAAGCGCT720
721CAAGGACAAAGGGATTGCCATGGAAAGCATAACTGTGTAT760
761CAGACAGTTGCACACCCAGGAATCCAAGGGAACCTGAACA800
801GCTACTATTCCCAGCAGGGGGTTCCAGCCAGCATCACATT840
841TTTTAGTCCCTCTGGCCTCACATACAGTCTCAAGCACATT880
881CAGGAGTTATCTGGTGACAATATCGATCAAATTAAGTTTG920
921CAGCCATCGGCCCCACTACGGCTCGCGCGCTGGCCGCCCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。