基因總覽
URI1 的正式名稱為 URI1 prefoldin like chaperone，屬於 RNA polymerase II subunit 5-mediating protein 家族。其蛋白質具有支架特性，來源描述它可組成含有 PFD 蛋白，以及參與轉錄與泛素化的蛋白質之 prefoldin-like 複合體；URI1 也屬於 PAQosome 複合體的組成成員。這些特性使 URI1 涉及多種蛋白質複合體的組裝與細胞調控工作。其功能涵蓋基因轉錄調節，以及營養與生長訊號相關過程。蛋白質全長為 535 個胺基酸，序列中有數段被註釋為無序區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000392271 ★ | 29,942,239–30,016,612 | 11 |
| ENST00000360605 | 29,923,644–30,017,781 | 11 |
| ENST00000570564 | 29,923,657–29,986,377 | 5 |
| ENST00000574233 | 29,923,691–30,005,436 | 6 |
| ENST00000585655 | 29,923,734–29,925,897 | 2 |
| ENST00000988732 | 29,942,185–30,017,781 | 11 |
| ENST00001109165 | 29,942,205–30,009,502 | 8 |
| ENST00001116644 | 29,942,229–29,943,370 | 2 |
| ENST00000909804 | 29,942,234–30,015,704 | 9 |
| ENST00001109164 | 29,942,239–30,012,064 | 9 |
| ENST00001116643 | 29,942,241–30,012,051 | 9 |
| ENST00000909805 | 29,942,260–30,015,709 | 11 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
URI1 參與基因轉錄調節。它與共抑制因子 UXT 協同，抑制 androgen receptor（AR）介導的轉錄；兩者也會與染色質及 NKX3-1 啟動子區域相聯。來源指出，URI1 可能藉由抑制 AR 介導的基因轉錄及前列腺癌細胞的非貼附生長而具有腫瘤抑制作用，但這項描述保留「可能」的性質。URI1 亦被描述為卵巢癌細胞存活所需，並可拮抗 hepatitis B virus X protein 造成的轉錄調節作用。
在生長訊號方面，URI1 於正常生長條件下有助維持 S6K1 訊號與 BAD 磷酸化，避免持續的 S6K1 訊號造成潛在不利影響。生長因子刺激時，URI1-PPP1CC 複合體構成負回饋機制的一部分，可抵銷過強的 S6K1 存活訊號傳至 BAD。URI1 也會抑制粒線體中的 PPP1CC 磷酸酶活性；其與 PPP1CC 的交互作用具有磷酸化依賴性，並受生長因子條件影響。
URI1 另以 mTOR 依賴的方式協調營養敏感基因表現的調節。來源將它描述為可能的支架蛋白，可組裝包含 PFD 蛋白，以及具有轉錄或泛素化功能之蛋白的 prefoldin-like 複合體。URI1 亦是 PAQosome 的成員；該複合體參與多種蛋白質複合體的生合成，顯示 URI1 的功能也涉及蛋白質複合體的組裝。
Promoter 與基因調控
>URI1 ENST00000392271 GRCh38 chr19:29941239-29942339 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAAGGCCACTTTCACGCAGTTAGGTTAATAGGAGGCTGTACAAAGGGCTGTAGGAGGAAGTGGGCACAGG AGTTCTAAAATAATTGGAACGGCCAGGTGTGGTAGCTCACACCTGTAATCCTAGCACTTCAGGGAATCCA AGACAGGAGGTTAGCTAAGACAGGAGGCTCGCTTAATGTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGGGAGACCC CGCCTCTACAAAAAATAGAAAAATTAACAGGATGTGTTGGTGCGGGCCAGTGGTCCCAGCTACTCCTGAG GCTGAGGTGGGAAGATCGCTTGAGTCTAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGAAATGATGGCACTACTGCACT CCAGCCCGGGCGACAGACCAAGACTCAGTCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGTGGGGGCAAA GTTATCCTTGGAAAATTTCTTAGTCCATTCATAGCAGCATATTAAAATTAGTACAGTAGCTTAATTTATA TAAGAGAAAATACAATGTGTACAGTAATTAATGAACATGCAAAATATAATTGTATATTTCAACTCACTAA AAAGGCACAGAAAGAGTTGAATTTGCTAAAATTAAATGTGCTTATGAAACAGCTCTAGTACATGAATTAA GCTCCTAGATACAGATGCAGCGCCAAACGACGGGGAGGGAGATGGGGCACTCAAGGCGACACGCGGCTCT TGTTGCCGAGCGTTTCCTGGGCGTGGAGCTTCTATAGAATGTAAGCTTTTTTTTTTTAAGGTTCCAAAGC CTATATTTAGTGCTTTCATATACGTAATCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAATATCGGCATAAAATGTAA GCTTCCAGAGGGATACAAACGCAGCCCAGCGCGGACACCGCCAGCCCCAGCCACGCGGTTCGCATCAAGC GCACTCCCCTGGGGGCGGGGCCTGCGCGAGCTGGGCGTGTCGGGGGCGGGGCCTGCGCGCTTGCTTCCGG CGTGCCGCGAGAGGCGGGGCGTGTGGGGAGGCGCGGCCGCCACGCGACGCCTGGCTGGGCCCGCACCGGA GAGGCGTCTCGGTACCTGGCAGGCGGCCTGCTACTCGGAGCCCGCTGCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| URI1_2 ↗ | 19:29,923,657 | 正股 | 29,923,608–29,923,667 |
| URI1_1 ↗ | 19:29,942,260 | 正股 | 29,942,211–29,942,270 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_9FTTQ · promoter · 29941749–29942249 · regulatory
· motif · 29942210–29942219 · motif
· motif · 29942358–29942367 · motif
· motif · 29942488–29942499 · motif
· motif · 29942494–29942505 · motif
· motif · 29942494–29942505 · motif
· motif · 29942576–29942591 · motif
· motif · 29942628–29942637 · motif
· motif · 29942684–29942695 · motif
· motif · 29942688–29942701 · motif
· motif · 29942793–29942802 · motif
· motif · 29942793–29942802 · motif
· motif · 29944431–29944442 · motif
· motif · 29946837–29946851 · motif
· motif · 29946837–29946851 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：535 aa
URI1 蛋白全長為 535 個胺基酸，屬於 RNA polymerase II subunit 5-mediating protein 家族。序列註釋指出，胺基酸 1–23、223–330、352–383 及 412–431 為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
URI1 可位於細胞核、細胞質、粒線體及樹突細胞突起。 於粒線體中，它與 PFDN2、PFDN4、PPP1CC、RPS6KB1 及 STAP1 共定位；此描述為共定位資訊，不代表這些蛋白質的其他定位也適用於 URI1。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell projection, dendrite。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- GTF2F1P35269 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GTF2F2P13984 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- OGTO15294 · UniProt INTERACTION · 10 experiments · 2 筆來源紀錄
- PFDN2Q9UHV9 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- POLR2EP19388 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PPP1CCP36873 · UniProt INTERACTION · 21 experiments · 2 筆來源紀錄
- PTGES3Q15185 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPAP3Q9H6T3 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- AhrP30561 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Esr1P19785 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
URI1 可形成同源二聚體，並是 PAQosome 與 URI 複合體的成員。來源列出的互作對象包括 POLR2E/RPB5、RUVBL1、RUVBL2、PFDN2、PFDN4、STAP1、UXT、PPP1CC、GTF2F1、GTF2F2、DMAP1、TSC1、TSC2、PRPF8 及 EFTUD2。URI1 與 PFDN2、PFDN4、STAP1 的互作具有磷酸化依賴性，且受生長條件影響；與 PPP1CC 的互作則具有磷酸化及生長因子依賴性。與 PRPF8、EFTUD2 的互作依賴 ZNHIT2。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | URI1 參與基因轉錄調節，並與共抑制因子 UXT 協同抑制 AR 轉錄；兩者也會與 NKX3-1 啟動子區域染色質相聯。URI1 可能抑制 AR 介導的轉錄及前列腺癌細胞的非貼附生長，並為卵巢癌細胞存活所需；它也會拮抗 hepatitis B virus X protein 的轉錄調節作用。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Involved in gene transcription regulation. Acts as a transcriptional repressor in concert with the corepressor UXT to regulate androgen receptor (AR) transcription. May act as a tumor suppressor to repress AR-mediated gene transcription and to inhibit anchorage-independent growth in prostate cancer cells. Required for cell survival in ovarian cancer cells. Together with UXT, associates with chromatin to the NKX3-1 promoter region. Antagonizes transcriptional modulation via hepatitis B virus X protein |
| 功能 | 在正常生長條件下，URI1 有助維持 S6K1 訊號與 BAD 磷酸化；URI1-PPP1CC 複合體則於生長因子刺激時負向回饋，限制過強的 S6K1 存活訊號傳至 BAD。URI1 會抑制粒線體中的 PPP1CC 磷酸酶活性，並以 mTOR 依賴方式協調營養敏感基因表現調節；它似乎也能組裝 prefoldin-like 複合體。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Plays a central role in maintaining S6K1 signaling and BAD phosphorylation under normal growth conditions thereby protecting cells from potential deleterious effects of sustained S6K1 signaling. The URI1-PPP1CC complex acts as a central component of a negative feedback mechanism that counteracts excessive S6K1 survival signaling to BAD in response to growth factors. Mediates inhibition of PPP1CC phosphatase activity in mitochondria. Coordinates the regulation of nutrient-sensitive gene expression availability in a mTOR-dependent manner. Seems to be a scaffolding protein able to assemble a prefoldin-like complex that contains PFDs and proteins with roles in transcription and ubiquitination |
| 交互作用 | URI1 可形成同源二聚體，並是 PAQosome 的組成成員；該複合體參與多種蛋白質複合體的生合成。URI1 與多種蛋白質互作，其中部分互作具有條件性：與 PFDN2、PFDN4、STAP1 的互作依賴磷酸化並受生長條件影響，與 PPP1CC 的互作依賴磷酸化及生長因子，而與 PRPF8、EFTUD2 的互作依賴 ZNHIT2。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Component of the PAQosome complex which is responsible for the biogenesis of several protein complexes and which consists of R2TP complex members RUVBL1, RUVBL2, RPAP3 and PIH1D1, URI complex members PFDN2, PFDN6, PDRG1, UXT and URI1 as well as ASDURF, POLR2E and DNAAF10/WDR92. Interacts with POLR2E/RPB5, RUVBL2 and RUVBL1. Interacts with PFDN2, PFDN4 and STAP1; the interactions are phosphorylation-dependent and occur in a growth-dependent manner in the mitochondrion. Interacts with UXT. Interacts with PPP1CC; the interaction is phosphorylation-dependent and occurs in a growth factor-dependent manner. Interacts (via the middle C-terminal region) with GTF2F1 and GTF2F2. Interacts with DMAP1. Interacts with TSC1 and TSC2. Interacts with PRPF8 and EFTUD2 in a ZNHIT2-dependent manner PMID 12737519 ↗ · PMID 14615539 ↗ · PMID 15367675 ↗ · PMID 21397856 ↗ · PMID 21730289 ↗ · PMID 28561026 ↗ · PMID 31738558 ↗ · PMID 9819440 ↗ |
| 細胞定位 | URI1 位於細胞核、細胞質、粒線體及樹突細胞突起；在粒線體中，URI1 與 PFDN2、PFDN4、PPP1CC、RPS6KB1 及 STAP1 共定位。 | 推論支持 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm; Mitochondrion; Cell projection, dendrite; Colocalizes with PFDN2, PFDN4, PPP1CC, RPS6KB1 and STAP1 at mitochondrion |
核酸與蛋白質序列
GTGTGGGGAGGCGCGGCCGCCACGCGACGCCTGGCTGGGC40CCGCACCGGAGAGGCGTCTCGGTACCTGGCAGGCGGCCTG80CTACTCGGAGCCCGCTGCGGGGCGGCGGCGGCGGGGACAT120GCACGTGTGAGATGCGGCAGCGGGCGGCGCGGACGCGAAC160AGCAGCGGCGGCGGCGGGCGCGGCCTCCTGGGCGCGGGGC200GCGCGGTGCCTGAGGGCGGGCGCGCGGGCGCTGGGCAACT240GCCGGCCGCGCCGCCTGCGCAGGCGCTGGTTCAGGACTCA280CACGCCGCGCTGAGGCCCGCGGGCCCGTCATGGAGGCGCC320CACCGTGGAGACGCCCCCCGACCCCTCGCCCCCTTCGGCC360CCGGCCCCTGCCCTGGTTCCGTTGCGCGCCCCGGATGTGG400CGCGGCTGCGCGAGGAGCAGGAAAAGGTGGTCACTAACTG440CCAAGAGAGAATCCAGCATTGGAAGAAGGTAGATAATGAC480TATAATGCCCTTCGAGAAAGACTCAGCACCTTGCCTGATA520AATTGTCTTATAATATAATGGTACCATTTGGCCCTTTTGC560CTTCATGCCAGGAAAACTTGTCCATACTAATGAAGTCACT600GTTTTACTGGGGGACAACTGGTTTGCAAAGTGCTCAGCAA640AGCAGGCTGTAGGTTTAGTTGAGCACCGGAAAGAACATGT680AAGAAAAACAATAGATGACTTAAAAAAAGTGATGAAAAAT720TTTGAATCCAGAGTTGAATTCACAGAAGATTTGCAGAAAA760TGAGCGATGCTGCAGGTGATATTGTTGACATACGAGAAGA800AATTAAATGTGACTTCGAATTTAAAGCAAAACACCGAATT840GCTCATAAACCGCATTCCAAACCAAAAACTTCAGATATTT880TTGAAGCAGATATTGCAAATGATGTGAAATCCAAGGATTT920GCTAGCTGATAAAGAACTGTGGGCTCGACTTGAAGAACTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。