演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

UQCRFS1P1UQCRFSL1

ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 pseudogene 1

UQCRFS1P1 是位於人類第 22 號染色體的假基因;現有資料將其氧化還原酶活性及粒線體電子傳遞相關角色列為預測。

Homo sapiens22q13.1
OFFICIAL SYMBOL
UQCRFS1P1
CHROMOSOME
22
LOCUS TYPE
processed_pseudogene
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UQCRFS1P1 的正式名稱為 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 pseudogene 1,分類為假基因。假基因的分類表示此基因座並非可據此認定具有功能性蛋白質產物,因此不宜將其描述為已確認的酵素或蛋白質。現有資料對其分子角色僅提供預測:可能具有氧化還原酶活性,並可能參與粒線體中由 ubiquinol 傳遞至 cytochrome c 的電子運輸。這些預測不等同於已證實的功能。

Official symbol
UQCRFS1P1
Gene name
ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 pseudogene 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
pseudogene
HGNC ID
HGNC:12588
Locus type
pseudogene
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UQCRFSL1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q13.1
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegUQCRFS1P1pq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr22:39,875,289–39,876,108
Gene span
820 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000435169 ★39,875,289–39,876,1081

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

已知功能與來源註解

UQCRFS1P1 的功能註記屬於預測性描述,不能視為已確認的生化活性或生理作用。資料預測此基因可能具有氧化還原酶活性,但未提供酵素反應的實驗驗證、反應條件或具體作用機制,因此無法據此進一步說明其如何催化氧化還原反應。

資料也預測 UQCRFS1P1 可能參與粒線體電子傳遞,方向涉及 ubiquinol 至 cytochrome c。這項描述指出可能相關的電子傳遞路徑及兩種分子,但未交代其參與方式、是否直接傳遞電子,或在該過程中的具體位置與作用。因此,不能將路徑中的其他蛋白質功能或機制歸屬於 UQCRFS1P1。

由於 UQCRFS1P1 被分類為假基因,而來源未提供其產物或功能驗證資訊,以上活性與生物過程均應保留為預測,不宜延伸為已證實的蛋白質功能或生物學效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 39875289 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UQCRFS1P1 ENST00000435169 GRCh38 chr22:39874289-39875389 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAAAACTATTTTTACCCCATGTTCTCCTACAAATAGATCTTGAGAGCTTGTTTGGAGGTCCTAAAAAGGG
AGTGCAGCTACTCCTATACCCTTGACCAAAGAAAAATCCTCTTCTATCAGCAAAGGTCATCCTCTTTGAC
CAAGAATCCAACTTTAGGAGAGACACACATACAGCGGTGAGGAAGGAAAAGGACTCCTGCCTAGCCAGCC
AGATTGCCCTCACATCCAAAATGACAAACTTCTACTCATCATAAGACAACATTAGAAATGGAAAAGACAA
GCTACAGAATTTTTGTAGCTTGTAGGATGGCAGAAAATATCTATAATATGTCTATCTGACAAAGAACTCA
TATCCAAAATATGTAAAAATTCCTAGAAATCAATAATAAAAAGATAAAATGTTAAAAATAGGCAAAATAT
TTGAGCAGGCAATACTTGAACAGGCAAAAGATGTCCTTGTGGGCAAAAATCATATGAAAAGGCACTTAAC
AACTTTTCAGGGAAATGCAAATTAAAACCAAATTGAAACAACATTATACTCCCAACAAAATGGCTAAATT
GAAAATAATAACATTCCTAAGTGTTGATAAGGATGTGAACAACAAATTCTCATATATTGGTAGTGAAATC
ACTTAAGAAAACTTTAGTTTCTAGTCATATTTAATGGTTTCTACAACCCAGAAATTTCACTCTTCAGGAT
ATACCAAAGAGAACCGAATGCATATCGCACAGGAATGTTCATAAGAGTTTTATTCACAATAACTCAAAGC
TATAAGCATCCCAAATATTATCCATCAGCAAAAGATGGATAAACTGTGGTATGCACATACAATTGAATAC
AACTCAGCAATAAAAACAAATGATATTCTGATATACATAACAATATGGATGACTCTCAGAAACATTATGT
TGAGAGAAGCCAGAAACTGAAGAACACATACGGTATGCTTCCATTTATATAAATTTTAAGAACAAATGCA
ACAAATCTATACAGTTAAAGAAATTCGGTCGGTCGCAGCCCGCTCGGGCCCGTTCGCGCCCGTCCTGTCG
GCCACGTCCCGCGGGGTGGCGGGCGCGCTGCGGCCCTTGGTGCAGGCCACG
UQCRFS1P1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_836MN3 · enhancer · 39875279–39875508 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

pseudogene

UQCRFS1P1 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000435169 ★processed_pseudogene820 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion

資料將 UQCRFS1P1 定位於粒線體;此為來源所列的定位資訊,未提供定位改變條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的基因產物定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能資料預測 UQCRFS1P1 可能具有氧化還原酶活性,並可能參與粒線體中由 ubiquinol 傳遞至 cytochrome c 的電子運輸;這些功能描述屬預測,並非已確認的實驗結果。另列其位於粒線體。推論支持
證據與來源

Predicted to enable oxidoreductase activity. Predicted to be involved in mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c. Located in mitochondrion.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
細胞定位資料將 UQCRFS1P1 的位置標示於粒線體。資料庫紀錄
證據與來源

Located in mitochondrion.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000435169 · 820 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAATTCGGTCGGTCGCAGCCCGCTCGGGCCCGTTCGCGCC40
41CGTCCTGTCGGCCACGTCCCGCGGGGTGGCGGGCGCGCTG80
81CGGCCCTTGGTGCAGGCCACGGTGCCCGCCACCCCGGAGC120
121AGCCTGTGTTGGACCTGAAGCGGCCCTTCCTCAGCCGGGA160
161GTCGCTGAGCGGCCAGGCCGTGCGCCGGCCTTTGGTCGCC200
201TCCGTGGGCCTCAATGTCCCTGCTTCTGTTTGTTATTCCC240
241ACACAGACGTCAAGGTGCCTGACTTCTCTGAATACCGCCG280
281CCTTGAAGTTTTAGATAGTACGAAGTCTTCAAGAGAAAGC320
321ACCGAGGCTAGGAAAGGTTTCTCCTATTTGGTAACTGGAG360
361TAACTACTGTGGGTGTCGCATATGCTGCCAAGAATGCCGT400
401CACCCAGTTCGTTTCCAGCATGAGTGCTTCTGCTGATGTG440
441TTGGCCCTGGCGAAAATCGAAATCAAGTTATCCGATATTC480
481CAGAAGGCAAGAACATGGCTTTCAAATGGAGAGGCAAACC520
521CCTGTTTGTACGTCATAGAACCCAGAAGGAAATTAAGCAG560
561GAAGCTGCAGTTGAATTATCACAGTTGAGGGACCCACAGC600
601ATGATCTAGATCGAGTAAAGAAACCTGAATGGGTTATCCT640
641GATAGGTGTTTGCACTCATCTTGGTTGTGTACCCATTGCA680
681AATGCAGGAGATTTTGGTGGTTATTACTGCCCTTGCCATG720
721GGTCACACTATGATGCATCTGGCAGGATCAGATTGGGTCC760
761TGCTACTCTCAACCTTGAAGTCCCCACGTATGAGTTCACC800
801AGTGACGATATGGTGATTGT820

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。