基因總覽
UQCRFS1P1 的正式名稱為 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 pseudogene 1,分類為假基因。假基因的分類表示此基因座並非可據此認定具有功能性蛋白質產物,因此不宜將其描述為已確認的酵素或蛋白質。現有資料對其分子角色僅提供預測:可能具有氧化還原酶活性,並可能參與粒線體中由 ubiquinol 傳遞至 cytochrome c 的電子運輸。這些預測不等同於已證實的功能。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000435169 ★ | 39,875,289–39,876,108 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
UQCRFS1P1 的功能註記屬於預測性描述,不能視為已確認的生化活性或生理作用。資料預測此基因可能具有氧化還原酶活性,但未提供酵素反應的實驗驗證、反應條件或具體作用機制,因此無法據此進一步說明其如何催化氧化還原反應。
資料也預測 UQCRFS1P1 可能參與粒線體電子傳遞,方向涉及 ubiquinol 至 cytochrome c。這項描述指出可能相關的電子傳遞路徑及兩種分子,但未交代其參與方式、是否直接傳遞電子,或在該過程中的具體位置與作用。因此,不能將路徑中的其他蛋白質功能或機制歸屬於 UQCRFS1P1。
由於 UQCRFS1P1 被分類為假基因,而來源未提供其產物或功能驗證資訊,以上活性與生物過程均應保留為預測,不宜延伸為已證實的蛋白質功能或生物學效應。
Promoter 與基因調控
>UQCRFS1P1 ENST00000435169 GRCh38 chr22:39874289-39875389 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TAAAACTATTTTTACCCCATGTTCTCCTACAAATAGATCTTGAGAGCTTGTTTGGAGGTCCTAAAAAGGG AGTGCAGCTACTCCTATACCCTTGACCAAAGAAAAATCCTCTTCTATCAGCAAAGGTCATCCTCTTTGAC CAAGAATCCAACTTTAGGAGAGACACACATACAGCGGTGAGGAAGGAAAAGGACTCCTGCCTAGCCAGCC AGATTGCCCTCACATCCAAAATGACAAACTTCTACTCATCATAAGACAACATTAGAAATGGAAAAGACAA GCTACAGAATTTTTGTAGCTTGTAGGATGGCAGAAAATATCTATAATATGTCTATCTGACAAAGAACTCA TATCCAAAATATGTAAAAATTCCTAGAAATCAATAATAAAAAGATAAAATGTTAAAAATAGGCAAAATAT TTGAGCAGGCAATACTTGAACAGGCAAAAGATGTCCTTGTGGGCAAAAATCATATGAAAAGGCACTTAAC AACTTTTCAGGGAAATGCAAATTAAAACCAAATTGAAACAACATTATACTCCCAACAAAATGGCTAAATT GAAAATAATAACATTCCTAAGTGTTGATAAGGATGTGAACAACAAATTCTCATATATTGGTAGTGAAATC ACTTAAGAAAACTTTAGTTTCTAGTCATATTTAATGGTTTCTACAACCCAGAAATTTCACTCTTCAGGAT ATACCAAAGAGAACCGAATGCATATCGCACAGGAATGTTCATAAGAGTTTTATTCACAATAACTCAAAGC TATAAGCATCCCAAATATTATCCATCAGCAAAAGATGGATAAACTGTGGTATGCACATACAATTGAATAC AACTCAGCAATAAAAACAAATGATATTCTGATATACATAACAATATGGATGACTCTCAGAAACATTATGT TGAGAGAAGCCAGAAACTGAAGAACACATACGGTATGCTTCCATTTATATAAATTTTAAGAACAAATGCA ACAAATCTATACAGTTAAAGAAATTCGGTCGGTCGCAGCCCGCTCGGGCCCGTTCGCGCCCGTCCTGTCG GCCACGTCCCGCGGGGTGGCGGGCGCGCTGCGGCCCTTGGTGCAGGCCACG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_836MN3 · enhancer · 39875279–39875508 · regulatory
基因座與轉錄註解
UQCRFS1P1 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000435169 ★ | processed_pseudogene | 820 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
資料將 UQCRFS1P1 定位於粒線體;此為來源所列的定位資訊,未提供定位改變條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的基因產物定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 資料預測 UQCRFS1P1 可能具有氧化還原酶活性,並可能參與粒線體中由 ubiquinol 傳遞至 cytochrome c 的電子運輸;這些功能描述屬預測,並非已確認的實驗結果。另列其位於粒線體。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable oxidoreductase activity. Predicted to be involved in mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c. Located in mitochondrion. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | 資料將 UQCRFS1P1 的位置標示於粒線體。 | 資料庫紀錄 |
DNA 與 RNA 序列
AAATTCGGTCGGTCGCAGCCCGCTCGGGCCCGTTCGCGCC40CGTCCTGTCGGCCACGTCCCGCGGGGTGGCGGGCGCGCTG80CGGCCCTTGGTGCAGGCCACGGTGCCCGCCACCCCGGAGC120AGCCTGTGTTGGACCTGAAGCGGCCCTTCCTCAGCCGGGA160GTCGCTGAGCGGCCAGGCCGTGCGCCGGCCTTTGGTCGCC200TCCGTGGGCCTCAATGTCCCTGCTTCTGTTTGTTATTCCC240ACACAGACGTCAAGGTGCCTGACTTCTCTGAATACCGCCG280CCTTGAAGTTTTAGATAGTACGAAGTCTTCAAGAGAAAGC320ACCGAGGCTAGGAAAGGTTTCTCCTATTTGGTAACTGGAG360TAACTACTGTGGGTGTCGCATATGCTGCCAAGAATGCCGT400CACCCAGTTCGTTTCCAGCATGAGTGCTTCTGCTGATGTG440TTGGCCCTGGCGAAAATCGAAATCAAGTTATCCGATATTC480CAGAAGGCAAGAACATGGCTTTCAAATGGAGAGGCAAACC520CCTGTTTGTACGTCATAGAACCCAGAAGGAAATTAAGCAG560GAAGCTGCAGTTGAATTATCACAGTTGAGGGACCCACAGC600ATGATCTAGATCGAGTAAAGAAACCTGAATGGGTTATCCT640GATAGGTGTTTGCACTCATCTTGGTTGTGTACCCATTGCA680AATGCAGGAGATTTTGGTGGTTATTACTGCCCTTGCCATG720GGTCACACTATGATGCATCTGGCAGGATCAGATTGGGTCC760TGCTACTCTCAACCTTGAAGTCCCCACGTATGAGTTCACC800AGTGACGATATGGTGATTGT820cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。