演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UQCRC2QCR2

ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 2

UQCRC2 編碼 ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 2,是粒線體呼吸鏈複合體 III 的核心次單元,並屬於 peptidase M16 家族。

Homo sapiens16p12.2UniProt P22695
OFFICIAL SYMBOL
UQCRC2
CHROMOSOME
16
UNIPROT
P22695
PDB / ALPHAFOLD
9CG3
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UQCRC2 是蛋白質編碼基因,其產物 ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 2 屬於 peptidase M16 家族的 UQCRC2/QCR2 次家族。它是粒線體 ubiquinol-cytochrome c oxidoreductase 的兩個核心蛋白次單元之一,與 UQCRC1/QCR1 同屬核心組成。此複合體亦稱 cytochrome b-c1 complex 或 complex III,是多次單元的跨膜酵素複合體,參與粒線體電子傳遞鏈。來源指出,兩個核心次單元分別與粒線體加工胜肽酶 MPP 的 beta-MPP 和 alpha-MPP 同源;UQCRC2/QCR2 對應 alpha-MPP。這項家族與結構關係提供了認識其蛋白質特性的基礎,相關作用方式及其在呼吸鏈中的功能見下文。

Official symbol
UQCRC2
Gene name
ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12586
UniProt
P22695
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
QCR2UQCR2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p12.2
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegUQCRC2pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:21,952,636–21,990,814
Gene span
38,179 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000268379 ★21,953,361–21,983,66014
ENST0000086441221,952,636–21,985,39115
ENST0000095196721,952,646–21,983,35415
ENST0000056155321,953,287–21,983,32513
ENST0000086441321,953,287–21,983,63813
ENST0000086441421,953,287–21,983,63215
ENST0000086441521,953,287–21,983,63814
ENST0000086441621,953,287–21,983,63815
ENST0000086441721,953,287–21,983,3528
ENST0000086441821,953,287–21,983,34215
ENST0000093884021,953,287–21,983,64214
ENST0000093884121,953,287–21,983,6386

顯示 12/33 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UQCRC2 是 ubiquinol-cytochrome c oxidoreductase(cytochrome b-c1 complex,complex III)的核心次單元。此複合體位於粒線體電子傳遞鏈中;呼吸鏈的其他多次單元複合體包括 succinate dehydrogenase(complex II)及 cytochrome c oxidase(complex IV)。它們協同將來自 NADH 與 succinate 的電子傳遞至分子氧,形成跨越粒線體內膜的電化學梯度,進而驅動跨膜運輸及 ATP synthase。

在複合體 III 中,電子由 ubiquinol 傳給 cytochrome c。這項氧化還原反應與質子跨越粒線體內膜的轉移相連;質子以 quinol 上的氫形式跨膜運送。這一過程稱為 Q cycle:兩個質子自基質消耗,四個質子釋放至膜間腔,並有兩個電子傳遞給 cytochrome c。來源對此機制標示為 By similarity。

UQCRC2/QCR2 與 UQCRC1/QCR1 分別和粒線體加工胜肽酶 MPP 的 alpha-MPP 與 beta-MPP 同源,且似乎保留了 MPP 的加工特性;此項描述同樣屬於 By similarity。來源另指出,UQCRC2 可能參與 UQCRFS1 納入複合體 III 後的原位加工,協助其形成成熟的 Rieske protein 與其粒線體標靶序列(MTS)/subunit 9;此功能屬於 Probable,並非確定結論。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 21953361 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UQCRC2 ENST00000268379 GRCh38 chr16:21952361-21953461 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGATCTTGTAAAAACACCGATTCGGATCCAATATGGGACCTGGAGTTCATACATTTCTAATCAACTCCT
AAATGATATTGATGCTGATACTGTCGGTTTCCCAACCAAGCAACGTAGCAAGGTACGAAACTCTAAAGTC
CCTAAAGGGCAGGGACCACGCCTCTCGCGTTGGCATAGTGCCTAGCTCAAGGCACTTTCTGGGTTAACAC
TCGCTGAGGACCGGAGTGAACGCCCCCGCCCCAAGTCGTCACGTGACTGACTTTCTCCAACTGCCGGTTT
CGGCTCACATAACACACCTACTATCCAAAACATTTCTATTTTCCTAACACAAAAACTATAGCTAAGTTTT
TATATTCTATGTAGCCCCAGCCTAGGACGTAAATTCCACGAGACCAAAAGCCTTGTGATGATTCCCCGAG
GTTGCTGACCCTCCCGGTGTGTCCCGGGCCTGCTCTGGGGGACACAGCGGCGAATACGTTGAACGAGGCC
CCTGTTTCACGGAGCTAAAGATCCAGTAAGGACTTCACCCAGCGAGAGGCAACTACGCCGGGCTTCGATA
CCCAATACCTCTGCAGAAAGGTGGAGTGGCAGGAATCTCCTGAAGCCTCCAACGTCCAGGAACGCGGAAA
CCCAGGGCCTCCAGTGCAGGTGTCATCCCGGAGGGCGCATGCGGAGTCCCAAGAGAGGCGCGTCCCATTG
GACAATGCTGAGCGGAAGAGCCCAAGATAGCGGGGGGAGTTGTGACAGGCTGCTGCAGACGTACTTAGAA
AAGGGGTGCATACTGGATATTCAGGCTAGGAGAAGAACGCAAAAAGCAGTGACGTACATTATTCTCTGCA
TATATTTACTTGGGAAATTGTGCGTCTCCCTATTCTGAGTCTTGGAGGAATTGGACTGGTCCAACCTTAT
AAAGAGAGCAGTAGAGCGCGGCAGTATAGAGAGTACCTCACGAAGGGGACGTGGGAAAGTGTTAGCGGGG
AACGCTGGGAAACTCCCGGCCTCCGCCACCATCTTGCTTTCCTTTAATCCGGCAGTGACCGTGTGTCAGA
ACAATCTTGAATCATGAAGCTACTAACCAGAGCCGGCTCTTTCTCGGTGAG
UQCRC2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UQCRC2_1 ↗16:21,953,368正股21,953,319–21,953,378

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_9BP8L · enhancer · 21950977–21951469 · regulatory

ENSR16_576DWX · CTCF_binding_site · 21951193–21951214 · regulatory

ENSR16_B6CM2 · enhancer · 21952127–21953003 · regulatory

ENSR16_9BP97 · promoter · 21953004–21953381 · regulatory

ENSR16_B6CM6 · enhancer · 21953382–21954079 · regulatory

· motif · 21949586–21949598 · motif

· motif · 21949810–21949823 · motif

· motif · 21949810–21949823 · motif

· motif · 21950045–21950057 · motif

· motif · 21951195–21951211 · motif

· motif · 21952589–21952602 · motif

· motif · 21952608–21952617 · motif

· motif · 21952608–21952617 · motif

· motif · 21952940–21952950 · motif

· motif · 21952981–21952992 · motif

· motif · 21953024–21953035 · motif

· motif · 21953024–21953035 · motif

· motif · 21953035–21953048 · motif

· motif · 21953035–21953048 · motif

· motif · 21953093–21953103 · motif

· motif · 21955106–21955117 · motif

· motif · 21958002–21958015 · motif

· motif · 21958002–21958015 · motif

· motif · 21958043–21958058 · motif

· motif · 21958043–21958058 · motif

· motif · 21958086–21958097 · motif

· motif · 21958087–21958098 · motif

· motif · 21958137–21958145 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:453 aa

1 aa453 aa轉運胜肽
依 P22695 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 2 長 453 個胺基酸,屬於 peptidase M16 家族的 UQCRC2/QCR2 次家族。其註解包含位於第 1 至 14 個胺基酸的粒線體轉運胜肽。

轉運胜肽Mitochondrion1–14 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9CG3…

PDB · 9CG3

EM · 2.96 A · K/W=1-453

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion inner membrane

UQCRC2 位於粒線體內膜,屬周邊膜蛋白,定位於膜的基質側。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 24 個夥伴 · 最多顯示 50 個
QCR2UQCRC2ACAP1APBA2CACNA1ADLG1DLG2DLG3DLG4FRMPD2GRID2IPGRIP1GRIP2hCG_1820408LHX5LNX1LNX2MAGI1MAGI2MPDZNHERF4PATJPDZK1SCRIBSNW1TJP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 24 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UQCRC2 是由 11 個次單元構成的 cytochrome b-c1 complex(complex III)之一部分;該複合體以必要的二聚體形式存在。它可在粒線體內膜與 complex I、complex IV 形成超複合體,並組成不同的超複合體或巨型複合體。來源亦記載 UQCRC2 與 RAB5IF 及 STMP1 互作,但未進一步說明這些互作的性質。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

UQCRC2 的變異與粒線體複合體 III 缺乏症、核型第 5 型(MC3DN5)相關,來源將此病描述為由影響該基因的變異所致。臨床表現會隨受影響組織而有高度差異,可包括粒線體腦病、精神運動發育遲緩、共濟失調、嚴重生長不良、肝功能障礙、腎小管病變、肌無力及運動不耐受。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UQCRC2 是粒線體 ubiquinol-cytochrome c oxidoreductase 的組成部分,該複合體參與電子傳遞及氧化磷酸化。呼吸鏈複合體協同將電子傳至分子氧並建立電化學梯度;complex III 透過 Q cycle 將電子由 ubiquinol 傳至 cytochrome c,同時轉移質子。UQCRC2/QCR2 與 MPP 的 alpha-MPP 同源,似乎保留其加工特性;此外,它可能參與複合體 III 中 UQCRFS1 的原位加工,形成成熟 Rieske protein 與 MTS/subunit 9。推論支持
證據與來源

Component of the ubiquinol-cytochrome c oxidoreductase, a multisubunit transmembrane complex that is part of the mitochondrial electron transport chain which drives oxidative phosphorylation. The respiratory chain contains 3 multisubunit complexes succinate dehydrogenase (complex II, CII), ubiquinol-cytochrome c oxidoreductase (cytochrome b-c1 complex, complex III, CIII) and cytochrome c oxidase (complex IV, CIV), that cooperate to transfer electrons derived from NADH and succinate to molecular oxygen, creating an electrochemical gradient over the inner membrane that drives transmembrane transport and the ATP synthase. The cytochrome b-c1 complex catalyzes electron transfer from ubiquinol to cytochrome c, linking this redox reaction to translocation of protons across the mitochondrial inner membrane, with protons being carried across the membrane as hydrogens on the quinol. In the process called Q cycle, 2 protons are consumed from the matrix, 4 protons are released into the intermembrane space and 2 electrons are passed to cytochrome c (By similarity). The 2 core subunits UQCRC1/QCR1 and UQCRC2/QCR2 are homologous to the 2 mitochondrial-processing peptidase (MPP) subunits beta-MPP and alpha-MPP respectively, and they seem to have preserved their MPP processing properties (By similarity). May be involved in the in situ processing of UQCRFS1 into the mature Rieske protein and its mitochondrial targeting sequence (MTS)/subunit 9 when incorporated into complex III (Probable)

PMID 29243944 ↗

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交互作用UQCRC2 是由 11 個次單元組成的 cytochrome b-c1 complex(complex III)核心次單元之一。該複合體包含呼吸次單元、兩個核心蛋白次單元及六個低分子量蛋白次單元,以必要二聚體形式存在,並可在粒線體內膜與 complex I、complex IV 組成不同超複合體及巨型複合體。來源另記載 UQCRC2 與 RAB5IF 及 STMP1 互作。含實驗來源
證據與來源

Component of the ubiquinol-cytochrome c oxidoreductase (cytochrome b-c1 complex, complex III, CIII), a multisubunit enzyme composed of 11 subunits. The complex is composed of 3 respiratory subunits cytochrome b, cytochrome c1 and Rieske protein UQCRFS1, 2 core protein subunits UQCRC1/QCR1 and UQCRC2/QCR2, and 6 low-molecular weight protein subunits UQCRH/QCR6, UQCRB/QCR7, UQCRQ/QCR8, UQCR10/QCR9, UQCR11/QCR10 and subunit 9, the cleavage product of Rieske protein UQCRFS1 (By similarity). The complex exists as an obligatory dimer and forms supercomplexes (SCs) in the inner mitochondrial membrane with NADH-ubiquinone oxidoreductase (complex I, CI) and cytochrome c oxidase (complex IV, CIV), resulting in different assemblies (supercomplex SCI(1)III(2)IV(1) and megacomplex MCI(2)III(2)IV(2)). Interacts with RAB5IF. Interacts with STMP1 (By similarity)

PMID 28844695 ↗ · PMID 31536960 ↗

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細胞定位UQCRC2 位於粒線體內膜,是周邊膜蛋白,並位於膜的基質側。推論支持
證據與來源

Mitochondrion inner membrane / Peripheral membrane protein / Matrix side

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疾病關聯粒線體複合體 III 缺乏症、核型第 5 型(MC3DN5)由影響 UQCRC2 的變異所致。疾病表現依受影響組織而高度不同,可包括粒線體腦病、精神運動發育遲緩、共濟失調、嚴重生長不良、肝功能障礙、腎小管病變、肌無力及運動不耐受。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrial complex III deficiency, nuclear type 5 MC3DN5 A disorder of the mitochondrial respiratory chain resulting in a highly variable phenotype depending on which tissues are affected. Clinical features include mitochondrial encephalopathy, psychomotor retardation, ataxia, severe failure to thrive, liver dysfunction, renal tubulopathy, muscle weakness and exercise intolerance. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615160

PMID 23281071 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000268379 · 1,914 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCCGCCACCATCTTGCTTTCCTTTAATCCGGCAGTGACC40
41GTGTGTCAGAACAATCTTGAATCATGAAGCTACTAACCAG80
81AGCCGGCTCTTTCTCGAGATTTTATTCCCTCAAAGTTGCC120
121CCCAAAGTTAAAGCCACAGCTGCGCCTGCAGGAGCACCGC160
161CACAACCTCAGGACCTTGAGTTTACCAAGTTACCAAATGG200
201CTTGGTGATTGCTTCTTTGGAAAACTATTCTCCTGTATCA240
241AGAATTGGTTTGTTCATTAAAGCAGGCAGTAGATATGAGG280
281ACTTCAGCAATTTAGGAACCACCCATTTGCTGCGTCTTAC320
321ATCCAGTCTGACGACAAAAGGAGCTTCATCTTTCAAGATA360
361ACCCGTGGAATTGAAGCAGTTGGTGGCAAATTAAGTGTGA400
401CCGCAACAAGGGAAAACATGGCTTATACTGTGGAATGCCT440
441GCGGGGTGATGTTGATATTCTAATGGAGTTCCTGCTCAAT480
481GTCACCACAGCACCAGAATTTCGTCGTTGGGAAGTAGCTG520
521ACCTTCAGCCTCAGCTAAAGATTGACAAAGCTGTGGCCTT560
561TCAGAATCCGCAGACTCATGTCATTGAAAATTTGCATGCA600
601GCAGCTTACCGGAATGCCTTGGCTAATCCCTTGTATTGTC640
641CTGACTATAGGATTGGAAAAGTGACATCAGAGGAGTTACA680
681TTACTTCGTTCAGAACCATTTCACAAGTGCAAGAATGGCT720
721TTGATTGGACTTGGTGTGAGTCATCCTGTTCTAAAGCAAG760
761TTGCTGAACAGTTTCTCAACATGAGGGGTGGGCTTGGTTT800
801ATCTGGTGCAAAGGCCAACTACCGTGGAGGTGAAATCCGA840
841GAACAGAATGGAGACAGTCTTGTCCATGCTGCTTTTGTAG880
881CAGAAAGTGCTGTCGCGGGAAGTGCAGAGGCAAATGCATT920
921TAGTGTTCTTCAGCATGTCCTCGGTGCTGGGCCACATGTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。