演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UPK1ATSPAN21

uroplakin 1A

UPK1A 編碼 tetraspanin(TM4SF)家族的多次穿膜蛋白 uroplakin 1A,是尿路上皮不對稱單位膜(AUM)的組成成分。

Homo sapiens19q13.12UniProt O00322
OFFICIAL SYMBOL
UPK1A
CHROMOSOME
19
UNIPROT
O00322
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UPK1A 是蛋白質編碼基因,產物為 uroplakin 1A,屬於 tetraspanin(TM4SF)家族。這是一種多次穿膜蛋白,具有細胞質、跨膜及細胞外區段;來源註解列出的蛋白質長度為 258 個胺基酸。uroplakin 1A 是尿路上皮細胞形成的高度特化生物膜——不對稱單位膜(AUM)——的組成成分。

Official symbol
UPK1A
Gene name
uroplakin 1A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12577
UniProt
O00322
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TSPAN21

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.12
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25UPK1Apq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:35,666,516–35,678,481
Gene span
11,966 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000222275 ★35,666,517–35,678,4818
ENST0000110492535,666,516–35,678,4778
ENST0000037901335,666,813–35,678,1608

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

uroplakin 1A 是不對稱單位膜(AUM)的組成成分。AUM 是終末分化的尿路上皮細胞形成的一種高度特化生物膜;來源以「By similarity」標示此功能,表示相關註解具有推論性質。

來源指出,uroplakin 1A 可能在膀胱上皮的正常生理功能中扮演重要角色,但其具體作用仍以可能性描述。它可能參與調節表層傘細胞的細胞膜通透性,也可能透過 AUM 與細胞骨架的相互作用,協助穩定頂端膜。這些敘述同樣屬於推論,不能視為已確立的作用機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 35666517 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UPK1A ENST00000222275 GRCh38 chr19:35665517-35666617 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTTGGGGGGCGACGGGGACTTTTCTTCAACCAAGCCCGGTGTGCCCCCTCTCATTTTCTAGCACGTTCTT
CTCCCCCATCTTTGCACTTATCTCAGACTCCCCTCACACACCTATCCTGGGTGCCATCCTTTCCCTCAGC
CCACCGCCCATGTAGTCAGCCTCCTAAGCGCCCCTTCCACCTGTCCCCTCATCTCCCCACTGCTCTGCCT
CGGTCCAGCCCTGGCCTTGGCAGGGGTCCCTGCCTGGGCCTCCCCACGGGCTCCCGGCCTCACAGAGGAG
CAGCCACCTGTGCAAGGTCACACAGCAGGAGAGACACTTCTGGGATTCAGGACCCACCTGTGGGTCCGAA
GTGGATTTTTTGTTTGTTTGGTTTTGGAGACAGGGCCTGGCTCTGTCACTCAAGCTGGAGTGCAATGGCA
CGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGTCCCCAGGTTCAGCCATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTG
GGACCACAGGCATGAGCCTGGCTAATTATTTTTGTATTTTTTATAGAAACGGGGTTTCACTATGTCACCC
AGTCTGGTCTCAAACTACTGAGCTCAAGCGATCCGCCTACCTCAGTTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG
CCTGAGCTACCACGCCCCGCCCTGATTTGGATCTTGCTCCTATTCCCAGGAAGGCCCATGTCCTAGCAAG
AGAGACACCAGGTGGTGCGCACGCCCCTCCACCTCCAACTCCTCCACCGCCAACAAAGCCTGGGACCCAG
AGGCCATGGGTCCTACACAATCTGGTATTTCAGGTCTATAAATCATGGGGGTGGCAGGGAGCCCATCAAA
GCTGTTCATCCAGCCTGGTCTGCCGGCTCAGCCTCTTGTCCACCCCACTGCCGTGCCCCAAAACACACAC
ACACACACACACACCCTCCCTCCTTCCTGGGAGACTAGCCCAAGGAGGGGCCTGGGCGTATATAGGGAGC
CACGGTGGGTGGGGCTGGCCAGAGAGGCTGCAGACAGAGAAGGTGAGGAGGGGGCCCTGGGAGTCTGGGT
ATGGCATGAGGGGTCTGAGGCTCAGGGAGGGGCAGTGCCAAGTTCAGGCCA
UPK1A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UPK1A_1 ↗19:35,666,798正股35,666,749–35,666,808

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:258 aa

1 aa258 aa跨膜區拓樸區域
依 O00322 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

uroplakin 1A 長 258 個胺基酸,屬於 tetraspanin(TM4SF)家族。其序列註解包含四段螺旋型跨膜區,分布於第 15–35、60–86、92–112 與 231–252 位;兩端及中間短區段位於細胞質,另有兩段細胞外區域。

拓樸區域Cytoplasmic1–14 aa
跨膜區Helical15–35 aa
拓樸區域Extracellular36–59 aa
跨膜區Helical60–86 aa
拓樸區域Cytoplasmic87–91 aa
跨膜區Helical92–112 aa
拓樸區域Extracellular113–230 aa
跨膜區Helical231–252 aa
拓樸區域Cytoplasmic253–258 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O00322…

AlphaFold · O00322

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

uroplakin 1A 被註解為膜蛋白及多次穿膜蛋白。 來源未提供其定位變化條件、細胞內特定膜區域或異構型差異。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TSPAN21UPK1ASFTPDfimH
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

uroplakin 1A 被註解為可形成由二硫鍵連結的同源二聚體,並與 uroplakin-2(UPK2)互作。這些互作資訊標示為「By similarity」,屬於相似性推論。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能uroplakin 1A 是終末分化尿路上皮細胞所形成之高度特化生物膜——不對稱單位膜(AUM)——的組成成分。它可能參與膀胱上皮正常生理功能,例如調節表層傘細胞的膜通透性,或透過 AUM 與細胞骨架的相互作用穩定頂端膜;這些作用為相似性推論,並非確定結論。推論支持
證據與來源

Component of the asymmetric unit membrane (AUM); a highly specialized biomembrane elaborated by terminally differentiated urothelial cells. May play an important role in normal bladder epithelial physiology, possibly in regulating membrane permeability of superficial umbrella cells or in stabilizing the apical membrane through AUM/cytoskeletal interactions (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用uroplakin 1A 可形成以二硫鍵連結的同源二聚體,並與 uroplakin-2(UPK2)互作。這些關係標註為「By similarity」,表示相關資訊來自相似性推論;來源未提供更進一步的實驗條件或功能結果。推論支持
證據與來源

Homodimer; disulfide-linked. Interacts with uroplakin-2 (UPK2) (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位uroplakin 1A 被註解為膜蛋白,並屬於多次穿膜蛋白。此定位資訊未進一步指出特定細胞內膜區域、定位改變的條件或不同異構型之間的差異。資料庫紀錄
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000222275 · 1,265 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGAGAGGCTGCAGACAGAGAAGGATGATGGCGTCTGCGGC40
41AGCAGCGGAGGCCGAGAAGGGATCTCCAGTTGTGGTGGGC80
81CTGCTAGTTGTGGGCAATATCATTATTCTGCTGTCAGGCC120
121TGTCCCTGTTTGCTGAGACCATATGGGTGACAGCCGACCA160
161GTACCGTGTATACCCACTGATGGGAGTCTCAGGCAAGGAT200
201GACGTCTTCGCTGGTGCCTGGATTGCCATCTTCTGCGGCT240
241TCTCCTTCTTCATGGTAGCCAGTTTTGGTGTGGGTGCCGC280
281ACTCTGCCGCCGCCGGTCCATGGTCCTCACGTACCTGGTG320
321CTCATGCTCATCGTCTACATCTTCGAGTGCGCCTCCTGCA360
361TCACGTCCTACACCCACCGTGACTACATGGTGTCCAACCC400
401ATCCCTGATCACCAAGCAGATGCTGACCTTCTACAGCGCG440
441GACACCGACCAGGGCCAGGAGCTGACCCGCCTCTGGGACC480
481GCGTCATGATTGAGCAAGAATGCTGTGGCACATCTGGTCC520
521CATGGACTGGGTGAACTTCACGTCAGCCTTCCGGGCGGCC560
561ACTCCGGAGGTGGTGTTCCCCTGGCCCCCACTGTGCTGTC600
601GCCGGACGGGAAACTTCATCCCCCTCAACGAGGAGGGCTG640
641CCGCCTGGGGCACATGGACTACCTGTTCACCAAGGGCTGC680
681TTCGAACACATCGGCCACGCCATCGACAGCTACACGTGGG720
721GTATCTCGTGGTTTGGGTTTGCCATCCTGATGTGGACGCT760
761CCCGGTCATGCTGATAGCCATGTATTTCTACACCATGCTC800
801TGAGGGACAGGAGGGGAAGGCAACATACACACCCCGGACT840
841CCTCCGCATCCTCCTCCTGCTTCCTCCGCTGGGCCTGGAT880
881GGCTGCCTCACCTCTCACCTCCCAACGTCCCTAGCCCTTA920
921CGTCCTTCCACTTCCAAGATCTTTTTCCAGGTTCCTGAGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。