基因總覽
UOX 的正式名稱為 urate oxidase (pseudogene),分類為偽基因。其名稱所指的 urate oxidase 是一種酵素,可催化尿酸氧化為尿囊素;但 UOX 已因突變而失活,在人類及部分其他靈長類中不具功能。因此,這個人類基因位點不應視為具有正常功能的 urate oxidase 蛋白質產物。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000471089 ★ | 84,365,428–84,397,831 | 8 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
正常的 urate oxidase 是一種酵素,能催化尿酸氧化為尿囊素。然而,人類 UOX 已因突變而失活,因此在此物種中不具功能,不能將正常酵素的催化作用歸於這個偽基因。
Promoter 與基因調控
>UOX ENST00000471089 GRCh38 chr1:84397731-84398831 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCCGATTTGCACACTTTAACTTCCTTTATTTGTAAAGGGAGGAAAGAGAATGGACATTCCCCTTAGGAAC TTCGCAGTGAGCCAGGCCAACTCTGTACCGAGGCTGTTTGCATGCAGCAGTCCTTCCATTTCATTTACCT ACCAGTCCACAGCTTTCCCTTCTTCATTTCTGCATGAAATTGTTGCTGCCCCCAGCACCCCAAAGAGGCC AAGGAAGAGCAAAGCAAAGGATGTTCTTAGCAGTCTTGCCATCATTTTCTGTTTCATTTATTTCATGCCA CAGCAGGACACTTTCCCCATAGATTGTGGAGTCTGAGTTTCAAGGCGCTCTCAGGCTGTGCTGGCTCTGA CGTTTGATTTGATTTACCTGTGCTGTTCGCTGTTCGGGGCATTTTCAGAGTGGGATGGATCCCATGTAAT TGTGCGATTCTGTCACAACATGCCAGCGTGACTCTGGATGCCTTTGTGCTGAATTGTTGACTGGTTTGCA AAGTCATCAAAAAGTTCTGCAGAAAAATAGGGAAAGATAGTTCACTCTTTGGAGTGAACATTGTTGTATG AAATTCATTGGGCAGGGGGACTTCATTTTAATAAGTAGATGTTAAATATATTTCATGTCTTCTCCTGTTT GACTCAATGAATGAGAGCAAATGCAGGTGGTTCGTACATTAAACAGAAATGATAAAACCTTATGTCTTAG TAATAATTAGGATCTGTCACTTAATAATCTCTGTCTTAAGGAACCAGTTGCTAAGGGATACTTCAAAGGG TTGCTTCAAAGTAACAGTAAATTTAACTGTATTTTACCAAAGATGTTTACATATTCTCTCCATCTTCCTG GTTTTAGCCACTCAATGTGGTGCTTCAGGCTGCTATGCAATAGGTAAACATATTGATCACCCACTCTTCA GGTTAATAAAAAATGTTACAAACATCTATTTTGCCCAAACTATGCTTTCTCATTCTCGAAGCTGAATCTG AAGTAGAAAACCAAAATAAAATGGCCCACTACCATAACAACTATAAAAAGGTGAGACCAATTTCTTTGTG AATCAGGGAAGGAGTAGATAGACATATGAAAATAATTTCTTTAATGCATAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_938HHX · enhancer · 84402145–84402453 · regulatory
· motif · 84398332–84398346 · motif
基因座與轉錄註解
UOX 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000471089 ★ | transcribed_unitary_pseudogene | 915 nt | 8 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 正常的 urate oxidase 是一種酵素,可催化尿酸氧化為尿囊素;但 UOX 因突變而失活,在人類及部分其他靈長類中不具功能。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Urate oxidase is an enzyme that catalyzes the oxidation of uric acid to allantoin. This gene has been inactivated by mutation and is nonfunctional in humans and some other primates. |
DNA 與 RNA 序列
ATGGCCCACTACCATAACAACTATAAAAAGAATGATGAGG40TGGAGTTTGTCCGAACTGGCTATGGGAAGGAAATGGTAAA80AGTTCTCCATATTCAGTGAGATGGAAAATATCACAGCATT120AAAGAGGTGGCAACTTCAGTGCAACTTACTCTAAGTTCCA160AAAAAGATTACCTGCATGGAGATAATTCAGACATCATCCC200TACAGACACCATCAAGAACACAGTTCATGTCTTGGCAAAG240TTTAAAGAAATCAAAAGCATAGAAGCCTTTGGTGTGAATA280TTTGTGAGCATTTTCTTTCTTCTTTTAACCATGTAATCCG320AGCTCAAGTCTACATGGAAGAAATCCCTTGGAAGCATCTT360GGAAAGAATGGAGTTAAGCATGTCCATGCATTTATTCACA400CTCCCACTGGAACACACTTCTGTGAAGTTGAACAGCTGAG440AAGTGGACCCCAAGTCATTCATTCTGGAATCAAAGACCTC480AAGGTCTTGAAAACAACACAGTCTGGATTTGAAGGTTTCA520TCAAGGACCAGTTCACTACCCTCCCTGAGGTGAAGGACTG560ATGCTTTGCCACCCAAGTGTACTGCAAGTGGCGCTACCAC600CAGTGCAGGGATGTGGACTTCAAGGCTACCTGGGACACCA640TTCGGGACCTTGTCATGGAGAAATCTGCTGGGCCCTATGA680CAAAGGTGAATACTTGACCTCTGTGCAGAAGACCCTCTGT720GATATCCAGGTGCTCTCCCTGAGCCGAGTTCCTGCGATAG760AAGATATGGAAATCAGCCTGCCAAACATTCACTACTTCAA800CATAGACATGTCCAAAATGGGTCTGATCAACAAGGAAGAG840GTAAGAGGTCTTGCTGCCATTAGACAATCCATATGGAAAA880ATTACTGGTACAGTCAAGAGGAAGTTGTCTTCAAG915cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。