基因總覽
UNC93B1 是蛋白質編碼基因,其產物為 unc-93B1 regulator of TLR signaling,屬於 unc-93 family。這是一種多次穿越膜的蛋白質,序列包含多個螺旋型跨膜區段,兩端則各有一段被註記為無序的區域。它的主要角色是協助調節 nucleotide-sensing Toll-like receptor(TLR)訊號,與先天及適應性免疫相關;具體的受體運輸和訊號作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000227471 ★ | 67,991,100–68,004,097 | 11 |
| ENST00000864506 | 67,991,100–68,004,134 | 10 |
| ENST00000864508 | 67,991,100–68,004,097 | 11 |
| ENST00000864509 | 67,991,100–68,004,134 | 11 |
| ENST00000930952 | 67,991,100–68,004,134 | 9 |
| ENST00000959345 | 67,991,100–68,004,134 | 10 |
| ENST00001002533 | 67,991,100–68,004,134 | 11 |
| ENST00001143600 | 67,991,100–68,004,134 | 11 |
| ENST00000864507 | 67,991,105–68,004,134 | 11 |
| ENST00000528423 | 67,998,387–68,004,982 | 6 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UNC93B1 參與先天與適應性免疫,主要透過調節可感知核苷酸的 Toll-like receptor(TLR)訊號發揮作用。來源指出,部分 TLR 需要 UNC93B1 才能由內質網運送至內體溶酶體;這類受體包括 TLR3、TLR7 與 TLR9。
受體抵達內體溶酶體後,能在該處接觸病原體核苷酸,並啟動訊號傳遞級聯反應。因此,UNC93B1 支援的是受體到達可接觸其訊號來源的細胞區室這一步驟,進而參與 TLR 訊號調節。來源描述此作用涉及一部分 TLR,並未表示所有 TLR 都依賴 UNC93B1。
此外,UNC93B1 可能參與移除自體反應性 B 細胞。來源以「可能」描述這項作用,未進一步交代其作用機制或具體條件,因此不宜將其表述為已確立的細胞移除途徑。整體來說,現有資料所支持的重點是 UNC93B1 對特定 TLR 的運輸,以及由此支援病原體核苷酸辨識和後續訊號活化。
Promoter 與基因調控
>UNC93B1 ENST00000227471 GRCh38 chr11:68003997-68005097 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CACCCATCCAGTCACAAGTATTGATCACTCAGTAGGTGCCCAATGCCATCCTCTGCATTTGGGAGAGGAT GTACCTAAAGAGCAGTGGGTGGAGGGGGGTGCACAGGGAGGGCATGGAAAACCAGAAGGGAAGTGAAGGG ACTGCATTCTCTGCAGGGATGGTCTCTTGTTCTGAGAGCTGAGTGGGAAGGAAGCCACCTGGGAGGCGCA GCAGGAAGAGCATTCAAACCAGAAGGAACCCAGGGGAGAGAATCTGGATATTTTCAAAAGTGGCCCCGTG GCTCCAGCCAGGTCGGTGGTAGCCAGTGCTTTGGAGTGTCGGCCCCACCACAGGCTCCCGCTGCAGCCCG GGATCCAGTGCCCAGCAGGATGGGGGCAGGTGGCTCTGGGCCCCACTACATGGTTGTGGCAGGGTCCCCC ATGTAGTTCAGTGGGGATCACAATCTCCACCTCCCAGGACCCACTCAAGCTCCCATTTGCACAGCCCAAA CTGGAGCAGGATGGGGACATGGGAGGTGGGCTCTGGCTGTAGCGTCCGGTGGTGGGAGGTGGGGTCCAGG TGGTGACGCTACTGTCCCTGCAGTGCTCTTTGATGAGCTGTAACAGCAGGCTTGGAGGTGGGGCTGGGGA CGACCCAGGCAACCCTGAGGGGAGCTTAAGGGAGCCAGGCAACCCTGGCACTTTTCCAAGGCTTTGCATT AACTCAATAGTTCCGCCATGGCCCCGGGGGTAGTGCCATGTATTTCTGTTTTACCGTCGAGGAAACGGAG GAAACCGAGGCACAAAGAAATGGAGTTAATTCCTAAAGTCACAGGGCCAGGAGGTGGCTGAGTGGGGATT CGAACTCACACCCCAGAGGGCACACACAGGCAGGCCCCTGCACACACGCGCGCGCGCGCGCGCACACACA CATACACACACACGTGTCCTGGAGGAGGCGGCCCGCAGGGCGGGACAGGGCGGGGCGGGGGCAGGTCCCG GCCGCCGGGAGGAAGTGGCCGGGCGGTCGCAGGGACTCCGGGGCGACCGCCGCGAGTCCGCAGTAGTTCG GGCCATGGAGGCGGAGCCGCCGCTCTACCCGATGGCGGGGGCTGCGGGGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UNC93B1_1 ↗ | 11:68,004,056 | 負股 | 68,004,046–68,004,105 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_83ZZJ5 · enhancer · 68002135–68002340 · regulatory
ENSR11_9ZZQP · promoter · 68002482–68002931 · regulatory
ENSR11_9ZZR6 · promoter · 68004087–68004587 · regulatory
ENSR11_9ZZRD · enhancer · 68004822–68005241 · regulatory
ENSR11_83ZZMQ · promoter · 68008393–68008588 · regulatory
ENSR11_83ZZMW · enhancer · 68008589–68008836 · regulatory
· motif · 68002881–68002890 · motif
· motif · 68002881–68002892 · motif
· motif · 68002881–68002892 · motif
· motif · 68003019–68003035 · motif
· motif · 68003495–68003502 · motif
· motif · 68003495–68003510 · motif
· motif · 68003580–68003595 · motif
· motif · 68004170–68004179 · motif
· motif · 68004170–68004179 · motif
· motif · 68004194–68004205 · motif
· motif · 68004194–68004205 · motif
· motif · 68004196–68004207 · motif
· motif · 68004196–68004207 · motif
· motif · 68004198–68004209 · motif
· motif · 68004198–68004209 · motif
· motif · 68004200–68004211 · motif
· motif · 68004200–68004211 · motif
· motif · 68004202–68004213 · motif
· motif · 68004202–68004213 · motif
· motif · 68004206–68004217 · motif
· motif · 68004206–68004217 · motif
· motif · 68005419–68005433 · motif
· motif · 68008852–68008861 · motif
· motif · 68008927–68008936 · motif
TLR 致效劑可上調 UNC93B1。來源未提供此調控的細胞條件或具體作用機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:597 aa
UNC93B1 蛋白長597個胺基酸,屬於 unc-93 family。序列註解包含12個螺旋型跨膜區段;N端第1至29位及C端第522至597位則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UNC93B1 位於內質網膜,也見於內體、溶酶體及含吞噬體的細胞質囊泡。 依相似性資料,細胞受到 CpG 二核苷酸刺激後,UNC93B1 會由內質網重新定位至內體和溶酶體;它也與 LAMP5 在大型內體囊泡中共定位。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 28 個夥伴
- BEST2Q8NFU1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC107Q8WV48 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD79AP11912 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLDN7O95471 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB3L1Q96BA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CSE1LP55060 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- EBPQ15125 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERGIC3Q9Y282 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FATE1Q969F0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FFAR3O14843 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR101Q96P66 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR37L1O60883 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPRC5DQ9NZD1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HHLA2Q9UM44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLRC1P26715 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KPNB1Q14974 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LDLRAD1Q5T700 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LEUTXA8MZ59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LIME1Q9H400 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MFFQ9GZY8-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- REEP1Q9H902 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC35C2Q9NQQ7-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SSMEM1Q8WWF3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SYNDIG1Q9H7V2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TLR8Q9NR97 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
UNC93B1 與 TLR3、TLR5、TLR7 及 TLR9 有交互作用;來源指出這些交互作用可能經由跨膜區域發生。此資料描述的是蛋白質交互作用,並未提供其形成特定複合體的資訊。
疾病與遺傳關聯
UNC93B1 變異與感染誘發的急性疱疹特異性腦病易感性相關。UNC93B1 缺乏症可由常染色體隱性突變造成,並使原本健康者易罹患單純疱疹腦炎;來源將此關聯歸因於 IFNs 產生受損。該缺乏症並未損害對多數病原體的免疫。此腦炎是少數 HHV-1 感染者發生的罕見併發症,可造成顳葉與額葉部分區域出血性壞死,病程可能致命。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UNC93B1 透過調節可感知核苷酸的 TLR 訊號參與先天與適應性免疫,並是部分 TLR(包括 TLR3、TLR7 與 TLR9)由內質網運送至內體溶酶體所必需;受體可在該處接觸病原體核苷酸並啟動訊號級聯。UNC93B1 也可能參與移除自體反應性 B 細胞。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays an important role in innate and adaptive immunity by regulating nucleotide-sensing Toll-like receptor (TLR) signaling. Required for the transport of a subset of TLRs (including TLR3, TLR7 and TLR9) from the endoplasmic reticulum to endolysosomes where they can engage pathogen nucleotides and activate signaling cascades. May play a role in autoreactive B-cells removal PMID 19006693 ↗ |
| 交互作用 | UNC93B1 與 TLR3、TLR5、TLR7 及 TLR9 交互作用;此交互作用可能透過跨膜區域介導。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with TLR3, TLR5, TLR7, and TLR9 (probably via transmembrane domain) PMID 24778236 ↗ · PMID 33432245 ↗ |
| 細胞定位 | UNC93B1 是多次穿越膜的蛋白質,位於內質網膜,亦見於內體、溶酶體及含吞噬體的細胞質囊泡。依相似性資料,細胞受 CpG 二核苷酸刺激後,UNC93B1 會由內質網重新定位至內體和溶酶體;並與 LAMP5 在大型內體囊泡中共定位。 | 推論支持 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein; Endosome; Lysosome; Cytoplasmic vesicle, phagosome; Relocalizes from endoplasmic reticulum to endosome and lysosome upon cell-stimulation with CpG dinucleotides (By similarity). Colocalizes with LAMP5 in large endosomal intracellular vesicles |
| 調控 | TLR 致效劑會上調 UNC93B1。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | UNC93B1 變異與感染誘發的急性疱疹特異性腦病易感性相關。此病是 HHV-1 感染者中的罕見併發症,可在數日內出現,伴隨顳葉與額葉部分區域出血性壞死、發燒、頭痛、癲癇、昏睡,常進展至昏迷且可能致命。常染色體隱性 UNC93B1 突變造成的缺乏症,會因 IFNs 產生受損而使原本健康者易罹患單純疱疹腦炎;但對多數病原體的免疫並未受損。 | 含實驗來源 | 證據與來源Encephalopathy, acute, infection-induced, 1, herpes-specific IIAE1 A rare complication of human herpesvirus 1 (HHV-1) infection, occurring in only a small minority of HHV-1 infected individuals. It is characterized by hemorrhagic necrosis of parts of the temporal and frontal lobes. Onset is over several days and involves fever, headache, seizures, stupor, and often coma, frequently with a fatal outcome. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry. Mutations in UNC93B1 resulting in autosomal recessive UNC93B1 deficiency predispose otherwise healthy individuals to isolated herpes simplex encephalitis due to impaired IFNs production. UNC93B1 deficiency, however, does not compromise immunity to most pathogens, unlike most known primary immunodeficiencies MIM: 610551 PMID 16973841 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGGCGGTCGCAGGGACTCCGGGGCGACCGCCGCGAGTCCG40CAGTAGTTCGGGCCATGGAGGCGGAGCCGCCGCTCTACCC80GATGGCGGGGGCTGCGGGGCCGCAGGGCGACGAGGACCTG120CTCGGGGTCCCGGACGGGCCCGAGGCCCCGCTGGACGAGC160TGGTGGGCGCGTACCCCAACTACAACGAGGAGGAGGAGGA200GCGCCGCTACTACCGCCGCAAGCGCCTGGGCGTGCTCAAG240AACGTGCTGGCTGCCAGCGCCGGGGGCATGCTCACCTACG280GCGTCTACCTGGGCCTCCTGCAGATGCAGCTGATCCTGCA320CTACGACGAGACCTACCGCGAGGTGAAGTATGGCAACATG360GGGCTGCCCGACATCGACAGCAAAATGCTGATGGGCATCA400ACGTGACTCCCATCGCCGCCCTGCTCTACACACCTGTGCT440CATCAGGTTTTTTGGAACGAAGTGGATGATGTTCCTCGCT480GTGGGCATCTACGCCCTCTTTGTCTCCACCAACTACTGGG520AGCGCTACTACACGCTTGTGCCCTCGGCTGTGGCCCTGGG560CATGGCCATCGTGCCTCTTTGGGCTTCCATGGGCAACTAC600ATCACCAGGATGGCGCAGAAGTACCATGAGTACTCCCACT640ACAAGGAGCAGGATGGGCAGGGGATGAAGCAGCGGCCTCC680GCGGGGCTCCCACGCGCCCTATCTCCTGGTCTTCCAAGCC720ATCTTCTACAGCTTCTTCCATCTGAGCTTCGCCTGCGCCC760AGCTGCCCATGATTTATTTCCTGAACCACTACCTGTATGA800CCTGAACCACACGCTGTACAATGTGCAGAGCTGCGGCACC840AACAGCCACGGGATCCTCAGCGGCTTCAACAAGACGGTTC880TGCGGACGCTCCCGCGGAGCGGAAACCTCATTGTGGTGGA920GAGCGTGCTCATGGCAGTGGCCTTCCTGGCCATGCTGCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。