演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UNC93B1UNC93

unc-93B1 regulator of TLR signaling

UNC93B1 編碼 unc-93B1 regulator of TLR signaling,屬於 unc-93 family,參與先天與適應性免疫中的 TLR 訊號調節。

Homo sapiens11q13.2UniProt Q9H1C4
OFFICIAL SYMBOL
UNC93B1
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q9H1C4
PDB / ALPHAFOLD
7C76
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UNC93B1 是蛋白質編碼基因,其產物為 unc-93B1 regulator of TLR signaling,屬於 unc-93 family。這是一種多次穿越膜的蛋白質,序列包含多個螺旋型跨膜區段,兩端則各有一段被註記為無序的區域。它的主要角色是協助調節 nucleotide-sensing Toll-like receptor(TLR)訊號,與先天及適應性免疫相關;具體的受體運輸和訊號作用方式見功能說明。

Official symbol
UNC93B1
Gene name
unc-93B1 regulator of TLR signaling
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13481
UniProt
Q9H1C4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UNC93UNC-93B

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q13.2
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegUNC93B1pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:67,991,100–68,004,982
Gene span
13,883 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000227471 ★67,991,100–68,004,09711
ENST0000086450667,991,100–68,004,13410
ENST0000086450867,991,100–68,004,09711
ENST0000086450967,991,100–68,004,13411
ENST0000093095267,991,100–68,004,1349
ENST0000095934567,991,100–68,004,13410
ENST0000100253367,991,100–68,004,13411
ENST0000114360067,991,100–68,004,13411
ENST0000086450767,991,105–68,004,13411
ENST0000052842367,998,387–68,004,9826

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UNC93B1 參與先天與適應性免疫,主要透過調節可感知核苷酸的 Toll-like receptor(TLR)訊號發揮作用。來源指出,部分 TLR 需要 UNC93B1 才能由內質網運送至內體溶酶體;這類受體包括 TLR3、TLR7 與 TLR9。

受體抵達內體溶酶體後,能在該處接觸病原體核苷酸,並啟動訊號傳遞級聯反應。因此,UNC93B1 支援的是受體到達可接觸其訊號來源的細胞區室這一步驟,進而參與 TLR 訊號調節。來源描述此作用涉及一部分 TLR,並未表示所有 TLR 都依賴 UNC93B1。

此外,UNC93B1 可能參與移除自體反應性 B 細胞。來源以「可能」描述這項作用,未進一步交代其作用機制或具體條件,因此不宜將其表述為已確立的細胞移除途徑。整體來說,現有資料所支持的重點是 UNC93B1 對特定 TLR 的運輸,以及由此支援病原體核苷酸辨識和後續訊號活化。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 68004097 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UNC93B1 ENST00000227471 GRCh38 chr11:68003997-68005097 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACCCATCCAGTCACAAGTATTGATCACTCAGTAGGTGCCCAATGCCATCCTCTGCATTTGGGAGAGGAT
GTACCTAAAGAGCAGTGGGTGGAGGGGGGTGCACAGGGAGGGCATGGAAAACCAGAAGGGAAGTGAAGGG
ACTGCATTCTCTGCAGGGATGGTCTCTTGTTCTGAGAGCTGAGTGGGAAGGAAGCCACCTGGGAGGCGCA
GCAGGAAGAGCATTCAAACCAGAAGGAACCCAGGGGAGAGAATCTGGATATTTTCAAAAGTGGCCCCGTG
GCTCCAGCCAGGTCGGTGGTAGCCAGTGCTTTGGAGTGTCGGCCCCACCACAGGCTCCCGCTGCAGCCCG
GGATCCAGTGCCCAGCAGGATGGGGGCAGGTGGCTCTGGGCCCCACTACATGGTTGTGGCAGGGTCCCCC
ATGTAGTTCAGTGGGGATCACAATCTCCACCTCCCAGGACCCACTCAAGCTCCCATTTGCACAGCCCAAA
CTGGAGCAGGATGGGGACATGGGAGGTGGGCTCTGGCTGTAGCGTCCGGTGGTGGGAGGTGGGGTCCAGG
TGGTGACGCTACTGTCCCTGCAGTGCTCTTTGATGAGCTGTAACAGCAGGCTTGGAGGTGGGGCTGGGGA
CGACCCAGGCAACCCTGAGGGGAGCTTAAGGGAGCCAGGCAACCCTGGCACTTTTCCAAGGCTTTGCATT
AACTCAATAGTTCCGCCATGGCCCCGGGGGTAGTGCCATGTATTTCTGTTTTACCGTCGAGGAAACGGAG
GAAACCGAGGCACAAAGAAATGGAGTTAATTCCTAAAGTCACAGGGCCAGGAGGTGGCTGAGTGGGGATT
CGAACTCACACCCCAGAGGGCACACACAGGCAGGCCCCTGCACACACGCGCGCGCGCGCGCGCACACACA
CATACACACACACGTGTCCTGGAGGAGGCGGCCCGCAGGGCGGGACAGGGCGGGGCGGGGGCAGGTCCCG
GCCGCCGGGAGGAAGTGGCCGGGCGGTCGCAGGGACTCCGGGGCGACCGCCGCGAGTCCGCAGTAGTTCG
GGCCATGGAGGCGGAGCCGCCGCTCTACCCGATGGCGGGGGCTGCGGGGCC
UNC93B1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UNC93B1_1 ↗11:68,004,056負股68,004,046–68,004,105

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_83ZZJ5 · enhancer · 68002135–68002340 · regulatory

ENSR11_9ZZQP · promoter · 68002482–68002931 · regulatory

ENSR11_9ZZR6 · promoter · 68004087–68004587 · regulatory

ENSR11_9ZZRD · enhancer · 68004822–68005241 · regulatory

ENSR11_83ZZMQ · promoter · 68008393–68008588 · regulatory

ENSR11_83ZZMW · enhancer · 68008589–68008836 · regulatory

· motif · 68002881–68002890 · motif

· motif · 68002881–68002892 · motif

· motif · 68002881–68002892 · motif

· motif · 68003019–68003035 · motif

· motif · 68003495–68003502 · motif

· motif · 68003495–68003510 · motif

· motif · 68003580–68003595 · motif

· motif · 68004170–68004179 · motif

· motif · 68004170–68004179 · motif

· motif · 68004194–68004205 · motif

· motif · 68004194–68004205 · motif

· motif · 68004196–68004207 · motif

· motif · 68004196–68004207 · motif

· motif · 68004198–68004209 · motif

· motif · 68004198–68004209 · motif

· motif · 68004200–68004211 · motif

· motif · 68004200–68004211 · motif

· motif · 68004202–68004213 · motif

· motif · 68004202–68004213 · motif

· motif · 68004206–68004217 · motif

· motif · 68004206–68004217 · motif

· motif · 68005419–68005433 · motif

· motif · 68008852–68008861 · motif

· motif · 68008927–68008936 · motif

TLR 致效劑可上調 UNC93B1。來源未提供此調控的細胞條件或具體作用機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:597 aa

1 aa597 aa功能區域跨膜區
依 Q9H1C4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UNC93B1 蛋白長597個胺基酸,屬於 unc-93 family。序列註解包含12個螺旋型跨膜區段;N端第1至29位及C端第522至597位則被註記為無序區域。

跨膜區Helical64–84 aa
跨膜區Helical110–130 aa
跨膜區Helical132–152 aa
跨膜區Helical160–180 aa
跨膜區Helical223–243 aa
跨膜區Helical285–305 aa
跨膜區Helical343–363 aa
跨膜區Helical378–398 aa
跨膜區Helical403–423 aa
跨膜區Helical428–448 aa
跨膜區Helical469–489 aa
跨膜區Helical491–511 aa
功能區域Disordered1–29 aa
功能區域Disordered522–597 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7C76…

PDB · 7C76

EM · 3.40 A · B=1-597

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum membrane;Endosome;Lysosome;Cytoplasmic vesicle, phagosome

UNC93B1 位於內質網膜,也見於內體、溶酶體及含吞噬體的細胞質囊泡。 依相似性資料,細胞受到 CpG 二核苷酸刺激後,UNC93B1 會由內質網重新定位至內體和溶酶體;它也與 LAMP5 在大型內體囊泡中共定位。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 28 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UNC93UNC93B1BEST2CCDC107CD79ACLDN7CREB3L1CSE1LEBPERGIC3FATE1FFAR3GPR101GPR37L1GPRC5DHHLA2KLRC1KPNB1LDLRAD1LEUTXLIME1MFFREEP1SLC35C2SSMEM1SYNDIG1TLR8TM4SF18TMEM2377b
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 28 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UNC93B1 與 TLR3、TLR5、TLR7 及 TLR9 有交互作用;來源指出這些交互作用可能經由跨膜區域發生。此資料描述的是蛋白質交互作用,並未提供其形成特定複合體的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

UNC93B1 變異與感染誘發的急性疱疹特異性腦病易感性相關。UNC93B1 缺乏症可由常染色體隱性突變造成,並使原本健康者易罹患單純疱疹腦炎;來源將此關聯歸因於 IFNs 產生受損。該缺乏症並未損害對多數病原體的免疫。此腦炎是少數 HHV-1 感染者發生的罕見併發症,可造成顳葉與額葉部分區域出血性壞死,病程可能致命。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UNC93B1 透過調節可感知核苷酸的 TLR 訊號參與先天與適應性免疫,並是部分 TLR(包括 TLR3、TLR7 與 TLR9)由內質網運送至內體溶酶體所必需;受體可在該處接觸病原體核苷酸並啟動訊號級聯。UNC93B1 也可能參與移除自體反應性 B 細胞。含實驗來源
證據與來源

Plays an important role in innate and adaptive immunity by regulating nucleotide-sensing Toll-like receptor (TLR) signaling. Required for the transport of a subset of TLRs (including TLR3, TLR7 and TLR9) from the endoplasmic reticulum to endolysosomes where they can engage pathogen nucleotides and activate signaling cascades. May play a role in autoreactive B-cells removal

PMID 19006693 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用UNC93B1 與 TLR3、TLR5、TLR7 及 TLR9 交互作用;此交互作用可能透過跨膜區域介導。含實驗來源
證據與來源

Interacts with TLR3, TLR5, TLR7, and TLR9 (probably via transmembrane domain)

PMID 24778236 ↗ · PMID 33432245 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位UNC93B1 是多次穿越膜的蛋白質,位於內質網膜,亦見於內體、溶酶體及含吞噬體的細胞質囊泡。依相似性資料,細胞受 CpG 二核苷酸刺激後,UNC93B1 會由內質網重新定位至內體和溶酶體;並與 LAMP5 在大型內體囊泡中共定位。推論支持
證據與來源

Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein; Endosome; Lysosome; Cytoplasmic vesicle, phagosome; Relocalizes from endoplasmic reticulum to endosome and lysosome upon cell-stimulation with CpG dinucleotides (By similarity). Colocalizes with LAMP5 in large endosomal intracellular vesicles

開啟資料庫紀錄 ↗

調控TLR 致效劑會上調 UNC93B1。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated by TLRs agonists

PMID 18082565 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯UNC93B1 變異與感染誘發的急性疱疹特異性腦病易感性相關。此病是 HHV-1 感染者中的罕見併發症,可在數日內出現,伴隨顳葉與額葉部分區域出血性壞死、發燒、頭痛、癲癇、昏睡,常進展至昏迷且可能致命。常染色體隱性 UNC93B1 突變造成的缺乏症,會因 IFNs 產生受損而使原本健康者易罹患單純疱疹腦炎;但對多數病原體的免疫並未受損。含實驗來源
證據與來源

Encephalopathy, acute, infection-induced, 1, herpes-specific IIAE1 A rare complication of human herpesvirus 1 (HHV-1) infection, occurring in only a small minority of HHV-1 infected individuals. It is characterized by hemorrhagic necrosis of parts of the temporal and frontal lobes. Onset is over several days and involves fever, headache, seizures, stupor, and often coma, frequently with a fatal outcome. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry. Mutations in UNC93B1 resulting in autosomal recessive UNC93B1 deficiency predispose otherwise healthy individuals to isolated herpes simplex encephalitis due to impaired IFNs production. UNC93B1 deficiency, however, does not compromise immunity to most pathogens, unlike most known primary immunodeficiencies MIM: 610551

PMID 16973841 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000227471 · 2,294 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGGCGGTCGCAGGGACTCCGGGGCGACCGCCGCGAGTCCG40
41CAGTAGTTCGGGCCATGGAGGCGGAGCCGCCGCTCTACCC80
81GATGGCGGGGGCTGCGGGGCCGCAGGGCGACGAGGACCTG120
121CTCGGGGTCCCGGACGGGCCCGAGGCCCCGCTGGACGAGC160
161TGGTGGGCGCGTACCCCAACTACAACGAGGAGGAGGAGGA200
201GCGCCGCTACTACCGCCGCAAGCGCCTGGGCGTGCTCAAG240
241AACGTGCTGGCTGCCAGCGCCGGGGGCATGCTCACCTACG280
281GCGTCTACCTGGGCCTCCTGCAGATGCAGCTGATCCTGCA320
321CTACGACGAGACCTACCGCGAGGTGAAGTATGGCAACATG360
361GGGCTGCCCGACATCGACAGCAAAATGCTGATGGGCATCA400
401ACGTGACTCCCATCGCCGCCCTGCTCTACACACCTGTGCT440
441CATCAGGTTTTTTGGAACGAAGTGGATGATGTTCCTCGCT480
481GTGGGCATCTACGCCCTCTTTGTCTCCACCAACTACTGGG520
521AGCGCTACTACACGCTTGTGCCCTCGGCTGTGGCCCTGGG560
561CATGGCCATCGTGCCTCTTTGGGCTTCCATGGGCAACTAC600
601ATCACCAGGATGGCGCAGAAGTACCATGAGTACTCCCACT640
641ACAAGGAGCAGGATGGGCAGGGGATGAAGCAGCGGCCTCC680
681GCGGGGCTCCCACGCGCCCTATCTCCTGGTCTTCCAAGCC720
721ATCTTCTACAGCTTCTTCCATCTGAGCTTCGCCTGCGCCC760
761AGCTGCCCATGATTTATTTCCTGAACCACTACCTGTATGA800
801CCTGAACCACACGCTGTACAATGTGCAGAGCTGCGGCACC840
841AACAGCCACGGGATCCTCAGCGGCTTCAACAAGACGGTTC880
881TGCGGACGCTCCCGCGGAGCGGAAACCTCATTGTGGTGGA920
921GAGCGTGCTCATGGCAGTGGCCTTCCTGGCCATGCTGCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。