基因總覽
UNC93A(unc-93 homolog A)是蛋白質編碼基因,產物屬於 unc-93 family。現有資料指出其與 N-acetylglucosamine 跨細胞膜運輸有關;蛋白質序列註解顯示它含有多個跨膜螺旋,符合多次穿越膜的蛋白質特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000230256 ★ | 167,291,315–167,316,014 | 8 |
| ENST00000860147 | 167,269,010–167,316,028 | 9 |
| ENST00000503433 | 167,271,169–167,296,196 | 4 |
| ENST00000366829 | 167,291,311–167,316,028 | 7 |
| ENST00001137799 | 167,291,311–167,316,028 | 8 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UNC93A 的已知功能是特定運輸 N-acetylglucosamine,使其跨越細胞膜。這項描述將運輸物質限定為 N-acetylglucosamine,並指出運輸方向跨越質膜;來源未進一步說明該運輸在不同細胞或生理條件下如何調節。
反應式所列的 N-acetyl-D-glucosamine(in) = N-acetyl-D-glucosamine(out),表示 N-acetyl-D-glucosamine 可由膜的一側移至另一側。現有資料未提供更細節的運輸機制、方向性或其他底物,因此不宜據此推論其能量需求、運輸速率或生理作用。
Promoter 與基因調控
>UNC93A ENST00000230256 GRCh38 chr6:167290315-167291415 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAGAACTTTACCCCATTTATCATTGGCCCTGATCTTCTGATGGTCTGGCAAGCTTCCCTGAGTAGTGTTG CCAGGATGCTAGACTTACCTGCGAGATTTGCCTTATAGATCTAATCTAGACAGAAATGGCTGACTTCACA GAACTTTGGAAACAATCTGCAGACATCAAGTTTTACTTATAATTGAATAAAAATAATTTTTCTTGCTTAT TAGCTATGACATTTGTGGTAAGTTGCTTAAAGCTCCAGACTTACCCCGTCTAATACAGTTGTCTCTAGCC ACATGTGGTTAAATTTTAATTGTAATTAACTAAAAGGAGATGCAGTTGTGAACTCATTTTATCAGTTGCA CTTGCCACATTTCAGAACTCAATAGTCACATGTGGCGAGTGGCTACCATACTGGACAACACTGCCCCAGA CCAAAATACCAAATCATTTAACTTTTCTGAAGCTGTTTCCTGTCTTATAATGGGTCTAAGATTTCTAATG ATCATTAGCATAGCACTATTGTTGGTAACATGAAATAATGCATGAAATTCTTTGCATATTGTAAAGTACT ATACTCATGTAAGTTGTTTTTTCTTTTAATAATTGCTGTACTGTGTTGTGAAACTGTACAGTCTTTGCAA TACTAAGACTTTGGCCCCAGGATCTTACAATCACGTTAGCTCTTTTTCAGAAGTTGAACTATGTGTCTTG AAGTTGACATTTATGCTTTGTTCTTTAAGACTGAAGTCCTCATTCTGCACCACTGACAACTTCTGACAGT TTCTCTTACTGTGGAAGGTTCTATTCTATATACACATAAAAAGTGAAACATATCACTTTACCATCTGGAC CATGTCTATTAGAATTTAATAGGAAAAAAGCGCAATTAACTAGAAGCTGGTAAGAGTAATGATCTTTTGC CCCATACAAAGTGGACATTGTGGATCACAGAGAAGGTAAATGAGTAACAGAGCTCCCGTATGCTTCATGG GGTCAGTGATAACCAAGTTCATTAACGAGTGACAGTCTTAATGACTAACACACCTCTAACATTTCACCTC TAGCTCAGATGAGAGAGAGAATGGGACTTCTTGGTACTGATTGTTTTTCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UNC93A_1 ↗ | 6:167,291,371 | 正股 | 167,291,322–167,291,381 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_B387DN · enhancer · 167288560–167289310 · regulatory
ENSR6_53GCDMC · CTCF_binding_site · 167288828–167288849 · regulatory
· motif · 167286540–167286553 · motif
· motif · 167286540–167286554 · motif
· motif · 167286540–167286555 · motif
· motif · 167286540–167286555 · motif
· motif · 167287015–167287026 · motif
· motif · 167288830–167288846 · motif
· motif · 167290947–167290962 · motif
· motif · 167291341–167291351 · motif
· motif · 167291351–167291364 · motif
· motif · 167291777–167291786 · motif
· motif · 167291777–167291786 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:457 aa
UNC93A 蛋白長 457 個胺基酸,屬於 unc-93 family。序列特徵註解標示 11 段螺旋型跨膜區域,支持其具有多次穿越膜的結構;這些區域的位置由蛋白質特徵資料標示,未提供各區段個別功能的說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UNC93A 定位於細胞膜,並被註記為多次穿越膜的蛋白質。 資料未指出定位會隨條件改變,也未提供異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 40 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ABHD16AO95870 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AQP6Q13520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATP13A1Q9HD20-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCL4P13236 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UNC93A 特定運輸 N-acetylglucosamine,使其跨越質膜;來源未進一步交代運輸條件、分子機制或是否涉及其他底物。 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | N-acetyl-D-glucosamine(in) = N-acetyl-D-glucosamine(out) | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | UNC93A 被註記為位於細胞膜的多次穿膜蛋白;此定位資訊未說明其在不同條件下是否改變,也未提供異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATTAACGAGTGACAGTCTTAATGACTAACACACCTCTAAC40ATTTCACCTCTAGCTCAGATGAGAGAGAGAATGGGACTTC80TTGGTACTGATTGTTTTTCCCATGCCTCAATTGGTTTCTT120TTAGGGAGCTACAAATTTACGTGTTCACTGGTGATTGATC160TTTTCATCCAGCACAATGGACAGAAGTCTAAGGAACGTCC200TTGTGGTTTCCTTTGGGTTCCTGCTTCTCTTTACAGCCTA240TGGAGGTCTGCAGAGCCTGCAGAGCAGCCTGTACAGCGAG280GAGGGCCTGGGTGTCACAGCGCTCAGCACCCTCTATGGAG320GCATGCTCCTGTCCTCCATGTTCCTCCCACCGCTCCTCAT360CGAGAGGCTGGGCTGCAAGGGGACCATCATCCTCTCCATG400TGTGGCTACGTGGCCTTCTCCGTGGGCAACTTCTTCGCCA440GCTGGTACACTTTGATCCCCACCTCCATACTGCTGGGACT480CGGGGCCGCCCCGCTGTGGTCTGCACAGTGCACATACCTC520ACGATCACGGGAAACACACATGCAGAGAAGGCGGGAAAGC560GTGGCAAAGACATGGTGAACCAGTATTTTGGCATCTTCTT600CCTCATATTCCAGTCATCCGGTGTGTGGGGCAACTTGATC640TCATCGCTGGTATTTGGCCAGACTCCCAGCCAAGAGACCC680TTCCAGAAGAGCAGCTCACGTCCTGTGGGGCCAGTGACTG720CCTGATGGCCACCACAACCACCAACAGCACCCAGAGGCCC760TCCCAGCAGCTGGTCTACACCCTCCTGGGCATCTACACTG800GGAGTGGTGTCCTGGCTGTCCTGATGATAGCTGCGTTCCT840CCAACCCATACGAGATGTTCAGCGGGAAAGTGAAGGAGAG880AAGAAATCAGTACCTTTCTGGTCCACTTTACTGTCGACTT920TCAAGCTATATAGAGATAAACGTCTGTGCCTCTTAATTCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。