基因總覽
UNC5B（unc-5 netrin receptor B）是蛋白質編碼基因，產物屬於 unc-5 家族，為單次穿膜的 netrin 受體。其胞外區包含 Ig-like、Ig-like C2-type 與兩個 TSP type-1 結構域；胞內區則具有 ZU5、UPA 與 Death domain。這種跨膜架構使受體能以胞外部分接收訊號，並透過胞內區域參與細胞反應。來源所述的角色涵蓋神經發育、血管形成與細胞凋亡；相關功能的具體作用方式見功能段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000335350 ★ | 71,212,570–71,302,864 | 17 |
| ENST00000373192 | 71,212,523–71,302,885 | 16 |
| ENST00000935473 | 71,212,523–71,302,885 | 15 |
| ENST00000935474 | 71,212,523–71,302,885 | 17 |
| ENST00000935475 | 71,212,523–71,302,885 | 17 |
| ENST00000935476 | 71,212,523–71,302,885 | 16 |
| ENST00000935477 | 71,212,523–71,302,885 | 16 |
| ENST00001140181 | 71,212,523–71,302,885 | 17 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UNC5B 是 netrin 受體，參與發育中神經系統的軸突導引。配體結合後，它可介導神經元生長錐的軸突排斥反應。來源指出，這種排斥可能與 UNC5B 和 DCC 結合有關，並可能由此啟動排斥訊號；此機制標示為依相似性推定，並非在此來源中作為確定結論陳述。
在血管新生過程中，UNC5B 作為 netrin 受體，負向調節血管分枝。來源描述，細胞接收 netrin 後，UNC5B 介導內皮生長錐中尖端細胞絲狀偽足的回縮；這項作用亦標示為依相似性推定。這些結果將 UNC5B 的受體功能連結至神經軸突與血管形態變化，但來源沒有進一步提供其作用於兩類細胞時的完整訊號路徑。
UNC5B 也具有依賴受體功能：未與 netrin 配體結合時，可促進細胞凋亡。來源指出，UNC5B 透過活化 DAPK1 介導此反應；缺少 NTN1 時，UNC5B 會降低 DAPK1 在 Ser-308 的自體抑制性磷酸化，進而提高其催化活性。這項作用說明配體是否存在會影響 UNC5B 與凋亡反應的關聯；其中 DAPK1 活化的具體調控描述標示為依相似性推定。
Promoter 與基因調控
>UNC5B ENST00000335350 GRCh38 chr10:71211570-71212670 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTGCTTAGCCCTGTGCCTGGCACAGGGAAGGTCTTTGCCTATGTTAGCTGATCCGCTCGTTCTGATCTCT CTGGGTTTCAATCCCAAGACACTGCCCATCCTTCAAACCTCACCTGTCCCCACGTGCTCCTTGGACCACC TTTGGGTGGTCAGGACTTTCCCCCTGGAATCAGACTGGCTGGGAGGGGAGAATCTTGGAAAGAGATTATT GACACTTGCACTGCAATTTCCACACAAGTTTTAAAATTTAATTCTATACCCCCTTATGAAATAGTTATCC TTTTCCTCCATTTTACAGATGATGATGAAGGGAGCAATAGAATTGTTAAGTAACTTGTTCAAGGTCACAC AGTAAATAAGGGGCAGAGTCCAAGTTTACACTGAGCCAAAAATGGCTGTCCCACTGTCAGGTAGGAGGCT AGTTTACAACAACGCAGGATCAGAGTGCTGGAGGGGTTTCCAGGGGTCTGGTTAACAGTTCTGCCGGAGA TCATACAGACAAGCAGAGCCAGCCAGGATGATCCTAATCTATACCCAGCTTCATATCGCTGTAAGCCCCC GCGTAACCAGGACTTGGGTGTTCTCATTTTGGGAGCCTTTTTTTTGGAAAGACCCCCACATGTGGAAGGC AGAGCGCATACTACAGACAGGGGAGCCAAAAGTGAGAGTCCTATGTTTAATCAGAGGAGAAAGCTGACAT GGCCAAGCCAAATGAAGGCGCAAAGCCAGATTTCCTTAATTTGGGGGAGCGAAAATTGGGCCGCCTCCAC GTCCAGCCATTCTCCAGCGGCCGGGTTTTTCAAAACGCTGCGCCCAGCGTCTCGCGAGGACCCTCCCCCC GGGTCCCCCAGCTCTGCCGCGGCCGCGCCCAGATGGCCGTCGGATCCCCCCTCAAGGTCCCCCTGTCGGC TCCGCCCTCGGTCGCCCAGGCCCCGCCCCGGCCGCGCGCGGTCCCCTCGGTTGGCGAACTCACTCCGGCG AGCGAGCGGCGGCGCTCGGCATTGTGGCAGGCGGCTGGGGCCGGCTAGGGCGCCGGAGCCGCACGCAGCC GCGGGGCTCCGAGAGGCGCGCACTGGGGCTGGGACTGCGCGGCGCCGCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UNC5B_1 ↗ | 10:71,212,570 | 正股 | 71,212,521–71,212,580 |
| UNC5B_2 ↗ | 10:71,213,012 | 正股 | 71,212,963–71,213,022 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_C93R6 · enhancer · 71208862–71210085 · regulatory
ENSR10_6BD536 · CTCF_binding_site · 71209206–71209254 · regulatory
ENSR10_BJ5KP · promoter · 71212080–71212937 · regulatory
ENSR10_5LQ8LH · CTCF_binding_site · 71212273–71212294 · regulatory
ENSR10_C93RG · enhancer · 71212938–71214503 · regulatory
ENSR10_C93RP · enhancer · 71216836–71218297 · regulatory
ENSR10_5LQ9H3 · CTCF_binding_site · 71217363–71217384 · regulatory
· motif · 71209208–71209224 · motif
· motif · 71209233–71209249 · motif
· motif · 71209235–71209251 · motif
· motif · 71211928–71211941 · motif
· motif · 71211928–71211943 · motif
· motif · 71212275–71212291 · motif
· motif · 71212398–71212408 · motif
· motif · 71212499–71212509 · motif
· motif · 71217365–71217381 · motif
來源將 UNC5B 的調控關聯列為 p53/TP53；未提供調控方向、作用條件或具體機制，因此無法進一步說明其對 UNC5B 的影響。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：945 aa
UNC5B 長 945 個胺基酸，N 端含訊號胜肽，胞外區位於第 27–377 位，接續第 378–398 位的穿膜螺旋，胞質區則延伸至 C 端。胞外區包含 Ig-like、Ig-like C2-type 與兩個 TSP type-1 結構域；胞質區具有 ZU5、UPA 區域及位於末端附近的 Death domain。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UNC5B 是細胞膜上的單次穿膜第一型膜蛋白，也與膜脂筏相關。 來源未指出其定位是否會隨特定條件或異構型而改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane raft。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- Agap2Q8CGU4 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- NTN1O95631 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
UNC5B 的胞質區與 DCC、GNAI2 有互作；其 Death domain 與 DAPK1 的 Death domain 互作。胞外區可直接結合 FLRT3，也與 FLRT2 互作，且對 FLRT3 的親和力較高。UNC5B 曾被辨識於含 FLRT3 與 ADGRL3 的複合體中，但不會單獨與 ADGRL3 互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UNC5B 是 netrin 受體，參與發育中神經系統的軸突導引；配體結合後可促使神經元生長錐產生軸突排斥，該反應可能與其和 DCC 結合並啟動排斥訊號有關（依相似性推定）。在血管新生時，UNC5B 負向調節血管分枝，並可在 netrin 反應中介導內皮尖端細胞絲狀偽足回縮（依相似性推定）。未結合 netrin 時，它也可作為依賴受體促進凋亡，並藉由降低 DAPK1 在 Ser-308 的自體抑制性磷酸化、提高其催化活性而活化 DAPK1；此調控機制標示為依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for netrin required for axon guidance. Mediates axon repulsion of neuronal growth cones in the developing nervous system upon ligand binding. Axon repulsion in growth cones may be caused by its association with DCC that may trigger signaling for repulsion (By similarity). Functions as a netrin receptor that negatively regulates vascular branching during angiogenesis. Mediates retraction of tip cell filopodia on endothelial growth cones in response to netrin (By similarity). It also acts as a dependence receptor required for apoptosis induction when not associated with netrin ligand. Mediates apoptosis by activating DAPK1. In the absence of NTN1, activates DAPK1 by reducing its autoinhibitory phosphorylation at Ser-308 thereby increasing its catalytic activity (By similarity) PMID 12598906 ↗ |
| 交互作用 | UNC5B 的胞質部分與 DCC、GNAI2 互作；其 Death domain 可與 DAPK1 的 Death domain 互作。胞外區與 FLRT3 直接互作，也與 FLRT2 互作，但對 FLRT3 的親和力較高。UNC5B 曾被辨識於含 FLRT3 與 ADGRL3 的複合體中，不過 UNC5B 本身不會單獨與 ADGRL3 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with the cytoplasmic part of DCC (By similarity). Interacts with GNAI2 via its cytoplasmic part. Interacts (via death domain) with DAPK1 (via death domain). Interacts (via extracellular domain) with FLRT3 (via extracellular domain); the interaction is direct. Interacts (via extracellular domain) with FLRT2 and FLRT3 (via extracellular domain), but has higher affinity for FLRT3. Identified in a complex with FLRT3 and ADGRL3; does not interact with ADGRL3 by itself PMID 12359238 ↗ · PMID 15729359 ↗ · PMID 18582460 ↗ · PMID 25374360 ↗ |
| 細胞定位 | UNC5B 位於細胞膜，是單次穿膜第一型膜蛋白，並與膜脂筏相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Membrane raft; Associated with lipid rafts PMID 25374360 ↗ |
| 調控 | UNC5B 的調控關聯列為 p53/TP53；來源未提供調控方向、條件或具體機制。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ATTGTGGCAGGCGGCTGGGGCCGGCTAGGGCGCCGGAGCC40GCACGCAGCCGCGGGGCTCCGAGAGGCGCGCACTGGGGCT80GGGACTGCGCGGCGCCGCCGCTGCGAGCGCCACTGAGCGG120TCGCGCAACTTCGGAGGCACAGCGCCGGAGCCAGGCGAGC160GCTCAGAGACCCGGAGCCAGAGGGGCGCGCCGGAGCCTCG200TTCGAGAGCCGGCGCCAGGCACCCACCGCGCTCCGAGTGC240CAGGCGGCCCTCCGCGCAGCGTGGCTTCCGCTGCCCCCAC280GGAAGGCACGGGCTGGCGCTGCCGGGCGCCGGGGAGGACG320GCGAGGAGGAGGCGGCGGCGGCGGAGACGGCGGCGGCGAG360ACTGGGGCCAGGGAGACAGCCCTGGGGGAGAGGCGCCCGA400ACCAGGCCGCGGGAGCATGGGGGCCCGGAGCGGAGCTCGG440GGCGCGCTGCTGCTGGCACTGCTGCTCTGCTGGGACCCGA480GGCTGAGCCAAGCAGGCACTGATTCTGGCAGCGAGGTGCT520CCCTGACTCCTTCCCGTCAGCGCCAGCAGAGCCGCTGCCC560TACTTCCTGCAGGAGCCACAGGACGCCTACATTGTGAAGA600ACAAGCCTGTGGAGCTCCGCTGCCGCGCCTTCCCCGCCAC640ACAGATCTACTTCAAGTGCAACGGCGAGTGGGTCAGCCAG680AACGACCACGTCACACAGGAAGGCCTGGATGAGGCCACCG720GCCTGCGGGTGCGCGAGGTGCAGATCGAGGTGTCGCGGCA760GCAGGTGGAGGAGCTCTTTGGGCTGGAGGATTACTGGTGC800CAGTGCGTGGCCTGGAGCTCCGCGGGCACCACCAAGAGTC840GCCGAGCCTACGTCCGCATCGCCTACCTGCGCAAGAACTT880CGATCAGGAGCCTCTGGGCAAGGAGGTGCCCCTGGACCAT920GAGGTTCTCCTGCAGTGCCGCCCGCCGGAGGGGGTGCCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。