演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UNC5AKIAA1976

unc-5 netrin receptor A

UNC5A(unc-5 netrin receptor A)是 UNC-5 家族的 netrin 受體,參與軸突導引與 netrin 訊號;未與 netrin 配體結合時,也可促進細胞凋亡。

Homo sapiens5q35.2UniProt Q6ZN44
OFFICIAL SYMBOL
UNC5A
CHROMOSOME
5
UNIPROT
Q6ZN44
PDB / ALPHAFOLD
4V2A
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UNC5A(unc-5 netrin receptor A)是蛋白質編碼基因,產物屬於 UNC-5 家族,為 netrin 受體。其蛋白質具有單次穿膜的第一型膜蛋白拓撲:胞外區與細胞質區由一段跨膜區分隔。胞外部分包含兩個免疫球蛋白樣結構域及一個 TSP type-1 結構域;細胞質部分則含有 ZU5 與 Death 結構域。這些區域構成 UNC5A 的基本結構特徵;其與 netrin 的關係及相關細胞功能見下方說明。

Official symbol
UNC5A
Gene name
unc-5 netrin receptor A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12567
UniProt
Q6ZN44
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KIAA1976UNC5H1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q35.2
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegUNC5Apq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr5:176,810,451–176,880,898
Gene span
70,448 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000329542 ★176,810,559–176,880,89815
ENST00000509580176,810,451–176,880,89816
ENST00000927830176,810,451–176,880,89816
ENST00000970734176,810,451–176,880,89814
ENST00001135533176,810,451–176,880,89815

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UNC5A 是 netrin 受體,參與 netrin 訊號路徑,並為軸突導引所需。來源指出,UNC5A 對神經突生長的促進作用會在 NTN1 存在時發生,說明其生長促進功能與 netrin 配體的訊號相連。

UNC5A 也具有依賴受體的功能:當它未與 netrin 配體結合時,會促進細胞凋亡的誘導。因此,配體結合狀態與其功能結果相關;來源分別描述了 NTN1 存在時的神經突生長促進作用,以及未結合 netrin 時的凋亡誘導作用。這些資料支持 UNC5A 兼具軸突導引相關受體與依賴受體的角色,但未提供更細的下游分子機制或特定細胞情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 176810559 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UNC5A ENST00000329542 GRCh38 chr5:176809559-176810659 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGCAGCCCTCTGTTTATTTTAACCCGATTAGGGAATGGGGGTGGGGCACAGGAGACTCCAGCAGCGGTC
ACTGCTGGAGGCTCCAGGAGACGACGTGACTTGACCAAGGTCACAGAGCTGGAAGGTGAAGTCGCCTGGA
CCCTACCCCCGGTCTCCCTAGCTGCCAAAGCCCAGCTCGTTCCTTTACACCCACGTCGCGGGCGCCGTGC
GCTCTCGGGGCTCAAACACCGCGCGCCCAGTCGGGTGTGCTGCGCCTGAAGGTTGTTTTCCTTCGGCGAA
CGGCGCCGAGGGGTTAGGGAAACCTTGGGTCATGGTGTGAGGCGCGCCCCTGGAATCCACCAGCCTGCGA
GGCTGGGACTGCGGGTGTCCCCGAGTCTGGCCTGCCAGCTCTGGTGGCCAGGGCACCTCTGCGCGCGGGC
CAGGGCCCCGGGGCTCTCCCGCAGTCCCCTAACCAAGCCGCGGGCTGGCAGCGTACCGCGGCGCCCGGAC
GACCCCGGAGCGCGGCCGCGAGGAAAGGGCGGGGGAGAGGACTGCAGCGGAACCTGCCCGGGGCACCCCT
GCCCTGGGCGGCTCTCCGCAGGCTGGCGCCGCGCCGGGGTCGCCGCAGCCCCGGGCCCCTCCCGGGCCAC
CTGTGCGCAGACTGGCGGGCCCGCGAGAGCCCGGATCCGGAGCACCGATCCACTCCGGGTTTCAGACTCC
TGCCCCTGTCCCTGGAGACCCCGCGGGGCGGTGGGAGGCCTCCACGCCCACCACCCCAAGCCCCTCCCTG
GGGGAGCCTCAGGCATCGCCCAGAGGGATTCCCGGTGCTGGGGGTGGCCCGCGCGCGCTGCGCGGGGCGG
CCCGGCCCCTCCTTCCTTCCCCCGCCCCTCCCAGCCGCCGCCCCGCTCCGTCGCTCCAGTCCGGGTTTTG
CGGCGCCCACCGGCCCGCTCTCCGGCTGCGGGCTCCGCGGCGCGGCTGGCTCGGTGCGCGGCGCGGCTGG
CGCTGCGCTCCGCCCCGGCTGCATTGCTGCGCTCCCGTGCCCAAGGGAGCCACGCGCCGCGTGCGCCCGG
CAGCCGGCCGCCCGGAGGCAGCGCAGTCCGCTGGCATGGGCCCCGGGGGCG
UNC5A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UNC5A_1 ↗5:176,810,561正股176,810,512–176,810,571

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_877CKH · open_chromatin_region · 176806284–176806473 · regulatory

ENSR5_B3B4F7 · promoter · 176810029–176810569 · regulatory

ENSR5_B3B4FB · enhancer · 176810570–176811453 · regulatory

ENSR5_B3B4FK · enhancer · 176812610–176813312 · regulatory

ENSR5_53JKTPP · CTCF_binding_site · 176812993–176813014 · regulatory

· motif · 176810299–176810309 · motif

· motif · 176810313–176810323 · motif

· motif · 176810398–176810408 · motif

· motif · 176810417–176810427 · motif

· motif · 176811001–176811010 · motif

· motif · 176812995–176813011 · motif

來源記載 UNC5A 受 p53/TP53 調控;未提供調控方向、作用條件或具體分子機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:842 aa

1 aa842 aa結構域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q6ZN44 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UNC5A 蛋白長 842 個胺基酸,N 端含訊號胜肽,胞外區位於第 26–306 位,跨膜螺旋位於第 307–327 位,細胞質區延伸至第 842 位。胞外區包含 Ig-like、Ig-like C2-type 與 TSP type-1 結構域;細胞質區包含 ZU5 與 Death 結構域。

訊號胜肽1–25 aa
拓樸區域Extracellular26–306 aa
跨膜區Helical307–327 aa
拓樸區域Cytoplasmic328–842 aa
結構域Ig-like44–141 aa
結構域Ig-like C2-type155–234 aa
結構域TSP type-1242–294 aa
結構域ZU5441–584 aa
結構域Death761–841 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4V2A…

PDB · 4V2A

X-ray · 2.40 A · A=1-303

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Membrane raft;Cell projection, neuron projection

UNC5A 位於細胞膜、膜筏及神經元突起。 與 PRKCABP 的交互作用會調節 UNC5A 的細胞表面表現,並使其從神經元及生長錐表面移除。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane raft;Cell projection, neuron projection。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KIAA1976UNC5A
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UNC5A 可形成同源二聚體與同源寡聚體,並與 MAGED1 及 PRKCABP 交互作用;PRKCABP 可能介導部分與 PKC 的交互作用,此關係標示為相似性推定。UNC5A 的胞外區與 FLRT2 的胞外區有交互作用;它也被記載可透過胞外區與 FLRT3 胞外區交互作用,該項為相似性推定。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UNC5A 是軸突導引所需的 netrin 受體,參與 netrin 訊號路徑;在 NTN1 存在時可促進神經突生長。若未與 netrin 配體結合,UNC5A 也具有依賴受體功能,並為細胞凋亡誘導所需。推論支持
證據與來源

Receptor for netrin required for axon guidance. Functions in the netrin signaling pathway and promotes neurite outgrowth in response to NTN1. It also acts as a dependence receptor required for apoptosis induction when not associated with netrin ligand

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用UNC5A 可形成同源二聚體及同源寡聚體,並與 MAGED1、PRKCABP 交互作用;PRKCABP 可能介導部分與 PKC 的交互作用,此為相似性推定。UNC5A 胞外區也與 FLRT2 胞外區交互作用;與 FLRT3 胞外區的交互作用同樣標示為相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Homodimer and homooligomer. Interacts with MAGED1. Interacts with PRKCABP, possibly mediating some interaction with PKC (By similarity). Interacts (via extracellular domain) with FLRT2 (via extracellular domain). Interacts (via extracellular domain) with FLRT3 (via extracellular domain) (By similarity)

PMID 25374360 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位UNC5A 是單次穿膜的第一型膜蛋白,位於細胞膜、膜筏及神經元突起。它與 PRKCABP 的交互作用會調節 UNC5A 的細胞表面表現,並導致 UNC5A 從神經元及生長錐表面移除。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Membrane raft; Cell projection, neuron projection; The interaction with PRKCABP regulates its surface expression and leads to its removal from the surface of neurons and growth cones

開啟資料庫紀錄 ↗

調控UNC5A 的調控與 p53/TP53 有關;來源未說明其調控方向、發生條件或具體機制。含實驗來源
證據與來源

By p53/TP53

PMID 12598906 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000329542 · 3,733 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCATTGCTGCGCTCCCGTGCCCAAGGGAGCCACGCGCCGC40
41GTGCGCCCGGCAGCCGGCCGCCCGGAGGCAGCGCAGTCCG80
81CTGGCATGGGCCCCGGGGGCGCCCCGAGCTGGGGCTCCGG120
121GCTGAGGCGCTAAAGCCGCCCTCCCGCCCGCGGGGCCCCG160
161CGCCCGGCCCGCCCGCCTGCCCGCCCGCGGCCATGGCCGT200
201CCGGCCCGGCCTGTGGCCAGCGCTCCTGGGCATAGTCCTC240
241GCCGCTTGGCTCCGCGGCTCGGGTGCCCAGCAGAGTGCCA280
281CCGTGGCCAACCCAGTGCCTGGTGCCAACCCGGACCTGCT320
321TCCCCACTTCCTGGTGGAGCCCGAGGATGTGTACATCGTC360
361AAGAACAAGCCAGTGCTGCTTGTGTGCAAGGCCGTGCCCG400
401CCACGCAGATCTTCTTCAAGTGCAACGGGGAGTGGGTGCG440
441CCAGGTGGACCACGTGATCGAGCGCAGCACAGACGGGAGC480
481AGTGGGCTGCCCACCATGGAGGTCCGCATTAATGTCTCAA520
521GGCAGCAGGTCGAGAAGGTGTTCGGGCTGGAGGAATACTG560
561GTGCCAGTGCGTGGCATGGAGCTCCTCGGGCACCACCAAG600
601AGTCAGAAGGCCTACATCCGCATAGCCTATTTGCGCAAGA640
641ACTTCGAGCAGGAGCCGCTGGCCAAGGAGGTGTCCCTGGA680
681GCAGGGCATCGTGCTGCCCTGCCGTCCACCGGAGGGCATC720
721CCTCCAGCCGAGGTGGAGTGGCTCCGGAACGAGGACCTGG760
761TGGACCCGTCCCTGGACCCCAATGTATACATCACGCGGGA800
801GCACAGCCTGGTGGTGCGACAGGCCCGCCTTGCTGACACG840
841GCCAACTACACCTGCGTGGCCAAGAACATCGTGGCACGTC880
881GCCGCAGCGCCTCCGCTGCTGTCATCGTCTACGTGGACGG920
921CAGCTGGAGCCCGTGGAGCAAGTGGTCGGCCTGTGGGCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。