演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UNC13Bhmunc13

unc-13 homolog B

UNC13B 編碼 unc-13 homolog B,屬於 unc-13 家族;其產物參與突觸囊泡成熟與神經傳遞物質釋放,相關功能證據標示為相似性推定。

Homo sapiens9p13.3UniProt O14795
OFFICIAL SYMBOL
UNC13B
CHROMOSOME
9
UNIPROT
O14795
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UNC13B 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 unc-13 homolog B,產物屬於 unc-13 家族。其蛋白質長 1,591 個胺基酸,具有多個不同類型的區域,包括 C2 結構域、MHD1 與 MHD2,以及 Phorbol-ester/DAG-type 鋅指區;另有兩段被註解為無序區。這些結構特色構成辨識此蛋白質的基本特徵。來源所述的功能涉及囊泡成熟與神經傳遞,但相關敘述均標示為相似性推定,具體作用內容見功能段落。

Official symbol
UNC13B
Gene name
unc-13 homolog B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12566
UniProt
O14795
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
hmunc13Unc13h2Munc13-2UNC13

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99p13.3
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegUNC13Bpq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:35,161,829–35,405,339
Gene span
243,511 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000635942 ★35,162,009–35,405,33540
ENST0000061957835,161,829–35,405,33940
ENST0000039678735,161,829–35,405,33941
ENST0000037849535,161,829–35,405,33939
ENST0000089338235,161,829–35,405,33940
ENST0000089338335,161,829–35,405,33939
ENST0000089338435,161,829–35,405,33939
ENST0000089338535,161,829–35,405,33939
ENST0000089338635,161,829–35,405,33938
ENST0000089338735,161,829–35,405,33937
ENST0000089338835,161,829–35,405,33940
ENST0000089338935,161,829–35,405,33938

顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UNC13B 參與胞吐作用期間的囊泡成熟,並被描述為 diacylglycerol 第二信使路徑的作用標的。來源將此功能列為相似性推定,未提供其分子作用細節或實驗條件。

在神經傳遞物質釋放過程中,UNC13B 參與突觸囊泡的預備,使囊泡在融合前進入可供釋放的狀態。它也參與依神經活動而進行的 readily releasable vesicle pool(RRP)補充;這些功能同樣屬於相似性推定。

UNC13B 對部分興奮性/麩胺酸能突觸的突觸囊泡成熟被描述為必要,但該描述不適用於抑制性/GABA 介導的突觸。來源沒有進一步界定這些突觸的範圍或差異機制,因此不宜將此結論延伸至所有突觸類型。

此外,UNC13B 與 UNC13A 協同促進神經元致密核心囊泡融合,並調控這些囊泡突觸釋放的位置與效率。這項作用亦標示為相似性推定;現有敘述指出其與囊泡融合及釋放特性的關聯,但未詳述調控步驟。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 35162009 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UNC13B ENST00000635942 GRCh38 chr9:35161009-35162109 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAAAAATCCCTATTCAGCTACTTACCTAGGGGTGCGTCTCAGGCTGAAAACGGCTGTCTACCATCCCAGA
AGTAGGAAAAAAACCCCTCATCTTCCCTGTTGGAAGTGAGCTCAAACTCCATAAAAGAGTTACCTGCCTT
CCCTCGTCATGGAAGCAGGAAAACTTGCCTTCCTTGTTGGAAGCAAGTAAAACTCCAAAATAATAATAAT
AATAATAATAATAATAATAATAATAGAGGGAGTTGTACAACAAAATGAACTTTAGATCTCGACCAAATTT
TGGGAGATCAGGGATTCTCTGGAGGGGGTGCTCCTAGACCTTAGCAAATTGTCCTGTTGGTTTGAGCCAT
GGAGTTAGCTCATGTTGGTACCAAGCATGGATAGGAGATTTGTCAAAGATCAGAGGTATCTCCACTCACA
ATCCCTCCGTGGTTACCATCCTTCATTCAGTAAATATTTACGGACTGATTACCATACACTAGGCACTATT
CCAGACATTGGAGATACAATGATGAGCATAAAAAACGGTCTAGATAAGAACTGAGGTCTCCAGACATACT
TTATGCCCACTCAGTTTTGTCTTTTGCCCTAGTTGCTAAACAAAACTTAACTTTGCTGTGCGGTGCGACT
TCGTTAACTTAAAATTACAGGCTGTCAGCTATGACCGCTAGACTCTAAGAAAGTCCAGTGGAAATCCTTC
AATGAAAAGAATCTGTTCTTGGGTGGAAGCCCCGCTCATGCAGGAGGAACAGAGGGCTTCCATTCTCGCG
TCACACAACTGAGGGTCAACCCCTTGCTCCCTGCAGTAAGCCTGATTAGTGGGCGGAGCTTCCTTCAGGA
TCGCAAGAAAGAAAGGAGGAAGGGGACCCCGCCTCCTACGTGCTCGCGGGGGGGGGCGGGGTCGGTGGAC
TGGGCGTGAGTTAATTGGCTGGGGGGCGGGGCACCACGGGTTGGCTCCGCCCAGGCGCTCGCGCGGATCC
CGGGTGGAATGACGGGAGGGAGTCCCGGCAGCTCCTACCTCCCAGCGATGGCGTCGCTGTGCCGCGCCCA
GTCCCCAGCCTGCCGGCCGGTACTCACCGCTACCCGGAGTTCGCTCAGACG
UNC13B 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UNC13B_1 ↗9:35,162,023正股35,161,974–35,162,033

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_9HXS3 · enhancer · 35161382–35161777 · regulatory

ENSR9_9HXS6 · promoter · 35161778–35162072 · regulatory

ENSR9_832WMH · enhancer · 35162073–35162287 · regulatory

ENSR9_9HXSC · promoter · 35162288–35162788 · regulatory

ENSR9_9HXT3 · enhancer · 35164798–35165064 · regulatory

· motif · 35163600–35163615 · motif

· motif · 35163600–35163615 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1591 aa

1 aa1591 aa結構域功能區域鋅指
依 O14795 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UNC13B 蛋白質長 1,591 個胺基酸,屬於 unc-13 家族。註解包含 C2 2(胺基酸 583–707)、MHD1(1013–1156)、MHD2(1263–1405)及 C2 3(1419–1546)等結構域,並有位於 477–527 的 Phorbol-ester/DAG-type 鋅指區。另有兩段無序區,分別位於 155–210 與 230–350。

結構域C2 2583–707 aa
結構域MHD11013–1156 aa
結構域MHD21263–1405 aa
結構域C2 31419–1546 aa
鋅指Phorbol-ester/DAG-type477–527 aa
功能區域Disordered155–210 aa
功能區域Disordered230–350 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O14795…

AlphaFold · O14795

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Membrane;Cell membrane;Synapse

UNC13B 被註解位於細胞質、膜周邊、細胞膜及突觸,並定位於突觸。 依相似性推定,結合 phorbol ester 後可轉位至質膜;此描述指出定位會隨該條件改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane;Synapse。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
hmunc13UNC13BDIRAS1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源記載 UNC13B 與 RIMS1 互作,但未說明互作的具體性質、發生情境或其是否構成特定複合體,因此不進一步推定其結合方式或功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UNC13B 參與胞吐作用中的囊泡成熟,並是 diacylglycerol 第二信使路徑的作用標的;它在囊泡融合前參與突觸囊泡預備,也參與依神經活動補充 readily releasable vesicle pool(RRP)。其對部分興奮性/麩胺酸能、而非抑制性/GABA 介導突觸的囊泡成熟具有必要性,並與 UNC13A 協同促進神經元致密核心囊泡融合及調控其突觸釋放位置與效率;上述功能均為相似性推定。推論支持
證據與來源

Plays a role in vesicle maturation during exocytosis as a target of the diacylglycerol second messenger pathway. Is involved in neurotransmitter release by acting in synaptic vesicle priming prior to vesicle fusion and participates in the activity-depending refilling of readily releasable vesicle pool (RRP) (By similarity). Essential for synaptic vesicle maturation in a subset of excitatory/glutamatergic but not inhibitory/GABA-mediated synapses (By similarity). In collaboration with UNC13A, facilitates neuronal dense core vesicles fusion as well as controls the location and efficiency of their synaptic release (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用來源記載 UNC13B 與 RIMS1 互作,但沒有提供互作發生的條件、實驗系統或功能結果,因此不據此判定其是否形成特定複合體或具有何種調控作用。推論支持
證據與來源

Interacts with RIMS1

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位UNC13B 被註解位於細胞質、膜周邊、細胞膜及突觸,並定位於突觸;依相似性推定,結合 phorbol ester 後會轉位至質膜,顯示其定位可在此條件下改變。推論支持
證據與來源

Cytoplasm; Membrane / Peripheral membrane protein; Cell membrane; Synapse; Localized to synapses. Translocated to the plasma membrane in response to phorbol ester binding (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000635942 · 14,600 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCCCGGCAGCTCCTACCTCCCAGCGATGGCGTCGCTGT40
41GCCGCGCCCAGTCCCCAGCCTGCCGGCCGGTACTCACCGC80
81TACCCGGAGTTCGCTCAGACGGTGAGATTTGGGGCGGGTC120
121CGAGGCAGCGGCGGGACGCTACCTGCGACCGGGACCATGA160
161GGAGCTGCCAGACCCGTGGGGCCGGTAACGAGAGCAGTCG200
201CGGCACCTGCTGAGAGGAAAGAGGGAGCGGTCCGGCGCGG240
241CTGGGGCGCGGCAGAGGCTTGCCCGATCCTCGGCCATGTC280
281ACTGCTCTGCGTGCGCGTTAAAAGGGCCAAATTCCAGGGT320
321TCACCAGATAAATTTAACACATATGTGACCCTGAAAGTAC360
361AGAATGTGAAGAGCACAACTGTAGCAGTTCGTGGTGATCA400
401GCCTTCCTGGGAACAGGATTTCATGTTTGAGATTAGTCGC440
441CTGGACCTGGGTCTAAGTGTGGAGGTATGGAACAAAGGAC480
481TGATCTGGGACACCATGGTGGGGACTGTGTGGATTGCGCT520
521GAAGACTATTCGTCAGTCGGATGAGGAAGGGCCTGGGGAA560
561TGGTCCACATTAGAGGCAGAGACGTTAATGAAAGACGATG600
601AGATCTGTGGAACTAGAAACCCAACTCCTCATAAAATTTT640
641GCTTGATACAAGATTTGAGTTGCCTTTTGATATCCCAGAG680
681GAGGAAGCCAGATATTGGACCTACAAATGGGAGCAAATCA720
721ATGCCTTGGGAGCTGACAATGAGTATTCTAGTCAAGAAGA760
761AAGCCAGAGGAAGCCATTGCCCACTGCTGCCGCCCAGTGT800
801TCTTTTGAAGACCCTGATAGTGCCGTCGATGACCGAGATA840
841GTGACTATCGCAGTGAGACCAGCAACAGCTTCCCACCTCC880
881TTACCATACAGCTTCCCAGCCCAACGCTTCTGTGCACCAG920
921TTCCCTGTGCCGGTGCGATCGCCACAGCAGCTGCTACTTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。