基因總覽
UNC119 是一個蛋白質編碼基因，產物 unc-119 lipid binding chaperone 歸屬於 PDE6D/unc-119 家族。此蛋白具有脂質結合伴護蛋白的性質，能辨識一部分帶有 N 端豆蔻醯化修飾的蛋白質；不同於只作用於單一貨物的描述，來源指出其辨識對象涵蓋多種豆蔻醯化蛋白。蛋白質長 240 個胺基酸，N 端 1–61 位被註記為無序區域；來源另將 N 端 1–59 位與中體定位、121–240 位與中心體定位分別連結。這些特徵提供了 UNC119 的家族、基本分子性質與區域概觀；其對細胞功能的具體參與方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000335765 ★ | 28,546,708–28,552,624 | 5 |
| ENST00000978060 | 28,546,705–28,552,653 | 5 |
| ENST00000484980 | 28,546,707–28,551,802 | 4 |
| ENST00000869304 | 28,546,707–28,552,653 | 4 |
| ENST00000913791 | 28,546,707–28,552,653 | 5 |
| ENST00000978062 | 28,546,707–28,552,653 | 5 |
| ENST00001043889 | 28,546,707–28,552,653 | 5 |
| ENST00001124260 | 28,546,707–28,552,620 | 5 |
| ENST00001133917 | 28,546,707–28,552,653 | 5 |
| ENST00000301032 | 28,546,708–28,552,653 | 4 |
| ENST00001118839 | 28,546,709–28,552,653 | 4 |
| ENST00000470125 | 28,546,711–28,549,399 | 3 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UNC119 具有脂質結合伴護蛋白功能，對一部分 N 端豆蔻醯化蛋白有專一性。它可直接結合這些蛋白的豆蔻醯基，並為其正確定位所需。這種貨物辨識能力將 UNC119 與蛋白質運送及定位相連；來源指出，相關作用涉及感覺神經元中的蛋白質運送，也可能參與感光細胞內的蛋白質運送。
在感覺神經元中，UNC119 結合豆蔻醯化的 GNAT1，且是 G 蛋白定位與運送所必需。於感光細胞，UNC119 涉及突觸功能，並可能參與蛋白質運送；後者在來源中以「可能」描述，並非確定結論。來源也將 UNC119 與胞內體回收及胞吞作用相連，並指出它參與細菌攝取，但未進一步限定這些作用的細胞或分子步驟。
在免疫細胞中，UNC119 作為 Src family kinase activator，參與訊息傳遞。它也透過 RAB11A 介導 Src family kinase 訊號，對細胞質分裂完成具有重要作用。這些描述涵蓋免疫細胞訊號與細胞分裂過程，但來源未提供更細的作用機制，因此不宜將其擴寫成特定下游反應或普遍適用的細胞效應。
Promoter 與基因調控
>UNC119 ENST00000335765 GRCh38 chr17:28552524-28553624 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTTCCAGATTTGGAATCAAACAGTCCTGAATTCAAATCCTTGTTTTTGCACTTATTGTCTGGAGAGCTTT GGATAAGGTATTGAATCTCTCTGAGCCTCAGTTTTTCATTTGTTCAAATGGCACTGATGATGTCTCCCTT ACAAGATGGTTGTGAGGAGTAAATGTGATCAGCATGTAAAGTGTCTGGCGTGTAGTAGGCTCTTAATAAA CACTGGCTGAATATGAATTGGAATGATACAAAGTCTGAGCTCTACTCTTTCTGCATTCACGCGTAAGTAA CAGTTTCCTGGTGTTTGTCCTCCTGTGCCCACAGGTCCACTTTGCTTCCACGTGGCCATGTGCCCTTCCT AGCTGGATTGCCCAAGGCTGTTAGCATCTGCTTTTTACCTGAGATACTAATTCATCAGGTCAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCTTGAGCACCAGCTGCAGGGAGCCTTCTGCTAGGTACAGGGGTCCTACAG AGAACAAAGTAGGCAGGACCAGTGCTTTCACAGAGCTGAGCTTTCAGGGGGAAGAGTCAGCGGACAAATA AAAATAATTTCACATAATGCATTAGAAAGACAAAAACAGGCTGGTCAGATGGTGACTGAGGGGGAAGGAC TTCAGACTGGGTGTGAGGGAGGCCCTTTGAGCAGATGACATTTGAGCTGTGACTAGGAGAAAAGAGGCCA TCTGGGGAAGACCATCCAAGCAGAGACCCTGAGCCTGGAACTCACGGGCAGAAAGGCTGGAACACAATGA GTAAGCGGAGAGGTAGTCAGGACCCCACTAGTACCAGTACAAGAAAGTGTTAGAAAAACAGAATGAAGCC CAGGGCAGGATACCCCGACTCCCATCCCCCGCGCCCGTCGCATTTCGGGAGGGTTGGGCCGGGCGGCGGG CGGGATCAGCGCAGGGCCCACCCCAGGGGCGGGGCCGGGGCGGGGCAGTACCTGGGGCCCCGGCCGGGGG CGGGGCTGCGGATGCTCCCACTTCCCCCGGCTCCAGCCGGCGCAGGCAGCGGCGGCAGCAGCAGGCGAGC CTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGCCGGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UNC119_4 ↗ | 17:28,547,199 | 負股 | 28,547,189–28,547,248 |
| UNC119_2 ↗ | 17:28,547,755 | 負股 | 28,547,745–28,547,804 |
| UNC119_1 ↗ | 17:28,552,612 | 負股 | 28,552,602–28,552,661 |
| UNC119_3 ↗ | 17:28,552,761 | 負股 | 28,552,751–28,552,810 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_8SMWL · enhancer · 28549255–28549388 · regulatory
ENSR17_9FBXW · promoter · 28549389–28549889 · regulatory
ENSR17_9FBZG · enhancer · 28551367–28551791 · regulatory
ENSR17_9FBZK · promoter · 28551792–28552292 · regulatory
ENSR17_9FBZS · promoter · 28552614–28553121 · regulatory
ENSR17_9FC24 · enhancer · 28553638–28554062 · regulatory
ENSR17_8SN2P · enhancer · 28554634–28554817 · regulatory
ENSR17_58PC7Q · CTCF_binding_site · 28554704–28554725 · regulatory
· motif · 28547780–28547791 · motif
· motif · 28547780–28547791 · motif
· motif · 28547804–28547815 · motif
· motif · 28547804–28547815 · motif
· motif · 28549970–28549983 · motif
· motif · 28549972–28549983 · motif
· motif · 28549974–28549983 · motif
· motif · 28551085–28551098 · motif
· motif · 28551085–28551098 · motif
· motif · 28551684–28551692 · motif
· motif · 28552986–28553001 · motif
· motif · 28554706–28554722 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：240 aa
UNC119 蛋白長 240 個胺基酸，屬於 PDE6D/unc-119 家族。第 1–61 位胺基酸被註記為無序區域；第 1–59 位與中體定位有關，第 121–240 位則與中心體定位有關。來源提供的是區域註解，未列出特定結構域名稱。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UNC119 在細胞週期間呈現位置變化：間期位於中心體；有絲分裂開始後，從紡錘體極轉移至紡錘體中區；至末期定位於細胞間橋，細胞質分裂時則位於中體。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 20 個夥伴
- AMOTA2BDD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AMOTQ4VCS5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARL15Q9NXU5 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ARL2P36404 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- ARL3P36405 · UniProt INTERACTION · 16 experiments
- C16orf74Q96GX8 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- CFTRP13569 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KRTAP1-3Q8IUG1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP9-3Q9BYQ3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP9-8Q9BYQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LRIF1Q5T3J3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NPHP3Q7Z494 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- PPP3CAQ08209-2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PPP3CCP48454 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBPMS2Q6ZRY4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RCAN3Q9UKA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM200AQ86VY9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TP53INP1Q96A56 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Arl2Q9D0J4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Arl3Q9WUL7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
UNC119 與 ARL2、ARL3 的 GTP 結合型態互作，促進豆蔻醯化貨物釋放；它也與 ARL3、RP2 形成複合體，RP2 在複合體中促使 ARL3 水解 GTP，進而釋放 UNC119。UNC119 與 LCK、LYN 的互作分別與其活化相關，也與 FYN 互作。另與 RAB11A 的互作具有細胞週期依賴性；與 USP48 互作則促進 UNC119 穩定性。來源亦列出其他互作，包括依賴修飾狀態或條件的 NPHP3、CYS1、MACIR，以及 CABP4、DNM1、CD44、KLHL18、PPP3CA、PPP3CB 和 PPP3CC。
疾病與遺傳關聯
UNC119 變異與兩種疾病條目相關。Immunodeficiency 13 是罕見且具異質性的症候群，定義為在沒有 HIV 感染或其他已知免疫缺陷原因時，CD4 T 淋巴球數可重複測得低於每微升 300 個，或低於 T 細胞總數的 20%；患者易有感染及惡性腫瘤。來源指出，影響 UNC119 的變異可能造成此病。Cone-rod dystrophy 24 則為自體顯性遺傳的視錐桿細胞失養症，來源將其歸因於影響 UNC119 的變異；病程以視錐細胞先退化、其後視桿細胞退化為特徵，並造成視力與視野損害。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UNC119 參與感光細胞突觸功能、免疫細胞訊息傳遞、胞內體回收、細菌攝取與胞吞作用，也涉及感覺神經元及可能的感光細胞蛋白質運送。它作為脂質結合伴護蛋白，辨識並結合部分 N 端豆蔻醯化蛋白，且為其定位所需；結合豆蔻醯化 GNAT1 對感覺神經元中 G 蛋白的定位與運送必要。UNC119 也透過 RAB11A 介導 Src family kinase 訊號，協助細胞質分裂完成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in synaptic functions in photoreceptor cells, the signal transduction in immune cells as a Src family kinase activator, endosome recycling, the uptake of bacteria and endocytosis, protein trafficking in sensory neurons and as lipid-binding chaperone with specificity for a diverse subset of myristoylated proteins. Specifically binds the myristoyl moiety of a subset of N-terminally myristoylated proteins and is required for their localization. Binds myristoylated GNAT1 and is required for G protein localization and trafficking in sensory neurons. Probably plays a role in trafficking proteins in photoreceptor cells. Plays important roles in mediating Src family kinase signals for the completion of cytokinesis via RAB11A PMID 12496276 ↗ · PMID 14757743 ↗ · PMID 19381274 ↗ · PMID 21642972 ↗ · PMID 22085962 ↗ · PMID 23535298 ↗ · PMID 22960633 ↗ |
| 交互作用 | UNC119 與多種蛋白互作，部分作用具條件性：無鈣時與 CABP4 互作；與 DNM1 互作會降低其 GTPase 活性；可能與 GTP 結合型 ARL1 互作，並與 ARL2、ARL3 的 GTP 結合型態互作以促進豆蔻醯化貨物釋放。它與 ARL3、RP2 形成複合體，RP2 促使 ARL3 水解 GTP，導致 UNC119 釋放；亦與豆蔻醯化的 NPHP3、CYS1互作。MACIR 僅在 UNC119 未結合豆蔻醯化蛋白時互作。UNC119 與 LCK、FYN、RAB11A、LYN、KLHL18、PPP3CA、PPP3CB、PPP3CC、CD44 及 USP48 互作；其中 LCK、LYN 活化，RAB11A 互作具細胞週期依賴性，USP48 促進 UNC119 穩定性。它也與 ABL1、ABL2、CRK 形成複合體，抑制 ABL kinases 對 CRK 的磷酸化；與 CD44 的互作則與 Shigella 入侵相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with CABP4; in the absence of calcium (By similarity). Interacts with DNM1; leading to a decrease of DNM1 GTPase activity (By similarity). May interact with GTP-bound ARL1. Interacts with ARL2 and ARL3 (GTP-bound forms); this promotes the release of myyristoylated cargo proteins. Found in a complex with ARL3, RP2 and UNC119; RP2 induces hydrolysis of GTP ARL3 in the complex, leading to the release of UNC119. Interacts with NPHP3 (when myristoylated). Interacts with CYS1 (when myristoylated). Interacts with MACIR; interaction only takes place when UNC119 is not liganded with myristoylated proteins. Interacts with LCK; this interaction plays a crucial role in activation of LCK. Interacts with FYN. Interacts with RAB11A; in a cell cycle-dependent manner. Interacts with LYN (via SH2 and SH3 domains); leading to LYN activation. Found in a complex with ABL1, ABL2, CRK and UNC119; leading to the inhibition of CRK phosphorylation by ABL kinases. Interacts with CD44; leading to Shigella invasion. Interacts with KLHL18 (via kelch repeats). Interacts with PPP3CA, PPP3CB and PPP3CC (By similarity). Interacts with USP48; this interaction promotes UNC119 stability PMID 11303027 ↗ · PMID 12496276 ↗ · PMID 14757743 ↗ · PMID 18588884 ↗ · PMID 19381274 ↗ · PMID 21642972 ↗ · PMID 22085962 ↗ · PMID 22960633 ↗ · PMID 23535298 ↗ · PMID 30945270 ↗ · PMID 31696965 ↗ · PMID 36293380 ↗ |
| 細胞定位 | UNC119 在間期細胞定位於中心體；有絲分裂開始後，從紡錘體極轉移至紡錘體中區；接著在末期定位於細胞間橋，並在細胞質分裂期間位於中體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle pole; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; Localizes to the centrosome in interphase cells and begins to translocate from the spindle pole to the spindle midzone after the onset of mitosis; it then localizes to the intercellular bridge in telophase cells and to the midbody in cytokinetic cells PMID 23535298 ↗ |
| 疾病關聯 | Immunodeficiency 13 是罕見且具異質性的症候群，特徵是在沒有 HIV 感染或其他已知免疫缺陷原因時，CD4 T 淋巴球數可重複低於每微升 300 個，或低於 T 細胞總數的 20%；此病易導致感染及惡性腫瘤。來源指出，影響 UNC119 的變異可能造成此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Immunodeficiency 13 IMD13 A rare and heterogeneous syndrome defined by a reproducible reduction in the CD4 T-lymphocyte count (less than 300 cells per microliter or less than 20% of total T-cells) in the absence of HIV infection or other known causes of immunodeficiency. IMD13 predisposes to infections and malignancy. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615518 PMID 22184408 ↗ |
| 疾病關聯 | Cone-rod dystrophy 24 是自體顯性遺傳的視錐桿細胞失養症，通常可見視網膜色素沉積，主要位於黃斑區；視錐細胞先減少，之後視桿細胞退化，造成視力及中央視野敏感度下降，並進一步喪失周邊視野。相較於 retinitis pigmentosa，因視錐細胞退化較快，嚴重視力損失較早發生。來源指出，影響 UNC119 的變異會造成此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cone-rod dystrophy 24 CORD24 An autosomal dominant form of cone-rod dystrophy, an inherited retinal dystrophy characterized by retinal pigment deposits visible on fundus examination, predominantly in the macular region, and initial loss of cone photoreceptors followed by rod degeneration. This leads to decreased visual acuity and sensitivity in the central visual field, followed by loss of peripheral vision. Severe loss of vision occurs earlier than in retinitis pigmentosa, due to cone photoreceptors degenerating at a higher rate than rod photoreceptors. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620342 PMID 11006213 ↗ · PMID 35947183 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTTCCCCCGGCTCCAGCCGGCGCAGGCAGCGGCGGCAGCA40GCAGGCGAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGA80AGGGCGGCGGTGGGGCCGGGACGGCGACGGAGTCCGCTCC120GGGGCCCTCGGGCCAGAGCGTGGCCCCCATACCACAGCCG160CCTGCGGAATCCGAATCTGGGTCCGAGTCGGAGCCGGACG200CAGGCCCAGGGCCCAGGCCGGGGCCGCTGCAGAGGAAGCA240GCCGATCGGGCCGGAGGACGTGCTGGGGCTGCAGCGGATC280ACCGGTGACTACCTCTGCTCCCCTGAGGAGAATATCTACA320AGATCGACTTTGTCAGGTTTAAGATTCGGGACATGGACTC360AGGCACTGTCCTCTTTGAAATCAAGAAGCCCCCAGTCTCA400GAACGGTTGCCCATCAACCGGCGGGACCTGGACCCCAATG440CTGGGCGCTTTGTCCGCTACCAGTTCACGCCTGCCTTCCT480CCGCCTGAGGCAGGTGGGAGCCACGGTGGAGTTCACAGTG520GGAGACAAGCCTGTCAACAACTTCCGCATGATCGAGAGGC560ACTACTTCCGCAACCAGCTACTCAAAAGCTTCGACTTCCA600CTTTGGCTTCTGCATCCCCAGCAGCAAGAACACCTGCGAG640CACATTTACGACTTCCCCCCTCTCTCCGAGGAGCTGATCA680GCGAGATGATCCGCCACCCGTATGAGACCCAGTCTGACAG720CTTCTACTTCGTGGATGACCGGCTGGTGATGCACAATAAA760GCAGACTATTCCTACAGCGGGACACCCTGACCCCACGGCT800GCCCTGACCCCAGGAGGCTCCAGTTCTGGGCTGGGAGCTG840TGACCTCCCCAACGCTCACCCCTCAACCCCAAGTCCTCTG880CTTGGGGAGTTCTCCAGGAGCTCCGGACCCTGAGTCAATG920TTGGGAGGAAGGGTACCTGGTGTCCCCAGTCAAGCCCATG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。