演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UGT8CGT

UDP glycosyltransferase 8

UGT8 編碼 UDP glycosyltransferase 8,屬於 UDP-glycosyltransferase 家族,可將 galactose 轉移至 ceramide,是 galactocerebroside 生合成的重要酵素。

Homo sapiens4q26UniProt Q16880
OFFICIAL SYMBOL
UGT8
CHROMOSOME
4
UNIPROT
Q16880
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UGT8 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 UDP glycosyltransferase 8。其產物屬於 UDP-glycosyltransferase 家族,具有將 galactose 接到 ceramide 上的酵素功能,參與形成 galactocerebroside。這類脂質是中樞神經系統與周邊神經系統髓鞘膜中豐富的 sphingolipid。蛋白質具有一段跨膜區域,整體為單次跨膜膜蛋白;其序列註解另標示 N 端 signal 區域。這些特徵概述了 UGT8 產物的家族歸屬、基本分子性質與主要生物學角色。

Official symbol
UGT8
Gene name
UDP glycosyltransferase 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12555
UniProt
Q16880
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CGT

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44q26
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25UGT8pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr4:114,598,335–114,679,771
Gene span
81,437 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000310836 ★114,598,807–114,678,2256
ENST00000507710114,598,335–114,678,5887
ENST00000880013114,598,335–114,678,2258
ENST00000880014114,598,335–114,678,2236
ENST00000913294114,598,335–114,678,5858
ENST00000913296114,598,335–114,678,2237
ENST00001120502114,598,335–114,679,7717
ENST00001123155114,598,335–114,679,7718
ENST00001136248114,598,335–114,678,2256
ENST00000880012114,598,374–114,678,5866
ENST00000913295114,598,374–114,678,2257
ENST00000880015114,599,119–114,678,2256

顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UGT8 的主要功能是催化 galactose 轉移至 ceramide,這是 galactocerebroside 生合成中的關鍵酵素步驟。Galactocerebroside 屬於 sphingolipid,且在中樞神經系統與周邊神經系統的髓鞘膜中含量豐富,因此 UGT8 所催化的反應連結了 ceramide 的修飾與這類髓鞘脂質的形成。

反應以 UDP-alpha-D-galactose 為 galactose 來源,將糖基接到 N-acyl-sphingoid base,產生 beta-D-galactosyl-(1<->1')-ceramide 類產物,並釋出 UDP 與 H(+)。來源列出的反應底物包括 N-acylsphing-4-enine,以及 N-(2-hydroxy-hexanoyl)-sphing-4-enine 或 sphinganine;相應產物為帶有 beta-D-galactosyl 基團的 sphing-4-enine 或 sphinganine 衍生物。

UGT8 的受質範圍也涵蓋帶羥基與不帶羥基脂肪酸的 ceramide,並可對 diglycerides 進行 galactosylation;此受質範圍的描述依據序列相似性推定。其功能因此歸入 sphingolipid metabolism,並直接參與 galactosylceramide biosynthesis。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 114598807 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UGT8 ENST00000310836 GRCh38 chr4:114597807-114598907 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTTCATGAAACTCACAATCTACCTCAGGCGCTCAAAGGCACTCGGCCTCTCAGGTCTGAGGCACCACAG
AGAGGCTTCCTTGGGCACAGTTGCTTGCTGGTCAAGACGCCAACTTGGCAAGGTTATGCTGCTGGCAAAG
GCAGATTCGTCAGAATAAAGTCGCCACAGGCTCAACCAGGCAAATCATGAATGGCCCTTTCAGCAGGAGC
CTGAGAGGAGGGATGTTATTCAGCCCAGCAACCCTATTTACTTTTTTTCAGGATCCCCAAACTCGCGTTT
TTTAAGGCTTTCCGCTACAAGAGAGCCAGAATTGAAGCCTGGGTTGGCGGCAGTGCAGGTACCTGCTCAC
CTAAGCATCCCTCTTTTAATTTTCCTAACTCCTCCACCCACTTGCCCAAGTATAACTTTTGAATGGATTC
AGCAGAAGTGAGGCAGGAAAGGCAGGAAGATGAGAAAAGGCGCGACATCAACACGCAGAGCTCACTGAGC
CGCCTTGATGATAAAAGGCGGGCACAGGGACTACGTGGGTGGTGGCAGAAAGGGCGCGGGACACGCCTCG
CAAAGAGGGAAGAGTGGGCGGGGCCACGTGCCGTTGTCAGAGTTCGCAACTCGAGCGCCCAGAGGGCTCG
CGAAAAGTCCCAGCCTGCAAGCCAACCTCGCTCAGCGGACGACTGGCCGGATCCCAACGCGCTGCCCCTT
GCCCAGCCTGCGAGCGCGTGGTACGAAGGCGCGTCTGCATCCATGCCCCAGCCCGGGGAGCTGGAGGCGC
TCGCAGTCAGAGGCGAGTGATGCTAGGCTGAGCGCGTGGCGGCCCGTGTCGTGCCCCGCTGAGCCAAGTG
CGGAAGGGCAGCGGCGCGCTCCGACTCTGCTCGCCGCACGCAGGGCGGGGCGCGGCTGGGGGGCGGGGGG
CCTGGCCGCCCGCTGGGAGCTGCGGACGAGCAGGCGCGCTGAGGACCCGAGGGAGGACACGGTTAAAGCA
TTGCTATCAACTGTGAACCCAGAGAGCCCTCCTTAGCCAACACGCTAACTCCGAAGCCTCCCTTACGCCC
CCGAACCACCGAAGGCGGCGACACCTGATTCAGCGCACAAACACAGGTCCC
UGT8 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UGT8_1 ↗4:114,598,402正股114,598,353–114,598,412
UGT8_2 ↗4:114,598,807正股114,598,758–114,598,817

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_BSQ3M · promoter · 114598280–114598817 · regulatory

ENSR4_85CZ8R · enhancer · 114598818–114598965 · regulatory

ENSR4_93NH5H · promoter · 114598966–114599466 · regulatory

ENSR4_85CZCB · enhancer · 114603167–114603334 · regulatory

ENSR4_93NH6Q · enhancer · 114603448–114603839 · regulatory

· motif · 114598326–114598339 · motif

· motif · 114598375–114598388 · motif

· motif · 114598389–114598398 · motif

· motif · 114598389–114598398 · motif

· motif · 114598389–114598398 · motif

· motif · 114598389–114598398 · motif

· motif · 114601557–114601572 · motif

· motif · 114601564–114601586 · motif

· motif · 114601564–114601586 · motif

· motif · 114602004–114602021 · motif

· motif · 114602013–114602021 · motif

· motif · 114602054–114602066 · motif

· motif · 114602057–114602064 · motif

· motif · 114603485–114603498 · motif

· motif · 114603594–114603609 · motif

· motif · 114603617–114603630 · motif

· motif · 114603645–114603658 · motif

· motif · 114603672–114603684 · motif

· motif · 114603701–114603712 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:541 aa

1 aa541 aa訊號胜肽跨膜區
依 Q16880 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UGT8 蛋白質長 541 個胺基酸,屬於 UDP-glycosyltransferase family。序列註解標示第 1–20 位為 Signal,並在第 472–492 位標示一段螺旋型跨膜區域;來源未提供其他功能區域的詳細描述。

訊號胜肽1–20 aa
跨膜區Helical472–492 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q16880…

AlphaFold · Q16880

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane;Endoplasmic reticulum

UGT8 被註記為膜蛋白及單次跨膜蛋白,並定位於內質網。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CGTUGT8
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UGT8 催化 galactose 轉移至 ceramide,這是 galactocerebroside 生合成中的關鍵酵素步驟。Galactocerebroside 是中樞與周邊神經系統髓鞘膜中豐富的 sphingolipid。依序列相似性資料,UGT8 也可將帶羥基或不帶羥基脂肪酸的 ceramide 與 diglycerides 進行 galactosylation。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the transfer of galactose to ceramide, a key enzymatic step in the biosynthesis of galactocerebrosides, which are abundant sphingolipids of the myelin membrane of the central nervous system and peripheral nervous system. Galactosylates both hydroxy- and non-hydroxy fatty acid-containing ceramides and diglycerides (By similarity)

PMID 9125199 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性an N-acylsphing-4-enine + UDP-alpha-D-galactose = a beta-D-galactosyl-(1<->1')-N-acylsphing-4-enine + UDP + H(+)推論支持
證據與來源

an N-acylsphing-4-enine + UDP-alpha-D-galactose = a beta-D-galactosyl-(1<->1')-N-acylsphing-4-enine + UDP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性an N-acyl-sphingoid base + UDP-alpha-D-galactose = a beta-D-Gal-(1<->1')-ceramide + UDP + H(+)含實驗來源
證據與來源

an N-acyl-sphingoid base + UDP-alpha-D-galactose = a beta-D-Gal-(1<->1')-ceramide + UDP + H(+)

PMID 9125199 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性N-(2-hydroxy-hexanoyl)-sphing-4-enine + UDP-alpha-D-galactose = N-(2-hydroxy-hexanoyl)-beta-D-galactosyl-sphing-4-enine + UDP + H(+)推論支持
證據與來源

N-(2-hydroxy-hexanoyl)-sphing-4-enine + UDP-alpha-D-galactose = N-(2-hydroxy-hexanoyl)-beta-D-galactosyl-sphing-4-enine + UDP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性N-(2-hydroxy-hexanoyl)-sphinganine + UDP-alpha-D-galactose = N-(2-hydroxyhexanoyl)-beta-D-galactosylsphinganine + UDP + H(+)推論支持
證據與來源

N-(2-hydroxy-hexanoyl)-sphinganine + UDP-alpha-D-galactose = N-(2-hydroxyhexanoyl)-beta-D-galactosylsphinganine + UDP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UGT8 的功能註記涵蓋 sphingolipid metabolism,並包括 galactosylceramide biosynthesis,顯示其參與 sphingolipid 代謝及 galactosylceramide 的生合成。資料庫紀錄
證據與來源

Sphingolipid metabolism; galactosylceramide biosynthesis

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位UGT8 被註記為膜蛋白,具有單次跨膜特性,並定位於內質網;此項定位資料未描述特定條件下的變化。推論支持
證據與來源

Membrane / Single-pass membrane protein; Endoplasmic reticulum

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000310836 · 3,733 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGAGCCCTCCTTAGCCAACACGCTAACTCCGAAGCCTC40
41CCTTACGCCCCCGAACCACCGAAGGCGGCGACACCTGATT80
81CAGCGCACAAACACAGGTCCCTTCTGTCCCGGATACAATT120
121ACGCGGCAGACACACACTCAAACTCGCGCGGGGCAGCCAA160
161GAGACGAGCTATGAAGTCTTACACTCCATATTTCATTCTC200
201CTGTGGAGTGCTGTTGGGATAGCGAAGGCTGCCAAAATCA240
241TCATCGTGCCGCCAATTATGTTTGAAAGCCATATGTACAT280
281TTTCAAGACGCTAGCCTCAGCCTTGCACGAGAGAGGCCAC320
321CATACAGTGTTCCTCCTCTCTGAAGGCAGAGACATCGCCC360
361CATCTAATCATTACAGCCTCCAGCGCTACCCAGGGATCTT400
401TAACAGTACCACCTCAGATGCTTTCCTACAGTCCAAGATG440
441CGGAATATTTTCTCTGGGAGATTGACAGCAATCGAACTGT480
481TTGACATACTGGATCACTATACTAAGAACTGTGACCTGAT520
521GGTTGGCAACCATGCCCTGATCCAGGGTCTGAAGAAAGAA560
561AAATTTGACCTGCTGCTGGTGGACCCTAATGATATGTGTG600
601GATTTGTGATAGCTCATCTTTTAGGGGTTAAATATGCTGT640
641ATTTTCAACTGGCCTTTGGTATCCTGCTGAAGTGGGTGCT680
681CCTGCTCCATTAGCATACGTCCCAGAGTTTAACTCACTCC720
721TCACAGACCGCATGAACTTGCTGCAAAGGATGAAAAATAC760
761CGGTGTTTACCTCATTTCCAGATTAGGGGTCAGCTTTCTG800
801GTTCTTCCCAAATATGAAAGGATAATGCAGAAGTACAACC840
841TGCTGCCAGAGAAGTCCATGTATGATTTGGTTCATGGGTC880
881CAGCCTGTGGATGCTGTGTACTGACGTAGCACTGGAATTC920
921CCAAGACCCACTCTGCCTAATGTTGTTTATGTAGGAGGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。