演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UGT2B4UGT2B11

UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4

UGT2B4 編碼 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4,參與脂溶性物質的葡萄糖醛酸化,並可作用於雌二醇與雌三醇。

Homo sapiens4q13.3UniProt P06133
OFFICIAL SYMBOL
UGT2B4
CHROMOSOME
4
UNIPROT
P06133
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 是由 UGT2B4 編碼的蛋白質,屬於 UDP-glycosyltransferase 家族。其基本作用是催化葡萄糖醛酸與受體底物結合的反應;來源指出,這類反應可作用於脂溶性底物,也包括內源性雌激素 estradiol 與 estriol。蛋白質具有單次跨膜區段,並定位於內質網膜。

Official symbol
UGT2B4
Gene name
UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12553
UniProt
P06133
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UGT2B11

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44q13.3
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25UGT2B4pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr4:69,478,118–69,526,017
Gene span
47,900 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000305107 ★69,480,165–69,495,9056
ENST0000087689269,478,118–69,495,9326
ENST0000087689369,478,118–69,495,9086
ENST0000096890169,478,118–69,526,0177
ENST0000098533169,478,118–69,495,9327
ENST0000098533369,478,118–69,495,9327
ENST0000113975669,478,118–69,495,9326
ENST0000051258369,480,165–69,495,8615
ENST0000109420269,480,165–69,495,9325
ENST0000110925169,481,504–69,495,9326
ENST0000051011469,495,699–69,526,0142

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UGT2B4 是 UDP-glucuronosyltransferase,可催化第二相生物轉化反應:將葡萄糖醛酸接合至脂溶性底物,使產物水溶性增加,進而有利於代謝物經尿液或膽汁排出。來源指出,此酵素參與藥物、外來異物及內源性化合物的清除與解毒。

反應中,葡萄糖醛酸受體與 UDP-alpha-D-glucuronate 反應,生成 beta-D-glucuronoside、UDP 與 H⁺。UGT2B4 也催化內源性雌激素的葡萄糖醛酸化:17alpha-estradiol 接受葡萄糖醛酸後,形成 17alpha-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate);16alpha,17alpha-estriol 則形成 16alpha,17alpha-estriol 17-O-(beta-D-glucuronate)。兩種反應均伴隨 UDP 與 H⁺生成。這些反應使底物轉為葡萄糖醛酸結合物,並與排泄及清除相關。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 69495905 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UGT2B4 ENST00000305107 GRCh38 chr4:69495805-69496905 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTTTCATCTTGAAACTCTCTAAATCATACATGATGGTTGTAAGAATCAACACGTAAATGCTATATCATA
AATGAACCTTTAAAATATTATGCTAAGTAAAATAAGCCAGCCATAAAATATCACATATTGTGTGATTCCA
TGTATTTAAAAAATGTCCAGAATAGGCAAATCTATAGAGACAGAAATTCAAGTAGCAGTTGCCCAGGATA
GGACAAATGCAGAAAGAAGGGGTAGGGAGTAAAAGGCTAAAGCTTATAGGGTTTATTTTTAGGAGATAAG
AGTTCTCTAAAATTGACTCTTACGGTAGAAGCACAATTCTGTGAATATACTATGAAACATTAAATTTTAC
ACAATAATTGATAATTTGTATGATATCTGAATTATACGTCAACAAATTTACAAAAGTTTTTGAACCACAT
TTAGCTATTTTATCTTTAGTTCTGTGTCAAAGAGACTGCAGGAACATGAGCCTCTCACTGCTACTCTTAT
GCACACTATTCTGAAATATATTACATGAGTCAGGTGATGAGTCCATCCAAGATCATTGATATTAGCTGAA
TTACAGCACTTAAAAATCTAGGGCTGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCA
AGGAGGGCAGATCACAAGGTCAGGGGTTCGAGACCATCCTGCCGAATACAGTGAAACCCCATCTCTACTA
AAAATACAGAAAAATTAGCTGGGTGCGGTGGCAGGTGCCTGTCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA
GGCAGGAGAGTGGTGTGAACCTGGGAGGAGGAGCTTGCAGTGAGCTCTCAAAAAAAAAAAAATCCAAAAA
GAACATTAAACGCACTTGTGTAAACAGGTCATCTACCTTTTATTTGTCTCTTTGTCATCCACATGCTCAG
ACTGTTAATATAATGTATTTACTTTGAAGTGTAAAAGTTACATTTTAACTTCTTGACTGATTTATACTGG
ATGTCACCATGAGAAATGACAGAAAGGAGCAGCAACTGGAAAACAAGCATTGCATTGCATCAGGATGTCT
ATGAAATGGACTTCAGCTCTTCTGCTGATACAGCTGAGCTGTTACTTTAGC
UGT2B4 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UGT2B4_1 ↗4:69,495,905負股69,495,895–69,495,954

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_932KR6 · enhancer · 69497106–69497392 · regulatory

· motif · 69495703–69495716 · motif

· motif · 69497179–69497193 · motif

· motif · 69497179–69497193 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:528 aa

1 aa528 aa訊號胜肽跨膜區
依 P06133 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UGT2B4 蛋白質長 528 個胺基酸,屬於 UDP-glycosyltransferase 家族。序列註解列出位於第 1–23 個胺基酸的訊號區,以及第 493–509 個胺基酸的螺旋型跨膜區段。

訊號胜肽1–23 aa
跨膜區Helical493–509 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P06133…

AlphaFold · P06133

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum membrane

UGT2B4 是單次跨膜蛋白,定位於內質網膜。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UGT2B11UGT2B4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UGT2B4 催化第二相生物轉化反應,將葡萄糖醛酸接合至脂溶性底物以提高代謝物水溶性,促進其經尿液或膽汁排出;此作用與藥物、外來異物及內源性化合物的清除和解毒相關,也包括內源性雌激素 estradiol 與 estriol 的葡萄糖醛酸化。含實驗來源
證據與來源

UDP-glucuronosyltransferase (UGT) that catalyzes phase II biotransformation reactions in which lipophilic substrates are conjugated with glucuronic acid to increase the metabolite's water solubility, thereby facilitating excretion into either the urine or bile. Essential for the elimination and detoxification of drugs, xenobiotics and endogenous compounds. Catalyzes the glucuronidation of the endogenous estrogen hormones such as estradiol and estriol

PMID 18719240 ↗ · PMID 23288867 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = acceptor beta-D-glucuronoside + UDP + H(+)含實驗來源
證據與來源

glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = acceptor beta-D-glucuronoside + UDP + H(+)

PMID 18719240 ↗ · PMID 23288867 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性17alpha-estradiol + UDP-alpha-D-glucuronate = 17alpha-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate) + UDP + H(+)含實驗來源
證據與來源

17alpha-estradiol + UDP-alpha-D-glucuronate = 17alpha-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate) + UDP + H(+)

PMID 18719240 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性16alpha,17alpha-estriol + UDP-alpha-D-glucuronate = 16alpha,17alpha-estriol 17-O-(beta-D-glucuronate) + UDP + H(+)含實驗來源
證據與來源

16alpha,17alpha-estriol + UDP-alpha-D-glucuronate = 16alpha,17alpha-estriol 17-O-(beta-D-glucuronate) + UDP + H(+)

PMID 23288867 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位UGT2B4 的定位註記為內質網膜,並描述為單次跨膜蛋白;此項資訊指向蛋白質本身的膜定位與跨膜型態。推論支持
證據與來源

Endoplasmic reticulum membrane / Single-pass membrane protein

PMID 8333863 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000305107 · 2,100 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAAAGGAGCAGCAACTGGAAAACAAGCATTGCATTGCAT40
41CAGGATGTCTATGAAATGGACTTCAGCTCTTCTGCTGATA80
81CAGCTGAGCTGTTACTTTAGCTCTGGGAGTTGTGGAAAGG120
121TGCTGGTGTGGCCCACAGAATTCAGCCACTGGATGAATAT160
161AAAGACAATCCTGGATGAACTTGTCCAGAGAGGTCATGAG200
201GTGACTGTATTGGCATCTTCAGCTTCCATTTCTTTCGATC240
241CCAACAGCCCATCTACTCTTAAATTTGAAGTTTATCCTGT280
281ATCTTTAACTAAAACTGAGTTTGAGGATATTATCAAGCAG320
321CTGGTTAAGAGATGGGCAGAACTTCCAAAAGACACATTTT360
361GGTCATATTTTTCACAAGTACAAGAAATCATGTGGACATT400
401TAATGACATACTTAGAAAGTTCTGTAAGGATATAGTTTCA440
441AATAAGAAACTTATGAAGAAACTACAGGAGTCAAGATTTG480
481ATGTTGTTCTTGCAGATGCTGTTTTCCCCTTTGGTGAGCT520
521GCTGGCCGAGTTACTTAAAATACCCTTTGTCTACAGCCTC560
561CGCTTCTCTCCTGGCTACGCAATTGAAAAGCATAGTGGAG600
601GACTTCTGTTCCCTCCTTCCTATGTGCCTGTTGTTATGTC640
641AGAACTAAGTGACCAAATGACTTTCATAGAGAGGGTAAAA680
681AATATGATCTATGTGCTTTATTTTGAATTTTGGTTCCAAA720
721TATTTGACATGAAGAAGTGGGATCAGTTCTACAGTGAAGT760
761TCTAGGAAGACCCACTACGTTATCTGAGACAATGGCAAAA800
801GCTGACATATGGCTTATTCGAAACTACTGGGATTTTCAAT840
841TTCCTCACCCACTCTTACCAAATGTTGAGTTCGTTGGAGG880
881ACTCCACTGCAAACCTGCCAAACCCCTACCGAAGGAAATG920
921GAAGAGTTTGTCCAGAGCTCTGGAGAAAATGGTGTTGTGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。