基因總覽
UGT2B28(UDP glucuronosyltransferase family 2 member B28)是人類的蛋白質編碼基因,產物屬於 UDP-glycosyltransferase family。現有資料將其描述為參與第二相生物轉化的 UDP-glucuronosyltransferase,能處理脂溶性受質;不過,另一筆功能註記明確指出其缺乏 UDP-glucuronosyltransferase 活性,因此對其功能的描述須保留這項來源間差異。蛋白質序列長 529 個胺基酸,含有 N 端訊號區段與靠近 C 端的跨膜螺旋。這些資訊界定了其家族歸屬、蛋白質性質與序列特徵;具體受質及催化反應則見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000335568 ★ | 69,280,475–69,295,050 | 6 |
| ENST00000511240 | 69,280,475–69,295,050 | 4 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
一筆功能註記描述,UGT2B28 可催化第二相生物轉化:將葡萄醣醛酸接合至脂溶性受質,使代謝物水溶性增加,進而有助於其經尿液或膽汁排出。該來源並將這類反應與藥物、外源性物質及內源性化合物的清除和解毒相連結。
列出的內源性受質包括類固醇激素,例如雄烷類的 androsterone 與 3alpha-androstanediol,以及雌激素 estradiol 和 estrone。來源也記載其可催化膽酸受質的葡萄醣醛酸化;膽酸被描述為促進膳食脂質吸收的天然清潔劑。此外,該酵素對酚類化合物 eugenol 也有葡萄醣醛酸化活性。
反應式以一般受質表示:葡萄醣醛酸受體與 UDP-alpha-D-glucuronate 反應,生成受體 beta-D-glucuronoside、UDP 與 H(+),概括了葡萄醣醛酸基的轉移。然而,另一筆來源註記指出 UGT2B28 缺乏 UDP-glucuronosyltransferase 活性;現有資料未解釋這項說法與受質反應描述之間的差異。因此,其催化能力及所列功能應依來源各自的敘述理解,不宜將兩者合併成一致而確定的結論。
Promoter 與基因調控
>UGT2B28 ENST00000335568 GRCh38 chr4:69279475-69280575 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACCCTCATACATTGTTGGTGAGAATAGAAAATTATTCACCCACTCTGAAAAAGTCTAGCAATTCCTCAAA AGATTACACTTACATTTACCACATAATTCAGTAATTGCCTTTCTAGGCATATCCCCAAGAAAAATAAAAA CATGTCCACAGAAATCATGCACATCAATGTTAAACAATGCTATTCATAATGACCAAAAGTGGAAGTAAAT CAGTATCCATCAACTATTAAATGAATAAATAAATTGTGTTTATAAATAGCATCTGATAACTATTTGGCAA TAAAAATGAAGTCCTTATTTACACTATTCTATGGATGGTCCTTTAAAAACATTAAACTAAGTAAAGGAAG CCAGCCACAAAAGACCACATATTATATCGTTCCATTTACTTTTAGAAAGAGCCTGAATAGGTGTATTTCT AGAGGCAGAAATTAGATTACTGGTTGCCCAGTGCAGGGCGGGTGCAGAAATTTGGTGGGGAGATGAGAGC TAATACACAGGAGTTTTTTGTTTTTTTAGATAAAACTGATTGTTATGTTGGATGCACAAGTCTGTGAATT TACAAGGAAATACTTAATTTTAAATACTAATTGATGAATCATATGGTATTTGAATTATACTTCAACAAAG TTTTACAAGATATTCCTTGAACCACGATATTCAAAAACGCTATTTGCATTGTACGATCACTTCATCTCTT ACTCTGTGTCAAGGGCCCTGCAGGACTCTCTCACTTGCCACTATTCTTGACACTATTATAAAATAGGTTA CATAAAACAGGGTACTTGCAAGGTCATTAATCTTAGGTGGATGACAGCGAATATAAACATAAAAGAAACA TCAAACATCCTTGAGTAAATATGAAGTAATCAAACTTTGTCTCCTTGTCATCCATGTACTCAGGATGCTC CTATAATATATTTACTTTGGATTGAAGGAGTTATGTTTTAACTTGATTGATTTATCTCTGTATATAAGTA TGAGAAAGAAACAGTGACTTGAAAAGAATGATTGCATTGCACCAGGATGGCTCTGAAGTGGACTTCAGTT CTTCTGCTGATACATCTCGGTTGTTACTTTAGCTCTGGGAGTTGTGGAAAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UGT2B28_1 ↗ | 4:69,280,475 | 正股 | 69,280,426–69,280,485 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:529 aa
UGT2B28 蛋白質長 529 個胺基酸,屬於 UDP-glycosyltransferase family。序列註解標示第 1–24 位為訊號區段,第 495–517 位為螺旋型跨膜區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 UGT2B28 標示於內質網膜,並註明其為單次跨膜蛋白;另列出細胞質的核周區域。 來源未說明這些位置是否代表不同條件下的動態變化。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UGT2B28 被描述為可進行第二相生物轉化,將葡萄醣醛酸接合至脂溶性受質,提高代謝物水溶性並促進其由尿液或膽汁排出。來源稱此作用有助於藥物、外源性物質與內源性化合物的清除和解毒,並列出雄烷類與雌激素、膽酸及酚類化合物 eugenol 為可被葡萄醣醛酸化的受質。 | 含實驗來源 | 證據與來源UDP-glucuronosyltransferase (UGT) that catalyzes phase II biotransformation reactions in which lipophilic substrates are conjugated with glucuronic acid to increase the metabolite's water solubility, thereby facilitating excretion into either the urine or bile. Essential for the elimination and detoxification of drugs, xenobiotics and endogenous compounds. Catalyzes the glucuronidation of endogenous steroid hormones such as androgens (androsterone, 3alpha-androstanediol) and estrogens (estradiol, estrone). Catalyzes the glucuronidation of bile acid substrates, which are natural detergents for dietary lipids absorption. Displays glucuronidation activity toward the phenolic compounds eugenol PMID 11300766 ↗ |
| 功能 | 來源註記 UGT2B28 缺乏 UDP-glucuronosyltransferase(UGT)活性。 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = acceptor beta-D-glucuronoside + UDP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = acceptor beta-D-glucuronoside + UDP + H(+) PMID 11300766 ↗ |
| 細胞定位 | 資料將 UGT2B28 標示為內質網膜上的單次跨膜蛋白,並列出細胞質的核周區域。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane / Single-pass membrane protein; Cytoplasm, perinuclear region PMID 11300766 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAAAAGAATGATTGCATTGCACCAGGATGGCTCTGAAGTG40GACTTCAGTTCTTCTGCTGATACATCTCGGTTGTTACTTT80AGCTCTGGGAGTTGTGGAAAGGTGCTGGTGTGGACCGGTG120AATACAGCCATTGGATGAATATGAAGACAATCCTGAAAGA160GCTTGTTCAGAGAGGTCATGAGGTGACTGTACTGGCATCT200TCAGCTTCCATTCTTTTTGATCCCAATGACGCATTCACTC240TTAAACTCGAAGTTTATCCTACATCTTTAACTAAAACTGA280ATTTGAGAATATCATCATGCAACAGGTTAAGAGATGGTCA320GACATTCAAAAAGATAGCTTTTGGTTATATTTTTCACAAG360AACAAGAAATCCTGTGGGAATTTCATGACATATTTAGAAA400CTTCTGTAAAGATGTAGTTTCAAATAAGAAAGTTATGAAA440AAACTACAAGAGTCAAGATTTGACATCATTTTTGCAGATG480CTTTTTTTCCTTGTGGTGAGCTGCTGGCTGCGCTACTTAA520CATACCGTTTGTGTACAGTCTCTGCTTCACTCCTGGCTAC560ACAATTGAAAGGCACAGTGGAGGACTGATTTTCCCTCCTT600CCTACATACCTGTTGTTATGTCAAAATTAAGTGATCAAAT640GACTTTCATGGAGAGGGTAAAAAACATGATCTATGTGCTT680TATTTTGACTTTTGGTTCCAAATGTGTGATATGAAGAAGT720GGGATCAGTTTTACAGTGAAGTTTTAGGAAGACCCACTAC760CTTATTTGAGACAATGGGGAAAGCTGACATATGGCTTATG800CGAAACTCCTGGAGTTTTCAATTTCCTCATCCATTCTTAC840CAAACATTGATTTTGTTGGAGGACTCCACTGCAAACCTGC880CAAACCCCTACCTAAGGAAATGGAGGAATTTGTACAGAGC920TCTGGTGAAAATGGTGTTGTGGTGTTTTCTCTGGGGTCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。