基因總覽
UDP glucuronosyltransferase family 2 member B15 是由蛋白質編碼基因 UGT2B15 產生的酵素,屬於 UDP-glycosyltransferase family。其主要角色是催化 glucuronic acid 與受體分子的接合,作用對象包括內源性化合物與外來物質。蛋白質長 530 個胺基酸,具有 N 端訊號區及靠近 C 端的跨膜區;這些序列特徵與其膜相關性質相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000338206 ★ | 68,646,597–68,670,652 | 6 |
| ENST00000871508 | 68,646,590–68,670,684 | 6 |
| ENST00000962480 | 68,646,590–68,670,665 | 5 |
| ENST00000998100 | 68,646,590–68,670,665 | 6 |
| ENST00000998101 | 68,646,590–68,670,665 | 4 |
| ENST00000998102 | 68,646,590–68,670,665 | 5 |
| ENST00001104024 | 68,646,590–68,670,665 | 5 |
| ENST00001137964 | 68,646,590–68,670,665 | 6 |
| ENST00001129693 | 68,652,847–68,670,665 | 5 |
| ENST00001107303 | 68,652,849–68,670,665 | 4 |
| ENST00001107304 | 68,654,563–68,670,665 | 5 |
| ENST00001107305 | 68,659,965–68,670,665 | 3 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UGT2B15 催化第二相生物轉化反應,將 glucuronic acid 接合至親脂性受質,形成葡萄醛酸化產物。此反應可提高代謝物的水溶性,進而促進其經尿液或膽汁排出;來源並指出,此酵素對藥物、外來物質及內源性化合物的清除與解毒具有重要作用。
其受質包含多種內源性類固醇激素,例如雄性激素 testosterone、androsterone,以及雌性激素 estradiol、epiestradiol、estriol 和 catechol estrogens。具體反應例子包括將 glucuronic acid 接合至 17alpha-estradiol 的 3 位氧原子、16alpha,17alpha-estriol 的 3 位氧原子,以及 5alpha-dihydrotestosterone 的 17 位氧原子;這些反應均伴隨 UDP 及 H(+) 生成。
UGT2B15 也可葡萄醛酸化若干外源性受質,涵蓋 phenolic compounds(如 eugenol、4-nitrophenol、4-hydroxybiphenyl)與 phenylpropanoids(如 naringenin、coumarins)。此外,來源依相似性指出,此酵素可作用於單萜醇 borneol、menthol 和 isomenthol;這些天然化合物可見於精油。對這類受質的描述屬於相似性推論,不能視為與其他已列反應相同程度的直接證據。
Promoter 與基因調控
>UGT2B15 ENST00000338206 GRCh38 chr4:68670552-68671652 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGCCTTTCTGCTACTTCCTCTACCCCTGTATTTTGCTTGGCTTGGTTCTCTAATTTGACTCAGCTTCACA TAAAGTCAGGAACTTCTCCTGCAAACAGAACTTCAGCTTCTCCAGTGGGGATGTGTATTCTGGAGAGGGG GATCACCCTTTCCCACTTCCATTGTTGGGGCACTCACAGTGTTTGGGATGTCTCCCAGGTCCTGCAGGAG CAGTACTCTTCCTGCAGAGGGTGTGTGGATCCTCTCAGAATTGCTGGTCTGTTCTTGCAGTTGATCTGCA GCTAAAATTCACAATGCAAGCCTCTGCATGCTGCTCTGTCTGGAGCTGCAATCTAGTCCTGCATCCCATC TGCCATGATCACTGGAAAACCCTCATTTATTTTTTAAAGGGTCCAGAAAATGCTAATCTATAGAGATAGA AATTAGATTAGTGGTTGCCTAGGGTAGGATGGATGCAAAATTTCAGAGTGGGGGGTTAGAGGCTATTGTA TAGAATCTTTTGGAGATAATACTGATTATTGTAGTGGATGTAAAATTCTGTGAATATACTAGGAAACATT GAACTGTACACACTAATTGGTGAGTCATATGGTATATGAATTATGTGTCAACAAAGTTTTAGAAGACATT ACTTGCACCACGATATTAAAAAATGCCGTTTGAGTTGTATAATTACTTCTTCTCTCTATGTCAAGGGCAC CGAACAGGCAGGAGCCTCTCACTTGCCACTGTTCTTAACAGTATTATAAAATAATTACATAAGACAGGTT ACTTACATATTCTAGGTCATAAAAATTATTGCTTGACTAGAGTAATTGTAAACATAAAAGAACACCAAAC ACACTAAAATAAATATGAGGTCATCAATCTTTTGTTGGTCTCCTTGGCATGCACCTATTCAGACTGTTAG TATTATGTATTTACTTCAAATTTTAGCAGTTATATTTTAACTTGATTGATTTTTCCTCAGATATAAGTAT GAGAAATGACAGAAAGAAACAACAACTGGAAAAGAAGCATTGCATAAGACCAGGATGTCTCTGAAATGGA CGTCAGTCTTTCTGCTGATACAGCTCAGTTGTTACTTTAGCTCTGGAAGCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UGT2B15_1 ↗ | 4:68,670,652 | 負股 | 68,670,642–68,670,701 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR4_5L653C · CTCF_binding_site · 68672084–68672105 · regulatory
ENSR4_842HWJ · open_chromatin_region · 68673284–68673440 · regulatory
· motif · 68670577–68670591 · motif
· motif · 68670577–68670591 · motif
· motif · 68670787–68670800 · motif
· motif · 68670787–68670800 · motif
· motif · 68672086–68672102 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:530 aa
UDP glucuronosyltransferase family 2 member B15 長 530 個胺基酸,屬於 UDP-glycosyltransferase family。序列註解包含位於第 1–23 個胺基酸的訊號區,以及第 495–515 個胺基酸的螺旋型跨膜區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UGT2B15 位於內質網膜,為單次跨膜蛋白質。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UGT2B15 催化第二相生物轉化,將 glucuronic acid 接合至親脂性受質以增加水溶性,促進經尿液或膽汁排出;作用於藥物、外來物質、類固醇激素及多類化合物。單萜醇的作用描述依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源UDP-glucuronosyltransferase (UGT) that catalyzes phase II biotransformation reactions in which lipophilic substrates are conjugated with glucuronic acid to increase the metabolite's water solubility, thereby facilitating excretion into either the urine or bile. Essential for the elimination and detoxification of drugs, xenobiotics and endogenous compounds. Catalyzes the glucuronidation of endogenous steroid hormones such as androgens (testosterone, androsterone) and estrogens (estradiol, epiestradiol, estriol, catechol estrogens). Displays glucuronidation activity toward several classes of xenobiotic substrates, including phenolic compounds (eugenol, 4-nitrophenol, 4-hydroxybiphenyl) and phenylpropanoids (naringenin, coumarins). Catalyzes the glucuronidation of monoterpenoid alcohols such as borneol, menthol and isomenthol, a class of natural compounds used in essential oils (By similarity) PMID 16595710 ↗ · PMID 18719240 ↗ · PMID 23288867 ↗ · PMID 7835232 ↗ · PMID 9295060 ↗ |
| 分子活性 | glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = acceptor beta-D-glucuronoside + UDP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = acceptor beta-D-glucuronoside + UDP + H(+) PMID 16595710 ↗ · PMID 18719240 ↗ · PMID 23288867 ↗ · PMID 7835232 ↗ · PMID 9295060 ↗ |
| 分子活性 | 17alpha-estradiol + UDP-alpha-D-glucuronate = 17alpha-estradiol 3-O-(beta-D-glucuronate) + UDP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源17alpha-estradiol + UDP-alpha-D-glucuronate = 17alpha-estradiol 3-O-(beta-D-glucuronate) + UDP + H(+) PMID 18719240 ↗ · PMID 23288867 ↗ |
| 分子活性 | 16alpha,17alpha-estriol + UDP-alpha-D-glucuronate = 16alpha,17alpha-estriol 3-O-(beta-D-glucuronate) + UDP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源16alpha,17alpha-estriol + UDP-alpha-D-glucuronate = 16alpha,17alpha-estriol 3-O-(beta-D-glucuronate) + UDP + H(+) PMID 23288867 ↗ |
| 分子活性 | 17beta-hydroxy-5alpha-androstan-3-one + UDP-alpha-D-glucuronate = 5alpha-dihydrotestosterone 17-O-(beta-D-glucuronate) + UDP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源17beta-hydroxy-5alpha-androstan-3-one + UDP-alpha-D-glucuronate = 5alpha-dihydrotestosterone 17-O-(beta-D-glucuronate) + UDP + H(+) PMID 16595710 ↗ |
| 細胞定位 | UGT2B15 被註記為位於內質網膜的單次跨膜蛋白質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AACAACTGGAAAAGAAGCATTGCATAAGACCAGGATGTCT40CTGAAATGGACGTCAGTCTTTCTGCTGATACAGCTCAGTT80GTTACTTTAGCTCTGGAAGCTGTGGAAAGGTGCTAGTGTG120GCCCACAGAATACAGCCATTGGATAAATATGAAGACAATC160CTGGAAGAGCTTGTTCAGAGGGGTCATGAGGTGACTGTGT200TGACATCTTCGGCTTCTACTCTTGTCAATGCCAGTAAATC240ATCTGCTATTAAATTAGAAGTTTATCCTACATCTTTAACT280AAAAATTATTTGGAAGATTCTCTTCTGAAAATTCTCGATA320GATGGATATATGGTGTTTCAAAAAATACATTTTGGTCATA360TTTTTCACAATTACAAGAATTGTGTTGGGAATATTATGAC400TACAGTAACAAGCTCTGTAAAGATGCAGTTTTGAATAAGA440AACTTATGATGAAACTACAAGAGTCAAAGTTTGATGTCAT480TCTGGCAGATGCCCTTAATCCCTGTGGTGAGCTACTGGCT520GAACTATTTAACATACCCTTTCTGTACAGTCTTCGATTCT560CTGTTGGCTACACATTTGAGAAGAATGGTGGAGGATTTCT600GTTCCCTCCTTCCTATGTACCTGTTGTTATGTCAGAATTA640AGTGATCAAATGATTTTCATGGAGAGGATAAAAAATATGA680TACATATGCTTTATTTTGACTTTTGGTTTCAAATTTATGA720TCTGAAGAAGTGGGACCAGTTTTATAGTGAAGTTCTAGGA760AGACCCACTACATTATTTGAGACAATGGGGAAAGCTGAAA800TGTGGCTCATTCGAACCTATTGGGATTTTGAATTTCCTCG840CCCATTCTTACCAAATGTTGATTTTGTTGGAGGACTTCAC880TGTAAACCAGCCAAACCCCTGCCTAAGGAAATGGAAGAGT920TTGTGCAGAGCTCTGGAGAAAATGGTATTGTGGTGTTTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。