基因總覽
UDP glucuronosyltransferase family 2 member B11 是由 UGT2B11 編碼的蛋白質,屬於 UDP-glycosyltransferase 家族。它是 UDP-glucuronosyltransferase 家族成員之一,參與脂溶性底物的葡萄糖醛酸接合作用。與其他 UGT2B 家族成員相比,UGT2B11 的底物範圍較窄,催化活性也較低;其生理角色目前仍不明確。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000446444 ★ | 69,199,951–69,214,748 | 6 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UGT2B11 催化第二相生物轉化反應,將葡萄糖醛酸接合到脂溶性底物上,使代謝物的水溶性提高,因而有助於代謝物經尿液或膽汁排出。反應中,受體底物與 UDP-alpha-D-glucuronate 反應,生成 beta-D-glucuronoside、UDP 與 H(+);若受體是醇類,產物則為 beta-D-glucuronoside。
此酵素的底物選擇性狹窄,且相較其他 UGT2B 次家族成員,催化活性很低。它較偏好催化兒茶酚雌激素的葡萄糖醛酸化,也能接合雌三醇與 3alpha-hydroxysteroids;但這些底物上的活性比 UGT2B7 低 30 至 90 倍。
UGT2B11 對 testosterone、hyodeoxycholic acid 或多數藥物沒有活性。由於可作用的底物有限,且催化效率低,其生理功能仍未明確。現有資料因此支持它能處理特定類型的脂溶性底物,但尚不足以確定這些反應在整體生理中的角色。
Promoter 與基因調控
>UGT2B11 ENST00000446444 GRCh38 chr4:69214648-69215748 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTCATACATTGTTGGTGAGAATAGAAAATTATTCACTCACTCTGAAAAAGTCTAGCAATTCCTCAAAAGG TTATATTTACATTTACCACATAATTCAGTAATTGCCTTTCTAGGCATATCCCCAAGAAAAATAAAAACAT GTCCACAGAATTCATGCACATCAATGTTAATCAATGCTATTCATAATGGCCAAAAGTGGAAGAAAATCAA TATCTATCAACTTATAAATGAATAAATAAATTGTGTTTATAAATAGCATCTGATACAATTTGGCAATAAA AATGAAGTCCTTATTTACACTATTCTACGGATGGTCCTTTAAAAACATTAAACTAAATAAAAGAAGCCAG CCACAAAAGACCACATACTATATTGTTCCGTTTACTTTTAAAAAGATCCTGAATAGGTGTGTTTCTAGAG GCAGAAATTAGATTACTGGTTGCCTAGTGCAGGGTGGATGCAGAAATTTGGTGGGGAGATGAGAACTAAT ACACAGGAGTTTTTTGTTTTTTTAGATAAAACTGATTGTTACGTTGGATGCACAAGTCTGTGAATTTACT AGGAAATACTTAATTTTAAATACTAATTGATGAATCATATGGTATTTGAATTATACTCCAACAAAGATTT ACAAGATATTCATTGAACCACGATATTCAAAAATGCTGTTTGCATTGTACAATCATTTCATCTCTTATTC TGTGTCAAGGGCTCTGCAGGACTCTCTCACTTGCCACTGTTCTTGACACTATTATAAAGTAGGTTACATA AAACAGGGTACTTGCAAGGTCATTAATCTTAGGTGGATGACAGTGAATATAAACATAAAAGAAACATAAA ACATCCTTGAGTAAATATGAAGTAATCGAACTTTGTTTGTCTCCTTGCCATCCATGTACTCAGGATGCTC CTATAATATATTTACTTTGGATTGGAGGAGTTATATTTTAACTTGATTGATTTATCTCTGTATATAAGTA TGAGAAAGAAACAGTGACTGGAAAAGAATGATCGCATTGCACCAGGATGACTCTGAAATGGACTTCAGTT CTTCTGCTGATACATCTCAGTTGTTACTTTAGCTCTGGGAGTTGTGGAAAA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UGT2B11_1 ↗ | 4:69,214,747 | 負股 | 69,214,737–69,214,796 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 69212314–69212323 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:529 aa
UGT2B11 蛋白質長 529 個胺基酸,屬於 UDP-glycosyltransferase 家族。序列註解標示其第 1 至 21 位為訊號區段,另有一段螺旋型跨膜區,位於第 493 至 513 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UGT2B11 被註記為單次跨膜蛋白,定位於微粒體膜與內質網膜;資料未指出其定位會隨條件或異構型而改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Microsome membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- ASPHQ12797-6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMBIM6P55061 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UGT2B11 催化第二相生物轉化,將葡萄糖醛酸接合至脂溶性底物,使代謝物水溶性提高,便於經尿液或膽汁排出。其底物選擇範圍狹窄,且相較其他 UGT2B 次家族成員催化活性很低;較偏好接合兒茶酚雌激素,也能作用於雌三醇與 3alpha-hydroxysteroids,但活性比 UGT2B7 低 30 至 90 倍。對 testosterone、hyodeoxycholic acid 及多數藥物沒有活性;其生理角色仍因底物有限與催化效率低而不明。 | 含實驗來源 | 證據與來源UDP-glucuronosyltransferase (UGT) that catalyzes phase II biotransformation reactions in which lipophilic substrates are conjugated with glucuronic acid to increase the metabolite's water solubility, thereby facilitating excretion into either the urine or bile. Exhibits narrow substrate specificity and very low catalytic activity compared to other UGT2B subfamily members. Preferentially glucuronidates catechol estrogens. Also conjugates estriol and 3alpha-hydroxysteroids with activities 30-90 fold lower than UGT2B7. Shows no activity toward testosterone, hyodeoxycholic acid or most drugs. Physiological role remains unclear due to limited substrate range and low catalytic efficiency PMID 8333863 ↗ · PMID 9169006 ↗ · PMID 9675083 ↗ |
| 分子活性 | glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = acceptor beta-D-glucuronoside + UDP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = acceptor beta-D-glucuronoside + UDP + H(+) PMID 8333863 ↗ · PMID 9169006 ↗ |
| 分子活性 | alcohol glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = a beta-D-glucuronoside + UDP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源alcohol glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = a beta-D-glucuronoside + UDP + H(+) PMID 9169006 ↗ |
| 細胞定位 | UGT2B11 被註記為單次跨膜蛋白,定位於微粒體膜及內質網膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Microsome membrane / Single-pass membrane protein; Endoplasmic reticulum membrane / Single-pass membrane protein PMID 9675083 ↗ · PMID 9169006 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAAAAGAATGATCGCATTGCACCAGGATGACTCTGAAATG40GACTTCAGTTCTTCTGCTGATACATCTCAGTTGTTACTTT80AGCTCTGGGAGTTGTGGAAAAGTGCTGGTGTGGGCCGCAG120AATACAGCCATTGGATGAATATGAAGACAATCCTGAAAGA160GCTTGTTCAGAGAGGTCATGAGGTGACTGTACTGGCATCT200TCAGCTTCCATTCTTTTTGATCCCAATGATGCATCCACTC240TTAAATTTGAAGTTTATCCTACATCTTTAACTAAAACTGA280ATTTGAGAATATCATCATGCAACAGGTTAAGAGATGGTCA320GACATTCGAAAAGATAGCTTTTGGTTATATTTTTCACAAG360AACAAGAAATCCTGTGGGAATTATATGACATATTTAGAAA400CTTCTGTAAAGATGTAGTTTCAAATAAGAAAGTTATGAAA440AAACTACAAGAGTCAAGATTTGACATCGTTTTTGCAGATG480CTGTTTTTCCCTGTGGTGAGCTGCTGGCTGCGCTACTTAA520CATACGGTTTGTGTACAGTCTCCGCTTTACTCCTGGCTAC560ACAATTGAAAGGCACAGTGGAGGACTGATTTTCCCTCCTT600CCTACATACCTATTGTTATGTCAAAATTAAGTGATCAAAT640GACTTTCATGGAGAGGGTAAAAAATATGATCTATGTGCTT680TATTTTGACTTTTGGTTCCAAATGTCTGATATGAAGAAGT720GGGATCAGTTTTACAGTGAAGTTTTAGGAAGACCCACTAC760CTTATTTGAGACAATGGGAAAAGCTGACATATGGCTTATG800CGAAACTCCTGGAGTTTTCAATTTCCTCATCCATTCTTAC840CAAACGTTGATTTTGTTGGAGGATTCCACTGCAAACCTGC880CAAACCCCTACCTAAGGAAATGGAGGAGTTTGTACAGAGC920TCTGGAGAAAATGGTGTTGTGGTGTTTTCTCTGGGGTCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。