基因總覽
UGT2B10(UDP glucuronosyltransferase family 2 member B10)是人類的蛋白質編碼基因,產生 UDP-glucuronosyltransferase 2B10,屬於 UDP-glycosyltransferase 家族。這類酵素參與物質的葡萄醣醛酸結合反應;UGT2B10 的已知受質範圍以含胺類化合物為特色。蛋白質序列長 528 個胺基酸,具有位於 N 端的訊號序列,以及靠近 C 端的單次跨膜螺旋,反映其膜蛋白性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000265403 ★ | 68,815,994–68,832,023 | 6 |
| ENST00000878267 | 68,815,917–68,833,559 | 6 |
| ENST00000878268 | 68,815,917–68,833,086 | 6 |
| ENST00000878271 | 68,815,917–68,832,017 | 6 |
| ENST00001091537 | 68,815,917–68,831,114 | 4 |
| ENST00001091538 | 68,815,917–68,831,114 | 6 |
| ENST00001121374 | 68,815,917–68,831,663 | 6 |
| ENST00001121375 | 68,815,917–68,831,091 | 5 |
| ENST00001141657 | 68,815,917–68,832,023 | 6 |
| ENST00000458688 | 68,815,993–68,830,943 | 6 |
| ENST00000878269 | 68,815,993–68,832,017 | 6 |
| ENST00000878270 | 68,815,993–68,832,017 | 6 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UGT2B10 催化第二階段生物轉化反應,將葡萄醣醛酸接合至脂溶性受質,使產物的水溶性提高,進而有利於經尿液或膽汁排出。此反應以 UDP-alpha-D-glucuronate 作為葡萄醣醛酸供體,生成受質的 beta-D-glucuronoside,並釋出 UDP 與 H⁺。
其作用偏重於含三級胺藥物及外來化合物的 N-葡萄醣醛酸化。已列出的受質包括菸草生物鹼、菸草特異性亞硝胺、三環抗憂鬱藥,以及含 imidazole 基團的化合物。UGT2B10 被描述為負責菸草特異性亞硝胺解毒的主要酵素之一,顯示其可參與這類化合物的代謝處理。
受質偏好並非涵蓋所有胺類:UGT2B10 對三級脂肪族胺及環狀胺的作用,明顯高於二級或一級胺。這種選擇性描述了其底物範圍的特徵;不過,資料也指出它不會使類固醇、hyodeoxycholic acid 或酚類外來化合物進行葡萄醣醛酸化。因此,不能將其功能概括為對所有脂溶性物質都具有相同作用。
Promoter 與基因調控
>UGT2B10 ENST00000265403 GRCh38 chr4:68814994-68816094 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGGCATATACCCAAGAAAAATAAAAACATGTCTACAGAAAGCATGTACATCAATGTTAATCAACGCTATT CATAATGGCCAAAAGTGGAAGAAAAACAATGTCCGTACACTGATAAATGAATGAATAAATAAATTGTGTT TATAAGTAGCATCTGATACTATTTGGCAATAAAAATGTGAACGCTATTTATAATGGCCAAAAGTGGAAGA AAATCAATGTCCATCCACTGAAAAATGAATAAATAATTTCTGCTTATAAGTAGCATCTGATAAAAAGCAA TAAAAATGAAATCCTTATATACACTATTCTATGGATGGTCCTTTAAAAACATTAAACTAAATAAAAGTAG CCAGCCACAAAAGACCACATATTATATAGTTTCATTTATTTTTAAAAAGATCCTGAATAGGCATATTTGT AGAGGCAGAAATTAGATTACTGGTTGCCCAGTACAGTGTGGGTGCAGAAATTCAGGTGGGGAGATGACAG TTAATATACAGGATTTTTTTTTTTTTTAGATAAAACTGATTGCTATGTTGGATGCACAAGTCTGTGAATT TACTAGGAAATATTTAATTTTAAATAATCATTCATGAATCATATGGTATGTGAATTATACTTCAACAAAG TTTTACAAAATATTCCTTGAACCAAGATATTCAAAAATTCTATTTGCATTGTATAATTACTTCATCTCTC ATTCTGTGTCAAGGGGCCTGCAGGACTCTCTCACTTGCCACTGTTCTTGACACTATTATAAAATACATTA TATAAAACACGATATTTGCAAGGTCATTAAACTTAGGTGGATGACACCAAATATAAACATAAAAGAAACA TCAAACATCCTTGAGTAAATATGAAGTAATCGAACTTTGTCTCCTTGCCATCCATGTACTCAGGATGCTC ATATAATGTATTTACTTTGAATTGAAGGAGTTATGTTTTAACTTGATTGATTTATCTCTGTATATAAGTA TGAGAAAGAAACAGTGACTGGAAAAGAATTATCACATTGCACAAGGATGGCTCTGAAATGGACTACAGTT CTGCTGATACAACTCAGTTTTTACTTTAGCTCTGGGAGTTGTGGAAAGGTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UGT2B10_1 ↗ | 4:68,815,995 | 正股 | 68,815,946–68,816,005 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 68815862–68815877 · motif
· motif · 68815863–68815877 · motif
· motif · 68818424–68818433 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:528 aa
UDP-glucuronosyltransferase 2B10 長 528 個胺基酸,屬於 UDP-glycosyltransferase 家族。序列註解標示第 1–23 位為訊號序列;第 492–512 位則為螺旋型跨膜區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UGT2B10 被註記為位於微粒體膜及內質網膜的單次跨膜蛋白。 資料未指出不同條件或異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Microsome membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
UGT2B10 可形成同源二聚體;資料未提供其他結合夥伴或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UGT2B10 催化第二階段生物轉化,將葡萄醣醛酸接合至脂溶性受質,以提高代謝物水溶性並促進其由尿液或膽汁排出。它主要使含三級胺的藥物與外來化合物進行 N-葡萄醣醛酸化,受質包括菸草生物鹼、菸草特異性亞硝胺、三環抗憂鬱藥及含 imidazole 基團的化合物,並是菸草特異性亞硝胺解毒的主要酵素。它偏好三級脂肪族胺和環狀胺,對二級或一級胺作用較弱;不會使類固醇、hyodeoxycholic acid 或酚類外來化合物葡萄醣醛酸化。 | 含實驗來源 | 證據與來源UDP-glucuronosyltransferase (UGT) that catalyzes phase II biotransformation reactions in which lipophilic substrates are conjugated with glucuronic acid to increase the metabolite's water solubility, thereby facilitating excretion into either the urine or bile. Specialized in N-glucuronidation of tertiary amine-containing drugs and xenobiotics. Catalyzes N-glucuronidation of tobacco alkaloids, tobacco-specific nitrosamines, tricyclic antidepressants and compounds containing imidazole groups. Major enzyme responsible for detoxification of tobacco-specific nitrosamines. Shows strong preference for tertiary aliphatic and cyclic amines over secondary or primary amines. Does not glucuronidate steroids, hyodeoxycholic acid, or phenolic xenobiotics PMID 17576790 ↗ · PMID 18238858 ↗ · PMID 18300939 ↗ · PMID 20133892 ↗ · PMID 28803208 ↗ · PMID 8333863 ↗ |
| 分子活性 | glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = acceptor beta-D-glucuronoside + UDP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源glucuronate acceptor + UDP-alpha-D-glucuronate = acceptor beta-D-glucuronoside + UDP + H(+) PMID 17576790 ↗ · PMID 17909004 ↗ · PMID 18238858 ↗ · PMID 18300939 ↗ · PMID 20133892 ↗ · PMID 28803208 ↗ |
| 交互作用 | Homodimerizes | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | UGT2B10 被註記為單次跨膜蛋白,定位於微粒體膜及內質網膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Microsome membrane / Single-pass membrane protein; Endoplasmic reticulum membrane / Single-pass membrane protein PMID 18238858 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAAAAGAATTATCACATTGCACAAGGATGGCTCTGAAATG40GACTACAGTTCTGCTGATACAACTCAGTTTTTACTTTAGC80TCTGGGAGTTGTGGAAAGGTGCTGGTATGGGCCGCAGAAT120ACAGCCTTTGGATGAATATGAAGACAATCCTGAAAGAACT160TGTTCAGAGAGGTCATGAGGTGACTGTACTGGCATCTTCA200GCTTCCATTCTTTTTGATCCCAACGACTCATCCACTCTTA240AACTTGAAGTTTATCCTACATCTTTAACTAAAACTGAATT280TGAGAATATCATCATGCAATTGGTTAAGAGATTGTCAGAA320ATTCAAAAAGATACATTTTGGTTACCTTTTTCACAAGAAC360AAGAAATCCTGTGGGCAATTAATGACATAATTAGAAACTT400CTGTAAAGATGTAGTTTCAAATAAGAAACTTATGAAAAAA440CTACAAGAGTCAAGATTTGACATCGTTTTTGCAGATGCTT480ATTTACCCTGTGGTGAGCTGCTGGCTGAGCTATTTAACAT520ACCCTTTGTGTACAGTCACAGCTTCAGTCCTGGCTACTCA560TTTGAAAGGCACAGTGGAGGATTTATTTTCCCTCCTTCCT600ACGTACCTGTTGTTATGTCAAAATTAAGTGATCAAATGAC640TTTCATGGAGAGGGTAAAAAATATGCTCTATGTGCTTTAT680TTTGACTTTTGGTTCCAAATATTTAATATGAAGAAGTGGG720ATCAGTTTTACAGTGAAGTTTTAGGAAGACCCACTACATT760ATCTGAGACAATGAGGAAAGCTGACATATGGCTTATGCGA800AACTCCTGGAATTTTAAATTTCCTCATCCATTCTTACCAA840ATGTTGATTTTGTTGGAGGACTCCACTGCAAACCTGCCAA880ACCCCTACCTAAGGAAATGGAGGAGTTTGTACAGAGCTCT920GGAGAAAATGGTGTTGTGGTGTTTTCTCTGGGGTCAATGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。