基因總覽
UGT1A8 的正式名稱為 UDP glucuronosyltransferase family 1 member A8,所屬基因座包含多種 UDP-glucuronosyltransferase。此基因座具有十三個不同的替代第一外顯子,後接四個共用外顯子;其中四個替代第一外顯子被視為假基因。其餘九個 5′ 外顯子各自可與四個共用外顯子剪接,形成 N 端不同、C 端相同的九種蛋白質。每個第一外顯子編碼受質結合位點,並由各自的啟動子調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|
顯示 0/0 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UGT1A8 編碼 UDP-glucuronosyltransferase,是葡萄醣醛酸化途徑中的酵素。此途徑可將類固醇、膽紅素、荷爾蒙及藥物等小型親脂性分子轉化為水溶性代謝物,使其能被排出。這項轉化描述了該酵素參與的代謝作用及其產物性質。
此酵素對多種受質具有葡萄醣醛酸酶活性,來源列出的受質包括香豆素、酚類、蒽醌類、黃酮類及部分類鴉片物質。這些受質範圍說明 UGT1A8 相關酵素作用並不限於單一類型的小分子;來源未進一步提供各受質的反應差異或條件。
Promoter 與基因調控
>UGT1A8 EPD:UGT1A8_1 GRCh38 chr2:233616672-233617772 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依 EPDnew v006 實驗支持 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,整段擷取區間未經功能驗證 AGTGCCAAGCCATTCATGAGGGAACCATGCCCATGATCCAAACATCTCCCACCATGCTTCACCTTCAACT CTGGGGATTATATTTGACCATGATATATGGAGGGGACAAACATACAAATTATATCAAAGGCATAGCATGG CTACTGTGAAAGGAGGGTAAAAACACAAAGATGACATCACCACTGACCTCAGGGAGTGCCCAGTAGACTG AGGGAGACAAGTACATATTTTCCTGAAGGAGGGCACTGGATTGATGGCATGTTTAGAATGTGGAAGTAGA GCGGCCACAGAAAGGCAGCCCGGCAGAGTGCTCGCACAAAGACTGGGCTAGAGACTCCCCACTGCATGTG ATGTATCTGAGGAAAGTCATTAAAATAGGTGATGGTCACTTTCCATCAAGTCCCTGGTATGGTCCATGGA GGCAGGGTTGTCAATGTCATTTCGGCATTTCAGAGGCCTCTCAGGGTTTGGATATGGCAGAAGACAACCA GCAATGATTATGCATTGCAGAGATGCAGGTGAGCCCCAATTTCTTGCCAGCTGGGAAGTCGGTGCTAAGG GGCCTTGCTGTCTTTCCTTGGAACATAGGATACCAATTTCTTTCTGGACAGAGAGTATTTGGTTGGCTAA AGTTAAAATCTAAATTTTGCTTTGGGATGAATTCCAAAAATATTAGCTTTATTCAAATTTACTTTCACTT TATCTTTCTGAATCTTCAAGGTCCTAAAGCATTGCTTAGTAATTTTGTTTCTAAACTCACGTTACAGCAC TGGGCATGATCTGTCCAAGGCAGAGACTATAAGCTACTCTTATAGTACTCTTATGAGATACATACAAGTA GGTATCTCAAAAAATGATACTCATGTATTCCTGTTCTTATGAGTAAATCATTGGCAGTGAGTGTGATTTT TTTTTTTTTTATGACAGGATAAATACACGCCCTCTATTGGGGTCAGGTTTTGTGCCTGTAGTTCTTCCGC CTACTGTATCATAGCAGCTTAGAATCCCAGCTGCTGGCTCGGGCTGCAGTTCTCTCATGGCTCGCACAGG GTGGACCAGCCCCATTCCCCTATGTGTTTCTCTGCTGCTGACCTGTGGCTT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UGT1A8_1 ↗ | 2:233,617,672 | 正股 | 233,617,623–233,617,682 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
基因座與轉錄註解
UGT1A8 依 HGNC/Ensembl 分類為 complex locus constituent。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| 尚未取得轉錄本資料。 | |||
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UGT1A8 編碼葡萄醣醛酸化途徑中的 UDP-glucuronosyltransferase,可將類固醇、膽紅素、荷爾蒙及藥物等小型親脂性分子轉為可排出的水溶性代謝物。其所在複合基因座含十三個替代第一外顯子及四個共用外顯子;四個替代第一外顯子屬假基因,其餘可形成九種 N 端不同、C 端相同的蛋白質,且各第一外顯子編碼受質結合位點並受各自啟動子調控。該酵素對多類受質具有葡萄醣醛酸酶活性。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This gene encodes a UDP-glucuronosyltransferase, an enzyme of the glucuronidation pathway that transforms small lipophilic molecules, such as steroids, bilirubin, hormones, and drugs, into water-soluble, excretable metabolites. This gene is part of a complex locus that encodes several UDP-glucuronosyltransferases. The locus includes thirteen unique alternate first exons followed by four common exons. Four of the alternate first exons are considered pseudogenes. Each of the remaining nine 5' exons may be spliced to the four common exons, resulting in nine proteins with different N-termini and identical C-termini. Each first exon encodes the substrate binding site, and is regulated by its own promoter. The enzyme encoded by this gene has glucuronidase activity with many substrates including coumarins, phenols, anthraquinones, flavones, and some opioids. |
DNA 與 RNA 序列
GTGCCTGTAGTTCTTCCGCCTACTGTATCATAGCAGCTTA40GAATCCCAGCTGCTGGCTCGGGCTGCAGTTCTCTCATGGC80TCGCACAGGGTGGACCAGCCCCATTCCCCTATGTGTTTCT120CTGCTGCTGACCTGTGGCTTTGCTGAGGCAGGGAAGCTGC160TGGTAGTGCCCATGGATGGGAGTCACTGGTTCACCATGCA200GTCGGTGGTGGAGAAACTTATCCTCAGGGGGCATGAGGTG240GTTGTAGTCATGCCAGAGGTGAGTTGGCAACTGGGAAAAT280CACTGAATTGCACAGTGAAGACTTACTCAACCTCATACAC320TCTGGAGGATCTGGACCGGGAATTCATGGATTTCGCCGAT360GCTCAATGGAAAGCACAAGTACGAAGTTTGTTTTCTCTAT400TTCTGAGTTCATCCAATGGTTTTTTTAACTTATTTTTTTC440GCATTGCAGGAGTTTGTTTAATGACCGAAAATTAGTAGAA480TACTTAAAGGAGAGTTCTTTTGATGCGGTGTTTCTTGATC520CTTTTGATGCCTGTGGCTTAATTGTTGCCAAATATTTCTC560CCTCCCCTCTGTGGTCTTCGCCAGGGGAATAGCTTGCCAC600TATCTTGAAGAAGGTGCACAGTGCCCTGCTCCTCTTTCCT640ATGTCCCCAGAATTCTCTTAGGGTTCTCAGATGCCATGAC680TTTCAAGGAGAGAGTACGGAACCACATCATGCACTTGGAG720GAACATTTATTTTGCCAGTATTTTTCCAAAAATGCCCTAG760AAATAGCCTCTGAAATTCTCCAAACACCTGTCACAGCATA800TGATCTCTACAGCCACACATCAATTTGGTTGTTGCGAACA840GACTTTGTTTTGGACTATCCCAAACCCGTGATGCCCAATA880TGATCTTCATTGGTGGTATCAACTGCCATCAGGGAAAGCC920ATTGCCTATGGAATTTGAAGCCTACATTAATGCTTCTGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。