基因總覽
UGT1A10 是 complex locus constituent,所屬基因座可產生多種 UDP-glucuronosyltransferase。此基因座具有十三個不同的替代第一外顯子,後接四個共用外顯子;其中四個替代第一外顯子被視為假基因,其餘九個可分別與四個共用外顯子剪接,形成 N 端不同、C 端相同的九種蛋白質。這種基因座架構提供了蛋白質形式的多樣性;每個第一外顯子皆編碼受質結合位點,並由各自的啟動子調控。UGT1A10 的正式名稱為 UDP glucuronosyltransferase family 1 member A10,屬於 UDP-glucuronosyltransferase 家族。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00001024184 | 233,636,474–233,773,300 | 6 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UGT1A10 編碼的酵素屬於葡萄糖醛酸化途徑。此途徑可將類固醇、膽紅素、荷爾蒙及藥物等小型親脂性分子轉化為水溶性代謝物,使其可經由排泄移除。這些是來源列舉的葡萄糖醛酸化作用對象,資料未進一步說明 UGT1A10 對每一類分子的作用情形。
對 UGT1A10 編碼的酵素,來源特別指出其對 mycophenolic acid、coumarins 與 quinolines 具有葡萄糖醛酸化活性。這些具體受質補充了該酵素在葡萄糖醛酸化途徑中的作用範圍;來源未提供反應效率、組織分布或各受質間差異等細節。
UGT1A10 所在的基因座包含多種 UDP-glucuronosyltransferase 編碼形式。其可用的替代第一外顯子分別與共用外顯子剪接,產生 N 端不同而 C 端相同的蛋白質形式;第一外顯子編碼受質結合位點,且各自受啟動子調控。這些基因座層級的資訊說明不同形式如何在結構與轉錄調控上有所區別,但來源沒有進一步界定此剪接架構對 UGT1A10 酵素活性的影響。
Promoter 與基因調控
>UGT1A10 ENST00001024184 GRCh38 chr2:233635474-233636574 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCATGAGAAATCACTCACAATTGGGAGGGCAGTGCCAAGCCATTCATGAGGGATCCATGCCCATGACCCA AACACCTCCCACCATGCTTCATCTCCAACACTGGGGATTATATTTGACCATGATATATGGAGGGGACAAA CATACAAACTACGTCAAAGGCAAAGCATGGCTACTGTGAAAGAAGGGTAAAAACACAGAGATGGCATCAC CTCTGACTTCCAGGAGTCCTCAGCAGACTGAGGGAGACAAGTACATATTTTCCTGAAAGAGGTCACTGGA GTGATGGTGTGTTTAGAATATAGAAGTAGAGCAGTCACAGAGAGGCAGCCCAGCAGAGTGTTCGCACAAG GACTGGGCCAGCAACTCCCCACTGCATGCAACGTATCTGAGGAAAGTCATTAAAATAGGTGATGGTCACT TTCCATCAAGTCCCTGGTATGGTCCATGGAGGCAGGGTTGTCAATCTCATTTTGGCATTTCAGAGGCCTC TCAGGGTTTGGATATGGAAGAAGACAACCAGCAATGATTATGCATTGCAGAGATGCAGGTGAGCCCCAGT TTCTTGCCAGTTGGGAGGTCAGTGCTAAGAGCCTTGCTGTCTTTCCCTGGAACATGAGATGCCAATTTCT TTCTGGACAGAGAGTATTTGGTTGGCTAAAGTCAAAATCTAAATTTTGCTTTGGGATAAATTCCAAAAAT ATTAGCATTATTCAAATTTACTTTCACTTTATCTTTCCGAATCTTCAAGGTCCAAAAGCATTGCTGAATA ATTCTGTTTCTAAACTCACTTGCAGCGTGCTCTCCCTCCAAGGCGAAGACCATAATCTACTCTTGTCTGG AAATCATACAAGTAGGTATCTCAGCAAATGATACTCGTGTGTTATCGTTCTTATGAGTAAATCATTGGCA GTGAGTGTGATTTTTTTTTTTTTATGAAAGGATAAATACACGCCCTCTATTGGGGTCAGGTTTTGTGCCT GTACTTCTTCCGCCTACTGTATCATAGCAGCTTAGAATCCCAGCTGCTGGCTCGGGCTGCAGTTCTCTCA TGGCTCGCGCAGGGTGGACCAGCCCCGTTCCTTTATGTGTGTGTCTACTGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UGT1A10_1 ↗ | 2:233,636,474 | 正股 | 233,636,425–233,636,484 |
| UGT1A10_2 ↗ | 2:233,636,600 | 正股 | 233,636,551–233,636,610 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
基因座與轉錄註解
UGT1A10 依 HGNC/Ensembl 分類為 complex locus constituent。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00001024184 | nonsense_mediated_decay | 2,517 nt | 6 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UGT1A10 編碼參與葡萄糖醛酸化的 UDP-glucuronosyltransferase,可將類固醇、膽紅素、荷爾蒙與藥物等小型親脂性分子轉為水溶性、可排泄的代謝物;其酵素對 mycophenolic acid、coumarins 與 quinolines 具有葡萄糖醛酸化活性。該基因位於含多個家族成員的複雜基因座,其中九個可用替代第一外顯子能與四個共用外顯子剪接,形成 N 端不同而 C 端相同的蛋白質。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This gene encodes a UDP-glucuronosyltransferase, an enzyme of the glucuronidation pathway that transforms small lipophilic molecules, such as steroids, bilirubin, hormones, and drugs, into water-soluble, excretable metabolites. This gene is part of a complex locus that encodes several UDP-glucuronosyltransferases. The locus includes thirteen unique alternate first exons followed by four common exons. Four of the alternate first exons are considered pseudogenes. Each of the remaining nine 5' exons may be spliced to the four common exons, resulting in nine proteins with different N-termini and identical C-termini. Each first exon encodes the substrate binding site, and is regulated by its own promoter. The enzyme encoded by this gene has glucuronidase activity on mycophenolic acid, coumarins, and quinolines. |
DNA 與 RNA 序列
GTGCCTGTACTTCTTCCGCCTACTGTATCATAGCAGCTTA40GAATCCCAGCTGCTGGCTCGGGCTGCAGTTCTCTCATGGC80TCGCGCAGGGTGGACCAGCCCCGTTCCTTTATGTGTGTGT120CTACTGCTGACCTGTGGCTTTGCCGAGGCAGGGAAGCTGC160TGGTAGTGCCCATGGATGGGAGTCACTGGTTCACCATGCA200GTCGGTGGTGGAGAAACTTATCCTCAGGGGGCATGAGGTG240GTTGTAGTCATGCCAGAGGTGAGTTGGCAACTGGAAAGAT280CACTGAATTGCACAGTGAAGACTTACTCAACCTCGTACAC320TCTGGAAGATCAGAACCGGGAATTCATGGTTTTCGCCCAT360GCTCAATGGAAAGCACAGGCACAAAGTATATTTTCTCTAT400TAATGAGTTCATCCAGTGGTTTTCTTGACTTATTTTTTTC440GCATTGCAGGAGTTTGTTTAATGACCGAAAATTAGTAGAA480TACTTAAAGGAGAGTTCTTTTGATGCAGTGTTTCTGGATC520CTTTTGATACCTGTGGCTTAATTGTTGCTAAATATTTCTC560CCTCCCCTCTGTGGTCTTCACCAGGGGAATATTTTGCCAC600CATCTTGAAGAAGGTGCACAGTGCCCTGCTCCTCTTTCCT640ATGTCCCCAATGATCTCTTAGGGTTCTCAGATGCCATGAC680TTTCAAGGAGAGAGTATGGAACCACATCGTGCACTTGGAG720GACCATTTATTTTGCCAGTATCTTTTTAGAAATGCCCTAG760AAATAGCCTCTGAAATTCTCCAAACCCCTGTCACGGCATA800TGATCTCTACAGTCACACATCAATTTGGTTGTTGCGAACG840GACTTTGTTTTGGACTATCCCAAACCCGTGATGCCCAACA880TGATCTTCATTGGTGGTATCAACTGTCATCAGGGAAAGCC920ATTGCCTATGGAATTTGAAGCCTACATTAATGCTTCTGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。