基因總覽
urocortin 是由 UCN 編碼的蛋白質荷爾蒙,屬於 sauvagine/corticotropin-releasing factor/urotensin I 家族。來源將其描述為身體適應壓力的重要調節因子,並指出它由下視丘釋放;其作用涉及與 CRH receptors 的結合。除壓力反應外,來源亦提及它與聽覺閾值及進食調節相關,其中部分功能是依序列相似性推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000296099 ★ | 27,307,400–27,308,445 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
urocortin 參與全身對壓力的適應。主要在身體或心理壓力下由下視丘釋放,並藉由結合 CRH receptors CRHR1 與 CRHR2 傳遞訊號。來源指出,UCN 依賴的訊號是壓力相關神經內分泌、自主神經(戰或逃)及行為反應的重要介質。
在適應壓力的過程中,urocortin 訊號會活化下視丘—腦下垂體—腎上腺軸,並促進促腎上腺皮質激素(ACTH)的產生。這些作用共同構成來源所述的壓力反應調節功能;資料未進一步說明各類反應之間的先後或相對貢獻。
依序列相似性推定,urocortin 也參與正常聽覺閾值的建立,並可降低食物攝取量、調節胃體及血漿中的 ghrelin 水準。這些項目標示為 By similarity,應視為相似性推定的功能,而非此處所列的直接實驗證據。
Promoter 與基因調控
>UCN ENST00000296099 GRCh38 chr2:27308345-27309445 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTCATTTCTAGAGCTGGAAAGAAGCCAAGAGACCACCAAGCCCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT TTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTTGCCTCACTGCAGCTT CCGCCTCCTGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGCGCATACCGC CACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCGCCATATTGGCCAGGCTGGTTTCAAAC TACTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCT GGCCAAGCCCAGTCTTACAAATGAGGACCCTGAGGTTGGTAGGAGGGAGGTGACCTGTCCACACCAGGAG TTAGCAGAAACTTGAACCCATATTTCTTTGCTGCTCATGGGCAGAGTTACACTGCTGCTATGATTCCCAG GAGAGAAACTGAACTTTGCTAAACTACTTTGGCAAACTCAAAAGCAGATGGGCCAGCCATTTGTGGTCTG AAAGCACTCGGATGCTAGAGACCCTCTGTTACATGGTGCCTGTCAGACAGCCCTACAATTTGGATCCTGG GGCTGGAAAAAGATAAGAATGCTGGGAGACTTTGGTTGTGGCAGACTGCCTCTCAGTGGGTCCCACTGTG TTGGCTGAGTGCCAGCGGTGGACTCCTGATGCCTGCATTTGCAGAACTGATAGCTGCAGGGAGGCAGTGG GTTCCAGCGGCACAGCGTTCTCACATTTCTGGCCACTTCTAGAGGCAGAGGACGGGGTCAGCACCATGGA CAGCCTCACGGTCCCGCCTCCCTTTCGTGTGTCAGAACACGCGACCCGGACTAGTCTGGTCTGGGGACGG CCCTAGTCATTGCTGGCTGTTCTAAGCGGGGCGAGGGACTCCCGTGGGTCCCAGAGCAGTCTTTACGCCC CAGCCGGCTTCTCGCTTTCCTGCGTCCAGTGCTGCTTCCAGCGCTAGCCCCAGGGGCACGAAGGCTGGTG TAGGGAGGTGCGCCCCTCCGGGGGCCCGCCAGCCGTCAGACTCGAAGCTGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_B7FB5 · enhancer · 27303017–27303739 · regulatory
ENSR2_58FDNM · CTCF_binding_site · 27303613–27303634 · regulatory
ENSR2_9DSMR · promoter · 27308435–27308843 · regulatory
· motif · 27303500–27303513 · motif
· motif · 27303500–27303513 · motif
· motif · 27303613–27303622 · motif
· motif · 27303615–27303631 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:124 aa
urocortin 長 124 個胺基酸,屬於 sauvagine/corticotropin-releasing factor/urotensin I 家族。蛋白質註解標示第 1–25 位胺基酸為訊號胜肽;第 23–46 位則註解為無序區域,兩個區域在第 23–25 位有重疊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
urocortin 的註解定位為分泌型。 來源未提供其他細胞內位置、定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | urocortin 是參與全身壓力適應的荷爾蒙,主要在身體或心理壓力下由下視丘釋放,並結合 CRHR1、CRHR2。其訊號介導壓力相關的神經內分泌、自主神經與行為反應,並活化下視丘—腦下垂體—腎上腺軸、促進 ACTH 產生。依序列相似性推定,它也參與正常聽覺閾值建立,並降低食物攝取、調節胃體及血漿 ghrelin。 | 含實驗來源 | 證據與來源Hormone that plays a central role in whole body adaptation to stress. Released by the hypothalamus primarily in response to physical or psychological stress and acts by binding to CRH receptors CRHR1 and CRHR2. UCN-dependent signaling is a primary mediator of the neuroendocrine, autonomic (fight-or-flight) and behavioral responses to stress, acting as a key regulator of adaptation by activating the hypothalamus-pituitary-adrenal axis, leading to corticotropin hormone (ACTH) production. Plays a role in the establishment of normal hearing thresholds (By similarity). Reduces food intake and regulates ghrelin levels in gastric body and plasma (By similarity) PMID 20966082 ↗ · PMID 24290358 ↗ · PMID 26350463 ↗ · PMID 32004470 ↗ · PMID 36335102 ↗ · PMID 8612563 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
TGCGTCCAGTGCTGCTTCCAGCGCTAGCCCCAGGGGCACG40AAGGCTGGTGTAGGGAGGTGCGCCCCTCCGGGGGCCCGCC80AGCCGTCAGACTCGAAGCTGTGGCTGTCATTGCTTCTACA120ATCAGTGCATGTTCTTCGCTGACGTCAGTCGGAGCTGTCC160TGGCACTATATAAGGCTGGCGACAGCCCCGGGACAGACCC200TGTGTTCCCCAAGGCGTCTTCAGCCTGCCCCGAGGGACAG240AGACTGGAGCTCAATCTTGGACCGTACAGACGCTCGCCGA280CAACCTGGCCGGCGGCACCATGAGGCAGGCGGGACGCGCA320GCGCTGCTGGCCGCGCTGCTGCTCCTGGTACAGCTGTGCC360CTGGGAGCAGCCAGAGGAGCCCCGAGGCGGCCGGGGTCCA400GGACCCGAGTCTGCGCTGGAGCCCCGGGGCACGGAACCAG440GGTGGCGGGGCCCGCGCGCTCCTCTTGCTGCTGGCGGAGC480GCTTCCCGCGCCGCGCGGGGCCCGGCCGATTGGGACTCGG520GACGGCAGGCGAGCGGCCGCGGCGGGACAACCCTTCTCTG560TCCATTGACCTCACCTTTCACCTGCTGCGGACCCTGCTGG600AGCTGGCGCGGACGCAGAGCCAGCGGGAGCGCGCCGAGCA640GAACCGCATCATATTCGACTCGGTGGGCAAGTGATGGCCC680GGTTTGGGGCTGCGAAAACGTTGACCCCTTTCCCCCACCC720CAGAGTTGGGATGCGGGGCAGAGCCACCAGGGCACTGTCT760GCGTGACTATTTTTTAATAAAAGTACTGAAGACCC795cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。