演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UCK2UMPK

uridine-cytidine kinase 2

UCK2(uridine-cytidine kinase 2)是 uridine kinase family 的蛋白質,參與 uridine 與 cytidine 的磷酸化及嘧啶核苷酸補救合成。

Homo sapiens1q24.1UniProt Q9BZX2
OFFICIAL SYMBOL
UCK2
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q9BZX2
PDB / ALPHAFOLD
1XRJ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UCK2 的正式名稱為 uridine-cytidine kinase 2,屬於蛋白質編碼基因,產物歸於 uridine kinase family。其蛋白質長度為 261 個胺基酸,序列兩端各有一段被註記為無序區域:第 1 至 24 個胺基酸,以及第 236 至 261 個胺基酸。從家族分類與已知底物可知,UCK2 的基本角色與核苷酸代謝相關;其具體催化反應及代謝途徑位置見功能說明。

Official symbol
UCK2
Gene name
uridine-cytidine kinase 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12562
UniProt
Q9BZX2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UMPK

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q24.1
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegUCK2pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:165,827,491–165,911,618
Gene span
84,128 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000367879 ★165,827,614–165,911,6187
ENST00000940421165,827,525–165,911,6185
ENST00000982064165,827,525–165,911,6156
ENST00000982065165,827,525–165,911,6165
ENST00001083041165,827,525–165,908,1097
ENST00001105768165,827,525–165,894,1493
ENST00001119631165,827,525–165,911,6186
ENST00001144691165,827,525–165,911,6187
ENST00000642653165,827,805–165,911,6188
ENST00000469256165,895,570–165,911,6185
ENST00000470820165,895,585–165,911,6184

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UCK2 催化 uridine 與 cytidine 的磷酸化,分別生成 uridine monophosphate(UMP)與 cytidine monophosphate(CMP)。此反應是核苷酸補救合成的起始步驟:細胞可由既有的核苷回收原料,進入嘧啶核苷酸代謝。對 uridine 而言,來源將反應列為由 uridine 合成 UMP 的單一步驟;對 cytidine 而言,則列為由 cytidine 合成 CTP 的三步途徑中的第一步。

反應可使用 ATP 或 GTP 作為磷酸供體;所列反應式則以 ATP 為供體,將 uridine 轉為 UMP,或將 cytidine 轉為 CMP,並生成 ADP 與 H⁺。這些底物選擇與產物差異,說明 UCK2 作用於特定嘧啶核苷,而非廣泛磷酸化各類核苷。

底物範圍亦包含多種 cytidine 與 uridine 核苷類似物,例如 6-azauridine、5-fluorouridine、4-thiouridine、5-bromouridine、N(4)-acetylcytidine、N(4)-benzoylcytidine、5-fluorocytidine、2-thiocytidine、5-methylcytidine 與 N(4)-anisoylcytidine。相對地,UCK2 不磷酸化 deoxyribonucleosides 或 purine ribonucleosides。這些結果界定了其對核糖核苷及嘧啶類底物的選擇性。

透過補救途徑,UCK2 的反應可將 uridine 導向 UMP 的生成,並為 cytidine 後續轉化至 CTP 提供起始步驟;因此,其功能連結核苷回收與嘧啶核苷酸合成。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 165827614 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UCK2 ENST00000367879 GRCh38 chr1:165826614-165827714 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCAGTTTCAGCGCTTTAGAAACCTTTTCTCTTCAAACACTAATACAGGGCCTAGACTGTACCAGCACTGT
TCTGAGAACTTTACATACACTAATTCATTTAATTCTCACAAAAATCCTGGGATGTAATTGCCATTATTAT
TCCCATTTAACAGATAAGAACACTGAAGCACAGAGAGATTAAGTAACTTGCTCAGGGACCTGGATGTGAA
TGCAGAAATCTGGCTCCAGAGGTGGAGTCTGAAACTGCCTTTCTAAGTGACTGATTGCCAATCTCTGGAA
AACCGTTCAATTGAAGATATTAATGGATCAAAATGTCAGTATGTTTTCAGATACCCTAACTCCATAGGAA
GCTCAGTGTATGGGATGAGATACTGTGGTTTAGAAGGGAATTGCTTTTCCAACGGAGGGCACCCTTCAGA
TAAGCCCCTCAAATTGCCCTTCACTAGAGAGTCGCACGAGGACAGGCCTGCTAAAAAGGATGGCGCTGGG
GGGTTTCCAAGACAGGAAATATCTAAAGCCAGCGGCTGACATATTATCTTGGCGAACGGGAGAAGGGAAA
AAGAACCCTCATTTTTTGGAAACACAAGTTTTTAGCCTGGATAATGGGTAAATGACATTAACTCTTCGTT
CCACACTAATCTTTCAAGCTTGTTCAAATTTTGCTTCTCAAACCTGGGCCATTCCTTCTTATCTAATCTG
CCTATTATTTCCTTCAAGCTTTTTATCCCTTCTGAAAATAGGTGGTAGCATACCAAATTAAAATACAGAA
CAGCCTGTTTCTTTCCCCCAGGGTCCACTAGGGCGCGTCGGAGAAAGGGTTAACCGGGCGGGTGGGAGGG
AAGGTCGGGCTCACACCTTTCGCAGAGACCTCGGGCGGCGGCGGGGCCCGGGAGGGGCGGAGGCTGGGGC
CAGACGCCTCGCCGCCTCCGCCTCGGCGAATAGCAGCGCGCTGCCCGCCCGGATTGGAGCAGCAGCATCA
CGCTGACCTCTGCCTGGGATGTAAACCGGACCAGCCGCTGCGGGCAAAGGAAGGCTCTTGGCTCCTTCGG
GAAACCCAGCCCCGTCACCGGGCTCCGAGCGGCTCGCAGGCGAGCGACAGC
UCK2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UCK2_1 ↗1:165,827,616正股165,827,567–165,827,626
UCK2_3 ↗1:165,895,553正股165,895,504–165,895,563

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_53G24ZN · CTCF_binding_site · 165827008–165827029 · regulatory

ENSR1_94FS5G · promoter · 165827124–165827624 · regulatory

ENSR1_7CQ9J7 · enhancer · 165827625–165827744 · regulatory

ENSR1_7CQ9JB · promoter · 165827745–165827815 · regulatory

ENSR1_DB85T · enhancer · 165827816–165830184 · regulatory

· motif · 165827010–165827026 · motif

· motif · 165827593–165827605 · motif

· motif · 165827596–165827603 · motif

· motif · 165827616–165827633 · motif

· motif · 165828196–165828212 · motif

· motif · 165828196–165828212 · motif

· motif · 165828497–165828508 · motif

· motif · 165832372–165832383 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:261 aa

1 aa261 aa功能區域
依 Q9BZX2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UCK2 蛋白質長 261 個胺基酸,屬於 uridine kinase family。序列註解將第 1–24 位及第 236–261 位分別標示為無序區域。

功能區域Disordered1–24 aa
功能區域Disordered236–261 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1XRJ…

PDB · 1XRJ

X-ray · 2.00 A · A/B=1-261

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UMPKUCK2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UCK2 以 homotetramer 形式組成複合體;此註記描述由相同蛋白質次單元構成的四聚體,不涉及其他互作夥伴。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UCK2 將 uridine 與 cytidine 分別磷酸化為 UMP 與 CMP,可使用 ATP 或 GTP 作為磷酸供體;不磷酸化 deoxyribonucleosides 或 purine ribonucleosides,並可作用於多種 cytidine 與 uridine 核苷類似物。含實驗來源
證據與來源

Phosphorylates uridine and cytidine to uridine monophosphate and cytidine monophosphate. Does not phosphorylate deoxyribonucleosides or purine ribonucleosides. Can use ATP or GTP as a phosphate donor. Can also phosphorylate cytidine and uridine nucleoside analogs such as 6-azauridine, 5-fluorouridine, 4-thiouridine, 5-bromouridine, N(4)-acetylcytidine, N(4)-benzoylcytidine, 5-fluorocytidine, 2-thiocytidine, 5-methylcytidine, and N(4)-anisoylcytidine

PMID 11306702 ↗ · PMID 11494055 ↗ · PMID 35583288 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性uridine + ATP = UMP + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

uridine + ATP = UMP + ADP + H(+)

PMID 11306702 ↗ · PMID 11494055 ↗ · PMID 35583288 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性cytidine + ATP = CMP + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

cytidine + ATP = CMP + ADP + H(+)

PMID 11306702 ↗ · PMID 11494055 ↗ · PMID 35583288 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UCK2 參與嘧啶代謝,並位於由 cytidine 經補救途徑合成 CTP 的三步流程中,負責第一步。資料庫紀錄
證據與來源

Pyrimidine metabolism; CTP biosynthesis via salvage pathway; CTP from cytidine: step 1/3

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性UCK2 參與嘧啶代謝,並催化由 uridine 經補救途徑合成 UMP 的流程;此途徑列為一步完成。資料庫紀錄
證據與來源

Pyrimidine metabolism; UMP biosynthesis via salvage pathway; UMP from uridine: step 1/1

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homotetramer含實驗來源
證據與來源

Homotetramer

PMID 15130468 ↗ · PMID 15735337 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000367879 · 4,801 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTAAACCGGACCAGCCGCTGCGGGCAAAGGAAGGCTCTTG40
41GCTCCTTCGGGAAACCCAGCCCCGTCACCGGGCTCCGAGC80
81GGCTCGCAGGCGAGCGACAGCGGCCTCAGCCCCGGCAGCG120
121CCCAGCGGCGGCTGCGGAAAGCGGAGGGAGTCCGACGCGG160
161GCGCGGGCGGGGAGCGTGCGTCCGTTCGCACAGGCAGCGG200
201GAGGAGGGGCGGCGCGAACCATGGCCGGGGACAGCGAGCA240
241GACCCTGCAGAACCACCAGCAGCCCAACGGCGGCGAGCCC280
281TTCCTTATAGGCGTCAGCGGGGGAACAGCTAGCGGCAAGT320
321CTTCCGTGTGTGCTAAGATCGTGCAGCTCCTGGGGCAGAA360
361TGAGGTGGACTATCGCCAGAAGCAGGTGGTCATCCTGAGC400
401CAGGATAGCTTCTACCGTGTCCTTACCTCGGAGCAGAAGG440
441CCAAAGCCCTGAAGGGCCAGTTCAACTTTGACCACCCGGA480
481TGCCTTTGACAATGAACTCATTCTCAAAACACTCAAAGAA520
521ATCACTGAAGGGAAAACAGTCCAGATCCCCGTGTATGACT560
561TTGTCTCCCATTCCCGGAAGGAGGAGACAGTTACTGTCTA600
601TCCCGCAGACGTGGTGCTCTTTGAAGGGATCCTGGCCTTC640
641TACTCCCAGGAGGTACGAGACCTGTTCCAGATGAAGCTTT680
681TTGTGGATACAGATGCGGACACCCGGCTCTCACGCAGAGT720
721ATTAAGGGACATCAGCGAGAGAGGCAGGGATCTTGAGCAG760
761ATTTTATCTCAGTACATTACGTTCGTCAAGCCTGCCTTTG800
801AGGAATTCTGCTTGCCAACAAAGAAGTATGCTGATGTGAT840
841CATCCCTAGAGGTGCAGATAATCTGGTGGCCATCAACCTC880
881ATCGTGCAGCACATCCAGGACATCCTGAATGGAGGGCCCT920
921CCAAACGGCAGACCAATGGCTGTCTCAACGGCTACACCCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。