基因總覽
UBL4A 是位於 X 染色體 Xq28 的蛋白質編碼基因，產物為 157 個胺基酸的 Ubiquitin-like protein 4A。其蛋白質具有 ubiquitin-like 結構域，名稱與結構特徵反映其泛素樣性質。UBL4A 是 BAG6/BAT3 複合體的組成成員；此複合體至少包含 BAG6、UBL4A 與 GET4/TRC35。UBL4A 因而參與細胞質中的蛋白質品質管制網絡，與錯誤折疊、疏水區域暴露或定位異常的蛋白質處理相關。其功能面向包括協助蛋白質運送，以及在不適合進入指定路徑時參與後續分流。具體的辨識、運送與降解安排，則取決於複合體及其作用情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000369660 ★ | 154,483,717–154,486,615 | 4 |
| ENST00001081112 | 154,483,717–154,486,628 | 3 |
| ENST00001134798 | 154,483,717–154,486,628 | 4 |
| ENST00000369653 | 154,485,193–154,486,628 | 5 |
| ENST00000630530 | 154,485,926–154,486,584 | 2 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBL4A 作為 BAG6/BAT3 複合體的一員，參與細胞質蛋白質品質管制。此複合體能使錯誤折疊或含有疏水斑塊的蛋白質維持可溶狀態，並協助將其適當送往內質網；若不適合進入該路徑，也可將其分流至蛋白酶體降解。這種分流功能使細胞能處理異常蛋白質，同時避免它們因疏水性而失去可溶性。
對於尾端錨定型／第二型跨膜蛋白，BAG6/BAT3 複合體參與其轉譯後送往內質網膜的過程。複合體被招募至核糖體後，會與新合成蛋白的跨膜區域互動，並與 SGTA、ASNA1 一同促進其送達內質網。若客戶蛋白無法正確送入內質網，便會被泛素化並導向蛋白酶體。此複合體也能處理錯誤定位至細胞質的分泌途徑蛋白，依情況將其送往內質網或蛋白酶體降解。
BAG6/BAT3 複合體亦參與內質網相關降解（ERAD）。在此品質管制過程中，不需要的內質網蛋白會逆向轉位至細胞質，再被送往蛋白酶體。複合體使這些逆向轉位的蛋白在細胞質中維持未摺疊但可溶的狀態，以利後續正確送達蛋白酶體。這些作用共同構成蛋白質運送與清除的分流機制；來源描述的是 BAG6/BAT3 複合體的功能，並未進一步界定 UBL4A 在各步驟中的獨立作用。
Promoter 與基因調控
>UBL4A ENST00000369660 GRCh38 chrX:154486515-154487615 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGACTATGCCTCCCAGGCCCCCTTCATTGTGGCGCTGAGCGGCACCTCCGAGATGCTGGCCTTGGTCATT GGCCACTTCATCTACAGCAGCCTGTTCCCAGTTCCCTGAGGCCTCTGGGTCAAGCTTTCATCAGCCCCAG CCCCCACACTCCACCAAAGTTCTCATGCACTATGCACTCAGAAAAATCCAGGCTTATTTTTTTTACTGAT TTTTTATTCTCCAGCTTTCAGTGCCAAAGAGGCCATGCTGAGTTAGGTAGGTGGGCGCTGCCCAGAAAAT ATATTTCAATAAAAGAGAGAAGCAAGCTTGGGTCCCTTCTACTCTTTGCCCTTTGGGGCCTGGGCGTGGG GGTAGAAAGAGTGTGCTGGGTAAGTGTGGACCAGGGTGGAGGGCCAGCTTGGGTGACACGGTGACCCCTG CATAGGCTTTCCCTATCAGCCCTCCCCGGGGGTGTCCCCACTCTGGGAGAGGTGGGAGGATGAGGGCAGA GGCGTAGCCCCCCTGCCCCCTCTCAAGCTCAGTGGAGCGTTTCGCAGCCAGACCAGAAAGGAGGAGGTAG GAAGCCACCAGACAGGGAGCGGGGGCGGGCCGTCTGTGGGTATGCAGGGCCAGGCGCCGCCAGCAGTCCT GGCGCGTGAGGTGGGCCAGGCAGTCCGCGGGGGCGAGCGTACCTTCTGGCCCTCCCTTCTCCATGTCCCA GCTCCCAGATGACGCCAACCTGGCCCGACTGGTTCCTGCTCCCAACTCCCCCGCGTCGTTGCTTTGGGAG GGGTCCGCCGGCCAGGGCGGTCGATGCGCGCATGCTAGGCGGGACCCCGGGGGGACTCCTCCCGGGGCGC AATTGGGCCGGGGGGCGGGGCCGGGGCGCGGACGGGGCAGGAGGGCGGGGCCGGGAAGCGCGGGCGGCGG GCGCGCCCCTCTCGCTGCTTCCGGCGGCGGCGGGCGGTTCCAGCGCGCGCCCGGGGCGGCGGCGCGCGGC GGGGGGTGGTTGGGGTGCGCGCCGGCCCGAGTGGACGCCGTCGCGACCGCCATGCAGCTGACGGTGAAGG CGCTGCAGGGCCGCGAGTGCAGCCTGCAGGTAGGGTCCCCGGGCCGGGCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UBL4A_2 ↗ | X:154,486,599 | 負股 | 154,486,589–154,486,648 |
| UBL4A_1 ↗ | X:154,487,823 | 負股 | 154,487,813–154,487,872 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_949BKG · enhancer · 154484614–154484946 · regulatory
ENSRX_B35MRJ · promoter · 154486574–154487105 · regulatory
ENSRX_CKBWH · enhancer · 154489444–154490603 · regulatory
ENSRX_B35MS5 · promoter · 154490604–154491180 · regulatory
ENSRX_53CC57S · CTCF_binding_site · 154490932–154490953 · regulatory
ENSRX_53CC58J · CTCF_binding_site · 154491082–154491103 · regulatory
· motif · 154486108–154486120 · motif
· motif · 154486110–154486117 · motif
· motif · 154486672–154486685 · motif
· motif · 154486681–154486690 · motif
· motif · 154486721–154486734 · motif
· motif · 154486751–154486764 · motif
· motif · 154486859–154486872 · motif
· motif · 154486949–154486962 · motif
· motif · 154487027–154487040 · motif
· motif · 154487196–154487208 · motif
· motif · 154487198–154487205 · motif
· motif · 154487198–154487213 · motif
· motif · 154490140–154490148 · motif
· motif · 154490312–154490323 · motif
· motif · 154490312–154490323 · motif
· motif · 154490314–154490323 · motif
· motif · 154490793–154490804 · motif
· motif · 154490793–154490804 · motif
· motif · 154490799–154490810 · motif
· motif · 154490799–154490810 · motif
· motif · 154490934–154490950 · motif
· motif · 154491084–154491100 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：157 aa
Ubiquitin-like protein 4A 長 157 個胺基酸，N 端第 1–76 位為 ubiquitin-like 結構域。第 96–138 位區段對與 BAG6 的互動具有必要性，且單獨即可支持此互動。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UBL4A 的定位資料列出細胞質、細胞質溶膠與細胞核。 來源未提供不同條件下的定位變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
- CDCA7LQ96GN5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHATP28329-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERP27Q96DN0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FGFR3P22607 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2P50222 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PER2O15055 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- S100PP25815 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SGTBQ96EQ0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TRAF4Q9BUZ4 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TRIM54Q9BYV2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- vifP12504 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
UBL4A 是 BAG6/BAT3 複合體的成員；該複合體至少由 BAG6、UBL4A 與 GET4/TRC35 組成。UBL4A 與 BAG6 有直接互動，且此互動是 UBL4A 蛋白質穩定性所必需。UBL4A 也與 USP13 互動，但這項關係可能是經由 BAG6 間接發生。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BAG6/BAT3 複合體參與細胞質蛋白質品質管制，使錯誤折疊或含疏水斑塊的蛋白質維持可溶，並協助其送往內質網或分流至蛋白酶體降解。複合體也參與尾端錨定型／第二型跨膜蛋白轉譯後送往內質網，並與 SGTA、ASNA1 協同；無法正確送達的客戶蛋白會被泛素化並導向蛋白酶體。它亦處理錯置於細胞質的分泌途徑蛋白，並在 ERAD 中維持逆向轉位蛋白未摺疊且可溶，以利送往蛋白酶體。 | 含實驗來源 | 證據與來源As part of a cytosolic protein quality control complex, the BAG6/BAT3 complex, maintains misfolded and hydrophobic patches-containing proteins in a soluble state and participates in their proper delivery to the endoplasmic reticulum or alternatively can promote their sorting to the proteasome where they undergo degradation. The BAG6/BAT3 complex is involved in the post-translational delivery of tail-anchored/type II transmembrane proteins to the endoplasmic reticulum membrane. Recruited to ribosomes, it interacts with the transmembrane region of newly synthesized tail-anchored proteins and together with SGTA and ASNA1 mediates their delivery to the endoplasmic reticulum. Client proteins that cannot be properly delivered to the endoplasmic reticulum are ubiquitinated and sorted to the proteasome. Similarly, the BAG6/BAT3 complex also functions as a sorting platform for proteins of the secretory pathway that are mislocalized to the cytosol either delivering them to the proteasome for degradation or to the endoplasmic reticulum. The BAG6/BAT3 complex also plays a role in the endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD), a quality control mechanism that eliminates unwanted proteins of the endoplasmic reticulum through their retrotranslocation to the cytosol and their targeting to the proteasome. It maintains these retrotranslocated proteins in an unfolded yet soluble state condition in the cytosol to ensure their proper delivery to the proteasome PMID 20676083 ↗ · PMID 21636303 ↗ · PMID 21743475 ↗ · PMID 25535373 ↗ · PMID 28104892 ↗ |
| 交互作用 | UBL4A 至少與 BAG6、GET4/TRC35 組成 BAG6/BAT3 複合體。UBL4A 與 BAG6 直接互動，且此互動為 UBL4A 蛋白質穩定性所必需；它也與 USP13 互動，但該關係可能透過 BAG6 間接形成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the BAG6/BAT3 complex, at least composed of BAG6, UBL4A and GET4/TRC35. Interacts with BAG6; the interaction is direct and required for UBL4A protein stability. Interacts with USP13; may be indirect via BAG6 PMID 20676083 ↗ · PMID 24424410 ↗ · PMID 25535373 ↗ · PMID 25713138 ↗ · PMID 34887561 ↗ |
| 細胞定位 | UBL4A 的定位資料列出細胞質、細胞質溶膠與細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCCGGCCCGAGTGGACGCCGTCGCGACCGCCATGCAGCTG40ACGGTGAAGGCGCTGCAGGGCCGCGAGTGCAGCCTGCAGG80TGCCAGAGGACGAGCTGGTGTCCACGCTGAAGCAGCTGGT120CTCCGAGAAGCTGAACGTCCCAGTGCGCCAGCAGCGGCTG160CTGTTCAAGGGCAAGGCCCTGGCAGATGGGAAACGACTCT200CGGATTATAGCATCGGGCCCAACTCCAAGCTCAACCTAGT240GGTCAAACCCCTGGAGAAGGTGCTACTAGAAGAAGGCGAG280GCCCAGAGGCTGGCCGACTCCCCACCCCCGCAGGTCTGGC320AGCTGATCTCCAAAGTCTTGGCCCGCCACTTCAGTGCGGC360AGATGCCAGCAGGGTCCTGGAACAGCTACAGAGGGATTAC400GAGAGGTCCCTGAGTCGCCTGACGCTGGACGACATCGAAC440GGTTGGCCAGCCGCTTCCTGCACCCTGAAGTGACTGAGAC480AATGGAGAAGGGCTTCTCCAAATAGAATTCTCGGAGCATG520GGGAGGTGCCCAACGCCAGGCTACCGCTGCATGTCGCACT560AAGTGTGTTCTCCTGTTGCAGTTGGGCTCATCATCATCAT600AGCTGGCATGTACCTGGCTCTGGCCAGGTGCTAGGCACTC640CTCACAGCTTGACCTGGGTTTGCTTCCACACCCTCAGAAG680AGGAGAGCCGGCACAGCAGAGGCACCGGCGATGAAGTGGC720ACAGCCCCAGTCGGAATCCAGCGGCTTCTGAAAGTGCCTT760GGTGTGAGAAGGAGGAAGGGGCCGCTTGGAGAGCTGGGCT800CTCGCATGTCATGTTTAGCCCACTGAGAATATACCCTCAG840GTGACTCCCTCCCGATCCTGAAAGGGAAAGCAGCTGTCAC880CTGACTTCTGGCGGGTCCAACATAGCCCTCAGCTTACCTC920TGCAGGAGGCCAAGTGACAGCCAGCCCTGGAACCCCCCGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。