基因總覽
UBL3 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 ubiquitin like 3。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 13q12.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000380680 ★ | 29,764,371–29,850,617 | 5 |
| ENST00001131564 | 29,764,274–29,850,710 | 5 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>UBL3 ENST00000380680 GRCh38 chr13:29850517-29851617 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TAGGTTGGAGAGGTGGCTTTCAGACTCTAAATTCATTGGCATTTATATATAGGCATCATATTGAGACTGC CCTTTCTAAAGTACTCTGTCAAAGGACTAAGAGATATGAATAGGGATTCAGATGTTGACCTCAGATTTAG GAACAAAATGCAGAAATCACAAATGTCCATCTGAATGGTGTCTCAACAATGGCATTATTTTCTCCTATTT GCTAATCACTGCAAGGCATATAGGTTTTCAATTACATTATGAGTTACATAGAATAGAATTTAGGGTCCAG ATGGGTAAACTGGTGAATCCCCATGAAGTTTGTAGTAGCTATTTCCTGATACAGATTTGATATAATAACA CTGTTGTATGTAATACAGTTTTGGTAATTTCAGTTAAGTAGATTGTAGCTTTATTGCCCTGGGTCTTCAA GGAAACACATGTTCAAATATTCTCACTGCTTAATGAGATCCTTGTTCCTGTTGAACTTATGTGACCTTAT TGGAAATCAATGATTGCTTTTGTTCTTCAAAATGTAATGTTGAGGAGACCTAGATGAAATCACTCTACAA AATGCATTGAGATTGCAGGATGTGGAGAATGTGCTGTAATTAAAATGAATGATTCTGCTTGGAGGTACAG CATATTTTAGCTCTGTGTGCATATCGTGCATAAGGGAATTTCTCTATGCAGAATTATTTTCTCCCAACAA TTCTCATGATCACAGCACTCCTGGTAGCAGGTATCACTTAACTCCTGGGCAGCAGCTTGTCCAAAGCAAG GGAAAGGGAGCTTTCCTTTCCTCGCAACTGTTGCTATGGGGGGCGTGGCTTCGGAGCTGGGTGAGGAGGC GTTCGGCGGCTCCCTCCCCCCCCCACCCTCGTAGACTACACTTCCCGTGATGCTCGAGGGAATGGTCTCC GTGGTGACGCACTTGGTGTCCGCGGAGGGAGGACGAGGACGGGGGCGGCGGCTGCTGCGAGGGGGGGCCC GTGCTCTCCCCGTTTCCCTTAGTCGCACTCAGGCAGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCCATGTTGGTTTG AGAGGCGATGACAGGAGGCGGCCGCGGCGTGTGGGACTGAAAAGTGAAGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UBL3_2 ↗ | 13:29,850,343 | 負股 | 29,850,333–29,850,392 |
| UBL3_1 ↗ | 13:29,850,617 | 負股 | 29,850,607–29,850,666 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR13_8TNNQ · enhancer · 29845516–29845715 · regulatory
ENSR13_B7WX8 · enhancer · 29847260–29848187 · regulatory
ENSR13_D3GZL · enhancer · 29848533–29850606 · regulatory
ENSR13_9FSWD · promoter · 29850607–29851107 · regulatory
ENSR13_9FSWX · enhancer · 29852524–29853001 · regulatory
· motif · 29845778–29845791 · motif
· motif · 29848668–29848683 · motif
· motif · 29849470–29849478 · motif
· motif · 29850126–29850139 · motif
· motif · 29850220–29850233 · motif
· motif · 29850341–29850354 · motif
· motif · 29850356–29850369 · motif
· motif · 29850575–29850585 · motif
· motif · 29850583–29850596 · motif
· motif · 29850586–29850599 · motif
· motif · 29850589–29850602 · motif
· motif · 29850659–29850672 · motif
· motif · 29850701–29850718 · motif
· motif · 29850748–29850758 · motif
· motif · 29850752–29850762 · motif
· motif · 29850754–29850764 · motif
· motif · 29850758–29850768 · motif
· motif · 29850775–29850788 · motif
· motif · 29850799–29850809 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：117 aa
Ubiquitin-like protein 3 長 117 個胺基酸，具有位於第 10 至 88 個胺基酸的 Ubiquitin-like 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UBL3 定位於細胞膜，並以脂質錨定方式與膜相關。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- GORASP2Q9H8Y8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HDAC7Q8WUI4-6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HEXBP07686 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- M1APQ8TC57 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBFOX1Q9NWB1-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TTRP02766 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | UBL3 定位於細胞膜，並透過脂質錨定與膜相關。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGTCGCACTCAGGCAGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCCA40TGTTGGTTTGAGAGGCGATGACAGGAGGCGGCCGCGGCGT80GTGGGACTGAAAAGTGAAGGAGGAGGAGGAGAAACAAAGC120TCTGAGAGGAAACCATTCCCGGGCTGAGGAGAAGGAGGAC160CCGGCCTCTTCCGGGGACCAGCCGAAGTCGGCGTCGCCCG200GAGCTCGCGAGGCCGGGGAGGGGAGGGGAAGGGAAGGCGG240AGACCGGGGAGGCGGCGGCGGGGAAGGCGGAGGCAGAAGA280GGAGTGGCGAGGAGCCGGAGACGATGCGCCCCGACCCCAG320CTGCTGTCCGGAGGCGCCCGCGGCCTGAGCCCAGAGGGGC360TGTGGAGTGTCCCGGCCGGCCCCGAGCACCCCCGCGCTGT400CGGTCCCCCGCTCCGGTCTTTCGCTTTGGCTTCCAACTAG440TTAAATGCCCTTGAGCGCGGGTTTCCGCGGCCCGGCTCTT480CGCCCCCGCGGCGCGAGTTGAGCCGTTTCCCCGCGCTGTC520CGCGCGGGCGCTCCGACAGCGGCTCTGCAGGGTCCGCGGC560CAGCGTCCGGCCACCGCTCGGCCGCCACTCAAGGCTCACG600CGTCGATGTGTAGCTACATAGTTATCTGTGTACATCCACG640CTGGGGCATTTTTCTCCTGCTTAATGAGGACTTGACTCGG680GAGCAAGTGTGAATCATTGCCGGGGCTGGGAAAGGAGGAA720GGCGCATTTAACCCCCTCCCACCCCTCTCCATGTCCGTGT760GTCACTCGGCTCGGTCCACCTGGCGCGGCCGGTCCTGGGG800CTGCTGCTGCTGTTGACGACGACGACGACGACGGGGGCTG840CCTCTGCTGTCCCGGGAGTTTCCTCCTGCTCCGGCCACAC880AGCTCCTGGGGATTGTTCCTCTTCGAACCAGAACCTCGGC920CTGACCGGCACTTTGGCTCCAAAATAACTTTATTTTTGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。