基因總覽
UBE4B 是蛋白質編碼基因，其產物 ubiquitination factor E4B 屬於 ubiquitin conjugation factor E4 家族，長 1302 個胺基酸。蛋白質末端含有 U-box 結構域，並有數段被註解為無序區域。這些基本特徵將它歸入參與泛素接合的因子家族；其具體底物與細胞過程依情境而異，詳見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000343090 ★ | 10,032,958–10,181,239 | 28 |
| ENST00000253251 | 10,032,832–10,181,244 | 27 |
| ENST00000672724 | 10,032,832–10,181,244 | 29 |
| ENST00000377153 | 10,032,832–10,073,118 | 3 |
| ENST00000892379 | 10,032,832–10,181,244 | 26 |
| ENST00000892380 | 10,032,832–10,181,244 | 26 |
| ENST00000892381 | 10,032,832–10,181,239 | 27 |
| ENST00000892382 | 10,032,832–10,181,244 | 25 |
| ENST00000892383 | 10,032,832–10,181,244 | 25 |
| ENST00000892384 | 10,032,832–10,181,244 | 27 |
| ENST00000921026 | 10,032,832–10,181,244 | 28 |
| ENST00000921027 | 10,032,832–10,181,244 | 27 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBE4B 具有 E3 泛素連接酶活性，也能作為 E4 泛素鏈延伸酶，參與多聚泛素鏈的組裝。其反應涉及將泛素由 E2 泛素接合酶轉移至受體蛋白的離胺酸，形成蛋白質泛素化修飾；不同底物上的泛素鏈可進一步影響蛋白質的後續處理。
在膜蛋白運輸方面，UBE4B 可透過與 ESCRT-0 成分 HGS 互作而被招募至早期胞內體，並泛素化 EGFR、APP 等膜蛋白貨物，促進其分選至多囊泡體，之後經溶酶體降解。另一條降解途徑涉及 TP53：UBE4B 促進 MDM2 介導的 TP53 多聚泛素化及後續降解。
UBE4B 也能在 TRA2A 與 PYCR2 上形成 Lys-11 或 Lys-48 連結的多聚泛素鏈，促使兩者由蛋白酶體降解；TRA2A 的降解因此連結到其可變剪接功能的調節。於橫紋肌中，UBE4B 可能與 STUB1、VCP/p97 協同，藉由促進肌球蛋白伴護蛋白 UNC45B 的蛋白酶體降解來調節肌球蛋白組裝。
此外，UBE4B 可多聚泛素化 KLHL22；KLHL22 是一種會降解 GATOR1 複合體蛋白 DEPDC5 的 E3 連接酶，因此這條調控關係與 mTOR 訊息傳遞路徑相關。當粒線體去極化時，UBE4B 介導 NIPSNAP1 泛素化，促進其與自噬受體 NDP52、p62/SQSTM1 互作，並使其後續經由溶酶體途徑降解。來源亦指出，UBE4B 對心臟發育及保護神經元免於 ER stress 引發的退化具有重要作用；此項描述屬於相似性推論。
Promoter 與基因調控
>UBE4B ENST00000343090 GRCh38 chr1:10031958-10033058 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTA CAGGCGCCCGCCGCCACATCTGGCTGATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGC CAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC GTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAATATTTGTATTCTTGTGCACCGGAGGATGGTTTTCCCCCACTGACTCC AAACGTCTTCCTTGCATTTGCTGTGTACAATTCAGTGATTTGGGTCTCTCATCCATTTATACTTTCAAAT TTTACCAATACTTTTTGAACACACTTAAAAAAAAAAAAACCCAGGAAGTATCTCTAAAAGGCCAAGGTAA AATAAAATGAATGGGAGTTCTTGTGTTCGAGTTTTCTTCCAACTGGGCTTTCCTGGAGGAGGTGGAAGAG TGTGTGGCAGATGTTTCAGAAAATGAGCGCTCAATACGGTAGATCACGCTCCCGGGGTCAAGGAGACGTT TTCCGTTTTCTTTTCCCTCGCTTAGGCGGCGGGCGCGCACAGTCCAGTGGGAGCGATGAGGTGTTTCTAG GCCCCCAAGTCACAGAAAAGCAGGCGATTGGGAACAACGGAGGCGCGGCGGGCCCCCGGGCCGCGGGCCA GCGCCACCTTCTGGTGGATCTTCCCCGACGCGAGTCTGGGAGTCGTCCCTCCCCTTGCCAGCCTACCTGG CTCAGGCCCGCCGCGCCCGCAGCCCCAGCGCGGTCGCCGTGGCAACGCCCCGCCCAGCCGCCAGCCTCCC TTTGCCCCTCCCCACGTCCGGCGCGGCTGCGCGGGACGGGGTGGGACGGAGGCGGGGAGAGGACGCAGGC GAGAGGAACTCGGCGGCGCGGCGCCCGCGGCCTATTGGCTGCCACGTCCCGGCGCCAGAAGCCCCGCCTC CCTGACGGGGGTCACGTGATCCCTTTCAAAGATGGCCGCCCTGTTGTTTTGATGAATAATACTTGGTGGG GCGAGGGGGAAAGAGTAGGGGTGGAGGGGTAGGAGGATTTACTCTTCCAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UBE4B_1 ↗ | 1:10,032,958 | 正股 | 10,032,909–10,032,968 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_B3ZQC · enhancer · 10031461–10031981 · regulatory
ENSR1_B3ZQH · promoter · 10032342–10033284 · regulatory
ENSR1_54CP9J · CTCF_binding_site · 10032655–10032676 · regulatory
ENSR1_B3ZQM · enhancer · 10033285–10034135 · regulatory
ENSR1_B3ZQR · enhancer · 10034272–10035281 · regulatory
· motif · 10032514–10032534 · motif
· motif · 10032626–10032636 · motif
· motif · 10032657–10032673 · motif
· motif · 10032702–10032712 · motif
· motif · 10032759–10032774 · motif
· motif · 10032759–10032774 · motif
· motif · 10032774–10032784 · motif
· motif · 10032801–10032811 · motif
· motif · 10032845–10032855 · motif
· motif · 10032928–10032938 · motif
· motif · 10032943–10032955 · motif
· motif · 10032945–10032952 · motif
· motif · 10032948–10032957 · motif
· motif · 10032948–10032957 · motif
· motif · 10033082–10033092 · motif
· motif · 10033111–10033121 · motif
· motif · 10033116–10033126 · motif
· motif · 10033141–10033151 · motif
· motif · 10033762–10033771 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1302 aa
ubiquitination factor E4B 長 1302 個胺基酸，屬於 ubiquitin conjugation factor E4 家族。其 C 端含 U-box 結構域（第 1227–1300 位），另有三段被註解為無序區域，分別位於第 1–155、299–406 與 1057–1077 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UBE4B 的定位包括早期胞內體、細胞質與細胞核。 EGFR 活化時，UBE4B 可經 HGS 招募至內體膜；此處描述的是 UBE4B 的招募情境，而非將 HGS 的定位直接視為 UBE4B 的定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- UBL7Q96S82 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- UBE2D2P62837 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- UBE2D3P61077-1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
UBE4B 與 VCP/p97、STUB1/CHIP、UNC45B、HGS、MDM2，以及 E2 泛素接合酶 UBCH5C 和 UBC4 有互作記錄。HGS 與 UBE4B 的互作可在 EGFR 活化時招募 UBE4B 至內體膜；來源亦描述 UBE4B 與 STUB1、VCP/p97 在肌球蛋白組裝調節上的功能關係，但未將所有互作都界定為同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UBE4B 兼具 E3 泛素連接酶與 E4 泛素鏈延伸酶功能，參與多聚泛素鏈組裝。相似性推論指出它對心臟發育及保護神經元免於 ER stress 引發的退化具有重要作用。它可由 HGS 招募至早期胞內體，泛素化 EGFR、APP 等膜蛋白以促進分選及溶酶體降解；也促進 MDM2 介導的 TP53 多聚泛素化與降解。UBE4B 可能與 STUB1、VCP/p97 協同促進 UNC45B 降解，調節橫紋肌肌球蛋白組裝；並使 TRA2A、PYCR2 形成 Lys-11 或 Lys-48 連結的多聚泛素鏈後由蛋白酶體降解，進而調節 TRA2A 可變剪接功能。它也可泛素化 KLHL22，關聯 mTOR 路徑調控；粒線體去極化時則泛素化 NIPSNAP1，促進其與 NDP52、p62/SQSTM1 互作並經溶酶體途徑降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as an E3 ubiquitin ligase and E4 ubiquitin chain elongation enzyme specifically involved in polyubiquitin chain assembly. Plays an essential role in cardiac development and in the protection of neurons from degeneration evoked by ER stress (By similarity). Is recruited to early endosomes via interaction with the ESCRT-0 component HGS, where it ubiquitinates membrane protein cargo such as EGFR and APP to promote their sorting into multivesicular bodies and subsequent lysosomal degradation. Promotes MDM2-mediated polyubiquitination and subsequent degradation of the tumor suppressor TP53. May regulate myosin assembly in striated muscles together with STUB1 and VCP/p97 by targeting myosin chaperone UNC45B for proteasomal degradation. Mediates the formation of 'Lys-11'- or 'Lys-48'-linked polyubiquitin chains on TRA2A and PYCR2 and induces their degradation by the proteasome. Thereby regulates the alternative splicing function of TRA2A. Also regulates the mTOR signaling pathway by polyubiquitinating KLHL22, an E3 ligase that degrades the GATOR1 complex protein DEPDC5 (By similarity). Under mitochondrial depolarization, mediates the ubiquitination of NIPSNAP1, thereby promoting its interaction with autophagy receptors NDP52 and p62/SQSTM1 and its subsequent degradation via the lysosome-dependent pathway PMID 17369820 ↗ · PMID 21317885 ↗ · PMID 24344129 ↗ · PMID 32841720 ↗ · PMID 35669517 ↗ · PMID 41596759 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. | 推論支持 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. |
| 分子活性 | UBE4B 涉及蛋白質修飾，具體類別包括蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | UBE4B 與 VCP/p97、STUB1/CHIP、UNC45B、HGS、MDM2，以及 E2 泛素接合酶 UBCH5C、UBC4 有互作。HGS 與 UBE4B 的互作會在 EGFR 活化時將 UBE4B 招募至內體膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with VCP/p97. Interacts with STUB1/CHIP and UNC45B. Interacts with HGS; this interaction recruits UBE4B to endosomal membranes in response to EGFR activation. Interacts with MDM2. Interacts with ubiquitin-conjugating enzyme E2s UBCH5C AND UBC4 PMID 17369820 ↗ · PMID 20696396 ↗ · PMID 24344129 ↗ |
| 細胞定位 | UBE4B 的細胞定位包括早期胞內體、細胞質與細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCCTTTCAAAGATGGCCGCCCTGTTGTTTTGATGAATAAT40ACTTGGTGGGGCGAGGGGGAAAGAGTAGGGGTGGAGGGGT80AGGAGGATTTACTCTTCCAGCGAGAGCTACGCGCATCCCA120TCCTCCCCCTCCCCCCTACCCGGGCTCCGGCGTGGAGGCG160GGGCGTGGCCGGCCTGCTTTGGGAGGGGAGGGGCTTCCCT200TACAGTGCTGGGCTCTGCCAGGACGGCTGTGGGGTCGCCT240TACCTCGGGGTATCCACTCTGCAGTCGACCAGTTCCCGCC280AGGAGCAAAGGGTAGGAAGGAGAGCAGGATCTGCTGTAGG320AACGCAGCTACCGCGCCACTATCACGAAGAAACAGCAGGC360TCGGGGCACGAGACGAACTGGAGACCGCGCTGCCTAGCTG400GGTAACCTGGGAAGCAGAGGGTAATAAGTGGCGCCTTAAG440ACAACCCTGTAGCAGCAGCAGTGGCGGCCAAAGGAGGCTG480CTCAGGGAACAAGCGGCTGTAGTAGTCTGTGGGGCGACTG520GAGTGACCGAAGCCAAGGCAGTTTAGTGCCTCTCGTGTTC560TTATTTTTTAACCTCTGACTATGCAATTCTGAAACCTCCC600CCATTCGGGGGACCAGACAGCCTGATAGACACCTTCCACT640CTCCTTCCTCCCGCCGTGGTCTCGAGAACAGAAGGATCTC680TCCTTAACGCCTTTCACCATTAAGAGGAAAGCGATGGAGG720AGCTGAGCGCTGATGAGATTCGACGGAGGCGCCTTGCACG760ACTTGCTGGTGGACAGACCTCTCAGCCAACCACCCCACTC800ACCTCTCCCCAGAGGGAGAACCCTCCGGGGCCTCCCATAG840CGGCATCAGCCCCAGGACCCTCTCAGAGTCTTGGTCTCAA880TGTCCACAACATGACCCCAGCTACCTCCCCAATAGGTGCA920TCAGGAGTAGCCCATCGAAGCCAGAGCAGTGAAGGAGTCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。