基因總覽
UBE4A 是蛋白質編碼基因，其正式名稱為 ubiquitination factor E4A。基因產物屬於 ubiquitin conjugation factor E4 family，是一種與泛素化相關的蛋白質。其序列長 1,066 個胺基酸，含有位於序列末端附近的 U-box 結構域；另有一段被註記為無序區域。現有資料將其描述為可能具有 ubiquitin-protein ligase 作用，並指出它可能兼具 E3 與 E4 ligase 角色；具體作用方式與相關生物學意義見功能段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000252108 ★ | 118,359,600–118,399,211 | 20 |
| ENST00000431736 | 118,359,581–118,399,211 | 20 |
| ENST00000857052 | 118,359,581–118,399,211 | 21 |
| ENST00000857053 | 118,359,581–118,399,211 | 21 |
| ENST00000857054 | 118,359,581–118,399,211 | 20 |
| ENST00000911347 | 118,359,581–118,399,211 | 20 |
| ENST00000911348 | 118,359,581–118,399,211 | 22 |
| ENST00000911349 | 118,359,581–118,399,211 | 22 |
| ENST00000911350 | 118,359,581–118,399,211 | 18 |
| ENST00000979888 | 118,359,581–118,399,211 | 20 |
| ENST00001040897 | 118,359,581–118,399,211 | 17 |
| ENST00001074805 | 118,359,581–118,399,211 | 18 |
顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBE4A 被描述為 ubiquitin-protein ligase，可能在特定 E1 與 E2 ligase 協同下作為 E3 ligase。這項角色涉及泛素由 E2 ubiquitin-conjugating enzyme 轉移至受體蛋白的 lysine 殘基：反應中，原先與 E2 結合的泛素轉接至受體蛋白，形成泛素化修飾。資料將此歸為蛋白質修飾與蛋白質泛素化活動。
除了可能的 E3 ligase 功能，UBE4A 也可能作為 E4 ligase，協助在已由另一個 E3 ubiquitin ligase 泛素化的底物上組裝多聚泛素鏈。這表示其可能參與既有泛素標記的延伸，而不是僅限於最初將泛素接到底物上的步驟；此作用描述仍屬可能性，資料未提供更細的底物或反應條件。
UBE4A 所介導的底物修飾包括 Lys-48 連結型多聚泛素化。這類鏈結是資料明確指出的修飾形式，但目前提供的資訊未進一步說明特定底物、細胞過程或其後續命運。因此可據此描述其參與特定類型的泛素鏈組裝，不能延伸推定特定生理結果。
Promoter 與基因調控
>UBE4A ENST00000252108 GRCh38 chr11:118358600-118359700 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCTCTAGGATGACACAGGAGGATGTGCATAGGTTATATGCAAATACTGCATCATTTTATGTAAGGAACTT GAGCATCCTTGGATTTTGGTACCCAAGGGGGTCCTGAAACAAATCCCCCACAGATACCAAGTGGATAGTC ATTCTCTTGGAATGTATCTTCTTTGGAGAAATGTCTATTCAAGTCCTTTGCCCTTTTTTGAACTGAACTG TTTGGGGGTTTTTCGTTCTTGTAGTTCTTTACATATTCTAGAGATGAATCCTTTATCAGATATATGAGTT GCAACTATTTTCTCTCAATCTGTGAATTTTCACTTGCACAGCGCTTTTAACTCTTGAAAATTATGCTGCT TCTATTATTTATGTGTATCCCGATCTCTTGCCCTCGTGACCCGCCCGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG ACTACAAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCATCTATGTGTATCTCAAAACAACCTTGTAGGATGTATACT GTCTCCACTTTACAGATAAGAAAACTGAAATCCAATCAAAGATAGCACACTCCAAAGATTGCTCCAAAGA CAGCACAACAATAACAAACTTGTAGTTGTTATTGCTGTTAGTGTTATCCCTTTGAATAATAGAGAGTAAC AGAAGCTGCTTCAAAAAGGTCTAGGACTGGTGGGAAAATAAGAGAGCAGACCCCCAACAGAGGTTGCGAG CAGAGCCAGGGATCACAGAGTTTTATCTGCCCTCGGTACGCTGATTTCCAAAACCCAGCCTCATATTCTA TACTCCAAAGCGCACTGCCAGGTGGGCCAACTCCAGCCCCCACAATCCGATGCCAAGGCCACTTCTTGCC ACTTCCTGCCCGCCTCCAGCCCGCCCCTAACAAGCTAGCGCATGCGCTGTAGGACTATTTGCGCGCCGTT CCCCCCGGTGAGCCTGCACACCGTGCTTCCGGCGCGGAGATGAACTTCCACATGCCCCGGCGCTTGTTGA TGACGTAACTTCCGGTTGCTGTGCTGAGTCGGAAGTGGGAACCCTTCGGCCGCTGAGATTCTGTCGTGTC GTCGCTGCTGGCACTTCAGGCTCTGGTAAGACAGGCAATAGCTTCAGGGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UBE4A_1 ↗ | 11:118,359,634 | 正股 | 118,359,585–118,359,644 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_BTH7Q · promoter · 118359110–118359654 · regulatory
ENSR11_BTH7S · enhancer · 118359655–118360305 · regulatory
· motif · 118359439–118359448 · motif
· motif · 118359476–118359487 · motif
· motif · 118359476–118359487 · motif
· motif · 118359516–118359531 · motif
· motif · 118359516–118359531 · motif
· motif · 118359533–118359542 · motif
· motif · 118359577–118359590 · motif
· motif · 118359577–118359590 · motif
· motif · 118359586–118359595 · motif
· motif · 118359586–118359597 · motif
· motif · 118359586–118359597 · motif
· motif · 118359586–118359599 · motif
· motif · 118359823–118359836 · motif
· motif · 118362344–118362359 · motif
· motif · 118362349–118362361 · motif
· motif · 118362352–118362359 · motif
· motif · 118362352–118362367 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1066 aa
UBE4A 蛋白長 1,066 個胺基酸，屬於 ubiquitin conjugation factor E4 family。序列第 987–1061 位具有 U-box 結構域；第 33–56 位則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 UBE4A 的細胞內定位註記為細胞質；未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- IP6K1Q92551 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MAVSQ7Z434 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- UBXN4Q92575 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
UBE4A 相關基因變異被列為可致自體隱性神經發育障礙，特徵包括肌張力低下、粗大動作與語言發展遲緩（NEDHMS）。此疾病通常從嬰兒期即有嚴重的整體發展遲緩，並可能伴隨癲癇、行為問題、遠端骨骼異常或顏面特徵異常。資料將疾病與影響該基因的變異相連結。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UBE4A 是泛素－蛋白質連接酶，可能與特定 E1、E2 ligase 協同作為 E3 ligase；也可能作為 E4 ligase，在另一個 E3 ligase 已泛素化的底物上組裝多聚泛素鏈。其介導的底物修飾包括 Lys-48 連結型多聚泛素化。 | 推論支持 | 證據與來源Ubiquitin-protein ligase that probably functions as an E3 ligase in conjunction with specific E1 and E2 ligases. May also function as an E4 ligase mediating the assembly of polyubiquitin chains on substrates ubiquitinated by another E3 ubiquitin ligase. Mediates 'Lys-48'-linked polyubiquitination of substrates |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. | 推論支持 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. |
| 分子活性 | UBE4A 相關活動包括蛋白質修飾，具體類別為蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | UBE4A 的細胞內定位註記為細胞質。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | 影響 UBE4A 的變異與自體隱性神經發育障礙（NEDHMS）相關，病程可自嬰兒期出現嚴重整體發展遲緩、軸向肌張力低下、行走能力受限或缺失、智能發展受損及語言能力不佳或缺失；也可能有癲癇、行為問題、遠端骨骼異常與顏面特徵異常。 | 含實驗來源 | 證據與來源Neurodevelopmental disorder with hypotonia and gross motor and speech delay NEDHMS An autosomal recessive disorder characterized by severe global developmental delay apparent from infancy, axial hypotonia, limited or absent ability to walk, impaired intellectual development, and poor or absent speech. Additional features may include seizures, behavioral problems, distal skeletal anomalies, and facial dysmorphism. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 619639 PMID 33420346 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTGCTGAGTCGGAAGTGGGAACCCTTCGGCCGCTGAGATT40CTGTCGTGTCGTCGCTGCTGGCACTTCAGGCTCTGCCTCT80CCCACTAGGTCTGGATGGAGGATACCTTAAAGTGAAATGA120CAGACCAGGAGAATAACAACAACATCTCAAGTAACCCCTT160TGCTGCTCTTTTTGGCTCCCTGGCTGATGCCAAACAGTTT200GCGGCAATCCAAAAAGAGCAGCTGAAGCAACAATCTGATG240AACTCCCAGCTAGCCCAGATGACTCGGATAATAGCGTGTC280AGAGAGCCTGGATGAATTCGATTACTCTGTGGCTGAGATT320AGCCGCTCATTCCGATCACAGCAGGAAATATGTGAGCAAC360TCAACATCAATCACATGATCCAAAGGATCTTCCTTATTAC400TCTGGACAACAGTGATCCCAGCTTGAAAAGCGGGAATGGC440ATCCCTAGCCGTTGTGTGTATTTGGAAGAAATGGCAGTAG480AGCTAGAAGATCAAGACTGGCTTGATATGAGCAATGTTGA520GCAGGCCCTCTTCGCTCGCTTATTACTTCAAGATCCAGGC560AACCACTTAATTAACATGACTTCTTCTACAACGCTAAATC600TCTCTGCTGATCGAGATGCAGGAGAGAGGCACATTTTTTG640TTACCTTTACTCCTGCTTCCAGAGAGCCAAGGAAGAGATT680ACCAAAGTTCCAGAGAACCTGCTACCCTTTGCAGTGCAGT720GCAGAAACCTCACTGTGTCCAATACCCGAACAGTTCTTCT760CACCCCAGAGATCTATGTTGACCAAAACATCCATGAGCAA800CTGGTAGATTTGATGTTAGAAGCCATCCAGGGAGCCCATT840TTGAAGATGTAACTGAGTTTCTGGAAGAGGTCATTGAAGC880CTTGATATTGGATGAGGAAGTTAGAACATTTCCAGAAGTC920ATGATTCCAGTGTTTGATATTTTATTGGGCCGAATAAAAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。