演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

UBE2V2UEV-2

ubiquitin conjugating enzyme E2 V2

UBE2V2 編碼 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族;其功能涉及 Lys-63 連結的多聚泛素鏈合成、轉錄活化及 DNA 損傷後的細胞存活。

Homo sapiens8q11.21UniProt Q15819
OFFICIAL SYMBOL
UBE2V2
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q15819
PDB / ALPHAFOLD
1J74
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

UBE2V2 是一個蛋白質編碼基因,產物為 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族。此蛋白具有 UBC core 結構域,構成其主要的蛋白質結構特徵。UBE2V2 的功能需要與 UBE2N 形成異源二聚體;兩者共同參與特定形式的多聚泛素鏈合成。它也與目標基因的轉錄活化、細胞週期進程、分化及 DNA 修復相關。其多聚泛素化作用不會導致蛋白質經由蛋白酶體降解。

Official symbol
UBE2V2
Gene name
ubiquitin conjugating enzyme E2 V2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12495
UniProt
Q15819
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UEV-2DDVit-1EDPF-1MMS2UEV2EDPF1DDVIT1EDAF-1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q11.21
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegUBE2V2pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:48,008,410–48,067,523
Gene span
59,114 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000523111 ★48,008,431–48,064,7084
ENST0000085185248,008,410–48,067,5233
ENST0000097642948,008,410–48,067,5235
ENST0000097643148,008,410–48,054,4714
ENST0000101548648,008,410–48,067,5234
ENST0000101548948,008,410–48,067,5235
ENST0000108244048,008,410–48,067,5234
ENST0000109587448,008,410–48,067,5234
ENST0000109587548,008,410–48,067,5232
ENST0000113490748,008,410–48,067,5234
ENST0000052134648,008,419–48,067,5235
ENST0000051763048,008,451–48,067,5234

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

UBE2V2 本身沒有 ubiquitin ligase 活性;其泛素化相關作用是在與 UBE2N 形成異源二聚體後進行。這個異源二聚體催化合成非典型多聚泛素鏈,鏈上的泛素分子透過 Lys-63 連結。此類多聚泛素化不會使目標蛋白質經由蛋白酶體降解,因此不能將它等同於以蛋白質分解為結果的泛素化作用。

除參與多聚泛素鏈合成外,UBE2V2 也與目標基因的轉錄活化有關。來源將這項作用描述為促進目標基因轉錄活化,但未進一步指出哪些目標基因或具體調控步驟,因此不宜延伸為特定基因或機制的主張。

UBE2V2 亦參與細胞週期進程的控制與細胞分化。現有資料支持其與這些生物學過程相關,但未提供更細的階段、細胞類型或作用方向,故不能據此推定它在所有情境中都會促進或抑制細胞週期或分化。

在 DNA 損傷反應方面,UBE2V2 參與無錯誤 DNA 修復途徑,並有助於細胞在 DNA 受損後存活。這些功能與其參與的泛素鏈形成相連,但來源未界定兩者間的完整因果次序,也未說明特定損傷類型或修復步驟。整體而言,來源所述功能涵蓋轉錄、細胞週期與分化,以及 DNA 損傷後的修復和存活,不能以蛋白酶體降解來概括其泛素化作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 48008431 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>UBE2V2 ENST00000523111 GRCh38 chr8:48007431-48008531 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGTGCAAAAATCACAAGCATTCCTATACACTAATAACAGACAAACAGAGAGCCAAATCATGAGTGAACTC
CCATTCACAATTGCTACAAAGAGAATAAAAATACCTAGGAATACAACCTACAAGGGATGTGAAAAATCTT
TTTTTTTTTTTTTTTTCAGTTTTATGTAGAGACTAGGTATCACTATGTTGTCCAAGCTGGTCTCAAAGTC
TTGGGTTCAAGCCATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGAAGTGAGCTTCGGCGCCC
AGCCTGTATTACTTTCCTTTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTGAAATGGAGTCTCCCTCTGTTGCCCAG
GCTGGAGTGCAGCGATTTCTGCTCACTGCAGCCTCACCTCTTGGGCTCACGTGACCCTCCCACCTCAGCA
TCCCTAGCTGTTCAAATTTATTGTCCAACTCTTTTGAATCGTTTATCAACGCAAATCTGTCAATGCCCAC
TTATTTTTATTTATTTTTTTGAGGCGGAGTCTCGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCG
CGGCTCATTGCCCCTCCGCCTCCCCGGTTCAAACGATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGATT
ACAGGCGCGCGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTGGCC
AGGCTGGTTTCGAACTCCTGACCTCGGGTGATCCGATCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGA
CGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCTCATGAACTTATTCTTTAGCGTTTCATTTTGAGAGCGGGATTCACAAG
GGAATTGCGGAAACAGCAGCGAGGCCCCGCGACCCCTCGGCCCACGTGCGCGCTGTCCCTCGGGTCGCCC
CGCGCCCGCCGGGGGCGGAGTCCGCTGTGACGCGTGCAGGGCGGCGCGCTCCCGGAAGTGACGCGCGACG
GTTCGTGCGTGCGTGCGGGCGGCTGCGTCGGGCTGCAGGAGAAGATGGCGGTCTCCACAGGTCGGTTCCC
GGGCCGGGCTGCGTGATTTTCCGCTCCGACCCGGCTCTGCCCCTCCGTCTG
UBE2V2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
UBE2V2_1 ↗8:48,008,431正股48,008,382–48,008,441

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_BCJ8M · promoter · 48007929–48008461 · regulatory

ENSR8_BCJ8P · enhancer · 48008462–48009284 · regulatory

· motif · 48007663–48007685 · motif

· motif · 48007663–48007685 · motif

· motif · 48008093–48008104 · motif

· motif · 48008140–48008155 · motif

· motif · 48008145–48008157 · motif

· motif · 48008148–48008155 · motif

· motif · 48008262–48008275 · motif

· motif · 48008274–48008285 · motif

· motif · 48008351–48008366 · motif

· motif · 48008389–48008400 · motif

· motif · 48008389–48008400 · motif

· motif · 48008391–48008400 · motif

· motif · 48008394–48008410 · motif

· motif · 48008453–48008463 · motif

· motif · 48008672–48008688 · motif

· motif · 48008672–48008688 · motif

· motif · 48008819–48008841 · motif

· motif · 48008819–48008841 · motif

· motif · 48008992–48009004 · motif

在培養的新鮮血液細胞中,經 vitamin D3 處理後,UBE2V2 的表現量上升。此調控觀察限於來源描述的細胞培養與處理條件。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:145 aa

1 aa145 aa結構域
依 Q15819 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

UBE2V2 蛋白長 145 個胺基酸,屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族。其 UBC core 結構域位於第 10 至 145 個胺基酸,涵蓋蛋白質末端的大部分序列。

結構域UBC core10–145 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1J74…

PDB · 1J74

X-ray · 1.90 A · A=1-145

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UEV-2UBE2V2UBE2NUBC35
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

UBE2V2 與 UBE2N 形成異源二聚體;來源亦指出 UBE2V2 會與 CHFR 結合。資料未進一步說明 CHFR 是否屬於該異源二聚體,或其結合所產生的功能結果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能UBE2V2 單獨不具有 ubiquitin ligase 活性;它與 UBE2N 形成的異源二聚體可催化合成以 Lys-63 連結的非典型多聚泛素鏈,而此類泛素化不會導致蛋白質被蛋白酶體降解。UBE2V2 也參與目標基因轉錄活化、細胞週期進程與分化的控制,以及無錯誤 DNA 修復,並有助於 DNA 損傷後的細胞存活。含實驗來源
證據與來源

Has no ubiquitin ligase activity on its own. The UBE2V2/UBE2N heterodimer catalyzes the synthesis of non-canonical poly-ubiquitin chains that are linked through 'Lys-63'. This type of poly-ubiquitination does not lead to protein degradation by the proteasome. Mediates transcriptional activation of target genes. Plays a role in the control of progress through the cell cycle and differentiation. Plays a role in the error-free DNA repair pathway and contributes to the survival of cells after DNA damage

PMID 10089880 ↗ · PMID 14562038 ↗ · PMID 20061386 ↗ · PMID 9705497 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用UBE2V2 與 UBE2N 形成異源二聚體,並會與 CHFR 結合。含實驗來源
證據與來源

Heterodimer with UBE2N. Binds CHFR

PMID 22325355 ↗ · PMID 22589545 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控在培養的新鮮血液細胞中,經 vitamin D3 處理後,UBE2V2 的表現量上升。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated in cultured fresh blood cells upon treatment with vitamin D3

PMID 9199207 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000523111 · 4,342 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGCTGCGTCGGGCTGCAGGAGAAGATGGCGGTCTCCACAG40
41GAGTTAAAGTTCCTCGTAATTTTCGCTTGTTGGAAGAACT80
81TGAAGAAGGACAAAAAGGAGTAGGCGACGGTACAGTTAGC120
121TGGGGCCTTGAAGATGATGAAGATATGACACTTACAAGGT160
161GGACAGGCATGATTATTGGGCCACCAAGGACAAATTATGA200
201AAACAGAATATATAGCCTGAAAGTAGAATGTGGACCTAAA240
241TACCCAGAAGCTCCTCCGTCAGTTAGATTTGTAACAAAAA280
281TTAATATGAACGGAATAAATAATTCCAGTGGGATGGTGGA320
321TGCCCGGAGCATACCAGTGTTAGCAAAATGGCAAAATTCA360
361TATAGCATTAAAGTTGTACTTCAAGAGCTAAGACGTCTAA400
401TGATGTCCAAAGAAAATATGAAGCTTCCACAGCCACCAGA440
441AGGACAAACATACAACAATTAATTTTAGTGGATCTCAAAC480
481TTGTCTTAAATCAACAACCTTCTACTCATGTTAATGTCTT520
521GATTAAATATCACAATGCAAAATACACATTAAGTAAAAGA560
561ATTCCAGCTGGTAAACATGACCTGGACATTTGTAAGAATA600
601TATTTAATATATGTACACCCATTATGTTTTCAGGTAACAG640
641GAGGAAAAATGCAGCACAATTTTTTTTCTCTTGAAAGGCA680
681CTGTCATTTAAACATAAACCTGGAGTACTCGAAATAGAAT720
721TCAGGTTTACAAGATGAAAGCGTGTGGAGAAGTGTCAGAT760
761GGCAGTGGAAGCATGTGTGTTTCTAAAAAGTAAAAATCTC800
801AAGAAAACAGAAATGGCATGCTTTACCCATCTTACTTAGT840
841GAAAGAGAGCTGCAGTTGAAATTGTTTAAAAAGTAGCAGG880
881TACAATGAATATTGTCACAGATGTGTTAATTTTTGAAGCA920
921ATGTGGGTGCTGACTACTAGTAGTATCAAAAATATGTTCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。