基因總覽
UBE2V1 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 ubiquitin conjugating enzyme E2 V1。其產物屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族，蛋白質長 147 個胺基酸，具有涵蓋第 12 至 147 個胺基酸的 UBC core。它本身沒有 ubiquitin ligase 活性；其生物學角色主要見於與其他蛋白質協同的情境，尤其是和 UBE2N 形成異源二聚體後，參與特定泛素鏈的合成。這些基本特性使 UBE2V1 成為泛素化相關細胞反應中的協同因子，而非單獨執行泛素連接酶功能的蛋白質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371674 ★ | 50,081,124–50,113,150 | 4 |
| ENST00000936103 | 50,081,122–50,113,234 | 4 |
| ENST00000371657 | 50,081,124–50,113,139 | 3 |
| ENST00000557021 | 50,081,124–50,113,198 | 5 |
| ENST00000617119 | 50,081,124–50,113,198 | 5 |
| ENST00000625172 | 50,081,124–50,113,198 | 5 |
| ENST00000340309 | 50,081,124–50,115,954 | 4 |
| ENST00000371677 | 50,081,124–50,115,954 | 5 |
| ENST00000415862 | 50,081,124–50,115,954 | 3 |
| ENST00000866194 | 50,081,124–50,113,146 | 5 |
| ENST00001079902 | 50,081,124–50,113,187 | 4 |
| ENST00001079903 | 50,081,124–50,113,172 | 4 |
顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBE2V1 本身不具有 ubiquitin ligase 活性。與 UBE2N 形成異源二聚體後，兩者可催化非典型多聚泛素鏈的合成，並以 Lys-63 相連。這類泛素化會活化 IKK，且來源指出此作用似乎不涉及蛋白質經由 proteasome 降解。UBE2V1 因而參與泛素訊號的傳遞，而其相關作用依賴協同蛋白質及特定鏈結形式。
在發炎訊息傳遞方面，UBE2V1 參與 IL1B、TNF、TRAF6 與 TRAF2 所介導的 NF-kappa-B 活化，並促進標的基因的轉錄活化。與 TRIM5 協同時，UBE2V1-UBE2N 異源二聚體可生成 Lys-63 連結型多聚泛素鏈，活化 MAP3K7/TAK1 複合體，進而引發 NF-kappa-B 與 MAPK 反應性發炎基因的誘導及表現；此作用也促進 TRIM5 對特定 capsid 的限制活性。
在病毒 RNA 相關訊息路徑中，UBE2V1 與 RNF135、UBE2N 一同催化依賴病毒 RNA 的 RIGI Lys-63 連結型多聚泛素化，活化下游訊息傳遞並導致 interferon beta 生成。此外，UBE2V1-UBE2N 與 TRAF3IP2 E3 ubiquitin ligase 共同介導 TRAF6 的 Lys-63 連結型多聚泛素化；TRAF6 是 IL17A 介導訊息路徑的組成因子。
UBE2V1 也參與細胞週期進程與分化的調控，並在無錯誤 DNA 修復路徑中發揮作用，有助於細胞在 DNA 損傷後存活。來源支持其涉入多種細胞反應，但未提供各作用之間的因果先後關係。
Promoter 與基因調控
>UBE2V1 ENST00000371674 GRCh38 chr20:50113050-50114150 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AATTTATAATAAAGGAGGAGTACCTTCTTGGGTTTATTTATTTGCAAAAATATTTCCCAAGGGCCTTTGC ACAAGCTGTTCCCTCTACCTCCTCATTGTTACGGTCTCTGCTGAAATATGACCACCTTAGGAGGCCCTTC CTGACCATCCTCTGCTGCTCTTGTCTTGGTTTATCTCTACCCTATCAGAATTATAGTTTCCTGTTTATTT ACTTGCTGTCTACGACTAGAATGTAAGTCCCTGAAAGCAGGGATTTGCTTCTTCAGAGATGTCTATCCAT CCCCAGCGCCTAGCACAGTGTCTGGTACATAGTAGGTGCTTAATGTTTGTTTGTTTGGTTGAATGAATGA ATGAACGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATTGGGTAGATGGTTAGCAAATGCTTTCCCTGCCACCT TAATGCCCCTAAATCATTTAGCTGCACCCACTCCAAGCCTTCTCTGGCCGGGGAGCATCAATCCTAGGAG CCAGATCATCTGACCTGGAGGGTGATGATTCAAAAAATTTGAACCTGGAGGTTAAAATTCTGCCTGTCTC TGCCACTTAACAGCTGAGTTTAGATAAATCGCTTGATCTCTCTCGGCTGCATTTTTCACATTAATTCTGA CCTTGCGGAGATGTGGTGAGGATCTAGATAGGAACTAGACAGGAAAAAGCCCCAAGCGAATTCGGCGCTT TTGTTTGAAGCTATATTTTCTTTTTCTTTCACAATCGCGCCTTCCCAAGCCTAGTCACCCCTGCCCTTCT CACTAAGCACATCACAACCTCCCTCGCACCCGATGTGTGGGGACTTGCAGGTTGCTGGGCCCTCGAGCAC GCAGATATTTCCTTTCTCTAAAAGGGAAGGAAAAGAGCCTTCCAGGCCACGGGTCGTGCAGGTCTCCGGG GCGGGCGTCAGCGGCGGCGTATGTGCGTGCGCGCGCGCCTGCGCATCAGGGCCGGGGGACGGGTAAGGGG GGGGTGAAGAAGGGGCCGGCCTTCAAGCAAGAGCGACGCAAGATGGCAGCCACCACGGGCTCGGGTGAGC GGGGGCGCCGGGCCCGGCCGGCCGAGGGGGCATGGGCTTGGGCCGGGGGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UBE2V1_1 ↗ | 20:50,113,146 | 負股 | 50,113,136–50,113,195 |
| UBE2V1_2 ↗ | 20:50,115,954 | 負股 | 50,115,944–50,116,003 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
在培養的結腸腺癌細胞分化過程中，UBE2V1 的表現量下調。此調控描述限於該培養細胞情境。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：147 aa
UBE2V1 蛋白長 147 個胺基酸，屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族。其 UBC core 位於第 12 至第 147 個胺基酸，涵蓋蛋白質的大部分序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
UBE2V1 位於細胞核內，但不在核仁中。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 25 個夥伴
- APBB2Q92870-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CRYAAP02489 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTAG1BP78358 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DAZAP2Q15038 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DMWDG5E9A7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM168AQ92567 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- FGFR3P22607 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRIN2CQ14957 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GSNP06396 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSPA5P11021 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIF1BO60333-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLK6Q92876 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKNO60260-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF11Q9Y3C5 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RNF111Q6ZNA4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SHISA4Q96DD7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TARDBPQ13148 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM32Q13049 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- UBE2NP61088 · UniProt INTERACTION · 20 experiments · 2 筆來源紀錄
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 9 experiments · 2 筆來源紀錄
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- XBP1P17861 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- XIAPP98170 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNRF1Q8ND25 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
UBE2V1 與 UBE2N 形成異源二聚體，並有與 TRAF6 互作的記錄。另有資料描述 UBE2V2-UBE2N 異源二聚體透過 STUB1 的 U-box domain 與 E3 ligase STUB1 互作；該複合體具有特定的 Lys-63 連結型多聚泛素化活性。此項描述涉及 UBE2V2，不能據此視為 UBE2V1 的直接互作證據。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UBE2V1 本身沒有 ubiquitin ligase 活性，與 UBE2N 形成異源二聚體後可催化 Lys-63 連結型非典型多聚泛素鏈合成，活化 IKK，且似乎不涉及 proteasome 降解。它參與多種 NF-kappa-B 訊息、轉錄活化、細胞週期與分化調控、無錯誤 DNA 修復及 DNA 損傷後細胞存活，也協同參與 TRIM5、RIGI 與 TRAF6 相關反應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Has no ubiquitin ligase activity on its own. The UBE2V1-UBE2N heterodimer catalyzes the synthesis of non-canonical poly-ubiquitin chains that are linked through Lys-63. This type of poly-ubiquitination activates IKK and does not seem to involve protein degradation by the proteasome. Plays a role in the activation of NF-kappa-B mediated by IL1B, TNF, TRAF6 and TRAF2. Mediates transcriptional activation of target genes. Plays a role in the control of progress through the cell cycle and differentiation. Plays a role in the error-free DNA repair pathway and contributes to the survival of cells after DNA damage. Promotes TRIM5 capsid-specific restriction activity and the UBE2V1-UBE2N heterodimer acts in concert with TRIM5 to generate 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains which activate the MAP3K7/TAK1 complex which in turn results in the induction and expression of NF-kappa-B and MAPK-responsive inflammatory genes. Together with RNF135 and UBE2N, catalyzes the viral RNA-dependent 'Lys-63'-linked polyubiquitination of RIGI to activate the downstream signaling pathway that leads to interferon beta production. UBE2V1-UBE2N together with TRAF3IP2 E3 ubiquitin ligase mediate 'Lys-63'-linked polyubiquitination of TRAF6, a component of IL17A-mediated signaling pathway PMID 11057907 ↗ · PMID 19825828 ↗ · PMID 20061386 ↗ · PMID 21512573 ↗ · PMID 31006531 ↗ · PMID 9305758 ↗ · PMID 9418904 ↗ · PMID 9580084 ↗ · PMID 9705497 ↗ |
| 交互作用 | UBE2V1 與 UBE2N 形成異源二聚體，並與 TRAF6 互作。另有描述指出 UBE2V2-UBE2N 異源二聚體可透過 STUB1 的 U-box domain 與 E3 ligase STUB1 互作，且該複合體具有特定的 Lys-63 連結型多聚泛素化活性；此項互作描述涉及 UBE2V2。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer with UBE2N. Interacts (UBE2V2-UBE2N heterodimer) with the E3 ligase STUB1 (via the U-box domain); the complex has a specific 'Lys-63'-linked polyubiquitination activity. Interacts with TRAF6 PMID 11057907 ↗ · PMID 16307917 ↗ · PMID 16893187 ↗ |
| 細胞定位 | UBE2V1 位於細胞核內，但被排除於核仁之外。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 在培養的結腸腺癌細胞分化期間，UBE2V1 表現量下調。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTCAAGCAAGAGCGACGCAAGATGGCAGCCACCACGGGC40TCGGGAGTAAAAGTCCCTCGCAATTTCCGACTGTTGGAAG80AACTCGAAGAAGGCCAGAAAGGAGTAGGAGATGGCACAGT120TAGCTGGGGTCTAGAAGATGACGAAGACATGACACTTACA160AGATGGACAGGGATGATAATTGGGCCTCCAAGAACAATTT200ATGAAAACCGAATATACAGCCTTAAAATAGAATGTGGACC240TAAATACCCAGAAGCACCCCCCTTTGTAAGATTTGTAACA280AAAATTAATATGAATGGAGTAAATAGTTCTAATGGAGTGG320TGGACCCAAGAGCCATATCAGTGCTAGCAAAATGGCAGAA360TTCATATAGCATCAAAGTTGTCCTGCAAGAGCTTCGGCGC400CTAATGATGTCTAAAGAAAATATGAAACTCCCTCAGCCGC440CCGAAGGACAGTGTTACAGCAATTAATCAAAAAGAAAAAC480CACAGGCCCTTCCCCTTCCCCCCAATTCGATTTAATCAGT520CTTCATTTTCCACAGTAGTAAATTTTCTAGATACGTCTTG560TAGACCTCAAAGTACCGGAAAGGAAGCTCCCATTCAAAGG600AAATTTATCTTAAGATACTGTAAATGATACTAATTTTTTG640TCCATTTGAAATATATAAGTTGTGCTATAACAAATCATCC680TGTCAAGTGTAACCACTGTCCACGTAGTTGAACTTCTGGG720ATCAAGAAAGTCTATTTAAATTGATTCCCATCATAACTGG760TGGGGCACATCTAACTCAACTGTGAAAAGACACATCACAC800AATCACCTTGCTGCTGATTACACGGCCTGGGGTCTCTGCC840TTCTCCCCTTACCCTCCCGCCTCCCACCCTCCCTGCAACA880ACAGCCCTCTAGCCTGGGGGGCTTGTTAGAGTAGATGTGA920AGGTTTCAGGTCGCAGCCTGTGGGACTACTGCTAGGTGTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。