基因總覽
UBE2N 是蛋白質編碼基因，產物為 ubiquitin conjugating enzyme E2 N，屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族。此蛋白質長 152 個胺基酸，具有涵蓋第 3 至 149 位胺基酸的 UBC core。作為 E2 泛素結合酶，它參與蛋白質泛素化；其作用可與不同 E2 夥伴及 E3 泛素連接酶共同完成，涉及多種細胞調控過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000318066 ★ | 93,405,684–93,441,947 | 4 |
| ENST00000549833 | 93,405,684–93,441,256 | 5 |
| ENST00000552442 | 93,405,684–93,442,263 | 3 |
| ENST00000889119 | 93,405,684–93,442,263 | 4 |
| ENST00001051432 | 93,405,684–93,442,263 | 3 |
| ENST00001094437 | 93,405,684–93,442,263 | 4 |
| ENST00001138962 | 93,405,684–93,442,263 | 4 |
| ENST00000550657 | 93,408,371–93,442,263 | 2 |
| ENST00001051431 | 93,408,371–93,442,263 | 4 |
| ENST00000934316 | 93,408,523–93,442,263 | 4 |
| ENST00001094440 | 93,409,357–93,442,263 | 3 |
| ENST00001130470 | 93,409,357–93,442,263 | 3 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBE2N 的主要功能之一，是與 UBE2V1 或 UBE2V2 形成異源二聚體，催化 Lys-63 連結型多聚泛素鏈的合成。這類非典型泛素化不會導致蛋白質經由蛋白酶體降解，因而可作為調控訊號，而非單純標記蛋白質供分解。UBE2N 也參與標的基因的轉錄活化，並與細胞週期進程及分化的調控有關。
在 DNA 損傷反應中，UBE2N 與 E3 泛素連接酶 HLTF、SHPRH 協同作用，在基因毒性壓力下促進 PCNA 的 Lys-63 連結型多聚泛素化；此修飾與 DNA 修復所需的無錯誤修復路徑有關，也有助於細胞在 DNA 損傷後存活。來源亦指出，UBE2N 似乎與 E3 泛素連接酶 RNF5 一同修飾 JKAMP，降低 JKAMP 與蛋白酶體及 ERAD 組成因子的關聯，藉此調節 JKAMP 功能。
UBE2N 參與若干免疫與訊號傳遞過程。UBE2V1-UBE2N 異源二聚體可與 TRIM5 協同產生 Lys-63 連結型多聚泛素鏈，活化 MAP3K7/TAK1 複合體，進而誘導 NF-kappa-B 與 MAPK 響應性發炎基因的表現，並促進 TRIM5 對特定衣殼的限制活性。此外，UBE2N 與 RNF135、UBE2V1 一同依賴病毒 RNA，促進 RIGI 的 Lys-63 連結型多聚泛素化，活化下游訊號並導向 interferon beta 生成。它也與 TRAF3IP2 E3 泛素連接酶共同介導 TRAF6 的此類泛素化；TRAF6 是 IL17A 訊號路徑的組成因子。
Promoter 與基因調控
>UBE2N ENST00000318066 GRCh38 chr12:93441847-93442947 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACAAAACAGCTCCTTGGAAAAGGTTAACTATCTAAGCCTCATTTGTAAAATGGAAACAACACCTCCTCAC GATTGCTGTGAAGATGAAGTAAAGTGCTTGCAAACAGTCCATCACACAGCAAACCATCCGTCATCAGGAT AAAACGCTTCCCCAACAATTCAATTTTCGGGCACCCCCACTCTAATTCTCTCATAGGACCTCGCACTCTA TAGGTAATCTCTGCTTTACGGATTACTCTGGGTTCTTTAAACCTCTCCTTGGTCATTCGTCCTGTTAACA ATTCTGAGTCTCAACCTTTAGGTCTAGGCGTTCAGAACCATTCTTCCCGCCTCCAACTCGCTCCAAACCC TTTTCCTTCAGCCTACCCTGGGCCTAGGGGCGTGTCAGAGGTCCGATTTATACAATTTAAACATCAAAAC TCCCCCAACAGCGTGTGAGTAACTGGAGAGACCCCCAGTCAGAGCTTTGCCACCGAGTTTCGGTCTTGCC CTCCCTTTGAGGAAGGAGCAAGACGATGAGCCCCACCTCAGTCGTTCACTGCAGAGCCAGCAGGGAACGC GCGCAATGCAGGCTGAGCTGAAAGAACGAACGCGTGAGCTGAAAGAACGAACGCGTGAATGAATGAATGG GATACGTCGTAGGCCAGGCCTCTGTTACGTCGTCCACCGGCGCGGGCGTGGCCACGGTTAAGAGAGACGC GCGCGCAGTCGCGCGCGGGTCGTGCCGTACCACCGTCGCGGGCAGGCTCGGCCACGAGCGCCAGAGCCCC GCGCCTCCCCTCGCGGCCTGTCCCAAGTCCCTGCCCCGCAACAGAGCGTCACTTCCGCCATCCCCGGCAG CGGTTGGGGCGGGGCGCACGGGGGAGGGGGCCAGGTCGGAGGGAAGCCCGCCCGTGCCCGAGCCCGCGCC CGAGCAGGGACTACATTTCCCGAGGGGCCTCGGCGGCGGCTGCGGCGACGGGCGCGGCAACGTCCCCCGG AAGTGGAGCCCGGGACTTCCACTCGTGCGTGAGGCGAGAGGAGCCGGAGACGAGACCAGAGGCCGAACTC GGGTTCTGACAAGATGGCCGGGCTGCCCCGCAGGATCATCAAGGTAACCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UBE2N_1 ↗ | 12:93,441,947 | 負股 | 93,441,937–93,441,996 |
| UBE2N_2 ↗ | 12:93,442,231 | 負股 | 93,442,221–93,442,280 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_BNJNM · enhancer · 93440381–93441245 · regulatory
ENSR12_93D4DG · promoter · 93441246–93441746 · regulatory
ENSR12_84Q6R8 · promoter · 93441925–93442166 · regulatory
ENSR12_CC9CG · enhancer · 93442167–93443325 · regulatory
· motif · 93437010–93437032 · motif
· motif · 93437010–93437032 · motif
· motif · 93437544–93437566 · motif
· motif · 93437544–93437566 · motif
· motif · 93439191–93439204 · motif
· motif · 93439196–93439208 · motif
· motif · 93439269–93439281 · motif
· motif · 93439271–93439278 · motif
· motif · 93439271–93439286 · motif
· motif · 93440245–93440257 · motif
· motif · 93440914–93440925 · motif
· motif · 93441200–93441211 · motif
· motif · 93441200–93441211 · motif
· motif · 93441372–93441389 · motif
· motif · 93441385–93441394 · motif
· motif · 93441667–93441676 · motif
· motif · 93441849–93441864 · motif
· motif · 93441849–93441864 · motif
· motif · 93441963–93441972 · motif
· motif · 93441963–93441974 · motif
· motif · 93441990–93442007 · motif
· motif · 93442009–93442022 · motif
· motif · 93442009–93442022 · motif
· motif · 93442115–93442128 · motif
· motif · 93442117–93442128 · motif
· motif · 93442117–93442128 · motif
· motif · 93442119–93442128 · motif
· motif · 93442241–93442252 · motif
· motif · 93442268–93442279 · motif
· motif · 93443819–93443832 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：152 aa
UBE2N 產物長 152 個胺基酸，屬於 ubiquitin-conjugating enzyme 家族。其 UBC core 位於第 3 至 149 位胺基酸，構成蛋白質的主要註解功能區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 22 個夥伴
- BIRC3Q13489 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HLTFQ14527 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- LRSAM1Q6UWE0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OTUB1Q96FW1-1 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- RBCK1Q9BYM8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RFWD3Q6PCD5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RNF11Q9Y3C5 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RNF13O43567 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RNF168Q8IYW5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RNF182Q8N6D2 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SHPRHQ149N8-1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- STUB1Q9UNE7 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TRAF6Q9Y4K3 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- TRIM32Q13049 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBE2V1Q13404 · UniProt INTERACTION · 20 experiments · 2 筆來源紀錄
- UBE2V2Q15819 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- XIAPP98170 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ZNRF1Q8ND25 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- Map3k1Q62925 · UniProt INTERACTION · 46 experiments
- ORF169bQ8VSD5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- otub-1Q9XVR6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Stub1Q9WUD1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
UBE2N 可與 UBE2V2 形成異源二聚體；此二聚體與 E3 泛素連接酶 STUB1 作用時，具有 Lys-63 連結型多聚泛素化活性。UBE2N 也與 RNF8、RNF168、RNF11、ARIH2、ZNRF1、HLTF 及 SHPRH 有交互作用；與 HLTF、SHPRH 的交互作用與基因毒性壓力下 PCNA 泛素化及 DNA 修復相關。另有資料指出它與 RIGI、RNF135 參與 RIGI 泛素化與活化。OTUB1 可抑制其 E2 結合活性；GPS2 也被報告具有此抑制作用，但此項關係屬相似性推定。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UBE2N 與 UBE2V1 或 UBE2V2 形成異源二聚體，催化不會導致蛋白酶體降解的 Lys-63 連結型多聚泛素鏈合成，並參與標的基因轉錄活化、細胞週期進程與分化調控。它與 HLTF、SHPRH 協同修飾基因毒性壓力下的 PCNA，支持 DNA 修復；也可能與 RNF5 一同修飾 JKAMP。其作用另涉及 TRIM5 限制活性、發炎基因誘導、病毒 RNA 依賴的 RIGI 活化及 interferon beta 生成，以及 IL17A 訊號中的 TRAF6 泛素化。 | 含實驗來源 | 證據與來源The UBE2V1-UBE2N and UBE2V2-UBE2N heterodimers catalyze the synthesis of non-canonical 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains. This type of polyubiquitination does not lead to protein degradation by the proteasome. Mediates transcriptional activation of target genes. Plays a role in the control of progress through the cell cycle and differentiation. Plays a role in the error-free DNA repair pathway and contributes to the survival of cells after DNA damage. Acts together with the E3 ligases, HLTF and SHPRH, in the 'Lys-63'-linked poly-ubiquitination of PCNA upon genotoxic stress, which is required for DNA repair. Appears to act together with E3 ligase RNF5 in the 'Lys-63'-linked polyubiquitination of JKAMP thereby regulating JKAMP function by decreasing its association with components of the proteasome and ERAD. Promotes TRIM5 capsid-specific restriction activity and the UBE2V1-UBE2N heterodimer acts in concert with TRIM5 to generate 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains which activate the MAP3K7/TAK1 complex which in turn results in the induction and expression of NF-kappa-B and MAPK-responsive inflammatory genes. Together with RNF135 and UB2V1, catalyzes the viral RNA-dependent 'Lys-63'-linked polyubiquitination of RIGI to activate the downstream signaling pathway that leads to interferon beta production. UBE2V1-UBE2N together with TRAF3IP2 E3 ubiquitin ligase mediate 'Lys-63'-linked polyubiquitination of TRAF6, a component of IL17A-mediated signaling pathway PMID 10089880 ↗ · PMID 14562038 ↗ · PMID 19269966 ↗ · PMID 19825828 ↗ · PMID 20061386 ↗ · PMID 21512573 ↗ · PMID 28469175 ↗ · PMID 31006531 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine. | 含實驗來源 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 ubiquitin-activating enzyme]-L-cysteine + S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine. PMID 20061386 ↗ |
| 分子活性 | UBE2N 參與蛋白質修飾，具體類別為蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | UBE2N 與 UBE2V2 形成異源二聚體，並與 STUB1、RNF8、RNF168、RNF11、ARIH2、HLTF、SHPRH、RIGI、RNF135 及 ZNRF1 交互作用。UBE2V2-UBE2N 與 STUB1 構成具 Lys-63 連結型多聚泛素化活性的複合體；HLTF、SHPRH 相關作用涉及基因毒性壓力下 PCNA 泛素化及 DNA 修復，RIGI 與 RNF135 則涉及 RIGI 泛素化和活化。OTUB1 會抑制 E2 結合活性；GPS2 也有此作用的相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer with UBE2V2. Interacts (UBE2V2-UBE2N heterodimer) with the E3 ligase STUB1 (via the U-box domain); the complex has a specific 'Lys-63'-linked polyubiquitination activity. Interacts with RNF8 and RNF168. Interacts with RNF11. Interacts with the E3 ligases, HLTF and SHPRH; the interactions promote the 'Lys-63'-linked polyubiquitination of PCNA upon genotoxic stress and lead to DNA repair. Interacts with ARIH2 (via RING-type 2). Interacts with OTUB1; leading to inhibit E2-conjugating activity. Interacts with GPS2; leading to inhibit E2-conjugating activity (By similarity). Interacts with RIGI and RNF135; involved in RIGI ubiquitination and activation. Interacts with ZNRF1 PMID 10089880 ↗ · PMID 11473255 ↗ · PMID 14562038 ↗ · PMID 16215985 ↗ · PMID 16307917 ↗ · PMID 17108083 ↗ · PMID 17130289 ↗ · PMID 18316726 ↗ · PMID 18615712 ↗ · PMID 18719106 ↗ · PMID 19203578 ↗ · PMID 19340006 ↗ · PMID 20725033 ↗ · PMID 22325355 ↗ · PMID 22367539 ↗ · PMID 22589545 ↗ · PMID 28469175 ↗ · PMID 29626159 ↗ |
| 細胞定位 | UBE2N 的細胞內定位包括細胞核與細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTCGTGCGTGAGGCGAGAGGAGCCGGAGACGAGACCAGA40GGCCGAACTCGGGTTCTGACAAGATGGCCGGGCTGCCCCG80CAGGATCATCAAGGAAACCCAGCGTTTGCTGGCAGAACCA120GTTCCTGGCATCAAAGCCGAACCAGATGAGAGCAACGCCC160GTTATTTTCATGTGGTCATTGCTGGCCCTCAGGATTCCCC200CTTTGAGGGAGGGACTTTTAAACTTGAACTATTCCTTCCA240GAAGAATACCCAATGGCAGCCCCTAAAGTACGTTTCATGA280CCAAAATTTATCATCCTAATGTAGACAAGTTGGGAAGAAT320ATGTTTAGATATTTTGAAAGATAAGTGGTCCCCAGCACTG360CAGATCCGCACAGTTCTGCTATCGATCCAGGCCTTGTTAA400GTGCTCCCAATCCAGATGATCCATTAGCAAATGATGTAGC440GGAGCAGTGGAAGACCAACGAAGCCCAAGCCATAGAAACA480GCTAGAGCATGGACTAGGCTATATGCCATGAATAATATTT520AAATTGATACGATCATCAAGTGTGCATCACTTCTCCTGTT560CTGCCAAGACTTCCTCCTCTTTGTTTGCATTTAATGGACA600CAGTCTTAGAAACATTACAGAATAAAAAAGCCCAGACATC640TTCAGTCCTTTGGTGATTAAATGCACATTAGCAAATCTAT680GTCTTGTCCTGATTCACTGTCATAAAGCATGAGCAGAGGC720TAGAAGTATCATCTGGATTGTTGTGAAACGTTTAAAAGCA760GTGGCCCCTCCCTGCTTTTATTCATTTCCCCCATCCTGGT800TTAAGTATAAAGCACTGTGAATGAAGGTAGTTGTCAGGTT840AGCTGCAGGGGTGTGGGTGTTTTTATTTTATTTTATTTTA880TTTTATTTTTGAGGGGGGAGGTAGTTTAATTTTATGGGCT920CCTTTCCCCCTTTTTTGGTGATCTAATTGCATTGGTTAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。