基因總覽
UBE2M 是人類的蛋白質編碼基因，其正式名稱為 ubiquitin conjugating enzyme E2 M。產物屬於 ubiquitin-conjugating enzyme family，並歸入 UBC12 subfamily；這項家族分類指出它是參與泛素樣蛋白質接合反應的 E2 酵素。蛋白質長 183 個胺基酸，具有 UBC core，另有與 UBA3 互動的區域。其 N 端部分被註記為無序區。這些特徵構成 UBE2M 蛋白的基本架構；其分子作用與生物學角色見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000253023 ★ | 58,555,712–58,558,611 | 6 |
| ENST00000940562 | 58,555,709–58,558,984 | 6 |
| ENST00001021886 | 58,555,711–58,558,984 | 6 |
| ENST00001021887 | 58,555,711–58,558,984 | 6 |
| ENST00001021891 | 58,555,711–58,558,984 | 6 |
| ENST00001021893 | 58,555,711–58,558,984 | 5 |
| ENST00001074904 | 58,555,711–58,558,984 | 5 |
| ENST00001141428 | 58,555,711–58,558,984 | 6 |
| ENST00000595957 | 58,556,141–58,558,954 | 7 |
| ENST00000596985 | 58,556,201–58,557,089 | 4 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
UBE2M 的主要功能是催化 NEDD8 共價接合至其他蛋白質。它從 UBA3-NAE1 E1 複合體接收 NEDD8，並在接合反應中促成 NEDD8 由 E1 轉移至 E2：E1 上與 NEDD8 相連的硫酯鍵解除，而 NEDD8 隨後以硫酯鍵連接至 E2 的半胱胺酸。這項反應使 UBE2M 成為 NEDD8 傳遞至受體蛋白質途徑中的 E2 成員。
UBE2M 與 E3 ubiquitin ligase RBX1 具有特異性互動；資料指出它不與 RBX2 以相同方式互動。這種差異提示 RBX1-UBE2M 複合體可使特定目標蛋白質發生 neddylation，已列出的目標包括 CUL1、CUL2、CUL3 與 CUL4。來源將此描述為特定目標的修飾作用，並未將其擴及所有蛋白質。
其相關功能分類為蛋白質修飾，具體為 protein neddylation。來源亦指出 UBE2M 參與細胞增殖，但沒有進一步說明此參與的分子步驟或條件，因此不宜據此推定更具體的增殖調控機制。
Promoter 與基因調控
>UBE2M ENST00000253023 GRCh38 chr19:58558511-58559611 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CATCCCCTTTTCCAGATAGTGGGGGAAGCGCAGAGGCTGCAGTGCGTGTCCGCTGGAACTTGAGGCCCAC GCCAATAGCGGCCCGATTCCGCCCCCACGTCGCGTTCCCCAAGTGTCCACCCCGACAGGTCTTCCCCTAC ACCACTGTAACCCTCCACAGTGCTTACCACTCTCTGGCACAATACATGTTTTGTTAGTTTACCTCAATCA GAATCTCCAGGAACGGGGATCTTTGGGTTTGCGATGGGACAGGGAAGGTACTCGACCTCGCACCCTCTGG GTAACGCATCTAGTCTCACTCAGGGTCTTGCCGCGATCACCCTGCCTTGTCTGTGACCCATAGGGTCAAA GGCAGGCCGGGCGGGTGGCGGCAGCAGCGGAGGTGACCACCCGCGCCGCGCTCTGCACATATATACAACT TAAGATGAAGTGACCGCGAGCAAAAGCGGCCCACGTCTGCCCCACTCAAAGATGGCGACTAACTCCGCTT CCTGCCCGGCCCCGCGAAAGTCGCCGGAAGTGACCTGCAAGGCCGCCGAAGCGTCATCTCCATGAACGGA AATGCCCGAGTCCAGCCGAAGGAGGCCGAACCCCAAACTCCATCGCTGAGCAACGCGGGTTTGCGGCGGC TGCGCAGGCGCACAACGCAGGCCGGGCGGGAAGAGCCAAAGCGGGCAGGCGGCGGAAATATCCGAAGCGG CGGGGCGCCCGAGGCCGTTGCCGACCTCCGCGCTAAAGCCGCTGCTGCCGCGGAAGACGATCCTCCAGTA CCCGCCCGCCGTCACCGCAGCTGCCGTGTCCTCCTCCCACCCCTAGCCGCACCCCCTCGCGGAGGGATCA GCTGAGCGGCCAAACGGCACGGTCGGGGGAGCCCCGAGTCCGCAGCTGCAGCGGGGCCTGAGACCAGAGT TGGCGAGGGCAAGGAAGGAGCGGCCCCGGGCAGTGGGGGCGGGGCCGGGCGGGCCCGAGAACAGCCGAAT TTGGCCGAGCGCTGCCGAGCGAGTCCGAGGCGCTGGGCCAGGCCGGAGCCGGACTACGGGAGCCGAGGCG GGCCGCGCGGTGGGCGCGGAGAGGAGCGGAGCGGCGCGGCAGGCCGGGCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| UBE2M_2 ↗ | 19:58,558,567 | 負股 | 58,558,557–58,558,616 |
| UBE2M_1 ↗ | 19:58,558,922 | 負股 | 58,558,912–58,558,971 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_5HQT8S · CTCF_binding_site · 58554744–58554765 · regulatory
ENSR19_5HQT99 · CTCF_binding_site · 58554840–58554861 · regulatory
ENSR19_BFLQJ · promoter · 58554950–58555595 · regulatory
ENSR19_5HQT9T · CTCF_binding_site · 58554966–58554987 · regulatory
ENSR19_5HQTT9 · CTCF_binding_site · 58558297–58558318 · regulatory
ENSR19_BFLR3 · promoter · 58558601–58559235 · regulatory
ENSR19_5HQTXH · CTCF_binding_site · 58558776–58558797 · regulatory
· motif · 58554746–58554762 · motif
· motif · 58554842–58554858 · motif
· motif · 58554968–58554984 · motif
· motif · 58555013–58555022 · motif
· motif · 58555013–58555024 · motif
· motif · 58555013–58555024 · motif
· motif · 58555051–58555062 · motif
· motif · 58555094–58555105 · motif
· motif · 58555111–58555124 · motif
· motif · 58555111–58555124 · motif
· motif · 58555135–58555146 · motif
· motif · 58555163–58555174 · motif
· motif · 58555163–58555174 · motif
· motif · 58555201–58555212 · motif
· motif · 58555201–58555212 · motif
· motif · 58555256–58555272 · motif
· motif · 58555997–58556008 · motif
· motif · 58557437–58557450 · motif
· motif · 58557789–58557797 · motif
· motif · 58557955–58557966 · motif
· motif · 58558089–58558096 · motif
· motif · 58558128–58558140 · motif
· motif · 58558131–58558138 · motif
· motif · 58558132–58558145 · motif
· motif · 58558164–58558177 · motif
· motif · 58558167–58558179 · motif
· motif · 58558172–58558189 · motif
· motif · 58558222–58558235 · motif
· motif · 58558228–58558235 · motif
· motif · 58558229–58558242 · motif
· motif · 58558258–58558270 · motif
· motif · 58558261–58558268 · motif
· motif · 58558261–58558276 · motif
· motif · 58558299–58558315 · motif
· motif · 58558352–58558366 · motif
· motif · 58558352–58558366 · motif
· motif · 58558778–58558794 · motif
· motif · 58558813–58558830 · motif
· motif · 58558822–58558839 · motif
· motif · 58558859–58558876 · motif
· motif · 58558970–58558981 · motif
· motif · 58558970–58558981 · motif
· motif · 58559090–58559099 · motif
· motif · 58559090–58559101 · motif
· motif · 58559257–58559270 · motif
· motif · 58559260–58559272 · motif
· motif · 58559263–58559270 · motif
· motif · 58559600–58559613 · motif
· motif · 58559618–58559625 · motif
· motif · 58559692–58559701 · motif
· motif · 58559704–58559721 · motif
· motif · 58562382–58562399 · motif
· motif · 58562623–58562632 · motif
· motif · 58562926–58562935 · motif
· motif · 58562937–58562954 · motif
· motif · 58563021–58563038 · motif
· motif · 58563078–58563087 · motif
· motif · 58563189–58563206 · motif
· motif · 58563363–58563374 · motif
· motif · 58563363–58563374 · motif
· motif · 58563382–58563393 · motif
· motif · 58563430–58563443 · motif
· motif · 58563430–58563443 · motif
· motif · 58563565–58563578 · motif
· motif · 58563565–58563578 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：183 aa
UBE2M 蛋白長 183 個胺基酸，屬於 ubiquitin-conjugating enzyme family 的 UBC12 subfamily。其 UBC core 位於第 29 至 173 個胺基酸；第 1 至 57 個胺基酸區域註記為與 UBA3 互動，而第 1 至 29 個胺基酸則被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- CUL1Q13616 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- DCUN1D1Q96GG9 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GNB2P62879 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEDD8Q15843 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- PRKNO60260-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBX1P62877 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- UBA3Q8TBC4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
UBE2M 與 UBA3、RBX1 有互動；資料另指出它與 RBX2 不具相同的特異性互動。N 端乙醯化形式的 UBE2M 透過 DCUN1 domain 與 DCUN1D1、DCUN1D2、DCUN1D3、DCUN1D4 及 DCUN1D5 互動。RBX1-UBE2M 被描述為可對特定目標蛋白質進行 neddylation 的複合體，這是功能關係的說明，不代表所列目標皆為直接結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | UBE2M 從 UBA3-NAE1 E1 複合體接收 NEDD8，並催化其共價接合至其他蛋白質。它與 RBX1 而非 RBX2 的特異性互動，提示 RBX1-UBE2M 複合體可修飾 CUL1、CUL2、CUL3 與 CUL4；UBE2M 也參與細胞增殖。 | 含實驗來源 | 證據與來源Accepts the ubiquitin-like protein NEDD8 from the UBA3-NAE1 E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. The specific interaction with the E3 ubiquitin ligase RBX1, but not RBX2, suggests that the RBX1-UBE2M complex neddylates specific target proteins, such as CUL1, CUL2, CUL3 and CUL4. Involved in cell proliferation PMID 10207026 ↗ · PMID 15361859 ↗ |
| 分子活性 | [E1 NEDD8-activating enzyme]-S-[NEDD8 protein]-yl-L-cysteine + [E2 NEDD8-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 NEDD8-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 NEDD8-conjugating enzyme]-S-[NEDD8-protein]-yl-L-cysteine. | 含實驗來源 | 證據與來源[E1 NEDD8-activating enzyme]-S-[NEDD8 protein]-yl-L-cysteine + [E2 NEDD8-conjugating enzyme]-L-cysteine = [E1 NEDD8-activating enzyme]-L-cysteine + [E2 NEDD8-conjugating enzyme]-S-[NEDD8-protein]-yl-L-cysteine. PMID 15361859 ↗ |
| 分子活性 | UBE2M 參與蛋白質修飾，具體的修飾類型為 protein neddylation。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | UBE2M 與 UBA3、RBX1 互動；其 N 端乙醯化形式則透過 DCUN1 domain 與 DCUN1D1、DCUN1D2、DCUN1D3、DCUN1D4 及 DCUN1D5 互動。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with UBA3 and RBX1. Interacts (N-terminally acetylated form) with (via DCUN1 domain) DCUN1D1, DCUN1D2, DCUN1D3, DCUN1D4 and DCUN1D5 PMID 15361859 ↗ · PMID 15694336 ↗ · PMID 19250909 ↗ · PMID 21940857 ↗ · PMID 23201271 ↗ · PMID 28581483 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAGTCCGAGGCGCTGGGCCAGGCCGGAGCCGGACTACGGG40AGCCGAGGCGGGCCGCGCGGTGGGCGCGGAGAGGAGCGGA80GCGGCGCGGCAGGCCGGGCGGGTGGCGGCAGCAGCGGAGG120AGGCCGCAGCTGCGGGTCCGAGGAGCGGAGGCGACGCGGG160CGGCGGCGGGGGGCCGGGTGGCCGGGGTCCCGGGCCCCGC200GGCGGCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCAGGATGATCAAGC240TGTTCTCGCTGAAGCAGCAGAAGAAGGAGGAGGAGTCGGC280GGGCGGCACCAAGGGCAGCAGCAAGAAGGCGTCGGCGGCG320CAGCTGCGGATCCAGAAGGACATAAACGAGCTGAACCTGC360CCAAGACGTGTGATATCAGCTTCTCAGATCCAGACGACCT400CCTCAACTTCAAGCTGGTCATCTGTCCTGATGAGGGCTTC440TACAAGAGTGGGAAGTTTGTGTTCAGTTTTAAGGTGGGCC480AGGGTTACCCGCATGATCCCCCCAAGGTGAAGTGTGAGAC520AATGGTCTATCACCCCAACATTGACCTCGAGGGCAACGTC560TGCCTCAACATCCTCAGAGAGGACTGGAAGCCAGTCCTTA600CGATAAACTCCATAATTTATGGCCTGCAGTATCTCTTCTT640GGAGCCCAACCCCGAGGACCCACTGAACAAGGAGGCCGCA680GAGGTCCTGCAGAACAACCGGCGGCTGTTTGAGCAGAACG720TGCAGCGCTCCATGCGGGGTGGCTACATCGGCTCCACCTA760CTTTGAGCGCTGCCTGAAATAGGGTTGGCGCATACCCACC800CCCGCCACGGCCACAAGCCCTGGCATCCCCTGCAAATATT840TATTGGGGGCCATGGGTAGGGGTTTGGGGGGCGGCCGGTG880GGGGAATCCCCTGCCTTGGCCTTGCCTCCCCTTCCTGCCA920CGTGCCCCTAGTTATTTTTTTTTTTTTAACACCATGTGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。